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VMD

VMD (Visual Molecular Dynamics) es un programa de modelamiento molecular y visualización de estructuras.[1]​ VMD fue principalmente desarrollado como una herramienta para ver y analizar los resultados de las simulaciones de dinámica molecular, pero también incluye herramientas para trabajar con datos de volumen, secuencias y objetos gráficos arbitrarios como conos, cilindros o esferas. Las escenas mostradas pueden ser exportadas a herramientas de renderizado como POV-Ray, Renderman, Tachyon, VMRL y muchas otras. Los usuarios pueden ejecutar sus propios scripts de TCl y Python, dado que VMD también incluye intérpretes para estos lenguajes. VMD es gratuito y de código libre..[2]

VMD
Información general
Tipo de programa Modelamiento molecular
Desarrollador Theoretical andn Computational Biophysics Group (TCB)
Licencia University of Illinois license
Estado actual Con soporte
Idiomas 1
Información técnica
Programado en C
Plataformas admitidas «x86», «x86-64»
Versiones
Última versión estable 1.9.2 (info) 29 de diciembre de 2014 (6 años, 7 meses y 17 días)
Archivos legibles
  • Protein Data Bank
  • CCP4
  • XYZ file format
  • Visual Molecular Dynamics file format
Asistencia técnica
Enlaces

Historia

VMD fue desarrollado por "Theoretical and Computational Biophysics Group" de la Universidad de Illinois y el Instituto Beckman. La versión original, llamada VRChem fue desarrollada en 1992 por Mike Krough, Bill Humphrey y Rick Kufrin. La versión inicial de VMD fue escrita por William Humphrey, Andrew Dalke, Ken Hamer, Jon Leech y James Phillips en 1995.

Enlaces externos

  • VMD web site
  • VMD on GPUs
  • Protein workbench STRAP

Referencias

  1. Humphrey, William; Dalke, Andrew; Schulten, Klaus (February 1996). «VMD: Visual molecular dynamics». Journal of Molecular Graphics 14 (1): 33-38. PMID 8744570. doi:10.1016/0263-7855(96)00018-5. 
  2. «VMD User's Guide Version 1.9.1». Massachusetts Institute of Technology. NIH Resource for Macromolecular Modeling and Bioinformatics. Consultado el 29 de enero de 2012. 
  •   Datos: Q7936565
  •   Multimedia: VMD

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