Neokaryotes

Neokaryotes es un clado eucariota propuesto por Cavalier-Smith en 1993 que consiste en los opimodos y los corticados como grupos hermanos. De manera que el grupo incluye a todos los pluricelulares conocidos como los animales, los hongos, las plantas y una serie de protistas relacionados con ellos.

Neokaryotes
(Mariposa un representante de Opimoda y planta un representante de Diaphoretickes).
Taxonomía
Dominio:	Eukaryota
(sin rango)	Neokaryotes Cavalier-Smith, 1993
Clados
Opimoda Diaphoretickes
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Este clado surgió porque los excavados otro grupo de protistaa se ven como los más basales dentro los eucariotas. Otras propuestas en conflicto unen a los excavados con los corticados en un clado llamado Bikonta o Diphoda y con Opimoda en el reino Protozoa. Sin embargo la mayoría de los excavados no parecen formar un grupo monofilético, ya que incluye a grupos más emparentados con los neocariotas y otros con menos relación. Es posible que los excavados sean un grupo parafilético relacionado con el origen de los demás eucariotas.^[1]​^[2]​^[3]​También hay que tener en cuenta que la filogenia eucariota todavía es controversial.

En esta clasificación dentro de Opimoda se incluye al filo Metamonada de Excavata y a Collodictyon-Malawimonas un grupo de eucariotas cuya posición es incierta y que a menudo se suele incluir dentro de Excavata.

Filogenia

Una posible filogenia encontrada por Cavalier-Smith y colaboradores es la siguiente:^[4]​^[5]​^[6]​^[7]​^[8]​^[9]​

Eukaryota	Euglenozoa         Percolozoa         Tsukubea       Jakobea     Neokaryotes Diaphoretickes   Supergrupo SAR         Hacrobia       Plantae   (=Archaeplastida)       Opimoda     Metamonada       Malawimonadea       Podiata   Varisulca     Amorphea   Amoebozoa     Obazoa   Apusozoa     Opisthokonta Holomycota Fungi     Holozoa Animalia

Referencias

1. Cavalier-Smith, Thomas (1 de mayo de 2013). «Early evolution of eukaryote feeding modes, cell structural diversity, and classification of the protozoan phyla Loukozoa, Sulcozoa, and Choanozoa». European Journal of Protistology 49 (2): 115-178. PMID 23085100. doi:10.1016/j.ejop.2012.06.001. 
2. Cavalier-Smith, Thomas (5 de septiembre de 2017). «Kingdom Chromista and its eight phyla: a new synthesis emphasising periplastid protein targeting, cytoskeletal and periplastid evolution, and ancient divergences». Protoplasma (en inglés) 255 (1): 297-357. ISSN 0033-183X. PMC 5756292. PMID 28875267. doi:10.1007/s00709-017-1147-3. 
3. Derelle, Romain; Torruella, Guifré; Klimeš, Vladimír; Brinkmann, Henner; Kim, Eunsoo; Vlček, Čestmír; Lang, B. Franz; Eliáš, Marek (17 de febrero de 2015). «Archean proteins pinpoint a single eukaryotic root». Proceedings of the National Academy of Sciences (en inglés) 112 (7): E693-E699. Bibcode:2015PNAS..112E.693D. ISSN 0027-8424. PMC 4343179. PMID 25646484. doi:10.1073/pnas.1420657112. 
4. Cavalier-Smith, T.; Chao, E. E.; Snell, E. A.; Berney, C.; Fiore-Donno, A. M.; Lewis, R. (2014). «Multigene eukaryote phylogeny reveals the likely protozoan ancestors of opisthokonts (animals, fungi, choanozoans) and Amoebozoa». Molecular Phylogenetics & Evolution 81: 71-85. PMID 25152275. doi:10.1016/j.ympev.2014.08.012. 
5. Cavalier-Smith, Thomas (23 de junio de 2010). «Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree». Biology Letters (en inglés) 6 (3): 342-345. ISSN 1744-9561. PMC 2880060. PMID 20031978. doi:10.1098/rsbl.2009.0948. 
6. He, Ding; Fiz-Palacios, Omar; Fu, Cheng-Jie; Fehling, Johanna; Tsai, Chun-Chieh; Baldauf, Sandra L. (2014). «An Alternative Root for the Eukaryote Tree of Life». Current Biology 24 (4): 465-470. PMID 24508168. doi:10.1016/j.cub.2014.01.036. 
7. Cavelier Smith (2013). «Early evolution of eukaryote feeding modes, cell structural diversity, and classification of the protozoan phyla Loukozoa, Sulcozoa, and Choanozoa». European Journal of Protistology 49 (2): 115-178. PMID 23085100. doi:10.1016/j.ejop.2012.06.001. 
8. Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W. et al. (11 de abril de 2016). «A new view of the tree of life». Nature Microbiology (en inglés) 1 (5): 16048. ISSN 2058-5276. PMID 27572647. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48.  Se sugiere usar |número-autores= (ayuda)
9. Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E.; Lewis, Rhodri (1 de junio de 2016). «187-gene phylogeny of protozoan phylum Amoebozoa reveals a new class (Cutosea) of deep-branching, ultrastructurally unique, enveloped marine Lobosa and clarifies amoeba evolution». Molecular Phylogenetics and Evolution 99: 275-296. PMID 27001604. doi:10.1016/j.ympev.2016.03.023. 

•   Datos: Q48836623