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Fosforilación oxidativa

La fosforilación oxidativa es un proceso metabólico que utiliza energía liberada por la oxidación de nutrientes para producir adenosina trifosfato (ATP). Se le llama así para distinguirla de otras rutas que producen ATP con menor rendimiento, llamadas "a nivel de sustrato". Se calcula que hasta el 90 % de la energía celular en forma de ATP es producida de esta forma.[1]

Esquema actual del sistema mitocondrial de la fosforilación. Los equivalentes reducidos que se generan en el metabolismo (NADH, FADH2) son ácidos oxidados por la cadena de transporte de electrones. La energía libre generada en esta reacción se emplea para bombear protones (puntos rojos) desde la matriz mitocondrial hasta el interior de las crestas mitocondriales, para dar lugar a la fuerza protón-motriz. Cuando este se disipa a través del retorno a la matriz de los protones a través de la ATP sintasa, la energía almacenada se emplea para fosforilar el ADP con un grupo fosfato para formar ATP.
El modelo actual cubre algunos problemas suscitados por el anterior. En primer lugar, todos los componentes activos de la cadena de transporte de electrones se encuentran exclusivamente en las crestas mitocondriales y formando supercomplejos, en la imagen representado por el supercomplejo I1III2IV1. Esto permite canalizar de unos complejos a otros las moléculas de transferencia de electrones. Previamente se pensaba que difundían libremente. En segundo lugar, la diferencia de pH, uno de los componentes de la fuerza protón-motriz junto con el potencial de membrana (ΔΨ) es de tan sólo 0,55 unidades, equivalente a 32 mV, insuficiente para impulsar la fosforilación. Sin embargo, existen circunstancias locales que aumentan este pH en un factor de 2 unidades. En primer lugar, la ATP sintasa forma dímeros y filas que comban y dan forma a la cresta mitocondrial, haciendo que el espacio interno tenga tan sólo 20 ± 4 nm. El espacio entre la membrana interna y externa es menor, de 12 ± 2,5 nm, pero cuenta con poros lo suficientemente grandes como para estar en equilibrio con el citoplasma. Los protones se concentran gracias al «efecto superficie» y al rápido flujo desde las fuentes de protones a los sumideros.

Consta de dos etapas: en la primera, la energía libre generada mediante reacciones químicas redox en varios complejos multiproteicos —conocidos en su conjunto como cadena de transporte de electrones— se emplea para producir, por diversos procedimientos como bombeo, ciclos quinona/quinol o bucles redox, un gradiente electroquímico de protones a través de una membrana asociada en un proceso llamado quimiosmosis. La cadena respiratoria está formada por tres complejos de proteínas principales (complejo I, III, IV), y varios complejos «auxiliares», utilizando una variedad de donantes y aceptores de electrones. Los tres complejos se asocian en supercomplejos para canalizar las moléculas transportadoras de electrones, la coenzima Q y el citocromo c, haciendo más eficiente el proceso.

La energía potencial de ese gradiente, llamada fuerza protón-motriz, se libera cuando se translocan los protones a través de un canal pasivo, la enzima ATP sintasa, y se utiliza en la adición de un grupo fosfato a una molécula de ADP para almacenar parte de esa energía potencial en los enlaces anhidro «de alta energía» de la molécula de ATP mediante un mecanismo en el que interviene la rotación de una parte de la enzima a medida que fluyen los protones a través de ella. En vertebrados, y posiblemente en todo el reino animal, se genera un ATP por cada 2,7 protones translocados. Algunos organismos tienen ATPasas con un rendimiento menor.

Existen también proteínas desacopladoras que permiten controlar el flujo de protones y generar calor desacoplando ambas fases de la fosforilación oxidativa.

Aunque las diversas formas de vida utilizan una gran variedad de nutrientes, casi todas realizan la fosforilación oxidativa para producir ATP, la molécula que provee de energía al metabolismo. Esta ruta es tan ubicua debido a que es una forma altamente eficaz de liberación de energía, en comparación con los procesos alternativos de fermentación, como la glucólisis anaeróbica.

Pese a que la fosforilación oxidativa es una parte vital del metabolismo, produce una pequeña proporción de especies reactivas del oxígeno tales como superóxido y peróxido de hidrógeno, lo que lleva a la propagación de radicales libres, provocando daño celular, contribuyendo a enfermedades y, posiblemente, al envejecimiento. Sin embargo, los radicales tienen un importante papel en la señalización celular, y posiblemente en la formación de enlaces disulfuro de las propias proteínas de la membrana interna mitocondrial. Las enzimas que llevan a cabo esta ruta metabólica son blanco de muchas drogas y productos tóxicos que inhiben su actividad.

Historia

 
El bioquímico Arthur Harden

El estudio de la fosforilación oxidativa se inició en 1906 con el informe de Arthur Harden sobre el papel vital del fosfato en la fermentación celular, aunque inicialmente se pensaba que solo los azúcar-fosfato estaban involucrados.[2]​ Sin embargo, a principios de los años 1940, la relación entre la oxidación de los azúcares y la generación de ATP fue establecida de forma definitiva por Herman Kalckar,[3]​ confirmando el papel central del ATP en la transferencia de energía, que había sido propuesto por Fritz Albert Lipmann en 1941.[4]​ Más tarde, en 1949, Friedkin y Morris Albert L. Lehninger demostraron que la coenzima NADH se encuentra relacionada con vías metabólicas tales como el ciclo del ácido cítrico y la síntesis de ATP.[5]

Durante otros veinte años, el mecanismo por el cual se generaba el ATP siguió siendo un misterio, con científicos buscando un elusivo «intermediario de alta energía», que enlazara las reacciones de oxidación y fosforilación.[6]​ El misterio fue resuelto por Peter D. Mitchell con la publicación de la teoría quimiosmótica en 1961.[7]​ En un principio la propuesta fue muy controvertida, pero fue aceptada lentamente y finalmente Mitchell recibió el Premio Nobel de Química en 1978 por su teoría.[8][9]​ La investigación posterior se centró en la purificación y caracterización de las enzimas involucradas, con importantes contribuciones realizadas por David E. Green sobre los complejos de la cadena de transporte de electrones, así como de Efraim Racker sobre la ATP sintasa.[10]​ Un paso fundamental hacia la solución de los mecanismos de la ATP sintasa fue proporcionada por Paul D. Boyer, con su desarrollo en 1973 del mecanismo de «cambio de unión», seguido por su radical propuesta de un sistema de catálisis rotacional en 1982.[11][12]​ Los trabajos más recientes incluyen estudios estructurales de las enzimas involucradas en la fosforilación oxidativa, llevados a cabo por John E. Walker, habiendo obtenido Walker y Boyer el Premio Nobel en 1997.[13]

Transferencia de energía por quimiosmosis

 
Modelo molecular del NAD+

La fosforilación oxidativa funciona con dos tipos de reacciones que están acopladas, una utiliza reacciones químicas que liberan energía, mientras que la otra utiliza esa energía para llevar a cabo sus reacciones.[14]​ El flujo de electrones a través de la cadena de transporte de electrones, desde donantes de electrones como NADH a aceptores de electrones tales como oxígeno, es un proceso exergónico —libera energía—, mientras que la síntesis de ATP es un proceso endergónico, el cual requiere de energía. Tanto la cadena de transporte de electrones como la ATP sintasa, están embebidos en la membrana, y la energía es transferida de la cadena de transporte de electrones a la ATP sintasa por el movimiento de protones a través de la membrana, en un proceso llamado quimiosmosis.[15]​ En la práctica, se comporta de manera similar a un simple circuito eléctrico, con una corriente de protones siendo transportados desde el lado negativo, lado N de la membrana hacia el lado positivo, lado P, por las enzimas de la cadena de transporte de electrones que bombean protones. Estas enzimas son como una batería, ya que realizan trabajo, para llevar corriente a través del circuito. El movimiento de protones crea un gradiente electroquímico a través de la membrana, el cual es llamado generalmente fuerza protón-motriz. Este gradiente tiene dos componentes: una diferencia en la concentración de protones (un gradiente de pH) y una diferencia en el potencial eléctrico, con un lado N, que posee carga negativa. La energía es almacenada mayormente como la diferencia de potenciales eléctricos en la mitocondria, pero también como un gradiente de pH en los cloroplastos.[16]

La ATP sintasa libera esta energía almacenada completando el circuito y permitiendo a los protones fluir a través del gradiente electroquímico, de nuevo hacia el lado N de la membrana.[17]​ Esta enzima se comporta de manera similar a un motor eléctrico ya que utiliza la fuerza protón-motriz para llevar a cabo la rotación de parte de su estructura y acoplar este movimiento con la síntesis de ATP.

La cantidad de energía liberada por la fosforilación oxidativa es elevada, comparada con la cantidad producida por la fermentación anaeróbica. La glucólisis produce solo dos moléculas de ATP, en cambio entre 30 y 36 ATP son producidos por la fosforilación oxidativa de los 10 NADH y 2 succinato obtenidos a través de la conversión de una molécula de glucosa en dióxido de carbono y agua.[18]​ Este resultado de ATP es el máximo teórico, ya que en la práctica algunos protones se filtran a través de la membrana, disminuyendo así la producción de ATP.[19]

Moléculas de transferencia de protones y electrones

 
Reducción de la coenzima Q desde su forma ubiquinona (Q) a la forma reducida de ubiquinol (QH2).

La cadena de transporte de electrones transporta tanto protones como electrones, transfiriendo electrones desde donantes hacia aceptores, y transportando protones a través de la membrana. Estos procesos utilizan moléculas de transferencia tanto solubles como unidas a proteínas. En la mitocondria, los electrones son transferidos dentro del espacio intermembranal por la proteína de transferencia de electrones solubles en agua, citocromo c.[20]​ Esto transporta solamente electrones, y estos son transferidos por la reducción y oxidación de un átomo de hierro que se encuentre en el grupo hemo de la proteína. El citocromo c se encuentra también en algunas bacterias, donde se ubica en el espacio periplasmático.[21]

Dentro de la membrana interna mitocondrial, el transportador de electrones liposoluble, la coenzima Q10 (Q) transporta tanto electrones como protones a través de un ciclo redox.[22]​ Esta pequeña molécula de benzoquinona es muy hidrófobica, de modo que difunde libremente en la membrana. Cuando Q acepta dos electrones o libera dos protones, es reducida a su forma ubiquinol (QH2); cuando QH2 libera dos electrones o acepta dos protones, es oxidada a su forma original de ubiquinona (Q). Como resultado, si dos enzimas están organizadas de modo que Q es reducida de un lado de la membrana y QH2 oxidada en el otro, la ubiquinona se acoplará a estas reacciones y actuará como lanzadera de protones a través de la membrana.[23]​ Algunas cadenas de transporte de electrones bacterianas utilizan quinonas diferentes, como la menaquinona, aparte de la ubiquinona.[24]

Dentro de las proteínas, los electrones son transferidos entre cofactores de flavina,[17][25]​ centros hierro-azufre, y citocromos. Existen varios tipos de centros hierro-azufre; los más simples que se encuentran en la cadena de transferencia de electrones consisten en dos átomos de hierro unidos por dos átomos azufre inorgánico; estos son centros [2Fe–2S]. El segundo tipo, los centros [4Fe–4S], contienen un cubo de cuatro átomos de hierro y cuatro de azufre. Cada átomo de hierro en estos centros es coordinado por un aminoácido, generalmente por el átomo de azufre de la cisteína. Los iones metálicos cofactores atraviesan por reacciones redox sin unir o liberar protones, de modo que en la cadena de transporte de electrones sirven solamente para el transporte de electrones entre proteínas. Los electrones se desplazan largas distancias a través de las proteínas saltando entre las cadenas que forman estos cofactores.[26]​ Esto ocurre por efecto túnel, el cual es rápido sobre distancias menores a 1,4−9 m.[27]

Cadena de transporte de electrones en eucariotas

Muchos procesos bioquímicos catabólicos, tales como la glucólisis, el ciclo de Krebs y la beta oxidación, producen la coenzima reducida NADH. Esta coenzima contiene electrones que tiene un elevado potencial de transferencia; es decir, que liberan una gran cantidad de energía tras su oxidación. Sin embargo, la célula no libera toda esta energía a la vez, si no sería una reacción incontrolable. En vez de ello, los electrones son eliminados del NADH y transferidos al oxígeno a través de una serie de enzimas cada una de las cuales libera una pequeña cantidad de energía. Este conjunto de enzimas, que consiste en complejos, del I al IV, llamado cadena de transporte de electrones se encuentra en la membrana de la mitocondria. El succinato también es oxidado por la cadena de transporte de electrones, pero entra en la vía metabólica por un punto diferente.

En eucariotas, las enzimas en este sistema de transporte de electrones utilizan la energía liberada de la oxidación de NADH para bombear protones a través de la membrana interna mitocondrial. Esto provoca una acumulación de protones en el espacio intermembrana, y genera un gradiente electroquímico a través de la membrana. La energía almacenada en este potencial es luego utilizada por la ATP sintasa para producir ATP. La fosforilación oxidativa en las mitocondrias de organismos eucariotas es el ejemplo de este proceso mejor comprendido. Las mitocondrias están presentes en casi todos los eucariotas, con la excepción de los protozoarios anaeróbicos tales como Trichomonas vaginalis que en su lugar reducen protones a hidrógeno en una reminiscencia de mitocondria llamada hidrogenosoma.[28]

Se ha comprobado que las enzimas de la cadena respiratoria se sitúan preferentemente en la membrana de las crestas mitocondriales. La membrana crestal está enriquecida en los componentes de estos complejos, aproximadamente en un 70 % del total. Se ha sugerido que esta distribución asimétrica podría deberse a que las juntas crestales suponen una barrera dinámica.[29]

Enzimas respiratorias y sustratos típicos de eucariotas.
Enzima respiratoria Par redox  Potencial medio 

(Volts)

 NADH deshidrogenasa NAD+ / NADH −0,32[30]
 Succinato deshidrogenasa FMN o FAD / FMNH2 o FADH2 −0,20[30]
 Complejo del citocromo bc1 Coenzima Q10ox / Coenzima Q10red +0,06[30]
 Complejo del citocromo bc1 Citocromo box / Citocromo bred +0,12[30]
 Complejo IV Citocromo cox / Citocromo cred +0,22[30]
 Complejo IV Citocromo aox / Citocromo ared +0,29[30]
 Complejo IV O2 / HO- +0,82[30]
Condiciones: pH = 7[30]

NADH- ubiquinona oxidorreductasa (complejo I)

 
Estructura molecular del complejo I por cristalografía de rayos X de Thermus thermophilus. MMDB ID 82358 .

La NADH-ubiquinona oxidorreductasa, también conocida como NADH deshidrogenasa o complejo I, es el primer complejo proteico en la cadena de transporte de electrones. Es uno de ensamblajes enzimáticos de membrana de mayor tamaño, y el mayor de la cadena respiratoria.

En términos generales, la reacción que cataliza es la oxidación de NADH y la transferencia de dos electrones a una quinona, normalmente una ubiquinona de entre 8 y 10 isoprenilos, aunque admite varios sustratos análogos. Posteriormente utiliza la energía liberada en esta reacción para la translocación de cuatro protones desde la matriz al espacio de intermembrana. La existencia de complejos I translocadores de Na+, aunque ha sido postulado en procariotas, a día de hoy no se sustenta en la evidencia.[31]​ En bacterias marinas y patógenas, como Vibrio cholerae existe una enzima diferente y sin aparente homología, la NADH:Ubiquinona oxidoreductasa dependiente de sodio, que bombea un ion Na+ por electrón en lugar protones.[32]

La ecuación global de esta reacción es:

 [33]

Esta reacción tiene dos componentes termodinámicamente distintos: Uno muy favorable, la transferencia de dos electrones desde NADH hasta la quinona. Los siguientes parámetros para las correspondientes semirreacciones pueden variar por las condiciones de solución, de membrana y de la posición de la cabeza de la quinona dentro de ella:

 

 

Lo cual nos da un  

Mecanismo catalítico de la reacción red/ox

 
Ruta de los electrones entre los centros hierro-sulfuro de la NADH deshidrogenasa

La reacción global de oxidación de la quinona por NADH tiene lugar a una velocidad elevadísima (Kcat≈500 s-1). La cinética y el mecanismo catalítico concreto se infieren de varios estudios, de tipo estructural a partir de la cristalografía de rayos X del complejo I de T. termophilus y de estudios de EPR a muy bajas temperaturas, conocida como "freeze quenching".[34]​ La longitud que recorren los electrones desde el centro de unión a flavina hasta el último centro, el N2 es de unos 90 Å. El primer paso consiste en la transferencia de dos electrones desde el NADH a la Flavina mononucleótido en la subunidad NDFUV1. Aunque no está probado, parece ser que lo más probable es que esto suceda mediante transferencia del hidruro, (o sea, dos electrones y un protón) evitando de esa manera la formación del intermediario NAD., que es inestable. Los estudios estructurales en T. thermophilus avalan esta posibilidad. Para ello, el NADH "apilaría" su anillo nicotinamida sobre el anillo isoaloxazina de la flavina, siendo el carbono C4 el donante de electrones en el NADH, y el aceptor sería el Carbono C5 de la flavina, separados ambos una distancia de unos 3,5 Å. En B.Taurus, a PH=7,8, los potenciales de NAD+ (-0,35 V) y de la flavina (-0,38 V)son muy próximos, de modo que este paso es reversible. Su velocidad es muy elevada: El proceso de unión de NADH, transferencia del hidrido y liberación de NAD+ tiene una KcatNADH/KmNADH>1 x 107 M-1 s-1[35]​ Es decir, que tiene lugar en un tiempo menor de 90 μs, lo cual está por debajo de la capacidad de medición de los instrumentos actuales más precisos.[34]

El segundo paso es muy importante, porque los dos electrones no son transferidos simultáneamente a la quinona: Uno de ellos pasa a gran velocidad (≈90μs) por toda la cadena de centros [Fe-S] hacia el último de ellos, el N2, próximo a la quinona, mientras que el otro es transferido a un centro próximo a la flavina (12 Å), el N1a y a la misma velocidad, por lo que se supone que ambos centros tienen el máximo potencial reductor de toda la enzima. Una vez oxidados ambos centros, la enzima parece "pararse" 1ms, lo cual parece indicar que ese es el periodo en el que la enzima aún permanece ligada al NAD+ para evitar la entrada de un nuevo NADH. Dado que el centro más cercano es el N3, y está en la vía de N2, es muy probable que el primero de los electrones parta hacia este centro, dejando durante un breve instante a la flavina como un intermediario flavosemiquinona. A partir de ahí, el electrón que entra en N3 parte hacia los centros N1b, N4 y N5. Todos ellos tienen un potencial redox muy similar, de modo que el electrón estaría "equilibrado" moviéndose entre ellos. La velocidad a la que tiene lugar la transmisión desde el paso limitante, es decir, el más lento (que o bien es la oxidación del NADH o la reducción de FMN) hasta la quinona avala la idea de que esto se produce por efecto túnel, unido a que todos los centros, salvo el N7 se encuentran por debajo de la distancia limitante de 14 Å.[36]

Lo cierto es que durante el tiempo que la enzima aparentemente permanece unida al NAD<+, no se detectan apenas señales del intermediario ubisemiquinona, lo cual significa que no es transferido a la semiquinona, y tampoco se detecta una caída significativa de energía libre. Se han propuesto varias explicaciones: El segundo electrón sería "retenido" en el centro N1a para evitar que se forme el intermediario flavosemiquinona, que podría generar radicales superóxido, puesto que este centro es fácilmente accesible al oxígeno. Entre tanto, el segundo electrón generaría un cambio conformacional suficiente para que pueda pasar el segundo y de esa manera ser transferidos casi simultáneamente a la quinona. En este momento se detecta el descenso en la energía libre.[36]​ El lugar donde se une la quinona, entre las subunidades hidrofóbica e hidrofílica parece tener la suficiente holgura para aceptar una gran variedad de bloqueantes.[37]

Este sistema también puede producir radicales superóxido, pero la cantidad y los lugares donde se producen, así como los mecanismos y proporciones concretas son objeto de mucha controversia y problemas de interpretación; aunque deben ser elevados, se discuten las cifras de 1-4 % del oxígeno respirado para todo el sistema OXPHOS.[38]

Estructura funcional

Hasta el momento no se tenían datos completos de cristalografía de rayos X del complejo con resolución suficiente, pero recientemente se ha podido lograr un modelo para la bacteria Thermus thermofilus de entre 3,3-4 Å, con lo que se están esclareciendo algunos detalles del mecanismo catalítico que eran desconocidos.[37]

En mitocondrias bovinas es un heteromultímero que consta de 45 subunidades, con una masa molecular de 969 kilodaltons (kDa).[39][40][41]​ En procariotas su tamaño es menor, y típicamente está formada por 14 subunidades y 10 cofactores, con un tamaño aproximado de 550 KDa.[42]​ Todas ellas cuentan homólogos en la forma mitocondrial, y se cree que forman la llamada "enzima mínima" o nuclear, ya que se considera que son suficientes para la transducción energética.[43]​ En plantas y algas el número de subunidades totales es 30, y en hongos, 37.[44]​ Recientemente un análisis ha encontrado homólogos de tres de estas proteínas supernumerarias en el complejo I de α-proteobacterias, consideradas las antepasadas de las mitocondrias.[45]

El resto de subunidades del complejo I mitocondrial, llamadas «accesorias», o «supernumerarias», varía en su número según las especies, tienen funciones enzimáticas aparentemente no relacionadas con la transducción energética, y su función no se comprende completamente.[46]​ Las siete subunidades "nucleares" del dominio intrínseco o de membrana son codificadas por el genoma mitocondrial, mientras que el resto lo son por el genoma nuclear. El ensamblaje de la enzima es muy complejo y no conocido en su totalidad, produciéndose patologías si surgen defectos.[47]

El complejo, que tiene forma de "L" consta de dos partes: una hidrofílica o extrínseca, que mira a la matriz o "lado P" de la membrana, y otra embebida en la propia membrana, llamada porción hidrofóbica o intrínseca. Las siete proteínas "nucleares" codificadas por el genoma mitocondrial se encuentran todas en esta porción. La enzima bovina, cuando se purifica en presencia de agentes caotrópicos suaves, puede disociarse en cuatro subcomplejos según las condiciones de tratamiento: Iα que comprende toda la porción extrínseca (Iλ) y parte de la intrínseca (Iγ) y la parte Iβ, que comprende casi toda la parte intrínseca. Funcionalmente consta de tres módulos: el módulo N, que une NADH y captura sus electrones transmitiéndolos al FMN y contiene los dos grupos prostéticos [2Fe-2S], el módulo Q, que contiene el resto de centros hierro sulfuro y transfiere esos electrones a la quinona, y por último el módulo P, encargado del bombeo de protones.[47]

Regulación

La regulación de la actividad del complejo I se produce principalmente por tres mecanismos: Control de la expresión génica, integración en supercomplejos ("respirasomas") e interacciones con otras proteínas, en especial, modificaciones postaduccionales.[39]

Complejos auxiliares

Los complejos auxiliares de la cadena respiratoria son un grupo de complejos multiproteicos que realizan la transferencia de electrones sin bombear protones al espacio de intermembrana. En la mayoría de los casos ello es debido a que el potencial de reducción de sus sustratos está muy próximo al de las quinonas y es insuficiente para la translocación de protones. También se consideran dentro de este grupo las llamadas "oxidasas alternativas", que transfieren electrones al oxígeno sin pasar por el complejo III y la citocromo oxidasa (complejo IV).[48]

Succinato-Q oxidorreductasa (complejo II)

 
Complejo II: Succinato-Q oxidorreductasa.

La enzima succinato-Q oxidorreductasa, también conocida como complejo II o sucinato deshidrogenasa, es el segundo punto de entrada en la cadena de transporte de electrones.[49]​ Es inusual debido a que esta enzima es la única que forma parte de los procesos del ciclo de Krebs y de la cadena de transporte de electrones. El complejo II consiste en cuatro subunidades de proteínas y contiene unida como cofactor la flavín adenín dinucleótido (FAD), centros hierro-azufre, y un grupo hemo que no participa en la transferencia de electrones hacia la coenzima Q, pero que se cree es importante en disminuir la producción de especies reactivas del oxígeno.[50][51]​ Oxida el succinato a fumarato y reduce la ubiquinona. Debido a que esta reacción libera menos energía que la oxidación de NADH, el complejo II no transporta electrones a través de la membrana y no contribuye al gradiente de protones.

   

En algunos eucariotas, tales como el helminto Ascaris suum, una enzima similar al complejo II, fumarato reductasa (menaquinol:fumarato oxidorreductasa, o QFR), opera de forma reversa oxidando ubiquinol y reduciendo fumarato. Esto permite al helminto sobrevivir en el ambiente anaeróbico del intestino grueso, llevando a cabo una fosforilación oxidativa anaeróbica con fumarato como aceptor de electrones.[52]​ Otra función no convencional del complejo II es observada en el parásito que provoca la malaria Plasmodium falciparum. En este caso, la acción invertida del complejo II como oxidasa es importante para regenerar el ubiquinol, el cual el parásito utiliza como una forma inusual de biosíntesis de pirimidina.[53]

Flavoproteína de transporte de electrones Q oxidorreductasa

La flavoproteína de transporte de electrones ubiquinona oxidorreductasa (oxidorreductasa ETF-Q), también conocida como flavoproteína de transporte de electrones deshidrogenasa, es el tercer punto de entrada a la cadena de transporte de electrones. Es una enzima que acepta electrones de la flavoproteína de transferencia de electrones en la matriz mitocondrial, y utiliza estos electrones para reducir ubiquinona.[54]​ Esta enzima contiene una flavina y un centro [4Fe–4S], pero, a diferencia de otros complejos respiratorios, se une a la superficie de la membrana y no atraviesa la bicapa lipídica.[55]

   

En mamíferos, esta ruta metabólica es importante en la beta oxidación de ácidos grasos y el catabolismo de aminoácidos y colinas, al aceptar electrones de múltiples acetil-CoA deshidrogenasas.[56][57]​ En plantas, la oxidorreductasa ETF-Q también es importante en la respuesta que permite la supervivencia por extensos periodos de oscuridad.[58]

Reductasas y oxidasas alternativas

Muchos organismos eucariotas poseen cadenas de transporte de electrones diferentes a la de los mamíferos, que difieren mucho de las más estudiadas de estos últimos (descritas anteriormente). Por ejemplo, en plantas, existen NADH oxidasas que oxidan el NADH en el citosol en lugar de la matriz mitocondrial, y transfieren estos electrones a las reservas de ubiquinona.[59]​ Estas enzimas no transportan protones, y por ello, reducen ubiquinona sin alterar el gradiente electroquímico a través de la membrana interna.[60]

Otro ejemplo de cadena de transporte de electrones divergente es la oxidasa alternativa, que es encontrada en plantas, así como algunos hongos, protistas y posiblemente algunos animales.[61][62]​ Esta enzima transfiere electrones directamente del ubiquinol al oxígeno.[63]

Las rutas de transporte de electrones producidos por estas oxidasas alternativas de NADH y ubiquinona tienen un menor rendimiento de ATP que la ruta completa. Las ventajas que se obtienen por estas rutas más cortas no son del todo conocidas. Sin embargo, las oxidasas alternativas son producidas como respuesta a situaciones de estrés ambiental, como el frío, especies reactivas del oxígeno e infección por patógenos, así como otros factores que inhiben la cadena de transporte de electrones completa.[64][65]​ Las rutas alternativas podrían, por lo tanto, aumentar la resistencia de los organismos ante daños, reduciendo el estrés oxidativo.[66]

Q-citocromo c oxidorreductasa (complejo III)

 
Transferencia de electrones en dos pasos, en el complejo III: Q-citocromo c oxidorreductasa. Luego de cada paso, Q (en la parte superior de la figura) abandona la enzima.

La Q-citocromo c oxidorreductasa también conocida como citocromo c reductasa, complejo del citocromo bc1, o simplemente complejo III.[67][68]​ En mamíferos, esta enzima es un dímero, con cada subunidad del complejo conteniendo once subunidades de proteínas, un centro hierro-azufre [2Fe-2S] y tres citocromos: un citocromo c1 y dos citocromos b.[69]​ Un citocromo es un tipo de proteína de transferencia de electrones que contiene al menos un grupo hemo. Los átomos de hierro dentro del grupo hemo del complejo III alternan entre sus estados de oxidación reducido (+2) y oxidado (+3) mientras los electrones son transferidos a través de la proteína.

La reacción catalizada por el complejo III es la oxidación de una molécula de ubiquinol y la reducción de dos moléculas de citocromo c, una proteína hemo libremente asociada con la mitocondria. A diferencia de la coenzima Q, que transporta dos electrones, el citocromo c transporta solo uno.

   

Debido a que solo uno de los electrones puede ser transferido desde el donante QH2 al aceptor citocromo c, a la vez, el mecanismo de reacción del complejo III es más elaborado que aquellos de los otros complejos respiratorios, y se da en dos pasos, llamados ciclo Q.[70]​ En el primer paso, la enzima se une a tres sustratos, primero, QH2, el cual es luego oxidado, siendo un electrón transferido al segundo sustrato, el citocromo c. Los dos protones liberados de QH2 pasan al espacio intermembrana. El tercer sustrato es Q, el cual acepta el segundo electrón de QH2 y es reducido a Q.-, el cual es un radical libre de ubisemiquinona. Los primeros dos sustratos son liberados, pero este intermediario de ubisemiquinona permanece unido. En el segundo paso, una segunda molécula de QH2 es unida y de nuevo pasa su primer electrón al aceptor citocromo c. El segundo electrón es transferido a la ubisemiquinona unida, reduciéndola a QH2 mientras gana dos protones de la matriz mitocondrial. Este QH2 es luego liberado de la enzima.[71]

Como la coenzima Q es reducida a ubiquinol en el lado interno de la membrana y oxidado a ubiquinona en el externo, hay una transferencia neta de electrones a través de la membrana, añadidos al gradiente de protones.[17]​ El mecanismo más bien complejo de dos pasos por el cual sucede esto es importante, ya que incrementa la eficiencia de la transferencia de protones. Si, en lugar del ciclo Q, una molécula de QH2 fuese utilizada directamente para reducir dos moléculas del citocromo c, la eficiencia se reduciría a la mitad, siendo transferido solo un protón por citocromo c reducido.[17]

Citocromo c oxidasa (complejo IV)

 
Complejo IV: citocromo c oxidasa.

La citocromo c oxidasa, también conocida como complejo IV, es el complejo final de proteínas en la cadena de transporte de electrones.[72]​ En mamíferos esta enzima posee una estructura extremadamente compleja y contiene trece subunidades, dos grupos hemo, así como múltiples iones metálicos como cofactores – en todas, tres átomos de cobre, uno de magnesio y uno de zinc.[73]

Esta enzima media la reacción final en la cadena de transporte de electrones y los transfiere al oxígeno, mientras bombea protones a través de la membrana.[74]​ El aceptor de electrones final es el oxígeno, llamado también aceptor terminal de electrones, el cual es reducido a agua en este paso. Tanto el bombeo directo de protones y la consumición de protones de la matriz en la reducción de oxígeno contribuyen al gradiente de protones. La reacción catalizada es la oxidación de citocromo c y la reducción de oxígeno:

   

Organización de complejos

El modelo original sobre como los complejos de la cadena respiratoria están organizados era que estos difundían libremente en la membrana mitocondrial.[75]​ Sin embargo, datos recientes sugieren que los complejos podrían formar estructuras de alto orden llamadas supercomplejos o "respirasomas."[76]​ En este modelo varios complejos existen como conjuntos organizados de enzimas que interaccionan entre ellas.[77]​ Estas asociaciones podrían permitir la canalización de sustratos entre varios complejos de enzimas, aumentando su tasa y eficiencia en la transferencia de electrones.[78]​ Dentro de los supercomplejos presentes en mamíferos, algunos componentes están presentes en mayor cantidad que otros, con una tasa entre complejos I/II/III/IV y ATP sintasa de aproximadamente 1:1:3:7:4.[79]​ Sin embargo, el debate sobre la hipótesis de estos supercomplejos aún no está resuelta, ya que algunos datos no parecen ajustarse a este modelo.[41][80]

Cadena de transporte de electrones en procariotas

En contraste con la similitud general en cuanto a estructura y función de la cadena de transporte de electrones en eucariotas, las bacterias y arqueas poseen una gran variedad de enzimas de transferencia de electrones. Estas utilizan un conjunto igualmente amplio de sustratos.[81]​ Al igual que en los eucariotas, la cadena de transporte de electrones de los procariotas utiliza la energía liberada de la oxidación de un sustrato para bombear iones a través de la membrana y generar un gradiente electroquímico. En bacterias, la fosforilación oxidativa en Escherichia coli ha sido estudiada en profundidad, mientras que los sistemas de arqueas han sido poco estudiados.[82]

La principal diferencia entre la fosforilación oxidativa en procariotas y eucariotas es que tanto bacterias como arqueas utilizan una gran variedad de donantes y aceptores de electrones. Esto permite a los procariotas desarrollarse en una amplia variedad de condiciones ambientales.[83]​ En E. coli, por ejemplo, la fosforilación oxidativa puede ser llevada a cabo por un gran número de pares de agentes reductores y oxidantes, los cuales son listados a continuación. El potencial medio de un químico mide cuanta energía es liberada cuanto este es oxidado o reducido, teniendo los agentes reductores un potencial negativo y los agentes oxidante un potencial positivo.

Enzimas respiratorias y sustratos en E. coli.[84]
Enzima respiratoria Par redox  Potencial medio 

(Volts)

 Formiato deshidrogenasa Bicarbonato / Formiato −0,43
 Hidrogenasa Protón / Hidrógeno −0,42
 NADH deshidrogenasa NAD+ / NADH −0,32
 Glicerol-3-fosfato deshidrogenasa DHAP / Gli-3-P −0,19
 Piruvato oxidasa  Acetato + Dióxido de carbono / Piruvato   ?
 Lactato deshidrogenasa Piruvato / Lactato −0,19
 D-aminoácido deshidrogenasa  2-oxoácido + Amoníaco / D-aminoácido   ?
 Glucosa deshidrogenasa Gluconato / Glucosa −0,14
 Succinato deshidrogenasa Fumarato / Succinato +0,03
 Ubiquinol oxidasa Oxígeno / Agua +0,82
 Nitrato reductasa Nitrato / Nitrito +0,42
 Nitrito reductasa Nitrito / Amoníaco +0,36
 Dimetil sulfóxido reductasa DMSO / DMS +0,16
 Trimetilamina N-óxido reductasa TMAO / TMA +0,13
 Fumarato reductasa Fumarato / Succinato +0,03

Como se muestra en la tabla anterior, E. coli es capaz de crecer con agentes reductores como el formiato, hidrógeno, o lactato como donantes de electrones, y nitrato, DMSO, u oxígeno como aceptores.[83]​ La mayor diferencia en el potencial entre un agente oxidante y uno reductor indica una mayor liberación de energía cuando reaccionan. Dentro de estos compuestos, el par succinato/fumarato es inusual, ya que su potencial es muy cercano a cero. El succinato puede ser oxidado a fumarato si se encuentra en presencia de un fuerte agente oxidante como el oxígeno, y el fumarato puede ser reducido utilizando un fuerte agente reductor como lo es el formiato. Estas reacciones alternativas son catalizadas por la succinato deshidrogenasa y la fumarato reductasa, respectivamente.[85]

Algunos procariotas utilizan pares redox que poseen una muy pequeña diferencia de potencial. Por ejemplo, las bacterias nitrificantes tales como Nitrobacter oxidan nitrito a nitrato, donando electrones al oxígeno. La pequeña cantidad de energía liberada en esta reacción es suficiente como para bombear protones y generar ATP, pero no es suficiente como para producir NADH o NADPH directamente para su uso en el anabolismo.[86]​ Este problema es solucionado utilizando una nitrito oxidorreductasa para producir la suficiente fuerza protón motriz como para hacer funcionar la cadena de transporte de electrones en sentido inverso, haciendo que el complejo I genere NADH.[87][88]

Los procariotas controlan su uso de donantes y aceptores de electrones variando las enzimas que producen, en respuesta a condiciones ambientales.[89]​ Esta flexibilidad es posible porque diferentes oxidasas y reductasas utilizan las mismas reservas de ubiquinona. Esto permite que muchas combinaciones de enzimas funcionen en conjunto, unidas por un intermediario común de ubiquinol.[84]​ Por ello es que estas cadenas respiratorias tienen un diseño modular fácilmente intercambiable con otros conjuntos de enzimas.

Además de esta diversidad metabólica, los procariotas también poseen una variedad de isoenzimas – diferentes enzimas que catalizan la misma reacción. Por ejemplo, en E. coli, hay dos tipos diferentes de ubiquinol oxidasa utilizando oxígeno como un aceptor de electrones. Bajo condiciones aeróbicas, la célula utiliza una oxidasa con baja afinidad por el oxígeno que es capaz de transportar dos protones por electrón. Sin embargo, si los niveles de oxígeno caen, cambian a una oxidasa que transfiere solo un protón por electrón, pero tiene una elevada afinidad por el oxígeno.[90]

ATP sintasa (complejo V)

ATP sintasa, también llamada complejo V, es la enzima final del proceso de la fosforilación oxidativa. Esta enzima se encuentra en todas las formas de vida y funciona de la misma manera tanto en procariotas como en eucariotas.[91]​ Esta enzima usa la energía almacenada en un gradiente de protones a través de la membrana para llevar a cabo la síntesis de ATP desde ADP y fosfato (Pi). Las estimaciones del número de protones necesarios para sintetizar una molécula de ATP oscilan entre tres y cuatro,[92][93]​ y algunos investigadores sugieren que las células pueden variar esta proporción, para ajustarse a diferentes condiciones.[94]

   

Esta reacción de fosforilación es un equilibrio, que puede ser cambiado alterando la fuerza protón motriz. En ausencia de una fuerza protón motriz, la reacción de la ATP sintasa se desplazará hacia la izquierda, hidrolizando ATP y bombeando protones fuera de la matriz a través de la membrana. Sin embargo, cuando la fuerza protón motriz es alta, la reacción es forzada a desplazarse en la dirección opuesta; de izquierda a derecha, permitiendo el flujo de protones en el sentido de su gradiente de concentración produciendo ADP desde ATP.[91]​ Es más, en la cercanamente relacionada proteína H+-ATPasa tipo vacuolar, la misma reacción es usada para acidificar los compartimentos celulares, bombeando protones e hidrolizando ATP.[95]

La ATP sintasa es un complejo masivo de proteínas con forma de hongo. El complejo de enzimas en mamíferos contiene 16 subunidades y posee una masa de aproximadamente 600 kilodaltons.[96]​ La porción embebida en la membrana es llamada FO y contiene un anillo de subunidades c y el canal de protones. El pedúnculo y la parte superior esférica es llamada F1 y es el sitio donde ocurre la síntesis de ATP. La porción esférica del extremo de F1 contiene seis proteínas de dos tipos diferentes (tres subunidades α y tres subunidades β), mientras que el "pedúnculo" consiste solo en una proteína: la subunidad γ, con un extremo extendiéndose en la esfera de subunidades α y β.[97]​ Ambas subunidades, α y β se unen a nucleótidos, pero solo la subunidad β cataliza la síntesis de ATP. Alcanzando por la base una porción de F1 e introduciéndose en la membrana se encuentra una larga subunidad en forma de bastón que ancla las subunidades α y β en la base de la enzima.

A medida que los protones atraviesan la membrana a través del canal en la base de la ATP sintasa, FO entra en rotación.[98]​ Esta rotación puede ser provocada por cambios en la ionización de aminoácidos en el anillo de subunidades c provocando interacciones electrostáticas que impulsan el anillo de subunidades c a través del canal de protones.[99]​ Este anillo de rotación provoca la rotación del eje central (el pedúnculo de la subunidad γ) dentro de las subunidades α y β. Estas subunidades son incapaces de rotar debido al brazo lateral que actúa como un estátor. Este movimiento del extremo de la subunidad γ en el interior de la esfera de subunidades α y β provee de energía para los sitios activos en las subunidades β para llevar a cabo un ciclo de movimientos que generan y luego liberan ATP.[100]

 
Mecanismo de la ATP sintasa. El ATP se muestra en rojo, el ADP y fosfato en rosado y la subunidad γ rotando, en negro.

La reacción de síntesis de ATP es llamada «mecanismo de cambio de unión» —del inglés binding change mechanism— e involucra el sitio activo de una subunidad β en ciclando a través de tres estados.[11]​ En el estado "abierto", el ADP y el fosfato entran en el sitio activo (mostrado en marrón en el diagrama). La proteína luego captura las moléculas y se une a ellas ligeramente (mostrado en rojo). La enzima luego cambia su conformación nuevamente y acerca las moléculas, con el sitio activo en el estado final (mostrado en rosado) uniendo el recién formada molécula de ATP con una elevada afinidad. Finalmente, el sitio activo cicla de nuevo a su estado original abierto, liberando ATP y uniéndose a más ADP y fosfato, preparándose así para el próximo ciclo.

En algunas bacterias y arqueas, la síntesis de ATP es llevada a cabo por el movimiento de iones sodio a través de la membrana celular, en lugar del movimiento de protones.[101][102]​ Arqueas tales como Methanococcus poseen la sintasa A1Ao, una forma de la enzima que contiene proteínas adicionales con muy poca similitud en cuanto a su secuencia con otras subunidades de ATP sintasa de bacterias o eucariotas. Es posible que en algunas especies, la forma A1Ao de la enzima sea una ATP sintasa especializada en el transporte de sodio,[103]​ pero esto puede que no sea así en todos los casos.[102]

Inhibidores

Existen varias drogas y toxinas que inhiben la fosforilación oxidativa. Aunque estas toxinas inhiben sólo una enzima en la cadena de transporte de electrones, la inhibición de cualquier paso detiene el resto del proceso. Por ejemplo, cuando la oligomicina inhibe a la enzima ATP sintasa, los protones no pueden ser devueltos a la mitocondria.[104]​ Como resultado, las bombas de protones son incapaces de operar, y el gradiente se torna demasiado fuerte como para ser superado. NADH deja de ser oxidado y el ciclo del ácido cítrico deja de operar porque la concentración de NAD+ cae por debajo de la concentración que estas enzimas pueden utilizar.

  • Cianuro: El cianuro es un potente veneno que inhibe la cadena de transporte de electrones y la fosforilación oxidativa bloqueando el paso de electrones del citocromo a3 al oxígeno en el complejo IV. Esto bloquea la cadena de transporte de electrones, lo que conlleva que no se genere el gradiente de protones y por tanto no se produzca la obtención de ATP con la consiguiente acumulación de NADH y FADH2. Además el cianuro se une a la hemoglobina impidiendo también la captación de oxígeno.
  • Oligomicina: La oligomicina, un antibiótico producido por Streptomyces, inhibe a la ATP pasa al unirse a la subunidad Fo e interferir en el transporte de H+ a través de Fo, inhibe por lo tanto la síntesis de ATP y como consecuencia de no eliminar el gradiente de protones se inhibe también a la cadena de transporte de electrones, por lo tanto disminuirá el consumo de O2 y se acumulará NADH y FADH2.
  • 2,4-Dinitrofenol: El 2,4-dinitrofenol es un agente desacoplante, es decir, desacopla la cadena de transporte de electrones de la fosforilación oxidativa. El desacoplamiento se produce ya que el 2,4-dinitrofenol hace permeable a los protones de la membrana interna mitocondrial deshaciendo la relación obligada entre la cadena respiratoria y la fosforilación oxidativa. El efecto de este veneno por tanto es la inhibición de la producción de ATP al no generarse el gradiente de pH pero si permite que la cadena de transporte de electrones continúe funcionando.
Compuesto Uso Efecto en la fosforilación oxidativa
Cianuro y
monóxido de carbono
Veneno Inhiben la cadena de transporte de electrones ya que se unen más fuertemente que el oxígeno a los centros FeCu en la citocromo c oxidasa, y por tanto evitan la reducción del oxígeno.[105]
Oligomicina Antibiótico Inhibe la ATP sintasa bloqueando el flujo de protones a través de la subunidad Fo.[104]
CCCP
2,4-Dinitrofenol
Veneno Ionóforos que interrumpen el gradiente de protones transportando estos a través de la membrana. Este ionoforo desacopla el bombeo de electrones de la ATP sintasa debido a que transporta electrones a través de la membrana mitocondrial interna.[106]
Rotenona Pesticida Impide la transferencia de electrones del complejo I a la ubiquinona al bloquear los sitios de unión a la ubiquinona.[107]
Malonato y oxaloacetato Inhibidores competitivos de la succinato de hidrogenasa (complejo II).[108]

No todos los inhibidores de la fosforilación oxidativa son toxinas. En el tejido adiposo marrón, los canales de protones regulados llamados proteínas desacopladoras son capaces de desacoplar la respiración de la síntesis de ATP.[109]​ Esta respiración rápida produce calor, y es particularmente importante como una vía para mantener la temperatura corporal en la hibernación de los animales, aunque estas proteínas pueden también tener una función más general en la respuesta de las células al estrés oxidativo.[110]

Véase también

Referencias

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Lecturas complementarias

Introductorias

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  • Schneider ED; Sagan D (2006). Into the Cool: Energy Flow, Thermodynamics and Life (1ª edición). University of Chicago Press. ISBN 0-226-73937-6. 
  • Lane N (2006). Power, Sex, Suicide: Mitochondria and the Meaning of Life (1ª edición). Oxford University Press, EE. UU. ISBN 0199205647. 

Avanzadas

  • Nicholls DG; Ferguson SJ (2002). Bioenergetics 3 (1ª edición). Academic Press. ISBN 0-125-18121-3. 
  • Haynie D (2001). Biological Thermodynamics (1ª edición). Cambridge University Press. ISBN 0-521-79549-4. 
  • Rajan SS (2003). Introduction to Bioenergetics (1ª edición). Anmol. ISBN 8-126-11364-2. 
  • Wikstrom M (Ed) (2005). Biophysical and Structural Aspects of Bioenergetics (1ª edición). Royal Society of Chemistry. ISBN 0-854-04346-2. 

Enlaces externos

  • Diagramas animados ilustrando la fosforilación oxidativa. Wiley and Co Concepts in Biochemistry (en inglés).
  • Metabolic Pathways of Biochemistry, de la Universidad George Washington (en inglés).
  • Lecturas de biofísica de Antony Crofts, Universidad de Illinois en Urbana-Champaign (en inglés).
  •   Datos: Q227564
  •   Multimedia: Oxidative phosphorylation

fosforilación, oxidativa, fosforilación, oxidativa, proceso, metabólico, utiliza, energía, liberada, oxidación, nutrientes, para, producir, adenosina, trifosfato, llama, así, para, distinguirla, otras, rutas, producen, menor, rendimiento, llamadas, nivel, sust. La fosforilacion oxidativa es un proceso metabolico que utiliza energia liberada por la oxidacion de nutrientes para producir adenosina trifosfato ATP Se le llama asi para distinguirla de otras rutas que producen ATP con menor rendimiento llamadas a nivel de sustrato Se calcula que hasta el 90 de la energia celular en forma de ATP es producida de esta forma 1 Esquema actual del sistema mitocondrial de la fosforilacion Los equivalentes reducidos que se generan en el metabolismo NADH FADH2 son acidos oxidados por la cadena de transporte de electrones La energia libre generada en esta reaccion se emplea para bombear protones puntos rojos desde la matriz mitocondrial hasta el interior de las crestas mitocondriales para dar lugar a la fuerza proton motriz Cuando este se disipa a traves del retorno a la matriz de los protones a traves de la ATP sintasa la energia almacenada se emplea para fosforilar el ADP con un grupo fosfato para formar ATP El modelo actual cubre algunos problemas suscitados por el anterior En primer lugar todos los componentes activos de la cadena de transporte de electrones se encuentran exclusivamente en las crestas mitocondriales y formando supercomplejos en la imagen representado por el supercomplejo I1III2IV1 Esto permite canalizar de unos complejos a otros las moleculas de transferencia de electrones Previamente se pensaba que difundian libremente En segundo lugar la diferencia de pH uno de los componentes de la fuerza proton motriz junto con el potencial de membrana DPS es de tan solo 0 55 unidades equivalente a 32 mV insuficiente para impulsar la fosforilacion Sin embargo existen circunstancias locales que aumentan este pH en un factor de 2 unidades En primer lugar la ATP sintasa forma dimeros y filas que comban y dan forma a la cresta mitocondrial haciendo que el espacio interno tenga tan solo 20 4 nm El espacio entre la membrana interna y externa es menor de 12 2 5 nm pero cuenta con poros lo suficientemente grandes como para estar en equilibrio con el citoplasma Los protones se concentran gracias al efecto superficie y al rapido flujo desde las fuentes de protones a los sumideros Consta de dos etapas en la primera la energia libre generada mediante reacciones quimicas redox en varios complejos multiproteicos conocidos en su conjunto como cadena de transporte de electrones se emplea para producir por diversos procedimientos como bombeo ciclos quinona quinol o bucles redox un gradiente electroquimico de protones a traves de una membrana asociada en un proceso llamado quimiosmosis La cadena respiratoria esta formada por tres complejos de proteinas principales complejo I III IV y varios complejos auxiliares utilizando una variedad de donantes y aceptores de electrones Los tres complejos se asocian en supercomplejos para canalizar las moleculas transportadoras de electrones la coenzima Q y el citocromo c haciendo mas eficiente el proceso La energia potencial de ese gradiente llamada fuerza proton motriz se libera cuando se translocan los protones a traves de un canal pasivo la enzima ATP sintasa y se utiliza en la adicion de un grupo fosfato a una molecula de ADP para almacenar parte de esa energia potencial en los enlaces anhidro de alta energia de la molecula de ATP mediante un mecanismo en el que interviene la rotacion de una parte de la enzima a medida que fluyen los protones a traves de ella En vertebrados y posiblemente en todo el reino animal se genera un ATP por cada 2 7 protones translocados Algunos organismos tienen ATPasas con un rendimiento menor Existen tambien proteinas desacopladoras que permiten controlar el flujo de protones y generar calor desacoplando ambas fases de la fosforilacion oxidativa Aunque las diversas formas de vida utilizan una gran variedad de nutrientes casi todas realizan la fosforilacion oxidativa para producir ATP la molecula que provee de energia al metabolismo Esta ruta es tan ubicua debido a que es una forma altamente eficaz de liberacion de energia en comparacion con los procesos alternativos de fermentacion como la glucolisis anaerobica Pese a que la fosforilacion oxidativa es una parte vital del metabolismo produce una pequena proporcion de especies reactivas del oxigeno tales como superoxido y peroxido de hidrogeno lo que lleva a la propagacion de radicales libres provocando dano celular contribuyendo a enfermedades y posiblemente al envejecimiento Sin embargo los radicales tienen un importante papel en la senalizacion celular y posiblemente en la formacion de enlaces disulfuro de las propias proteinas de la membrana interna mitocondrial Las enzimas que llevan a cabo esta ruta metabolica son blanco de muchas drogas y productos toxicos que inhiben su actividad Indice 1 Historia 2 Transferencia de energia por quimiosmosis 3 Moleculas de transferencia de protones y electrones 4 Cadena de transporte de electrones en eucariotas 4 1 NADH ubiquinona oxidorreductasa complejo I 4 1 1 Mecanismo catalitico de la reaccion red ox 4 1 2 Estructura funcional 4 1 3 Regulacion 4 2 Complejos auxiliares 4 2 1 Succinato Q oxidorreductasa complejo II 4 2 2 Flavoproteina de transporte de electrones Q oxidorreductasa 4 2 3 Reductasas y oxidasas alternativas 4 3 Q citocromo c oxidorreductasa complejo III 4 4 Citocromo c oxidasa complejo IV 4 5 Organizacion de complejos 5 Cadena de transporte de electrones en procariotas 6 ATP sintasa complejo V 7 Inhibidores 8 Vease tambien 9 Referencias 10 Lecturas complementarias 11 Enlaces externosHistoria Editar El bioquimico Arthur Harden El estudio de la fosforilacion oxidativa se inicio en 1906 con el informe de Arthur Harden sobre el papel vital del fosfato en la fermentacion celular aunque inicialmente se pensaba que solo los azucar fosfato estaban involucrados 2 Sin embargo a principios de los anos 1940 la relacion entre la oxidacion de los azucares y la generacion de ATP fue establecida de forma definitiva por Herman Kalckar 3 confirmando el papel central del ATP en la transferencia de energia que habia sido propuesto por Fritz Albert Lipmann en 1941 4 Mas tarde en 1949 Friedkin y Morris Albert L Lehninger demostraron que la coenzima NADH se encuentra relacionada con vias metabolicas tales como el ciclo del acido citrico y la sintesis de ATP 5 Durante otros veinte anos el mecanismo por el cual se generaba el ATP siguio siendo un misterio con cientificos buscando un elusivo intermediario de alta energia que enlazara las reacciones de oxidacion y fosforilacion 6 El misterio fue resuelto por Peter D Mitchell con la publicacion de la teoria quimiosmotica en 1961 7 En un principio la propuesta fue muy controvertida pero fue aceptada lentamente y finalmente Mitchell recibio el Premio Nobel de Quimica en 1978 por su teoria 8 9 La investigacion posterior se centro en la purificacion y caracterizacion de las enzimas involucradas con importantes contribuciones realizadas por David E Green sobre los complejos de la cadena de transporte de electrones asi como de Efraim Racker sobre la ATP sintasa 10 Un paso fundamental hacia la solucion de los mecanismos de la ATP sintasa fue proporcionada por Paul D Boyer con su desarrollo en 1973 del mecanismo de cambio de union seguido por su radical propuesta de un sistema de catalisis rotacional en 1982 11 12 Los trabajos mas recientes incluyen estudios estructurales de las enzimas involucradas en la fosforilacion oxidativa llevados a cabo por John E Walker habiendo obtenido Walker y Boyer el Premio Nobel en 1997 13 Transferencia de energia por quimiosmosis Editar Modelo molecular del NAD Articulo principal Quimiosmosis La fosforilacion oxidativa funciona con dos tipos de reacciones que estan acopladas una utiliza reacciones quimicas que liberan energia mientras que la otra utiliza esa energia para llevar a cabo sus reacciones 14 El flujo de electrones a traves de la cadena de transporte de electrones desde donantes de electrones como NADH a aceptores de electrones tales como oxigeno es un proceso exergonico libera energia mientras que la sintesis de ATP es un proceso endergonico el cual requiere de energia Tanto la cadena de transporte de electrones como la ATP sintasa estan embebidos en la membrana y la energia es transferida de la cadena de transporte de electrones a la ATP sintasa por el movimiento de protones a traves de la membrana en un proceso llamado quimiosmosis 15 En la practica se comporta de manera similar a un simple circuito electrico con una corriente de protones siendo transportados desde el lado negativo lado N de la membrana hacia el lado positivo lado P por las enzimas de la cadena de transporte de electrones que bombean protones Estas enzimas son como una bateria ya que realizan trabajo para llevar corriente a traves del circuito El movimiento de protones crea un gradiente electroquimico a traves de la membrana el cual es llamado generalmente fuerza proton motriz Este gradiente tiene dos componentes una diferencia en la concentracion de protones un gradiente de pH y una diferencia en el potencial electrico con un lado N que posee carga negativa La energia es almacenada mayormente como la diferencia de potenciales electricos en la mitocondria pero tambien como un gradiente de pH en los cloroplastos 16 La ATP sintasa libera esta energia almacenada completando el circuito y permitiendo a los protones fluir a traves del gradiente electroquimico de nuevo hacia el lado N de la membrana 17 Esta enzima se comporta de manera similar a un motor electrico ya que utiliza la fuerza proton motriz para llevar a cabo la rotacion de parte de su estructura y acoplar este movimiento con la sintesis de ATP La cantidad de energia liberada por la fosforilacion oxidativa es elevada comparada con la cantidad producida por la fermentacion anaerobica La glucolisis produce solo dos moleculas de ATP en cambio entre 30 y 36 ATP son producidos por la fosforilacion oxidativa de los 10 NADH y 2 succinato obtenidos a traves de la conversion de una molecula de glucosa en dioxido de carbono y agua 18 Este resultado de ATP es el maximo teorico ya que en la practica algunos protones se filtran a traves de la membrana disminuyendo asi la produccion de ATP 19 Moleculas de transferencia de protones y electrones Editar Reduccion de la coenzima Q desde su forma ubiquinona Q a la forma reducida de ubiquinol QH2 Vease tambien Cofactor La cadena de transporte de electrones transporta tanto protones como electrones transfiriendo electrones desde donantes hacia aceptores y transportando protones a traves de la membrana Estos procesos utilizan moleculas de transferencia tanto solubles como unidas a proteinas En la mitocondria los electrones son transferidos dentro del espacio intermembranal por la proteina de transferencia de electrones solubles en agua citocromo c 20 Esto transporta solamente electrones y estos son transferidos por la reduccion y oxidacion de un atomo de hierro que se encuentre en el grupo hemo de la proteina El citocromo c se encuentra tambien en algunas bacterias donde se ubica en el espacio periplasmatico 21 Dentro de la membrana interna mitocondrial el transportador de electrones liposoluble la coenzima Q10 Q transporta tanto electrones como protones a traves de un ciclo redox 22 Esta pequena molecula de benzoquinona es muy hidrofobica de modo que difunde libremente en la membrana Cuando Q acepta dos electrones o libera dos protones es reducida a su forma ubiquinol QH2 cuando QH2 libera dos electrones o acepta dos protones es oxidada a su forma original de ubiquinona Q Como resultado si dos enzimas estan organizadas de modo que Q es reducida de un lado de la membrana y QH2 oxidada en el otro la ubiquinona se acoplara a estas reacciones y actuara como lanzadera de protones a traves de la membrana 23 Algunas cadenas de transporte de electrones bacterianas utilizan quinonas diferentes como la menaquinona aparte de la ubiquinona 24 Dentro de las proteinas los electrones son transferidos entre cofactores de flavina 17 25 centros hierro azufre y citocromos Existen varios tipos de centros hierro azufre los mas simples que se encuentran en la cadena de transferencia de electrones consisten en dos atomos de hierro unidos por dos atomos azufre inorganico estos son centros 2Fe 2S El segundo tipo los centros 4Fe 4S contienen un cubo de cuatro atomos de hierro y cuatro de azufre Cada atomo de hierro en estos centros es coordinado por un aminoacido generalmente por el atomo de azufre de la cisteina Los iones metalicos cofactores atraviesan por reacciones redox sin unir o liberar protones de modo que en la cadena de transporte de electrones sirven solamente para el transporte de electrones entre proteinas Los electrones se desplazan largas distancias a traves de las proteinas saltando entre las cadenas que forman estos cofactores 26 Esto ocurre por efecto tunel el cual es rapido sobre distancias menores a 1 4 9 m 27 Cadena de transporte de electrones en eucariotas EditarArticulo principal Cadena de transporte de electrones Muchos procesos bioquimicos catabolicos tales como la glucolisis el ciclo de Krebs y la beta oxidacion producen la coenzima reducida NADH Esta coenzima contiene electrones que tiene un elevado potencial de transferencia es decir que liberan una gran cantidad de energia tras su oxidacion Sin embargo la celula no libera toda esta energia a la vez si no seria una reaccion incontrolable En vez de ello los electrones son eliminados del NADH y transferidos al oxigeno a traves de una serie de enzimas cada una de las cuales libera una pequena cantidad de energia Este conjunto de enzimas que consiste en complejos del I al IV llamado cadena de transporte de electrones se encuentra en la membrana de la mitocondria El succinato tambien es oxidado por la cadena de transporte de electrones pero entra en la via metabolica por un punto diferente En eucariotas las enzimas en este sistema de transporte de electrones utilizan la energia liberada de la oxidacion de NADH para bombear protones a traves de la membrana interna mitocondrial Esto provoca una acumulacion de protones en el espacio intermembrana y genera un gradiente electroquimico a traves de la membrana La energia almacenada en este potencial es luego utilizada por la ATP sintasa para producir ATP La fosforilacion oxidativa en las mitocondrias de organismos eucariotas es el ejemplo de este proceso mejor comprendido Las mitocondrias estan presentes en casi todos los eucariotas con la excepcion de los protozoarios anaerobicos tales como Trichomonas vaginalis que en su lugar reducen protones a hidrogeno en una reminiscencia de mitocondria llamada hidrogenosoma 28 Se ha comprobado que las enzimas de la cadena respiratoria se situan preferentemente en la membrana de las crestas mitocondriales La membrana crestal esta enriquecida en los componentes de estos complejos aproximadamente en un 70 del total Se ha sugerido que esta distribucion asimetrica podria deberse a que las juntas crestales suponen una barrera dinamica 29 Enzimas respiratorias y sustratos tipicos de eucariotas Enzima respiratoria Par redox Potencial medio Volts NADH deshidrogenasa NAD NADH 0 32 30 Succinato deshidrogenasa FMN o FAD FMNH2 o FADH2 0 20 30 Complejo del citocromo bc1 Coenzima Q10ox Coenzima Q10red 0 06 30 Complejo del citocromo bc1 Citocromo box Citocromo bred 0 12 30 Complejo IV Citocromo cox Citocromo cred 0 22 30 Complejo IV Citocromo aox Citocromo ared 0 29 30 Complejo IV O2 HO 0 82 30 Condiciones pH 7 30 NADH ubiquinona oxidorreductasa complejo I Editar Articulo principal NADH deshidrogenasa Vease tambien Anexo Subunidades de la NADH deshidrogenasa Estructura molecular del complejo I por cristalografia de rayos X de Thermus thermophilus MMDB ID 82358 La NADH ubiquinona oxidorreductasa tambien conocida como NADH deshidrogenasa o complejo I es el primer complejo proteico en la cadena de transporte de electrones Es uno de ensamblajes enzimaticos de membrana de mayor tamano y el mayor de la cadena respiratoria En terminos generales la reaccion que cataliza es la oxidacion de NADH y la transferencia de dos electrones a una quinona normalmente una ubiquinona de entre 8 y 10 isoprenilos aunque admite varios sustratos analogos Posteriormente utiliza la energia liberada en esta reaccion para la translocacion de cuatro protones desde la matriz al espacio de intermembrana La existencia de complejos I translocadores de Na aunque ha sido postulado en procariotas a dia de hoy no se sustenta en la evidencia 31 En bacterias marinas y patogenas como Vibrio cholerae existe una enzima diferente y sin aparente homologia la NADH Ubiquinona oxidoreductasa dependiente de sodio que bombea un ion Na por electron en lugar protones 32 La ecuacion global de esta reaccion es NADH Q 5H m a t r i z NAD QH 2 4H c i t o s o l displaystyle mbox NADH Q 5H matriz rightarrow mbox NAD mbox QH 2 mbox 4H citosol 33 Esta reaccion tiene dos componentes termodinamicamente distintos Uno muy favorable la transferencia de dos electrones desde NADH hasta la quinona Los siguientes parametros para las correspondientes semirreacciones pueden variar por las condiciones de solucion de membrana y de la posicion de la cabeza de la quinona dentro de ella NAD 2 H 2 e NADH H E p H 7 0 33 V displaystyle mbox NAD 2 mbox H 2 mbox e leftrightarrow mbox NADH mbox H mathit E pH7 0 33 mbox V Q 2 H 2 e Q H 2 E p H 7 0 07 V displaystyle Q 2H 2e leftrightarrow QH 2 mathit E pH7 0 07 mbox V Lo cual nos da un D E p h 7 0 4 V displaystyle Delta mbox E ph7 0 4V Mecanismo catalitico de la reaccion red ox Editar Ruta de los electrones entre los centros hierro sulfuro de la NADH deshidrogenasa La reaccion global de oxidacion de la quinona por NADH tiene lugar a una velocidad elevadisima Kcat 500 s 1 La cinetica y el mecanismo catalitico concreto se infieren de varios estudios de tipo estructural a partir de la cristalografia de rayos X del complejo I de T termophilus y de estudios de EPR a muy bajas temperaturas conocida como freeze quenching 34 La longitud que recorren los electrones desde el centro de union a flavina hasta el ultimo centro el N2 es de unos 90 A El primer paso consiste en la transferencia de dos electrones desde el NADH a la Flavina mononucleotido en la subunidad NDFUV1 Aunque no esta probado parece ser que lo mas probable es que esto suceda mediante transferencia del hidruro o sea dos electrones y un proton evitando de esa manera la formacion del intermediario NAD que es inestable Los estudios estructurales en T thermophilus avalan esta posibilidad Para ello el NADH apilaria su anillo nicotinamida sobre el anillo isoaloxazina de la flavina siendo el carbono C4 el donante de electrones en el NADH y el aceptor seria el Carbono C5 de la flavina separados ambos una distancia de unos 3 5 A En B Taurus a PH 7 8 los potenciales de NAD 0 35 V y de la flavina 0 38 V son muy proximos de modo que este paso es reversible Su velocidad es muy elevada El proceso de union de NADH transferencia del hidrido y liberacion de NAD tiene una KcatNADH KmNADH gt 1 x 107 M 1 s 1 35 Es decir que tiene lugar en un tiempo menor de 90 ms lo cual esta por debajo de la capacidad de medicion de los instrumentos actuales mas precisos 34 El segundo paso es muy importante porque los dos electrones no son transferidos simultaneamente a la quinona Uno de ellos pasa a gran velocidad 90ms por toda la cadena de centros Fe S hacia el ultimo de ellos el N2 proximo a la quinona mientras que el otro es transferido a un centro proximo a la flavina 12 A el N1a y a la misma velocidad por lo que se supone que ambos centros tienen el maximo potencial reductor de toda la enzima Una vez oxidados ambos centros la enzima parece pararse 1ms lo cual parece indicar que ese es el periodo en el que la enzima aun permanece ligada al NAD para evitar la entrada de un nuevo NADH Dado que el centro mas cercano es el N3 y esta en la via de N2 es muy probable que el primero de los electrones parta hacia este centro dejando durante un breve instante a la flavina como un intermediario flavosemiquinona A partir de ahi el electron que entra en N3 parte hacia los centros N1b N4 y N5 Todos ellos tienen un potencial redox muy similar de modo que el electron estaria equilibrado moviendose entre ellos La velocidad a la que tiene lugar la transmision desde el paso limitante es decir el mas lento que o bien es la oxidacion del NADH o la reduccion de FMN hasta la quinona avala la idea de que esto se produce por efecto tunel unido a que todos los centros salvo el N7 se encuentran por debajo de la distancia limitante de 14 A 36 Lo cierto es que durante el tiempo que la enzima aparentemente permanece unida al NAD lt no se detectan apenas senales del intermediario ubisemiquinona lo cual significa que no es transferido a la semiquinona y tampoco se detecta una caida significativa de energia libre Se han propuesto varias explicaciones El segundo electron seria retenido en el centro N1a para evitar que se forme el intermediario flavosemiquinona que podria generar radicales superoxido puesto que este centro es facilmente accesible al oxigeno Entre tanto el segundo electron generaria un cambio conformacional suficiente para que pueda pasar el segundo y de esa manera ser transferidos casi simultaneamente a la quinona En este momento se detecta el descenso en la energia libre 36 El lugar donde se une la quinona entre las subunidades hidrofobica e hidrofilica parece tener la suficiente holgura para aceptar una gran variedad de bloqueantes 37 Este sistema tambien puede producir radicales superoxido pero la cantidad y los lugares donde se producen asi como los mecanismos y proporciones concretas son objeto de mucha controversia y problemas de interpretacion aunque deben ser elevados se discuten las cifras de 1 4 del oxigeno respirado para todo el sistema OXPHOS 38 Estructura funcional Editar Hasta el momento no se tenian datos completos de cristalografia de rayos X del complejo con resolucion suficiente pero recientemente se ha podido lograr un modelo para la bacteria Thermus thermofilus de entre 3 3 4 A con lo que se estan esclareciendo algunos detalles del mecanismo catalitico que eran desconocidos 37 En mitocondrias bovinas es un heteromultimero que consta de 45 subunidades con una masa molecular de 969 kilodaltons kDa 39 40 41 En procariotas su tamano es menor y tipicamente esta formada por 14 subunidades y 10 cofactores con un tamano aproximado de 550 KDa 42 Todas ellas cuentan homologos en la forma mitocondrial y se cree que forman la llamada enzima minima o nuclear ya que se considera que son suficientes para la transduccion energetica 43 En plantas y algas el numero de subunidades totales es 30 y en hongos 37 44 Recientemente un analisis ha encontrado homologos de tres de estas proteinas supernumerarias en el complejo I de a proteobacterias consideradas las antepasadas de las mitocondrias 45 El resto de subunidades del complejo I mitocondrial llamadas accesorias o supernumerarias varia en su numero segun las especies tienen funciones enzimaticas aparentemente no relacionadas con la transduccion energetica y su funcion no se comprende completamente 46 Las siete subunidades nucleares del dominio intrinseco o de membrana son codificadas por el genoma mitocondrial mientras que el resto lo son por el genoma nuclear El ensamblaje de la enzima es muy complejo y no conocido en su totalidad produciendose patologias si surgen defectos 47 El complejo que tiene forma de L consta de dos partes una hidrofilica o extrinseca que mira a la matriz o lado P de la membrana y otra embebida en la propia membrana llamada porcion hidrofobica o intrinseca Las siete proteinas nucleares codificadas por el genoma mitocondrial se encuentran todas en esta porcion La enzima bovina cuando se purifica en presencia de agentes caotropicos suaves puede disociarse en cuatro subcomplejos segun las condiciones de tratamiento Ia que comprende toda la porcion extrinseca Il y parte de la intrinseca Ig y la parte Ib que comprende casi toda la parte intrinseca Funcionalmente consta de tres modulos el modulo N que une NADH y captura sus electrones transmitiendolos al FMN y contiene los dos grupos prosteticos 2Fe 2S el modulo Q que contiene el resto de centros hierro sulfuro y transfiere esos electrones a la quinona y por ultimo el modulo P encargado del bombeo de protones 47 Regulacion Editar La regulacion de la actividad del complejo I se produce principalmente por tres mecanismos Control de la expresion genica integracion en supercomplejos respirasomas e interacciones con otras proteinas en especial modificaciones postaduccionales 39 Complejos auxiliares Editar Los complejos auxiliares de la cadena respiratoria son un grupo de complejos multiproteicos que realizan la transferencia de electrones sin bombear protones al espacio de intermembrana En la mayoria de los casos ello es debido a que el potencial de reduccion de sus sustratos esta muy proximo al de las quinonas y es insuficiente para la translocacion de protones Tambien se consideran dentro de este grupo las llamadas oxidasas alternativas que transfieren electrones al oxigeno sin pasar por el complejo III y la citocromo oxidasa complejo IV 48 Succinato Q oxidorreductasa complejo II Editar Complejo II Succinato Q oxidorreductasa La enzima succinato Q oxidorreductasa tambien conocida como complejo II o sucinato deshidrogenasa es el segundo punto de entrada en la cadena de transporte de electrones 49 Es inusual debido a que esta enzima es la unica que forma parte de los procesos del ciclo de Krebs y de la cadena de transporte de electrones El complejo II consiste en cuatro subunidades de proteinas y contiene unida como cofactor la flavin adenin dinucleotido FAD centros hierro azufre y un grupo hemo que no participa en la transferencia de electrones hacia la coenzima Q pero que se cree es importante en disminuir la produccion de especies reactivas del oxigeno 50 51 Oxida el succinato a fumarato y reduce la ubiquinona Debido a que esta reaccion libera menos energia que la oxidacion de NADH el complejo II no transporta electrones a traves de la membrana y no contribuye al gradiente de protones Succinato Q Fumarato QH 2 displaystyle mbox Succinato mbox Q rightarrow mbox Fumarato mbox QH 2 En algunos eucariotas tales como el helminto Ascaris suum una enzima similar al complejo II fumarato reductasa menaquinol fumarato oxidorreductasa o QFR opera de forma reversa oxidando ubiquinol y reduciendo fumarato Esto permite al helminto sobrevivir en el ambiente anaerobico del intestino grueso llevando a cabo una fosforilacion oxidativa anaerobica con fumarato como aceptor de electrones 52 Otra funcion no convencional del complejo II es observada en el parasito que provoca la malaria Plasmodium falciparum En este caso la accion invertida del complejo II como oxidasa es importante para regenerar el ubiquinol el cual el parasito utiliza como una forma inusual de biosintesis de pirimidina 53 Flavoproteina de transporte de electrones Q oxidorreductasa Editar La flavoproteina de transporte de electrones ubiquinona oxidorreductasa oxidorreductasa ETF Q tambien conocida como flavoproteina de transporte de electrones deshidrogenasa es el tercer punto de entrada a la cadena de transporte de electrones Es una enzima que acepta electrones de la flavoproteina de transferencia de electrones en la matriz mitocondrial y utiliza estos electrones para reducir ubiquinona 54 Esta enzima contiene una flavina y un centro 4Fe 4S pero a diferencia de otros complejos respiratorios se une a la superficie de la membrana y no atraviesa la bicapa lipidica 55 ETF r e d Q ETF o x QH 2 displaystyle mbox ETF red mbox Q rightarrow mbox ETF ox mbox QH 2 En mamiferos esta ruta metabolica es importante en la beta oxidacion de acidos grasos y el catabolismo de aminoacidos y colinas al aceptar electrones de multiples acetil CoA deshidrogenasas 56 57 En plantas la oxidorreductasa ETF Q tambien es importante en la respuesta que permite la supervivencia por extensos periodos de oscuridad 58 Reductasas y oxidasas alternativas Editar Muchos organismos eucariotas poseen cadenas de transporte de electrones diferentes a la de los mamiferos que difieren mucho de las mas estudiadas de estos ultimos descritas anteriormente Por ejemplo en plantas existen NADH oxidasas que oxidan el NADH en el citosol en lugar de la matriz mitocondrial y transfieren estos electrones a las reservas de ubiquinona 59 Estas enzimas no transportan protones y por ello reducen ubiquinona sin alterar el gradiente electroquimico a traves de la membrana interna 60 Otro ejemplo de cadena de transporte de electrones divergente es la oxidasa alternativa que es encontrada en plantas asi como algunos hongos protistas y posiblemente algunos animales 61 62 Esta enzima transfiere electrones directamente del ubiquinol al oxigeno 63 Las rutas de transporte de electrones producidos por estas oxidasas alternativas de NADH y ubiquinona tienen un menor rendimiento de ATP que la ruta completa Las ventajas que se obtienen por estas rutas mas cortas no son del todo conocidas Sin embargo las oxidasas alternativas son producidas como respuesta a situaciones de estres ambiental como el frio especies reactivas del oxigeno e infeccion por patogenos asi como otros factores que inhiben la cadena de transporte de electrones completa 64 65 Las rutas alternativas podrian por lo tanto aumentar la resistencia de los organismos ante danos reduciendo el estres oxidativo 66 Q citocromo c oxidorreductasa complejo III Editar Transferencia de electrones en dos pasos en el complejo III Q citocromo c oxidorreductasa Luego de cada paso Q en la parte superior de la figura abandona la enzima La Q citocromo c oxidorreductasa tambien conocida como citocromo c reductasa complejo del citocromo bc1 o simplemente complejo III 67 68 En mamiferos esta enzima es un dimero con cada subunidad del complejo conteniendo once subunidades de proteinas un centro hierro azufre 2Fe 2S y tres citocromos un citocromo c1 y dos citocromos b 69 Un citocromo es un tipo de proteina de transferencia de electrones que contiene al menos un grupo hemo Los atomos de hierro dentro del grupo hemo del complejo III alternan entre sus estados de oxidacion reducido 2 y oxidado 3 mientras los electrones son transferidos a traves de la proteina La reaccion catalizada por el complejo III es la oxidacion de una molecula de ubiquinol y la reduccion de dos moleculas de citocromo c una proteina hemo libremente asociada con la mitocondria A diferencia de la coenzima Q que transporta dos electrones el citocromo c transporta solo uno QH 2 2Cit c o x 2H m a t r i z Q 2Cit c r e d 4H c i t o s o l displaystyle mbox QH 2 mbox 2Cit c ox mbox 2H matriz rightarrow mbox Q mbox 2Cit c red mbox 4H citosol Debido a que solo uno de los electrones puede ser transferido desde el donante QH2 al aceptor citocromo c a la vez el mecanismo de reaccion del complejo III es mas elaborado que aquellos de los otros complejos respiratorios y se da en dos pasos llamados ciclo Q 70 En el primer paso la enzima se une a tres sustratos primero QH2 el cual es luego oxidado siendo un electron transferido al segundo sustrato el citocromo c Los dos protones liberados de QH2 pasan al espacio intermembrana El tercer sustrato es Q el cual acepta el segundo electron de QH2 y es reducido a Q el cual es un radical libre de ubisemiquinona Los primeros dos sustratos son liberados pero este intermediario de ubisemiquinona permanece unido En el segundo paso una segunda molecula de QH2 es unida y de nuevo pasa su primer electron al aceptor citocromo c El segundo electron es transferido a la ubisemiquinona unida reduciendola a QH2 mientras gana dos protones de la matriz mitocondrial Este QH2 es luego liberado de la enzima 71 Como la coenzima Q es reducida a ubiquinol en el lado interno de la membrana y oxidado a ubiquinona en el externo hay una transferencia neta de electrones a traves de la membrana anadidos al gradiente de protones 17 El mecanismo mas bien complejo de dos pasos por el cual sucede esto es importante ya que incrementa la eficiencia de la transferencia de protones Si en lugar del ciclo Q una molecula de QH2 fuese utilizada directamente para reducir dos moleculas del citocromo c la eficiencia se reduciria a la mitad siendo transferido solo un proton por citocromo c reducido 17 Citocromo c oxidasa complejo IV Editar Articulo principal Citocromo c oxidasa Complejo IV citocromo c oxidasa La citocromo c oxidasa tambien conocida como complejo IV es el complejo final de proteinas en la cadena de transporte de electrones 72 En mamiferos esta enzima posee una estructura extremadamente compleja y contiene trece subunidades dos grupos hemo asi como multiples iones metalicos como cofactores en todas tres atomos de cobre uno de magnesio y uno de zinc 73 Esta enzima media la reaccion final en la cadena de transporte de electrones y los transfiere al oxigeno mientras bombea protones a traves de la membrana 74 El aceptor de electrones final es el oxigeno llamado tambien aceptor terminal de electrones el cual es reducido a agua en este paso Tanto el bombeo directo de protones y la consumicion de protones de la matriz en la reduccion de oxigeno contribuyen al gradiente de protones La reaccion catalizada es la oxidacion de citocromo c y la reduccion de oxigeno 4Cit c r e d O 2 8H m a t r i z 4Cit c o x 2H 2 O 4H c i t o s o l displaystyle mbox 4Cit c red mbox O 2 mbox 8H matriz rightarrow mbox 4Cit c ox mbox 2H 2 mbox O mbox 4H citosol Organizacion de complejos Editar El modelo original sobre como los complejos de la cadena respiratoria estan organizados era que estos difundian libremente en la membrana mitocondrial 75 Sin embargo datos recientes sugieren que los complejos podrian formar estructuras de alto orden llamadas supercomplejos o respirasomas 76 En este modelo varios complejos existen como conjuntos organizados de enzimas que interaccionan entre ellas 77 Estas asociaciones podrian permitir la canalizacion de sustratos entre varios complejos de enzimas aumentando su tasa y eficiencia en la transferencia de electrones 78 Dentro de los supercomplejos presentes en mamiferos algunos componentes estan presentes en mayor cantidad que otros con una tasa entre complejos I II III IV y ATP sintasa de aproximadamente 1 1 3 7 4 79 Sin embargo el debate sobre la hipotesis de estos supercomplejos aun no esta resuelta ya que algunos datos no parecen ajustarse a este modelo 41 80 Cadena de transporte de electrones en procariotas EditarVease tambien Metabolismo microbiano En contraste con la similitud general en cuanto a estructura y funcion de la cadena de transporte de electrones en eucariotas las bacterias y arqueas poseen una gran variedad de enzimas de transferencia de electrones Estas utilizan un conjunto igualmente amplio de sustratos 81 Al igual que en los eucariotas la cadena de transporte de electrones de los procariotas utiliza la energia liberada de la oxidacion de un sustrato para bombear iones a traves de la membrana y generar un gradiente electroquimico En bacterias la fosforilacion oxidativa en Escherichia coli ha sido estudiada en profundidad mientras que los sistemas de arqueas han sido poco estudiados 82 La principal diferencia entre la fosforilacion oxidativa en procariotas y eucariotas es que tanto bacterias como arqueas utilizan una gran variedad de donantes y aceptores de electrones Esto permite a los procariotas desarrollarse en una amplia variedad de condiciones ambientales 83 En E coli por ejemplo la fosforilacion oxidativa puede ser llevada a cabo por un gran numero de pares de agentes reductores y oxidantes los cuales son listados a continuacion El potencial medio de un quimico mide cuanta energia es liberada cuanto este es oxidado o reducido teniendo los agentes reductores un potencial negativo y los agentes oxidante un potencial positivo Enzimas respiratorias y sustratos en E coli 84 Enzima respiratoria Par redox Potencial medio Volts Formiato deshidrogenasa Bicarbonato Formiato 0 43 Hidrogenasa Proton Hidrogeno 0 42 NADH deshidrogenasa NAD NADH 0 32 Glicerol 3 fosfato deshidrogenasa DHAP Gli 3 P 0 19 Piruvato oxidasa Acetato Dioxido de carbono Piruvato Lactato deshidrogenasa Piruvato Lactato 0 19 D aminoacido deshidrogenasa 2 oxoacido Amoniaco D aminoacido Glucosa deshidrogenasa Gluconato Glucosa 0 14 Succinato deshidrogenasa Fumarato Succinato 0 03 Ubiquinol oxidasa Oxigeno Agua 0 82 Nitrato reductasa Nitrato Nitrito 0 42 Nitrito reductasa Nitrito Amoniaco 0 36 Dimetil sulfoxido reductasa DMSO DMS 0 16 Trimetilamina N oxido reductasa TMAO TMA 0 13 Fumarato reductasa Fumarato Succinato 0 03Como se muestra en la tabla anterior E coli es capaz de crecer con agentes reductores como el formiato hidrogeno o lactato como donantes de electrones y nitrato DMSO u oxigeno como aceptores 83 La mayor diferencia en el potencial entre un agente oxidante y uno reductor indica una mayor liberacion de energia cuando reaccionan Dentro de estos compuestos el par succinato fumarato es inusual ya que su potencial es muy cercano a cero El succinato puede ser oxidado a fumarato si se encuentra en presencia de un fuerte agente oxidante como el oxigeno y el fumarato puede ser reducido utilizando un fuerte agente reductor como lo es el formiato Estas reacciones alternativas son catalizadas por la succinato deshidrogenasa y la fumarato reductasa respectivamente 85 Algunos procariotas utilizan pares redox que poseen una muy pequena diferencia de potencial Por ejemplo las bacterias nitrificantes tales como Nitrobacter oxidan nitrito a nitrato donando electrones al oxigeno La pequena cantidad de energia liberada en esta reaccion es suficiente como para bombear protones y generar ATP pero no es suficiente como para producir NADH o NADPH directamente para su uso en el anabolismo 86 Este problema es solucionado utilizando una nitrito oxidorreductasa para producir la suficiente fuerza proton motriz como para hacer funcionar la cadena de transporte de electrones en sentido inverso haciendo que el complejo I genere NADH 87 88 Los procariotas controlan su uso de donantes y aceptores de electrones variando las enzimas que producen en respuesta a condiciones ambientales 89 Esta flexibilidad es posible porque diferentes oxidasas y reductasas utilizan las mismas reservas de ubiquinona Esto permite que muchas combinaciones de enzimas funcionen en conjunto unidas por un intermediario comun de ubiquinol 84 Por ello es que estas cadenas respiratorias tienen un diseno modular facilmente intercambiable con otros conjuntos de enzimas Ademas de esta diversidad metabolica los procariotas tambien poseen una variedad de isoenzimas diferentes enzimas que catalizan la misma reaccion Por ejemplo en E coli hay dos tipos diferentes de ubiquinol oxidasa utilizando oxigeno como un aceptor de electrones Bajo condiciones aerobicas la celula utiliza una oxidasa con baja afinidad por el oxigeno que es capaz de transportar dos protones por electron Sin embargo si los niveles de oxigeno caen cambian a una oxidasa que transfiere solo un proton por electron pero tiene una elevada afinidad por el oxigeno 90 ATP sintasa complejo V EditarArticulo principal ATP sintasa ATP sintasa tambien llamada complejo V es la enzima final del proceso de la fosforilacion oxidativa Esta enzima se encuentra en todas las formas de vida y funciona de la misma manera tanto en procariotas como en eucariotas 91 Esta enzima usa la energia almacenada en un gradiente de protones a traves de la membrana para llevar a cabo la sintesis de ATP desde ADP y fosfato Pi Las estimaciones del numero de protones necesarios para sintetizar una molecula de ATP oscilan entre tres y cuatro 92 93 y algunos investigadores sugieren que las celulas pueden variar esta proporcion para ajustarse a diferentes condiciones 94 ADP P i 4H c i t o s o l ATP H 2 O 4H m a t r i z displaystyle mbox ADP mbox P i mbox 4H citosol rightleftharpoons mbox ATP mbox H 2 mbox O mbox 4H matriz Esta reaccion de fosforilacion es un equilibrio que puede ser cambiado alterando la fuerza proton motriz En ausencia de una fuerza proton motriz la reaccion de la ATP sintasa se desplazara hacia la izquierda hidrolizando ATP y bombeando protones fuera de la matriz a traves de la membrana Sin embargo cuando la fuerza proton motriz es alta la reaccion es forzada a desplazarse en la direccion opuesta de izquierda a derecha permitiendo el flujo de protones en el sentido de su gradiente de concentracion produciendo ADP desde ATP 91 Es mas en la cercanamente relacionada proteina H ATPasa tipo vacuolar la misma reaccion es usada para acidificar los compartimentos celulares bombeando protones e hidrolizando ATP 95 La ATP sintasa es un complejo masivo de proteinas con forma de hongo El complejo de enzimas en mamiferos contiene 16 subunidades y posee una masa de aproximadamente 600 kilodaltons 96 La porcion embebida en la membrana es llamada FO y contiene un anillo de subunidades c y el canal de protones El pedunculo y la parte superior esferica es llamada F1 y es el sitio donde ocurre la sintesis de ATP La porcion esferica del extremo de F1 contiene seis proteinas de dos tipos diferentes tres subunidades a y tres subunidades b mientras que el pedunculo consiste solo en una proteina la subunidad g con un extremo extendiendose en la esfera de subunidades a y b 97 Ambas subunidades a y b se unen a nucleotidos pero solo la subunidad b cataliza la sintesis de ATP Alcanzando por la base una porcion de F1 e introduciendose en la membrana se encuentra una larga subunidad en forma de baston que ancla las subunidades a y b en la base de la enzima A medida que los protones atraviesan la membrana a traves del canal en la base de la ATP sintasa FO entra en rotacion 98 Esta rotacion puede ser provocada por cambios en la ionizacion de aminoacidos en el anillo de subunidades c provocando interacciones electrostaticas que impulsan el anillo de subunidades c a traves del canal de protones 99 Este anillo de rotacion provoca la rotacion del eje central el pedunculo de la subunidad g dentro de las subunidades a y b Estas subunidades son incapaces de rotar debido al brazo lateral que actua como un estator Este movimiento del extremo de la subunidad g en el interior de la esfera de subunidades a y b provee de energia para los sitios activos en las subunidades b para llevar a cabo un ciclo de movimientos que generan y luego liberan ATP 100 Mecanismo de la ATP sintasa El ATP se muestra en rojo el ADP y fosfato en rosado y la subunidad g rotando en negro La reaccion de sintesis de ATP es llamada mecanismo de cambio de union del ingles binding change mechanism e involucra el sitio activo de una subunidad b en ciclando a traves de tres estados 11 En el estado abierto el ADP y el fosfato entran en el sitio activo mostrado en marron en el diagrama La proteina luego captura las moleculas y se une a ellas ligeramente mostrado en rojo La enzima luego cambia su conformacion nuevamente y acerca las moleculas con el sitio activo en el estado final mostrado en rosado uniendo el recien formada molecula de ATP con una elevada afinidad Finalmente el sitio activo cicla de nuevo a su estado original abierto liberando ATP y uniendose a mas ADP y fosfato preparandose asi para el proximo ciclo En algunas bacterias y arqueas la sintesis de ATP es llevada a cabo por el movimiento de iones sodio a traves de la membrana celular en lugar del movimiento de protones 101 102 Arqueas tales como Methanococcus poseen la sintasa A1Ao una forma de la enzima que contiene proteinas adicionales con muy poca similitud en cuanto a su secuencia con otras subunidades de ATP sintasa de bacterias o eucariotas Es posible que en algunas especies la forma A1Ao de la enzima sea una ATP sintasa especializada en el transporte de sodio 103 pero esto puede que no sea asi en todos los casos 102 Inhibidores EditarExisten varias drogas y toxinas que inhiben la fosforilacion oxidativa Aunque estas toxinas inhiben solo una enzima en la cadena de transporte de electrones la inhibicion de cualquier paso detiene el resto del proceso Por ejemplo cuando la oligomicina inhibe a la enzima ATP sintasa los protones no pueden ser devueltos a la mitocondria 104 Como resultado las bombas de protones son incapaces de operar y el gradiente se torna demasiado fuerte como para ser superado NADH deja de ser oxidado y el ciclo del acido citrico deja de operar porque la concentracion de NAD cae por debajo de la concentracion que estas enzimas pueden utilizar Cianuro El cianuro es un potente veneno que inhibe la cadena de transporte de electrones y la fosforilacion oxidativa bloqueando el paso de electrones del citocromo a3 al oxigeno en el complejo IV Esto bloquea la cadena de transporte de electrones lo que conlleva que no se genere el gradiente de protones y por tanto no se produzca la obtencion de ATP con la consiguiente acumulacion de NADH y FADH2 Ademas el cianuro se une a la hemoglobina impidiendo tambien la captacion de oxigeno Oligomicina La oligomicina un antibiotico producido por Streptomyces inhibe a la ATP pasa al unirse a la subunidad Fo e interferir en el transporte de H a traves de Fo inhibe por lo tanto la sintesis de ATP y como consecuencia de no eliminar el gradiente de protones se inhibe tambien a la cadena de transporte de electrones por lo tanto disminuira el consumo de O2 y se acumulara NADH y FADH2 2 4 Dinitrofenol El 2 4 dinitrofenol es un agente desacoplante es decir desacopla la cadena de transporte de electrones de la fosforilacion oxidativa El desacoplamiento se produce ya que el 2 4 dinitrofenol hace permeable a los protones de la membrana interna mitocondrial deshaciendo la relacion obligada entre la cadena respiratoria y la fosforilacion oxidativa El efecto de este veneno por tanto es la inhibicion de la produccion de ATP al no generarse el gradiente de pH pero si permite que la cadena de transporte de electrones continue funcionando Compuesto Uso Efecto en la fosforilacion oxidativaCianuro ymonoxido de carbono Veneno Inhiben la cadena de transporte de electrones ya que se unen mas fuertemente que el oxigeno a los centros Fe Cu en la citocromo c oxidasa y por tanto evitan la reduccion del oxigeno 105 Oligomicina Antibiotico Inhibe la ATP sintasa bloqueando el flujo de protones a traves de la subunidad Fo 104 CCCP2 4 Dinitrofenol Veneno Ionoforos que interrumpen el gradiente de protones transportando estos a traves de la membrana Este ionoforo desacopla el bombeo de electrones de la ATP sintasa debido a que transporta electrones a traves de la membrana mitocondrial interna 106 Rotenona Pesticida Impide la transferencia de electrones del complejo I a la ubiquinona al bloquear los sitios de union a la ubiquinona 107 Malonato y oxaloacetato Inhibidores competitivos de la succinato de hidrogenasa complejo II 108 No todos los inhibidores de la fosforilacion oxidativa son toxinas En el tejido adiposo marron los canales de protones regulados llamados proteinas desacopladoras son capaces de desacoplar la respiracion de la sintesis de ATP 109 Esta respiracion rapida produce calor y es particularmente importante como una via para mantener la temperatura corporal en la hibernacion de los animales aunque estas proteinas pueden tambien tener una funcion mas general en la respuesta de las celulas al estres oxidativo 110 Vease tambien EditarMetabolismo Translocasa de la membrana interna Translocasa de la membrana externa RespirometriaReferencias Editar Chen Jin Qiang Patrick R Cammarata Christopher P Baines James D Yager 2009 Regulation of mitochondrial respiratory chain biogenesis by estrogens estrogen receptors and physiological pathological and pharmacological implications Biochimica et Biophysica Acta BBA Molecular Cell Research 1793 10 1540 1570 ISSN 0167 4889 doi 10 1016 j bbamcr 2009 06 001 La referencia utiliza el parametro obsoleto coautores ayuda Harden A Young W J 1906 The alcoholic 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contiene una traduccion derivada de Oxidative phosphorylation de Wikipedia en ingles publicada por sus editores bajo la Licencia de documentacion libre de GNU y la Licencia Creative Commons Atribucion CompartirIgual 3 0 Unported Datos Q227564 Multimedia Oxidative phosphorylationObtenido de https es wikipedia org w index php title Fosforilacion oxidativa amp oldid 137781326, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

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