Variante Alfa del SARS-CoV-2
La variante Alfa (conocida comúnmente como variante británica, por el país en donde se originó el brote inicial, o de forma científica como linaje B.1.1.7) es una variante mutada del SARS-CoV-2, virus que causa la COVID-19.[1][2] Ha sido reclasificada a Variante de Preocupación (Variant of Concern 202012/01) por Meera Chand et al. en un informe publicado por Public Health England el 21 de diciembre de 2020.[4] En un informe escrito por cuenta del COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium, Andrew Rambaut et al. se refirieron a la variante como linaje B.1.1.7.[5]
| VUI-202012/01 B.1.1.7 | ||
|---|---|---|
| Casos confirmados de VUI-202012/01 en el mundo. (Hasta el 23 de enero de 2021) Leyenda + 1000 Casos confirmados 100-999 Casos confirmados 50-99 Casos confirmados 10-49 Casos confirmados 5-9 Casos confirmados 2-4 Casos confirmados 1 Caso confirmado Tiene casos confirmados, | ||
| Agente patógeno | ||
| Patógeno | SARS-CoV-2 | |
| Tipo de patógeno | Virus | |
| Enfermedad causada | COVID-19 | |
| Datos históricos | ||
| Inicio del contagio | Octubre de 2020 | |
| Lugar de inicio | Reino Unido | |
| Lugares afectados | 103 territorios | |
| Datos del contagio | ||
| Casos confirmados | 263 420 (24 de marzo de 2021) | |
| Aviso médico | ||
En lo que corresponde a la variante, se detectó por primera vez en el Reino Unido en octubre de 2020 a partir de una muestra tomada el mes anterior extendiéndose muy rápidamente a mediados de diciembre. Dicha aparición se ha correlacionado con un aumento significativo en la tasa de infección por COVID-19 en Inglaterra, infiriéndose que se debe, al menos en parte, a la mutación N501Y dentro del dominio de unión al receptor de la proteína espiga, que se une al receptor ECA2 en humanos.
Genética
Las mutaciones en el SARS-CoV-2 son comunes: se han detectado más de 4.000 mutaciones solo en la glucoproteína de pico, según el COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK). El enfoque en las mutaciones es una forma común de rastrear la propagación del virus. Además de mostrar, por ejemplo, que el SARS-CoV-2 llegó al Reino Unido de más de 1.000 incidentes separados, también muestra que una variante con la mutación G614 ha reemplazado por completo al D614 anterior.
La variante VUI - 202012/01 está definida por 17 mutaciones. Una de las mutaciones más importantes parece ser una mutación puntual, N501Y, un cambio de asparagina (N) a tirosina (Y) en el sitio de aminoácidos 501. Esto se debe a su posición dentro el dominio de unión al receptor de la glicoproteína de pico (RBD), más específicamente en el motivo de unión al receptor (RBM), que se une a la ECA2 . Las mutaciones en el RBD pueden cambiar el reconocimiento de anticuerpos y la especificidad de unión a ECA2 y hacen que el virus se vuelva más infeccioso; de hecho, se ha demostrado que N501Y mejora la afinidad de unión de ECA2. Además, 69-70del, una deleción de los aminoácidos en las posiciones 69 y 70 de la glicoproteína de pico, se ha descubierto "en virus que eludían la respuesta inmune en algunos pacientes inmunodeprimidos".
En una teleconferencia el 18 de diciembre, el Grupo Asesor de Amenazas de Virus Respiratorios Nuevos y Emergentes (NERVTAG), que asesora al gobierno del Reino Unido, consideró la posibilidad de un escape antigénico, diciendo: "La ubicación de las mutaciones en el dominio de unión al receptor del La glucoproteína de pico plantea la posibilidad de que esta variante sea antigénicamente distinta de las variantes anteriores. Se han identificado cuatro reinfecciones probables entre 915 sujetos con esta variante, pero se necesita más trabajo para comparar esta tasa de reinfección con conjuntos de datos comparables".
Detección
Los dos primeros genomas que pertenecen al linaje B.1.1.7 se recolectaron el 20 de septiembre de 2020 en Kent y otro el 21 de septiembre de 2020 en el Gran Londres. Estas secuencias se han enviado a la base de datos de secuencias de GISAID (accesiones de secuencia EPI_ISL_601443 y EPI_ISL_581117 respectivamente). Al 15 de diciembre, hay 1623 genomas en el linaje B.1.1.7. De estos, 519 fueron muestreados en el Gran Londres, 555 en Kent, 545 en otras regiones del Reino Unido, incluidas Escocia y Gales, y 4 en otros países.
El rastreo hacia atrás utilizando evidencia genética sugiere que esta nueva variante surgió en septiembre de 2020 y luego circuló en niveles muy bajos en la población hasta mediados de noviembre. El aumento de casos relacionados con la nueva variante salió a la luz por primera vez a fines de noviembre cuando la Agencia Gubernamental de Salud Pública de Inglaterra (en inglés: Public Health England o por su abreviatura, PHE) estaba investigando por qué las tasas de infección en Kent no estaban disminuyendo a pesar de las restricciones nacionales. PHE luego descubrió un grupo vinculado a esta variante que se extendió rápidamente a Londres y Essex.
Diseminación
A mediados de diciembre de 2020 se pesquisa un aumento progresivo de la prevalencia de la nueva variante en Reino Unido. Al día 13 de ese mes, se reportaba un total de 1108 casos [6]
Estadísticas
Número de casos registrados
Datos de GISAID del Rastreador de Variantes [7]
Gráficos
Casos confirmados por países
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- Los datos proporcionados por diversas fuentes, tales como; gubernamentales, prensa u oficiales son actualizados cada semana desde su última publicación.
Características
Contagio
NERVTAG concluyó en una reunión telefónica el 18 de diciembre de 2020 que tenían una confianza moderada en que VUI-202012/01 era sustancialmente más transmisible que otras variantes, pero que no había datos suficientes para llegar a ninguna conclusión sobre el mecanismo subyacente del aumento de la transmisibilidad (por ejemplo, aumento de la carga viral , distribución tisular de la replicación del virus, intervalo de serie, etc.), la distribución por edad de los casos o la gravedad de la enfermedad.
El primer ministro británico Boris Johnson, dijo el 19 de diciembre de 2020 que la nueva variante podría ser hasta un 70% más transmisible que las variantes anteriores, aunque había una "considerable incertidumbre". El gobierno francés cuestionó la opinión de Johnson, diciendo que "no se ha demostrado en esta etapa". Vivek Murthy, ex Cirujano General de los Estados Unidos, actual candidato a Cirujano General y copresidente del Consejo Asesor de COVID-19, estuvo de acuerdo con Johnson en que la variante parecía ser más fácilmente transmisible.
Virulencia
NERVTAG había concluido en una reunión el 18 de diciembre de 2020 que no había datos suficientes para llegar a una conclusión sobre la gravedad de la enfermedad. En la sesión informativa de Johnson al día siguiente, los funcionarios dijeron que "no había evidencia" a esa fecha de que la nueva variante causara una mayor mortalidad o se viera afectada de manera diferente por las vacunas y los tratamientos; Vivek Murthy estuvo de acuerdo con esto.
Susan Hopkins, asesora médica conjunta de NHS Test and Trace and Public Health England (PHE), declaró a mediados de diciembre de 2020: "Actualmente no hay evidencia de que esta cepa cause una enfermedad más grave, aunque se está detectando en una amplia geografía, especialmente donde se detectan más casos".
A partir del 19 de diciembre de 2020, el laboratorio de Public Health England en Porton Down estaba realizando pruebas para encontrar pruebas de si la nueva variante afecta la gravedad de la enfermedad.
La secuenciación genética de esta cepa ha mostrado una mutación de parada Q27 que "trunca la proteína ORF8 o la vuelve inactiva". Un estudio anterior de las variantes del SARS-CoV-2 eliminadas del gen ORF8 señaló que "se han asociado con síntomas más leves y mejores resultados de la enfermedad". El estudio también señaló que, "SARS-CoV-2 ORF8 es una proteína similar a inmunoglobulina (Ig) que modula la patogénesis", "SARS-CoV-2 ORF8 media la degradación del complejo mayor de histocompatibilidad I (MHC-I)", y "SARS-CoV-2 ORF8 suprime la respuesta antiviral mediada por interferón de tipo I (IFN)".
Efectividad de la vacuna
A fines de 2020, se estaban implementando o desarrollando varias vacunas COVID-19. Si bien la nueva variante tiene mutaciones en la glicoproteína de pico a la que se dirigen las tres vacunas principales, el sistema inmunológico produce anticuerpos contra varias regiones de la proteína en respuesta a la vacuna, por lo que se cree que es poco probable que una sola mutación reduzca las vacunas eficaz.
Sin embargo, a medida que ocurren más mutaciones, es posible que sea necesario modificar las vacunas. El SARS-CoV-2 no muta tan rápidamente como los virus de la influenza y las nuevas vacunas que demostraron ser efectivas a fines de 2020 son tipos que pueden ajustarse si es necesario. A finales de 2020, las autoridades sanitarias y los expertos alemanes, británicos y estadounidenses creen que las vacunas existentes serán tan eficaces contra la nueva cepa VUI - 202012/01 como contra las cepas anteriores.
Al 20 de diciembre de 2020, Public Health England confirmó que "no hay evidencia" que sugiera que la nueva cepa sea resistente a la vacuna Pfizer-BioNTech que se usa actualmente en el programa de vacunación COVID-19 en el Reino Unido y que las personas aún deberían estar protegidas.
Propagación
El primer caso probablemente ocurrió a mediados de septiembre de 2020 en Londres o Kent, Reino Unido. Al 13 de diciembre de 2020, se habían identificado 1.108 casos con esta variante en el Reino Unido en casi 60 autoridades locales diferentes. Estos casos fueron predominantemente en el sureste de Inglaterra. La variante también se ha identificado en Gales y Escocia. A mediados de diciembre, se estimó que casi el 60 por ciento de los casos en Londres involucraron VUI - 202012/01. El 20 de diciembre de 2020, la BBC informó que la Organización Mundial de la Salud (OMS) había dicho que se habían notificado nueve casos de la nueva variante en Dinamarca, uno en los Países Bajos y uno en Australia. Más tarde, el mismo día, se informó que se habían encontrado cuatro en Bélgica y uno en Italia. El Reino Unido y Dinamarca están secuenciando sus casos de coronavirus a tasas considerablemente más altas que la mayoría de los demás y se consideró probable que otros países detectaran la variante más tarde; Christian Drosten, un destacado experto alemán en COVID-19, dijo que probablemente ya esté circulando en Alemania, mientras que Céline Gounder, miembro del Consejo Asesor de COVID-19 de Joe Biden y virólogo Jeremy Luban de la Facultad de Medicina de la Universidad de Massachusetts dijo que era razonable pensar que ya está en Estados Unidos (donde la secuenciación tiende a ser esporádica).
Variante N501Y
Una variante con el mismo cambio a nivel de N501Y se detectó en Sudáfrica que podría resultar en una mayor transmisibilidad), pero un linaje diferente de la cepa del Reino Unido. Dicha mutación también se ha detectado en otros lugares: en Australia (junio-julio de 2020), en los Estados Unidos (julio) y en Brasil (abril), aún no está claro si surgió espontáneamente en el Reino Unido o se importó.
Control
Todos los países del Reino Unido se vieron afectados por restricciones de viaje nacionales en reacción a la mayor propagación de COVID-19, atribuida al menos en parte a VUI - 202012/01, con efecto a partir del 20 de diciembre de 2020. Durante diciembre de 2020, un número cada vez mayor de países de todo el mundo anunciaron prohibiciones temporales o estaban considerando prohibir los viajes de pasajeros desde el Reino Unido y, en varios casos, desde otros países como los Países Bajos y Dinamarca. Algunos países prohibieron los vuelos; otros solo permitieron la entrada a sus nacionales, sujetos a una prueba de SARS-CoV-2 negativa. Un portavoz de la OMS dijo que "en toda Europa, donde la transmisión es intensa y generalizada, los países deben redoblar sus enfoques de control y prevención". La mayoría de las prohibiciones de los países de la UE fueron de 48 horas, a la espera de una reunión de respuesta política integrada de los representantes de la UE el 21 de diciembre para evaluar la amenaza de la nueva variante y coordinar una respuesta conjunta. Muchos países de todo el mundo impusieron restricciones a los viajes de pasajeros desde el Reino Unido; la vecina Francia también restringió los vehículos de mercancías tripulados. Algunos también aplicaron restricciones a los viajes desde otros países. Al 21 de diciembre de 2020 el único continente excepto la Antártida sin prohibiciones de viajar desde el Reino Unido fue Australia, confiando en que su cuarentena de 14 días en todas las llegadas fue suficiente.
Véase también
- Variantes de SARS-CoV-2
- Cluster 5, una variante de SARS-CoV-2 encontrada en granjas de visones danesas con otra mutación en el dominio de unión al receptor.
- Variante 501.V2 - Beta, una variante de SARS-CoV-2 encontrada en Sudáfrica con mutaciones que se parecen parcialmente a VOC-202012/01.
- Variante B.1.1.248 - Gamma, una variante de SARS-CoV-2 encontrada en Japón pero de origen Brasileño.
- Variante B.1.617 - Delta, una variante de SARS-CoV-2 encontrada en India doble mutaciones variante.
Notas
- Linaje B.117
- Nuevos casos por país de SARS-CoV-2 en variante alfa en Colombia, Armenia, Burkina Faso, Macao, San Vicente y las Granadinas, San Cristóbal y Nieves, Guinea Ecuatorial, San Marino, República Centroafricana y Azerbaiyán
- VUI/2020/1201
- La variante británica - Variant of Concern 20DEC01 - abreviado por VUI / 20201201
- 118 miembros de la OMS del país B117 al 6 de junio de 2021 - Albania, Angola, Argentina, Armenia, Aruba, Australia, Austria, Azerbaiyán, Baréin, Belice, Bután, Bolivia, Bosnia y Herzegovina, Brasil, Islas Vírgenes Británicas, Brunéi, Bulgaria, Burkina Faso, Cabo Verde, Camboya, Canadá, Camerún, Chipre, República Centroafricana, Colombia, Comoras, Congo, Costa Rica, Croatia, Dinamarca, RD Congo, República Dominicana, Ecuador, Egipto, Estonia, Finlandia, Francia, Gabón, Gambia, Georgia, Alemania, Gibraltar, Ghana, Granada, Grecia, Guyana, Haití, Hong Kong , Hungría, Islandia, India, Indonesia, Irán, Irak, Irlanda, Israel, Italia, Jamaica, Japón, Jordania, Kenia, Kuwait, Kirguistán, Letonia, Líbano, Lesoto, Liberia, Libia, Lituania, Luxemburgo, Malasia, Malta, Mauritania, Mauricio, Montenegro, Marruecos, Nepal, Macedonia del Norte, Países Bajos, Nueva Zelanda, Nigeria, Oman, Pakistán, Perú, Filipinas, Polonia, Portugal, Puerto Rico, República de Corea, Rusia, Rumania, Ruanda, San Cristóbal y Nieves, Santa Lucía, San Vicente y las Granadinas, Arabia Saudita, Senegal, Eslovaquia, Eslovenia, Sur África, España, Sri Lanka, Suecia, Suiza, Tayikistán, Tailandia, Trinidad y Tobago, Togo, Túnez, Turquía, Ucrania, Uruguay, Emiratos Árabes Unidos, Estados Unidos de América, Reino Unido, Ciudad del Vaticano, Venezuela, Vietnam
- 72 miembros no han reportado B117 al 6 de junio de 2021 - Afganistán, Argelia, Andorra, Antigua y Barbuda, Bahamas, Benín, Botsuana, Territorio Británico del Océano Índico, Botsuana, Burundi, Chad, Islas Cook, Costa de Marfil, Cuba, RPD de Corea, Yibuti, Dominica, Eritrea, El Salvador, Etiopía, Fiji, Granada, Guatemala, Guinea, Guinea-Bissau, Honduras, Kazajstán, Kiribati, Madagascar, Laos, Malawi, Maldivas, Micronesia, Islas Marshall, Malí, Mongolia, Mozambique, Namibia, Nauru, Nicaragua, Níger, Martinica, San Pedro y Miquelón, Niue, Islas Marianas del Norte, Palau, Panamá, Paraguay, Papua Nueva Guinea, Qatar, Samoa, San Marino, Santo Tomé y Príncipe, Seychelles, Sierra Leona, Surinam, Islas Salomón, Somalia, Sudán del Sur, Sudán, Suazilandia, Siria, Timor-Leste, Tonga, Turkmenistán, Tuvalu, Vanuatu, Uganda, Tanzania, Yemen, Zambia y Zimbabue .
Referencias
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- Error en la cita: Etiqueta
<ref>no válida; no se ha definido el contenido de las referencias llamadasRambaut et al. - https://www.bmj.com/content/371/bmj.m4857
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