fbpx
Wikipedia

ARID1A

La proteína ARID1A ("dominio de interacción rico en AT de la proteína A1", del inglés "AT-rich interactive domain-containing protein 1A") es una proteína humana codificada por el gen arid1A.[1][2][3]​ Este gen codifica una proteína de la familia SWI/SNF, cuyos miembros tienen actividades de tipo helicasa y ATPasa, y están implicados en la regulación de la transcripción de determinados genes por medio de alteraciones en la estructura de la cromatina en la región que alberga dichos genes. La proteína codificada forma parte del complejo SNF/SWI de remodelación de la cromatina dependiente de ATP, el cual es necesario para la activación transcripcional de genes normalmente reprimidos por la estructura de la cromatina. ARID1A posee al menos dos dominios conservados que podrían ser cruciales para esta función. El primero de ellos, es un dominio de unión a ADN que puede unirse específicamente a regiones del ADN ricas en AT. El segundo de ellos, es el dominio C-terminal de la proteína el cual es capaz de estimular la activación de la transcripción de glucocorticoides dependientes de receptor. Parece ser que esta proteína confiere especificidad al complejo SNF/SWI y podría ser la responsable de reclutar y dirigir el complejo a sus dianas correspondientes por medio de interacciones proteína-ADN o proteína-proteína. Cabe destacar que han sido descritos dos transcritos diferentes provenientes del mismo gen, que dan lugar a dos isoformas de la proteína.[3]

ARID1A

Estructura tridimensional de la proteína ARID1A.
Estructuras disponibles
PDB

Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

 Lista de códigos PDB
1RYU
Identificadores
Símbolos ARID1A (HGNC: 11110) ; B120; BAF250; BAF250a; BM029; C1orf4; ELD; MRD14; OSA1; P270; SMARCF1; hELD; hOSA1
Identificadores
externos
Locus Cr. 1 p35.3
Patrón de expresión de ARNm
Más información
Ortólogos
Especies
Entrez
8289 93760
Ensembl
Véase HS Véase MM
UniProt
O14497 A2BH40
RefSeq
(ARNm)
NM_006015 NM_001080819
RefSeq
(proteína) NCBI
NP_006006 NP_001074288
Ubicación (UCSC)
Cr. 1:
27.02 – 27.11 Mb
Cr. 4:
133.68 – 133.76 Mb
PubMed (Búsqueda)

Interacciones

La proteína ARID1A ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Referencias

  1. Takeuchi T, Furihata M, Heng HH, Sonobe H, Ohtsuki Y (Aug de 1998). «Chromosomal mapping and expression of the human B120 gene». Gene 213 (1-2): 189-93. PMID 9630625. 
  2. Takeuchi T, Chen BK, Qiu Y, Sonobe H, Ohtsuki Y (Feb de 1998). «Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats». Gene 204 (1-2): 71-7. PMID 9434167. 
  3. «Entrez Gene: ARID1A AT rich interactive domain 1A (SWI-like)». 
  4. Kato, Hiroyuki; Tjernberg Agneta, Zhang Wenzhu, Krutchinsky Andrew N, An Woojin, Takeuchi Tamotsu, Ohtsuki Yuji, Sugano Sumio, de Bruijn Diederik R, Chait Brian T, Roeder Robert G (Feb. de 2002). «SYT associates with human SNF/SWI complexes and the C-terminal region of its fusion partner SSX1 targets histones». J. Biol. Chem. (United States) 277 (7): 5498-505. ISSN 0021-9258. PMID 11734557. doi:10.1074/jbc.M108702200. 
  5. Wang, W; Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari P A, Biggar S R, Muchardt C, Kalpana G V, Goff S P, Yaniv M, Workman J L, Crabtree G R (Oct. de 1996). «Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex». EMBO J. (ENGLAND) 15 (19): 5370-82. ISSN 0261-4189. PMID 8895581. 
  6. Zhao, K; Wang W, Rando O J, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree G R (Nov. de 1998). «Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling». Cell (UNITED STATES) 95 (5): 625-36. ISSN 0092-8674. PMID 9845365. 

Enlaces externos

  • MeSH: ARID1A+protein,+human (en inglés)
  •   Datos: Q18032797

arid1a, proteína, dominio, interacción, rico, proteína, inglés, rich, interactive, domain, containing, protein, proteína, humana, codificada, arid1a, este, codifica, proteína, familia, cuyos, miembros, tienen, actividades, tipo, helicasa, atpasa, están, implic. La proteina ARID1A dominio de interaccion rico en AT de la proteina A1 del ingles AT rich interactive domain containing protein 1A es una proteina humana codificada por el gen arid1A 1 2 3 Este gen codifica una proteina de la familia SWI SNF cuyos miembros tienen actividades de tipo helicasa y ATPasa y estan implicados en la regulacion de la transcripcion de determinados genes por medio de alteraciones en la estructura de la cromatina en la region que alberga dichos genes La proteina codificada forma parte del complejo SNF SWI de remodelacion de la cromatina dependiente de ATP el cual es necesario para la activacion transcripcional de genes normalmente reprimidos por la estructura de la cromatina ARID1A posee al menos dos dominios conservados que podrian ser cruciales para esta funcion El primero de ellos es un dominio de union a ADN que puede unirse especificamente a regiones del ADN ricas en AT El segundo de ellos es el dominio C terminal de la proteina el cual es capaz de estimular la activacion de la transcripcion de glucocorticoides dependientes de receptor Parece ser que esta proteina confiere especificidad al complejo SNF SWI y podria ser la responsable de reclutar y dirigir el complejo a sus dianas correspondientes por medio de interacciones proteina ADN o proteina proteina Cabe destacar que han sido descritos dos transcritos diferentes provenientes del mismo gen que dan lugar a dos isoformas de la proteina 3 ARID1AEstructura tridimensional de la proteina ARID1A Estructuras disponiblesPDBBuscar ortologos PDBe RCSB Lista de codigos PDB1RYUIdentificadoresSimbolosARID1A HGNC 11110 B120 BAF250 BAF250a BM029 C1orf4 ELD MRD14 OSA1 P270 SMARCF1 hELD hOSA1IdentificadoresexternosOMIM 603024MGI 1935147HomoloGene 21216EBI ARID1AGeneCards Gen ARID1AUniProt ARID1ALocusCr 1 p35 3 Ontologia genicaReferencias AmiGO QuickGOPatron de expresion de ARNmMas informacionOrtologosEspeciesHumano RatonEntrez8289 93760EnsemblVease HS Vease MMUniProtO14497 A2BH40RefSeq ARNm NM 006015 NM 001080819RefSeq proteina NCBINP 006006 NP 001074288Ubicacion UCSC Cr 1 27 02 27 11 Mb Cr 4 133 68 133 76 MbPubMed Busqueda 1 2 vte editar datos en Wikidata Interacciones EditarLa proteina ARID1A ha demostrado ser capaz de interaccionar con SMARCB1 4 5 SMARCA4 5 6 Referencias Editar Takeuchi T Furihata M Heng HH Sonobe H Ohtsuki Y Aug de 1998 Chromosomal mapping and expression of the human B120 gene Gene 213 1 2 189 93 PMID 9630625 Takeuchi T Chen BK Qiu Y Sonobe H Ohtsuki Y Feb de 1998 Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats Gene 204 1 2 71 7 PMID 9434167 a b Entrez Gene ARID1A AT rich interactive domain 1A SWI like Kato Hiroyuki Tjernberg Agneta Zhang Wenzhu Krutchinsky Andrew N An Woojin Takeuchi Tamotsu Ohtsuki Yuji Sugano Sumio de Bruijn Diederik R Chait Brian T Roeder Robert G Feb de 2002 SYT associates with human SNF SWI complexes and the C terminal region of its fusion partner SSX1 targets histones J Biol Chem United States 277 7 5498 505 ISSN 0021 9258 PMID 11734557 doi 10 1074 jbc M108702200 La referencia utiliza el parametro obsoleto coautores ayuda a b Wang W Cote J Xue Y Zhou S Khavari P A Biggar S R Muchardt C Kalpana G V Goff S P Yaniv M Workman J L Crabtree G R Oct de 1996 Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI SNF complex EMBO J ENGLAND 15 19 5370 82 ISSN 0261 4189 PMID 8895581 La referencia utiliza el parametro obsoleto coautores ayuda Zhao K Wang W Rando O J Xue Y Swiderek K Kuo A Crabtree G R Nov de 1998 Rapid and phosphoinositol dependent binding of the SWI SNF like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling Cell UNITED STATES 95 5 625 36 ISSN 0092 8674 PMID 9845365 La referencia utiliza el parametro obsoleto coautores ayuda Enlaces externos EditarMeSH ARID1A protein human en ingles Datos Q18032797 Obtenido de https es wikipedia org w index php title ARID1A amp oldid 118913468, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

español

, española, descargar, gratis, descargar gratis, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, imagen, música, canción, película, libro, juego, juegos