Betacoronavirus
Los betacoronavirus son uno de los cuatro géneros de coronavirus pertenecientes a la subfamilia Orthocoronavirinae dentro de la familia Coronaviridae, del orden Nidovirales. Estos virus están envueltos, y pertenecen a la clase IV de la clasificación de Baltimore (virus ARN monocatenario positivos). Son zoonosis que ocasionalmente infectan a humanos. Los géneros de coronavirus contienen varios linajes virales y Betacoronavirus consiste en cuatro de estos. Un nombre alternativo para el género es coronavirus del grupo 2.
| Betacoronavirus | ||
|---|---|---|
| Clasificación de los virus | ||
| Dominio: | Riboviria | |
| Grupo: | IV (Virus ARN monocatenario positivo) | |
| Reino: | Orthornavirae | |
| Filo: | Pisuviricota | |
| Clase: | Pisoniviricetes | |
| Orden: | Nidovirales | |
| Suborden: | Cornidovirineae | |
| Familia: | Coronaviridae | |
| Subfamilia: | Orthocoronavirinae | |
| Género: | Betacoronavirus | |
| subgéneros y especies | ||
| ||
Los beta-CoV más importantes en la clínica humana son: OC43 y HKU1 para el linaje A, SARS-CoV y SARS-CoV-2 para el linaje B[1] y MERS-CoV para el linaje C. MERS-CoV es el primer betacoronavirus perteneciente al linaje C que se sabe que infecta a los humanos.[2][3]
Los géneros Alphacoronavirus y Betacoronavirus descienden del acervo genético de los murciélagos.[4][5][6]
Virología
Los alfa y betacoronavirus infectan principalmente a los murciélagos, pero también, a otras especies como los humanos, los camellos y los conejos.[4][5][6][7] Los Beta-CoV que han causado epidemias en humanos generalmente inducen fiebre y síntomas respiratorios. Entre ellos se incluyen:
Genoma
Su genoma oscila entre las 26 y 32 kilobases, por lo que es de gran tamaño. La estructura general del genoma de β-CoV es similar a la de otros CoV, con una poliproteína replicasa ORF1ab ( rep, pp1ab ), entre otros elementos. Esta poliproteína se escinde en muchas proteínas no estructurales.
A mayo de 2013, se han publicado en GenBank 46 genomas completos de Orthocoronavirinae.[8]
Clasificación
Dentro del género Betacoronavirus (Coronavirus del grupo 2), se reconocen comúnmente cuatro linajes (a, b, c y d).
- El linaje A (subgénero Embecovirus ) incluye HCoV-OC43 y HCoV-HKU1 (varias especies)
- El linaje B (subgénero Sarbecovirus ) incluye SARS-CoV (varias especies) y SARS-CoV 2 (inicialmente 2019-nCoV)
- El linaje C (subgénero Merbecovirus) incluye el coronavirus de murciélago Tylonycteris HKU4 (BtCoV-HKU4), el coronavirus de murciélago Pipistrellus HKU5 (BtCoV-HKU5) y MERS-CoV (varias especies)
- El linaje D (subgénero Nobecovirus) incluye el coronavirus de murciélago Rousettus HKU9 (BtCoV-HKU9)[9]
Los cuatro linajes también se nombran ocasionalmente usando letras griegas o numéricamente.[8] Otro subgénero es el Hibecovirus, incluido Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013. [10]
Morfología
Los virus del linaje A difieren de todos los demás de este género en que tienen una proteína similar a un pico más corta llamada hemaglutinina esterasa (HE).
Los coronavirus se llaman así por su apariencia bajo el microscopio electrónico donde se observan unos picos formando una corona que rodea su superficie similar a la corona solar. Esta morfología es creada por los peplómeros de los picos de la superficie viral, que son proteínas que pueblan la superficie del virus y determinan el tropismo por el huésped. El orden Nidovirales lleva el nombre en referencia a la palabra latina nidus, que significa nido. Se refiere a la producción de este orden de un conjunto anidado de ARNm 3'-coterminal durante la infección.[11]
Se han descrito varias estructuras de las proteínas de los picos. El dominio de unión al receptor en la proteína del pico de Alphacoronavirus y Betacoronavirus está catalogado como IPR018548.[12] La proteína en cuestión es un trímero (PDB 3jcl ); y su estructura central se asemeja a la de las proteínas F (fusión) del paramixovirus.[13] El receptor no está muy conservado. Por ejemplo, entre los Sarbecovirus, solo un sublinaje que contiene al virus SARS posee el receptor ECA2.
Referencias
- «Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses». nextstrain. Consultado el 18 de enero de 2020.
- ProMED. MERS-CoV–Eastern Mediterranean (06) (http://www.promedmail.org/)
- Memish, Z. A.; Zumla, A. I.; Al-Hakeem, R. F.; Al-Rabeeah, A. A.; Stephens, G. M. (2013). «Family Cluster of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Infections». New England Journal of Medicine 368 (26): 2487-94. PMID 23718156. doi:10.1056/NEJMoa1303729.
- ↑ Woo, P. C.; Wang, M.; Lau, S. K.; Xu, H.; Poon, R. W.; Guo, R.; Wong, B. H.; Gao, K. et al. (2007). «Comparative analysis of twelve genomes of three novel group 2c and group 2d coronaviruses reveals unique group and subgroup features». Journal of Virology 81 (4): 1574-85. PMC 1797546. PMID 17121802. doi:10.1128/JVI.02182-06.
- ↑ Lau, S. K.; Woo, P. C.; Yip, C. C.; Fan, R. Y.; Huang, Y.; Wang, M.; Guo, R.; Lam, C. S. et al. (2012). «Isolation and characterization of a novel Betacoronavirus subgroup A coronavirus, rabbit coronavirus HKU14, from domestic rabbits». Journal of Virology 86 (10): 5481-96. PMC 3347282. PMID 22398294. doi:10.1128/JVI.06927-11.
- ↑ Lau, S. K.; Poon, R. W.; Wong, B. H.; Wang, M.; Huang, Y.; Xu, H.; Guo, R.; Li, K. S. et al. (2010). «Coexistence of different genotypes in the same bat and serological characterization of Rousettus bat coronavirus HKU9 belonging to a novel Betacoronavirus subgroup». Journal of Virology 84 (21): 11385-94. PMC 2953156. PMID 20702646. doi:10.1128/JVI.01121-10.
- Zhang, Wei; Zheng, Xiao-Shuang; Agwanda, Bernard; Ommeh, Sheila; Zhao, Kai; Lichoti, Jacqueline; Wang, Ning; Chen, Jing et al. (24 de octubre de 2019). «Serological evidence of MERS-CoV and HKU8-related CoV co-infection in Kenyan camels». Emerging Microbes & Infections 8 (1): 1528-1534. doi:10.1080/22221751.2019.1679610.
- ↑ Cotten, Matthew; Lam, Tommy T.; Watson, Simon J.; Palser, Anne L.; Petrova, Velislava; Grant, Paul; Pybus, Oliver G.; Rambaut, Andrew et al. (19 de mayo de 2013). «Full-Genome Deep Sequencing and Phylogenetic Analysis of Novel Human Betacoronavirus - Vol. 19 No. 5 - May 2013 - CDC». Emerging Infectious Diseases 19 (5): 736-42B. PMC 3647518. PMID 23693015. doi:10.3201/eid1905.130057. Consultado el 22 Apr 2014.
- . 19 de febrero de 2013. Archivado desde el original el 31 de mayo de 2013. Consultado el 22 Apr 2014.
- Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo: Global Epidemiology of Bat Coronaviruses, in: Viruses. 2019 Feb; 11(2): 174, doi:10.3390/v11020174
- Woo, P. C.; Huang, Y.; Lau, S. K.; Yuen, K. Y. (2010). «Coronavirus genomics and bioinformatics analysis». Viruses 2 (8): 1804-20. PMC 3185738. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803.
- Huang, C; Qi, J; Lu, G; Wang, Q; Yuan, Y; Wu, Y; Zhang, Y; Yan, J et al. (1 de noviembre de 2016). «Putative Receptor Binding Domain of Bat-Derived Coronavirus HKU9 Spike Protein: Evolution of Betacoronavirus Receptor Binding Motifs.». Biochemistry 55 (43): 5977-5988. PMID 27696819. doi:10.1021/acs.biochem.6b00790.
- Walls, Alexandra C.; Tortorici, M. Alejandra; Bosch, Berend-Jan; Frenz, Brandon; Rottier, Peter J. M.; DiMaio, Frank; Rey, Félix A.; Veesler, David (8 de febrero de 2016). «Cryo-electron microscopy structure of a coronavirus spike glycoprotein trimer». Nature 531 (7592): 114-117. doi:10.1038/nature16988.
Enlaces externos
- Viralzone : Betacoronavirus