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Bacteriófago T7

El bacteriófago T7 (o el fago T7) es un bacteriófago, virus que infecta a las bacterias. Infecta a la mayoría de las cepas de Escherichia coli y depende de estos huéspedes para propagarse. Tiene un ciclo de vida lítico, lo que significa que destruye la célula que infecta. También posee varias propiedades que lo convierten en un fago ideal para la experimentación: su purificación y concentración han producido valores consistentes en análisis químicos; puede volverse no infeccioso por exposición a la luz ultravioleta; y se puede utilizar en la presentación de fagos para clonar proteínas de unión a ARN. [1]

 
T7

Estructura del bacteriófago T7
Taxonomía
Dominio: Duplodnaviria
Reino: Heunggongvirae
Filo: Uroviricota
Clase: Caudoviricetes
Orden: Caudovirales
Familia: Autographiviridae
Género: Teseptimavirus
Especie: Virus de Escherichia T7

Descubrimiento

En un estudio de 1945 de Demerec y Fano,[2]​ T7 se utilizó para describir uno de los siete tipos de fagos (T1 a T7) que crecen líticamente en Escherichia coli;[3]​ aunque los siete fagos se numeraron arbitrariamente, más tarde se descubrió que los fagos con números impares, o fagos T-impares, compartían características morfológicas y bioquímicas que los distinguen de los fagos T-pares.[4]​ Antes de ser referido físicamente como T7, el fago se utilizó en experimentos anteriores. El biofísico germano-estadounidense Max Delbrück trabajó con el mismo virus a fines de la década de 1930, llamándolo fago δ, y el microbiólogo franco-canadiense Félix d'Herelle probablemente estudió a su pariente cercano en la década de 1920.[5][3]

Anfitriones

T7 crece en cepas rugosas de Escherichia coli (es decir, aquellas sin polisacárido de antígeno O de longitud completa en su superficie) y algunas otras bacterias entéricas, pero parientes cercanos también infectan cepas lisas e incluso encapsuladas.[6]​sss E. coli es más resistente a T7 que a algunos otros fagos similares.

Estructura del vivión

 
Microfotografía coloreada de un virión T7 con sus seis fibras de la cola que están dobladas hacia atrás contra su cápside. Las fibras se extienden cuando el virus localiza un huésped adecuado.
 
Dibujo esquemático anotado de un virión del fago T7 de Enterobacteria (sección transversal y vista lateral)

El virus tiene una simetría estructural compleja, con una cápside del fago que es icosaédrica (veinte caras) con un diámetro interno de 55 nm y una cola de 19 nm de diámetro y 28,5 nm de longitud unida a la cápside.[7]​ La expulsión de proteínas de la cápside tras la infección hace que el virus cambie de estructura cuando ingresa a la célula.[8]

Genoma

El genoma del fago T7 fue uno de los primeros genomas completamente secuenciados y se publicó en 1983.[9][10]​ La cabeza de la partícula del fago contiene el genoma de ADN bicatenario de aproximadamente 40 kpb que codifica 55 proteínas.[11]

 

Ciclo de vida

T7 tiene un ciclo de vida de 17 min a 37 °C, es decir, el tiempo desde la infección hasta la lisis de la célula huésped cuando se liberan nuevos fagos. Debido al corto período de latencia, la mayoría de los estudios fisiológicos se realizan a 30 °C, donde las células infectadas se lisan después de 30 min. Sin embargo, se han aislado cepas de T7 de alta aptitud con un período de latencia de solo ~ 11 min a 37 °C creciendo en condiciones óptimas en resultados de medios enriquecidos. Este fago adaptado puede experimentar una expansión efectiva de su población en más de 1013 en una hora de crecimiento.[13]

Infección de bacterias huésped

 
T7 infectando una célula huésped. Dibujo esquemático con anotaciones.
 
Tomogramas de un virión T7 en acción. T7 utiliza sus fibras para "caminar" a través de la superficie celular y finalmente infectar la célula.
 
Ciclo de reproducción de T7, en total.
 
Maquinaria de replicación de T7, detalles.

El fago T7 reconoce ciertos receptores en la superficie de las células de E. coli y se une a la superficie celular mediante las fibras de la cola viral. En algunas cepas de T7, las fibras de la cola se reemplazan con picos de la cola que degradan los antígenos O o K en la superficie celular por medio de la actividad enzimática.

El proceso de adsorción y penetración utiliza lisozimas para crear una abertura dentro de la capa de peptidoglicano de la pared celular bacteriana, lo que permite la transferencia del ADN viral a la bacteria. La cola corta y rechoncha del fago similar a T7 es demasiado corta para abarcar la envoltura celular y, para expulsar el genoma del fago en la célula al inicio de la infección, las proteínas del virión primero deben hacer un canal desde la punta de la cola. en el citoplasma celular.[14]​</nowiki> El fago también libera cinco proteínas necesarias para comenzar la replicación del genoma viral y escindir el genoma del huésped.[15]​ T7 se ha desarrollado para anular varias de las defensas de la bacteria huésped, incluida la pared celular de peptidoglicano y el sistema CRISPR.[15]​ Una vez que el fago T7 ha insertado el genoma viral, el proceso de replicación del ADN del genoma del hospedador se detiene y comienza la replicación del genoma viral.

En condiciones óptimas, el fago T7 puede completar el proceso lítico en 25 minutos, lo que lleva a la muerte de la célula huésped de E. coli. En el momento de la lisis, el virus puede producir más de 100 descendientes.[15]

Componentes

Gp5 (codificada por el gen gp5 ) es la ADN polimerasa del fago T7. La polimerasa T7 utiliza la tiorredoxina endógena de E. coli, una proteína REDOX, como abrazadera deslizante durante la replicación del ADN del fago (aunque la tiorredoxina normalmente tiene una función diferente). La abrazadera deslizante funciona para mantener la polimerasa en el ADN, lo que aumenta la velocidad de síntesis.[16]

Replicación y reparación del ADN

El fago T7 tiene el replisoma de ADN más simple conocido, que consiste en una helicasa y una primasa que residen en una sola cadena polipeptídica que forma un hexámero en presencia de ADN y ATP o dTTP. La ADN polimerasa de T7, asistida por la tiorredoxina de E. coli, realiza la síntesis de ADN de hebra principal y retrasada.

En el fago T7, las roturas de la doble hebra del ADN probablemente se reparan mediante la inserción de un parche de ADN del donante en un espacio en el sitio de rotura.[17]​ Esta reparación de roturas de doble hebra es facilitada por la proteína del gen 2.5 que promueve el apareamiento de hebras complementarias homólogas de ADN.[18]

Intermedios replicativos

El ADN intracelular de replicación del fago T7, cuando se estira después de la lisis celular, suele ser más largo que el cromosoma del fago maduro (11 a 15 µM) y puede presentarse en forma de hebras lineales altamente concatenadas de hasta 66 veces la longitud del fago maduro. cromosoma.[19]​ El ADN en replicación también se puede ver en forma de estructuras de anillos enrollados que parecen corresponder a configuraciones de ADN en bucles múltiples en las que los giros superhélicos, necesarios para la compactación del ADN, se alivian mediante cortes en las hebras tras la lisis celular.

Aplicaciones en biología molecular

La secuencia del promotor de T7 se usa ampliamente en biología molecular debido a su afinidad extremadamente alta por la ARN polimerasa T7 y, por lo tanto, a su alto nivel de expresión.

Se ha utilizado como modelo en biología sintética.[20]​ El ADN modificado se diseñó para que fuera más fácil trabajar con él de varias maneras: los elementos funcionales individuales se separaron mediante sitios de endonucleasas de restricción para una modificación simple, y los dominios de codificación de proteínas superpuestos se separaron y, cuando fue necesario, se modificaron por un solo par de bases; mutaciones silenciosas. La T7 se ha probado en osteosarcoma humano para tratar células tumorales.

Referencias

  1. name=":1"
  2. «Bacteriophage-Resistant Mutants in Escherichia Coli». Genetics 30 (2): 119-36. March 1945. PMC 1209279. PMID 17247150.  Parámetro desconocido |vauthors= ignorado (ayuda)
  3. Bacteriophages. Academic Press. 31 de diciembre de 2012. pp. 226-. ISBN 978-0-12-394788-8.  Parámetro desconocido |veditors= ignorado (ayuda)
  4. Cammack, Richard; Atwood, Teresa; Campbell, Peter; Parish, Howard; Smith, Anthony; Vella, Frank; Stirling, John, eds. (2006). Oxford Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology. Oxford University Press. ISBN 9780191727641. doi:10.1093/acref/9780198529170.001.0001. 
  5. d’Herelle, F. (1926). The Bacteriophage and Its Behavior. Baltimore, MD: Williams & Wilkins
  6. Molineux, I. J. (2006). Chapter 20: The T7 group. In: The Bacteriophages (R. Calendar, ed.), pp. 277. Oxford University Press, Oxford.
  7. «Teseptimavirus ~ ViralZone page». viralzone.expasy.org. Consultado el 18 de noviembre de 2019. 
  8. Molineux, Ian J.; Panja, Debabrata (March 2013). «Popping the cork: mechanisms of phage genome ejection». Nature Reviews Microbiology 11 (3): 194-204. ISSN 1740-1534. PMID 23385786. S2CID 205498472. doi:10.1038/nrmicro2988. 
  9. «Genome of bacteriophage T7». Consultado el 18 de mayo de 2011. 
  10. Dunn, J. J.; Studier, F. W. (1983). «Complete nucleotide sequence of bacteriophage T7 DNA and the locations of T7 genetic elements». Journal of Molecular Biology 166 (4): 477-535. PMID 6864790. doi:10.1016/S0022-2836(83)80282-4. 
  11. «Uniprot: reference proteome of bacteriophage T7». 
  12. Häuser, R; Blasche, S; Dokland, T; Haggård-Ljungquist, E; von Brunn, A; Salas, M; Casjens, S; Molineux, I et al. (2012). Bacteriophage protein-protein interactions. Advances in Virus Research 83. pp. 219-98. ISBN 9780123944382. PMC 3461333. PMID 22748812. doi:10.1016/B978-0-12-394438-2.00006-2. 
  13. Heineman, R. H.; Bull, J. J. (2007). «Testing Optimality with Experimental Evolution: Lysis Time in a Bacteriophage». Evolution 61 (7): 1695-1709. PMC 1974807. PMID 17598749. doi:10.1111/j.1558-5646.2007.00132.x. 
  14. Chang, C. Y.; Kemp, P; Molineux, I. J. (2010). «Gp15 and gp16 cooperate in translocating bacteriophage T7 DNA into the infected cell». Virology 398 (2): 176-86. PMC 2825023. PMID 20036409. doi:10.1016/j.virol.2009.12.002. <nowiki>
  15. . Archivado desde el original el 17 de agosto de 2011.  Parámetro desconocido |url-status= ignorado (ayuda)
  16. Jeffery, Constance J. (1 de enero de 1999). «Moonlighting proteins». Trends in Biochemical Sciences 24 (1): 8-11. ISSN 0968-0004. PMID 10087914. doi:10.1016/S0968-0004(98)01335-8. 
  17. Lai YT, Masker W. Repair of double-strand breaks by incorporation of a molecule of homologous DNA. Mol Microbiol. 2000 Apr;36(2):437-46. PubMed
  18. Yu M, Masker W. T7 single strand DNA binding protein but not T7 helicase is required for DNA double strand break repair. J Bacteriol. 2001 Mar;183(6):1862-9.PubMed
  19. Bernstein C, Bernstein H. Coiled rings of DNA released from cells infected with bacteriophages T7 or T4 or from uninfected Escherichia coli. J Virol. 1974 Jun;13(6):1346-55. doi: 10.1128/JVI.13.6.1346-1355.1974. PMID: 4598784; PMCID: PMC355455.
  20. «Refactoring bacteriophage T7». Molecular Systems Biology 1: E1-E10. 2005. PMC 1681472. PMID 16729053. doi:10.1038/msb4100025.  Parámetro desconocido |vauthors= ignorado (ayuda)

Enlaces externos

  • MeSH: T7+Phage (en inglés)
  • [1] ViralZone
  • . Revista de microbios
  • T7 reference proteome en Uniprot


  •   Datos: Q24808060
  •   Multimedia: Category:Bacteriophage T7
  •   Especies: Escherichia virus T7

bacteriófago, debe, confundirse, fago, bacteriófago, fago, bacteriófago, virus, infecta, bacterias, infecta, mayoría, cepas, escherichia, coli, depende, estos, huéspedes, para, propagarse, tiene, ciclo, vida, lítico, significa, destruye, célula, infecta, tambi. No debe confundirse con Fago T4 El bacteriofago T7 o el fago T7 es un bacteriofago virus que infecta a las bacterias Infecta a la mayoria de las cepas de Escherichia coli y depende de estos huespedes para propagarse Tiene un ciclo de vida litico lo que significa que destruye la celula que infecta Tambien posee varias propiedades que lo convierten en un fago ideal para la experimentacion su purificacion y concentracion han producido valores consistentes en analisis quimicos puede volverse no infeccioso por exposicion a la luz ultravioleta y se puede utilizar en la presentacion de fagos para clonar proteinas de union a ARN 1 T7Estructura del bacteriofago T7TaxonomiaDominio DuplodnaviriaReino HeunggongviraeFilo UroviricotaClase CaudoviricetesOrden CaudoviralesFamilia AutographiviridaeGenero TeseptimavirusEspecie Virus de Escherichia T7 editar datos en Wikidata Indice 1 Descubrimiento 2 Anfitriones 3 Estructura del vivion 4 Genoma 5 Ciclo de vida 5 1 Infeccion de bacterias huesped 5 2 Componentes 6 Replicacion y reparacion del ADN 6 1 Intermedios replicativos 7 Aplicaciones en biologia molecular 8 Referencias 9 Enlaces externosDescubrimiento EditarEn un estudio de 1945 de Demerec y Fano 2 T7 se utilizo para describir uno de los siete tipos de fagos T1 a T7 que crecen liticamente en Escherichia coli 3 aunque los siete fagos se numeraron arbitrariamente mas tarde se descubrio que los fagos con numeros impares o fagos T impares compartian caracteristicas morfologicas y bioquimicas que los distinguen de los fagos T pares 4 Antes de ser referido fisicamente como T7 el fago se utilizo en experimentos anteriores El biofisico germano estadounidense Max Delbruck trabajo con el mismo virus a fines de la decada de 1930 llamandolo fago d y el microbiologo franco canadiense Felix d Herelle probablemente estudio a su pariente cercano en la decada de 1920 5 3 Anfitriones EditarT7 crece en cepas rugosas de Escherichia coli es decir aquellas sin polisacarido de antigeno O de longitud completa en su superficie y algunas otras bacterias entericas pero parientes cercanos tambien infectan cepas lisas e incluso encapsuladas 6 sss E coli es mas resistente a T7 que a algunos otros fagos similares Estructura del vivion Editar Microfotografia coloreada de un virion T7 con sus seis fibras de la cola que estan dobladas hacia atras contra su capside Las fibras se extienden cuando el virus localiza un huesped adecuado Dibujo esquematico anotado de un virion del fago T7 de Enterobacteria seccion transversal y vista lateral El virus tiene una simetria estructural compleja con una capside del fago que es icosaedrica veinte caras con un diametro interno de 55 nm y una cola de 19 nm de diametro y 28 5 nm de longitud unida a la capside 7 La expulsion de proteinas de la capside tras la infeccion hace que el virus cambie de estructura cuando ingresa a la celula 8 Genoma EditarEl genoma del fago T7 fue uno de los primeros genomas completamente secuenciados y se publico en 1983 9 10 La cabeza de la particula del fago contiene el genoma de ADN bicatenario de aproximadamente 40 kpb que codifica 55 proteinas 11 Ciclo de vida EditarT7 tiene un ciclo de vida de 17 min a 37 C es decir el tiempo desde la infeccion hasta la lisis de la celula huesped cuando se liberan nuevos fagos Debido al corto periodo de latencia la mayoria de los estudios fisiologicos se realizan a 30 C donde las celulas infectadas se lisan despues de 30 min Sin embargo se han aislado cepas de T7 de alta aptitud con un periodo de latencia de solo 11 min a 37 C creciendo en condiciones optimas en resultados de medios enriquecidos Este fago adaptado puede experimentar una expansion efectiva de su poblacion en mas de 1013 en una hora de crecimiento 13 Infeccion de bacterias huesped Editar T7 infectando una celula huesped Dibujo esquematico con anotaciones Tomogramas de un virion T7 en accion T7 utiliza sus fibras para caminar a traves de la superficie celular y finalmente infectar la celula Ciclo de reproduccion de T7 en total Maquinaria de replicacion de T7 detalles El fago T7 reconoce ciertos receptores en la superficie de las celulas de E coli y se une a la superficie celular mediante las fibras de la cola viral En algunas cepas de T7 las fibras de la cola se reemplazan con picos de la cola que degradan los antigenos O o K en la superficie celular por medio de la actividad enzimatica El proceso de adsorcion y penetracion utiliza lisozimas para crear una abertura dentro de la capa de peptidoglicano de la pared celular bacteriana lo que permite la transferencia del ADN viral a la bacteria La cola corta y rechoncha del fago similar a T7 es demasiado corta para abarcar la envoltura celular y para expulsar el genoma del fago en la celula al inicio de la infeccion las proteinas del virion primero deben hacer un canal desde la punta de la cola en el citoplasma celular 14 lt nowiki gt El fago tambien libera cinco proteinas necesarias para comenzar la replicacion del genoma viral y escindir el genoma del huesped 15 T7 se ha desarrollado para anular varias de las defensas de la bacteria huesped incluida la pared celular de peptidoglicano y el sistema CRISPR 15 Una vez que el fago T7 ha insertado el genoma viral el proceso de replicacion del ADN del genoma del hospedador se detiene y comienza la replicacion del genoma viral En condiciones optimas el fago T7 puede completar el proceso litico en 25 minutos lo que lleva a la muerte de la celula huesped de E coli En el momento de la lisis el virus puede producir mas de 100 descendientes 15 Componentes Editar Gp5 codificada por el gen gp5 es la ADN polimerasa del fago T7 La polimerasa T7 utiliza la tiorredoxina endogena de E coli una proteina REDOX como abrazadera deslizante durante la replicacion del ADN del fago aunque la tiorredoxina normalmente tiene una funcion diferente La abrazadera deslizante funciona para mantener la polimerasa en el ADN lo que aumenta la velocidad de sintesis 16 Replicacion y reparacion del ADN EditarEl fago T7 tiene el replisoma de ADN mas simple conocido que consiste en una helicasa y una primasa que residen en una sola cadena polipeptidica que forma un hexamero en presencia de ADN y ATP o dTTP La ADN polimerasa de T7 asistida por la tiorredoxina de E coli realiza la sintesis de ADN de hebra principal y retrasada En el fago T7 las roturas de la doble hebra del ADN probablemente se reparan mediante la insercion de un parche de ADN del donante en un espacio en el sitio de rotura 17 Esta reparacion de roturas de doble hebra es facilitada por la proteina del gen 2 5 que promueve el apareamiento de hebras complementarias homologas de ADN 18 Intermedios replicativos Editar El ADN intracelular de replicacion del fago T7 cuando se estira despues de la lisis celular suele ser mas largo que el cromosoma del fago maduro 11 a 15 µM y puede presentarse en forma de hebras lineales altamente concatenadas de hasta 66 veces la longitud del fago maduro cromosoma 19 El ADN en replicacion tambien se puede ver en forma de estructuras de anillos enrollados que parecen corresponder a configuraciones de ADN en bucles multiples en las que los giros superhelicos necesarios para la compactacion del ADN se alivian mediante cortes en las hebras tras la lisis celular Aplicaciones en biologia molecular EditarLa secuencia del promotor de T7 se usa ampliamente en biologia molecular debido a su afinidad extremadamente alta por la ARN polimerasa T7 y por lo tanto a su alto nivel de expresion Se ha utilizado como modelo en biologia sintetica 20 El ADN modificado se diseno para que fuera mas facil trabajar con el de varias maneras los elementos funcionales individuales se separaron mediante sitios de endonucleasas de restriccion para una modificacion simple y los dominios de codificacion de proteinas superpuestos se separaron y cuando fue necesario se modificaron por un solo par de bases mutaciones silenciosas La T7 se ha probado en osteosarcoma humano para tratar celulas tumorales Referencias Editar name 1 Bacteriophage Resistant Mutants in Escherichia Coli Genetics 30 2 119 36 March 1945 PMC 1209279 PMID 17247150 Parametro desconocido vauthors ignorado ayuda a b Bacteriophages Academic Press 31 de diciembre de 2012 pp 226 ISBN 978 0 12 394788 8 Parametro desconocido veditors ignorado ayuda Cammack Richard Atwood Teresa Campbell Peter Parish Howard Smith Anthony Vella Frank Stirling John eds 2006 Oxford Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology Oxford University Press ISBN 9780191727641 doi 10 1093 acref 9780198529170 001 0001 d Herelle F 1926 The Bacteriophage and Its Behavior Baltimore MD Williams amp Wilkins Molineux I J 2006 Chapter 20 The T7 group In The Bacteriophages R Calendar ed pp 277 Oxford University Press Oxford Teseptimavirus ViralZone page viralzone expasy org Consultado el 18 de noviembre de 2019 Molineux Ian J Panja Debabrata March 2013 Popping the cork mechanisms of phage genome ejection Nature Reviews Microbiology 11 3 194 204 ISSN 1740 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Virology 398 2 176 86 PMC 2825023 PMID 20036409 doi 10 1016 j virol 2009 12 002 lt nowiki gt a b c New Details about Bacteriophage T7 Host Interactions Archivado desde el original el 17 de agosto de 2011 Parametro desconocido url status ignorado ayuda Jeffery Constance J 1 de enero de 1999 Moonlighting proteins Trends in Biochemical Sciences 24 1 8 11 ISSN 0968 0004 PMID 10087914 doi 10 1016 S0968 0004 98 01335 8 Lai YT Masker W Repair of double strand breaks by incorporation of a molecule of homologous DNA Mol Microbiol 2000 Apr 36 2 437 46 PubMed Yu M Masker W T7 single strand DNA binding protein but not T7 helicase is required for DNA double strand break repair J Bacteriol 2001 Mar 183 6 1862 9 PubMed Bernstein C Bernstein H Coiled rings of DNA released from cells infected with bacteriophages T7 or T4 or from uninfected Escherichia coli J Virol 1974 Jun 13 6 1346 55 doi 10 1128 JVI 13 6 1346 1355 1974 PMID 4598784 PMCID PMC355455 Refactoring bacteriophage T7 Molecular Systems Biology 1 E1 E10 2005 PMC 1681472 PMID 16729053 doi 10 1038 msb4100025 Parametro desconocido vauthors ignorado ayuda Enlaces externos EditarMeSH T7 Phage en ingles 1 ViralZone New Details about T7 host interactions Revista de microbios T7 reference proteome en Uniprot Datos Q24808060 Multimedia Category Bacteriophage T7 Especies Escherichia virus T7Obtenido de https es wikipedia org w index php title Bacteriofago T7 amp oldid 136544029, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

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