fbpx
Wikipedia

Secuenciación del genoma

Agosto 24, 2021

Para la secuenciación del ADN, véase Secuenciación del ADN.

La secuenciación del genoma es uno o varios procesos de laboratorio que determina la la secuencia completa de ADN en el genoma de un organismo en un proceso único. Esto supone la secuenciación de todos los cromosomas de un organismo con ADN, así como el contenido en el de mitocondrias y, para las plantas, en cloroplastos.

Imagen de los 23 pares de cromosomas de cuerpo humano.

La secuenciación del genoma entero no debe confundirse con el análisis de ADN, que sólo determina la probabilidad de que el material genético proviene de un individuo o grupo en particular, y no contiene información adicional sobre las relaciones genéticas, origen o susceptibilidad a enfermedades específicas.[1]​ También, a diferencia de la consecuencia del genoma completo, el genotipo SOPAN cubre menos del 0,1% del genoma. Casi todos los genomas completos son exclusivamente de los microbios; el término "genoma completo" así se utiliza libremente para significar "más del 97%". El resto de este artículo se centra en los genomas humanos casi completos.

En general, conocer la secuenciación completa de ADN del genoma de un individuo no proporciona, por sí sola, información clínica útil; pero esto puede cambiar con el tiempo ya que un gran número de estudios científicos continúan siendo publicados detallando asociaciones claras entre variantes genéticas específicas y las enfermedades.[2]​[3]​

La herramienta de secuenciación de genes en el nivel SNP permite a los científicos identificar variantes funcionales de los estudios de asociación y mejorar el conocimiento a disposición de los investigadores interesados en la biología evolutiva y, por lo tanto, pueden sentar las bases para predecir la susceptibilidad a la enfermedad y la respuesta a los fármacos.[4]​

Además, al alinear los genomas secuenciados, se pueden obtener las mutaciones somáticas producidas, como las sustituciones de bases.

Las células utilizadas para la secuenciación

Casi cualquier muestra biológica que contenga una copia completa del ADN, incluso una cantidad muy pequeña, de ADN o ADN antiguo, puede proporcionar el material genético necesario para la secuenciación del genoma completo. Dichas muestras pueden incluir saliva, células epiteliales, la médula ósea, folículos pilosos pues el cabello no contiene ADN al estar constituido enteramente por queratina, semillas, hojas de las plantas, o cualquier otra cosa que tenga células que contengan ADN.

La secuencia del genoma en una sola célula seleccionada de una población mixta de células se puede determinar usando técnicas de secuenciación de genoma de la célula única. Esto tiene ventajas importantes en microbiología ambiental en los casos en que una sola célula de una especie de microorganismo particular puede ser aislado de una población mixta por microscopía sobre la base de sus características morfológicas, distintivas u otros. En tales casos, las medidas normalmente necesarias de aislamiento y el crecimiento del organismo en cultivo pueden ser omitidas, permitiendo así la secuenciación de un espectro mucho mayor de genomas de organismos.[5]​

La secuenciación del genoma de células individuales está siendo probado como un método de diagnóstico genético de preimplantación, en el que una célula de embrión creada por la fertilización in vitro es tomada y analizada antes de la transferencia de embriones en el útero.[6]​ Después de la implantación, el ADN fetal libre de células puede ser tomado por una sencilla venopunción de la madre y se utiliza para la secuenciación del genoma del feto.[7]​

Frecuencias de mutación en los cánceres

La secuenciación del genoma entero ha establecido la frecuencia de mutación de los genomas humanos completos. La frecuencia de mutaciones en el genoma entre generaciones de seres humanos (de padres a hijos) es de alrededor de 70 nuevas mutaciones por generación.[8]​[9]​ Se encontró un nivel aún más bajo de variación comparando la secuenciación del genoma completo de las células sanguíneas de un par de gemelos monocigóticos (gemelos idénticos) de 100 años de edad.[10]​ Sólo se encontraron 8 diferencias somáticas, aunque la variación somática que ocurre en menos del 20% de las células de la sangre se detecta.

En la proteína, específicamente las regiones del genoma humano de codificación, se estima que hay alrededor de 0,35 mutaciones que cambiarían la secuencia de la proteína entre generaciones padre / hijo (al menos de una proteína mutada por generación).[11]​

Tipos de cáncer, sin embargo, tienen frecuencias de mutación mucho más altas. La frecuencia particular depende del tipo de tejido, si existe una deficiencia de reparación del ADN, un desajuste, y la exposición a agentes que dañan el ADN, tales como irradiación UV o de los componentes del humo del tabaco. Atún y Amos han resumido las frecuencias de mutación por megabase (Mb),[12]​ como se muestra en la tabla (junto con las frecuencias indicadas de mutaciones por genoma).

Las altas frecuencias de mutación en el cáncer reflejan la inestabilidad del genoma. Lo cual es característico de los cánceres.

Frecuencias de mutación
Tipo de célula La frecuencia de mutación / Mb Mb La frecuencia de mutación por genoma diploide
La línea germinal 0.023 70
Meduloblastoma 0.15-0.6 900-3,600
Leucemia linfocítica aguda 0.3 1,800
Leucemia linfocítica crónica <1 <6,000
Cáncer de próstata 0.9 5,400
Mieloma múltiple 2.9 17,400
Carcinoma colorrectal ~5 ~30,000
Estable de microsatélites (MSS) 2.8 16,800
Microsatélites inestable (MSI) 47 282,000
Carcinoma hepatocelular 4.2 25,200
Cáncer de mama 1.18-1.66 7,080-9,960
Cáncer de pulmón 17.7 106,200
Cáncer de pulmón de células pequeñas 7.4 44,400
Cáncer de pulmón en células (los fumadores) 10.5 63,000
Cáncer de pulmón de células no pequeñas (los no fumadores) 0.6 3,600
Adenocarcinoma de pulmón (los fumadores) 9.8 58,500
Adenocarcinoma de pulmón (los no fumadores) 1.7 10,200
Melanoma ~30 ~180,000
Irradiación-UV melanoma crónico inducido 111 666,000
Melanoma no inducido por irradiación-UV en piel sin pelo de las extremidades 3-14 18,000-84,000
Melanoma inducido por UV en piel con cabello 5-55 30,000-330,000

Las primeras técnicas

 
Un ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer. Tales secuenciadores capilares automatizados son los primeros esfuerzos de secuenciación de genomas.

La secuenciación de casi la totalidad de un genoma humano se llevó a cabo por primera vez en 2000, en parte mediante el uso de la secuenciación escopeta. Mientras la secuencia completa del genoma escopeta para los pequeños (4000-7000 pares de bases) genomas ya estaba en uso en 1979,[13]​ una aplicación más amplia se benefició de la secuencia final por parejas, conocido coloquialmente como secuenciación de doble cañón de escopeta. Como proyectos de secuenciación comenzaron a asumir más y más complicados genomas, varios grupos comenzaron a darse cuenta de que la información útil se puede obtener mediante la secuenciación de los dos extremos de un fragmento de ADN. Aunque realizar la secuenciación de ambos extremos del misma fragmento y hacer el seguimiento de los datos emparejados era más engorroso que la secuenciación de un solo extremo de dos fragmentos distintos, el conocimiento de que las dos secuencias se orientan en direcciones opuestas y a punto de la longitud de un fragmento era valiosa en la reconstrucción de la secuencia del fragmento objetivo original.

La primera descripción publicada de la utilización de extremos emparejados fue en 1990 como parte de la secuencia humana de la HPRT locus,[14]​ aunque el uso de extremos emparejados se limitó a cerrar las brechas después de la aplicación de un enfoque tradicional de secuenciación escopeta. La primera descripción teórica de una estrategia de secuenciación final emparejada, suponiendo fragmentos de longitud constante, fue en 1991.[15]​ En 1995 Roach et al. introdujo la innovación de utilizar fragmentos de distintos tamaños,[16]​ y ha demostrado que una estrategia de secuenciación por pares puros sería posible en objetivos grandes. La estrategia fue adoptada posteriormente por el Instituto de Investigación Genómica (TIGR) para secuenciar el genoma completo de la bacteria Haemophilus influenzae en 1995,[17]​ y luego por Celera Genomics para secuenciar todo el genoma de la mosca de fruta en 2000, [ 18 ] y, posteriormente, todo el genoma humano. Applied Biosystems, que ahora se llama Life Technologies, fabricado los secuenciadores capilares automatizados utilizados tanto por Celera Genomics y el Proyecto Genoma Humano.

Si bien la secuenciación capilar fue el primer enfoque para secuenciar con éxito un genoma humano casi completo, todavía es demasiado caro y lleva mucho tiempo para fines comerciales. Debido a esto, la tecnología de secuenciación escopeta, a pesar de que todavía es relativamente "nueva", desde el año 2005 está siendo desplazada por tecnologías como la pirosecuenciación, secuenciación SMRT y tecnología nanoporo.[18]​

Debido a que la secuencia de datos que se produce puede ser bastante grande (por ejemplo, existen aproximadamente seis mil millones de pares de bases en cada genoma diploide humana), los datos del genoma se almacenan electrónicamente y requieren una gran potencia de cálculo y capacidad de almacenamiento. La secuenciación completa del genoma hubiera sido casi imposible antes de la llegada de los microprocesadores, los ordenadores, y la era de la información.

Las técnicas actuales

Una forma posible de lograr una secuenciación rentable y de alto rendimiento, necesario para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo, es mediante el uso de tecnología de nanoporos, que es una tecnología patentada por la Universidad de Harvard y Oxford Nanopore Tecnologías con licencia para las empresas de biotecnología.[19]​ Para facilitar su iniciativas de secuenciación del genoma completo, Illumina tecnología de secuenciación de nanoporos con licencia de Oxford Tecnologías Nanopore y Sequenom licencia la tecnología de la Universidad de Harvard.[20]​[21]​

Otra forma posible de lograr secuenciación de alto rendimiento es mediante la utilización de fluoróforo. Pacific Biosciences está utilizando actualmente este enfoque en su tecnología de secuenciación de ADN: SMRT (siglas en inglés para "molécula única en tiempo real").[22]​

Complete Genomics ha desarrollado la tecnología ADN Nanoball (DNB) que organiza el ADN en arreglos de autoensamblaje.[23]​

Pirosecuenciación es un método de secuenciación de ADN basado en la secuenciación por principio de síntesis. La técnica fue desarrollada por Pål Nyrén y su estudiante Mostafa Ronaghi en el Instituto Real de Tecnología en Estocolmo en 1996,[24]​[25]​[26]​ y en la actualidad está siendo utilizado por 454 Life Sciences, como base para una plataforma de secuenciación del genoma completo.[27]​

Comercialización

 
Coste total de la secuenciación de un genoma humano calculado por elNHGRI.

Un número de empresas públicas y privadas están compitiendo para desarrollar una plataforma de secuenciación del genoma completo que sea comercialmente sólida tanto para la investigación y uso clínico,[28]​ incluyendo Illumina,[29]​ Knome,[30]​ Sequenom,[31]​ 454 Life Sciences,[32]​ Pacific Biosciences,[33]​ Complete Genomics,[34]​ Helicos Biosciences,[35]​ GE Global Research (General Electric), Affymetrix, IBM, Intelligent Bio-Systems,[36]​ Life Technologies y Oxford Nanopore Technologies.[37]​ Estas empresas están fuertemente financiadas y respaldadas por los capitalistas de riesgo, fondos de cobertura y bancos de inversión.[38]​[39]​

Incentivo

En octubre de 2006, la Fundación X Prize, que trabaja en colaboración con la Fundación J. Craig Venter Science, estableció el X Premio Arconte de Genómica,[40]​ con la intención de otorgar US $ 10 millones para "el primer equipo que logre construir un dispositivo y usarlo para secuenciar 100 genomas humanos dentro de 10 días o menos, con una precisión de no más de un error en cada millón de bases secuenciadas, con secuencias que cubran con precisión al menos el 98% del genoma, y con un costo recurrente de no más de 1.000 dólares por genoma ".[41]​ Una tasa de error de 1 en 1.000.000 bases, de un total de aproximadamente seis mil millones de bases en el genoma diploide humana, significaría unos 6.000 errores por genoma. Las tasas de error necesarios para su uso clínico generalizado, como la medicina predictiva[42]​ se encuentra en la actualidad por más de 1.400 pruebas de secuenciación de genes individuales clínicos[43]​ (por ejemplo, errores en los genes BRCA1 gen de cáncer de mama análisis de riesgos). A partir de agosto de 2013, el X Premio Arconte de Genómica ha sido cancelado.[44]​

2007

En 2007, Applied Biosystems comenzó a vender un nuevo tipo de secuenciador llamado sistema sólido.[45]​ La tecnología permite a los usuarios secuenciar 60 gigabases por ejecución.[46]​

2009

En marzo de 2009, se anunció que Complete Genomics había firmado un acuerdo con el Instituto Broad de secuenciar los genomas del cáncer de los pacientes y de secuenciar genomas completos de cinco de ellos.[47]​ En abril de 2009, Complete Genomics anunció que planeaba secuenciar 1000 genomas completos entre junio de 2009 y el final del año y que planeaban ser capaces de secuenciar genomas completos de un millón por año para el 2013.[48]​

En junio de 2009, Illumina anunció que iban a lanzar su servicio propio de secuenciación de genoma completo a una profundidad de 30x por $ 48.000 por genoma.[49]​[50]​Jay Flatley, Presidente y CEO de Illumina, declaró que "durante los próximos cinco años, quizá más pronto, el precio para la secuenciación del genoma completo caerá de $ 48,000 a menos de $ 1,000."[51]​

En agosto de 2009, el fundador de Helicos Biosciences, Stephen Quake, declaró que, usando la molécula del secuenciador de la compañía, secuenció su propio genoma completo por menos de $ 50.000. Dijo que espera que el costo de secuencias el genoma completo de cada persona disminuya a $ 1.000 en los próximos dos o tres años.[52]​

En agosto de 2009, Pacific Biosciences aseguro un adicional de $ 68 millones en nuevo financiamiento, con lo que su capitalización total de $ 188 millones.[53]​ Pacific Biosciences, dijo que van a utilizar esta inversión adicional con el fin de prepararse para el próximo lanzamiento de su servicio de secuenciación del genoma completo en 2010.[54]​ Complete Genomics seguido de asegurar otros $ 45 millones en una cuarta ronda de fondos de riesgo durante el mismo mes.[55]​Complete Genomics también ha hecho la afirmación de que será secuenciar 10 000 genomas completos a finales de 2010.[56]​

GE Global Research es también parte de esta carrera para comercializar la secuenciación del genoma completo, ya que han estado trabajando en la creación de un servicio que ofrecerá un genoma completo por $ 1,000 o menos.[57]​[58]​

En octubre de 2009, IBM anunció que también estaban en la carrera para proporcionar la secuenciación del genoma completo por menos de $ 1,000, con el objetivo final de poder proporcionar sus servicios de $ 100 USD por genoma.[59]​La tecnología de secuenciación del genoma completo de IBM, que utiliza nanoporos, que se conoce como el "ADN Transistor".[60]​

En noviembre de 2009, Complete Genomics publicó un artículo revisado por pares en la ciencia que demuestra su capacidad para secuenciar un genoma humano completo por $ 1.700. USD[61]​ De ser cierto, esto significaría que el costo de la secuenciación del genoma completo ha bajado de forma exponencial dentro de un solo año a partir de alrededor de $ 100.000 a $ 50.000 y ahora a $ 1.700. Este costo de consumibles se detalla claramente en la Ciencia de papel.[62]​ Sin embargo, Complete Genomics ha publicado previamente declaraciones de que era incapaz de seguir. Por ejemplo, la empresa declaró que lanzaría oficialmente y liberar su servicio durante el "verano de 2009", proporcionará un "$ 5000" servicio de la secuenciación del genoma completo por el "verano de 2009", y "secuencia de 1.000 genomas entre junio de 2009 y el final de 2009 "- todos los cuales, a partir de noviembre de 2009, aún no se han producido.[48]​[63]​[64]​ Complete Genomics lanzó su servicio de secuenciación del genoma humano en I + D en octubre de 2008 y su servicio comercial en mayo de 2010. La compañía secuencio 50 genomas en 2009. Desde entonces, ha aumentado significativamente el rendimiento de su fábrica de la secuenciación del genoma y fue capaz de secuenciar y analizar los genomas de 300 en Q3 2010.

También en noviembre de 2009, Complete Genomics anunció que estaba comenzando un estudio de la secuenciación del genoma humano a gran escala de la enfermedad de Huntington (hasta 100 genomas) con el Instituto de Biología de Sistemas.

2010

En marzo de 2010, los investigadores del Colegio Médico de Wisconsin, anunció el primer uso exitoso de secuenciación de Genoma amplia para cambiar el tratamiento de un paciente.[65]​ Esta historia fue retomada más tarde, por la cual el artículo obtuvo un Pulitzer.[66]​ y la promociona como un significativo logro en la revistaNature[67]​ y por el director de los NIH en congresos.

En junio de 2010, Illumina bajó el costo de su servicio de secuenciación individual a $ 19.500.

2011

Knome ofrece los servicios de la secuenciación del genoma completo (98%) por US $ 39,5 mil para los consumidores, o $ 29,500 para los investigadores (en función de sus necesidades).[68]​[69]​

En mayo de 2011, Illumina redujo su servicio de secuenciación completa del genoma de 5.000 dólares por genoma humano, o $ 4,000 si el pedido es de 50 o más.[70]​ Helicos Biosciences, Pacific Biosciences, Complete Genomics, Illumina, Sequenom, Ion Sistemas torrent, Halcyon Molecular, NABsys, aparece IBM y GE Global a todo ser va cabeza a cabeza en la carrera para la comercialización de la secuenciación del genoma completo.[18]​[58]​

2012

En enero de 2012, Life Technologies presentó un secuenciador para decodificar un genoma humano en un día por 1.000 dólares, aunque estas afirmaciones aún no se han validado por los clientes en los dispositivos comerciales.[71]​ Una empresa del Reino Unido que salió de la Universidad de Oxford ha llegado con una máquina de secuenciación del ADN (the MinION) del tamaño de una memoria USB, que cuesta $ 900 y permite secuenciar genomas más pequeños (pero genomas humanos no completos en la primera versión)[72]​ (Mientras Oxford Nanopore declaró en febrero que iban a atacar con un secuenciador en el acceso temprano comercial a finales de 2012, esto no ocurrió.)

En noviembre de 2012, de Gene Gene, Ltd comenzó a ofrecer la secuenciación del genoma completo a un precio introductorio de $ 5,495 (con un requisito mínimo de 3 muestras por pedido). Actualmente el precio es de 6995 dólares y el requisito mínimo quedó eliminado.[73]​[74]​[75]​

Una serie de publicaciones en 2012 demostró la utilidad de la secuenciación de SMRT de Pacific Biosciences en la generación de secuencias del genoma completo con el conjunto novo.[76]​ Algunas de estas publicaciones informaron sobre tuberías automatizadas que podrían ser utilizados para generar estos conjuntos de todo el genoma.[77]​[78]​Otros trabajos demostraron cómo se podrían utilizar datos de la secuencia PacBio para actualizar los proyectos de genomas para completar genomas.[79]​

2014

Una noticia en febrero de 2014 declaró que Illumina había anunciado "el tan esperado genoma humano por 1000 dólares... por parte de la empresa HiSeq X 10 system."[80]​

Interrupción al mercado de arreglos de ADN

La secuenciación completa del genoma proporciona información sobre un genoma que es varios órdenes de magnitud mayor que la proporcionada por el líder anterior en la tecnología de genotipado, las secuencias de ADN. Para los seres humanos, las secuencias de ADN actualmente proporcionan información genotípica en un máximo de un millón de variantes genéticas,[81]​[82]​[83]​ mientras que la secuenciación del genoma completo proporcionará información sobre los seis mil millones de bases en el genoma humano, o 3.000 veces más de datos. Debido a esto, la secuenciación del genoma completo se considera una innovación disruptiva a los mercados de matriz de ADN como la exactitud en un rango de 99,98% a 99,999% (en regiones de ADN no repetitivas) y su coste de consumibles de $ 5000 por 6 mil millones de pares de bases es competitivo (para algunas aplicaciones) con secuencias de ADN ($ 500 por 1 millón de pares de bases).[32]​ Agilent, otro fabricante de chip de ADN establecida, se trabaja en la dirigida (región selectiva) tecnologías de secuenciación del genoma.[84]​ Se cree que Affymetrix, el pionero de la tecnología de matriz en la década de 1990, ha quedado a la zaga debido a la significativa turbulencia corporativa y de valores y actualmente no está trabajando en algún enfoque de secuenciación del genoma completo conocido.[85]​[86]​[87]​ No se sabe qué va a pasar con el mercado de matriz de ADN una vez que la secuenciación del genoma completo se convierta en un mercado generalizado, especialmente en lo que las empresas y laboratorios que desarrollan esta tecnología de punta para realizar economías de escala. Se postula, sin embargo, que esta nueva tecnología puede disminuir significativamente el tamaño del mercado total para secuencias de ADN y cualquier otra tecnología de secuenciación, una vez que se convierte en un lugar común para los individuos y para los recién nacidos tienen sus genomas completos secuenciados.[88]​

Secuenciación vs análisis

En principio, la secuenciación del genoma completo puede proporcionar datos en bruto sobre los seis mil millones de nucleótidos en el ADN de un individuo. Sin embargo, no proporciona un análisis de lo que significa la información o la forma en que podría ser utilizado en diversas aplicaciones clínicas, como en la medicina para ayudar a prevenir la enfermedad. A partir de 2010 las empresas que están trabajando en la secuenciación del genoma completo proporcionan datos certificados CLIA (Illumina) y servicios de análisis para la interpretación de los datos del genoma completo (knome), con una sola institución que ofrece la secuenciación y el análisis en un entorno clínico.[89]​ Sin embargo, hay mucho espacio para los investigadores o empresas para mejorar este tipo de análisis y hacerlo útil para los médicos y los pacientes.[90]​[91]​[92]​

Uso de diagnóstico y el impacto social

Barato, la secuenciación del genoma completo eficiente será un logro importante no sólo para el campo de la genómica, sino para toda la civilización humana, ya que, por primera vez, las personas podrán tener la totalidad de su genoma secuenciado. Utilizando esta información, se especula que los profesionales de la salud, como los médicos y los asesores genéticos, con el tiempo será capaz de utilizar la información genómica para predecir qué enfermedades puede tener en el futuro una persona y tratar de minimizar el impacto de esta enfermedad o evitar por completo a través de la implementación de diagnósticos personalizados, la medicina preventiva. La secuenciación completa del genoma permitirá a los profesionales de la salud para analizar todo el genoma humano de un individuo y por lo tanto detectar todas las variantes genéticas relacionadas con la enfermedad, independientemente de la prevalencia o frecuencia de la variante genética. Esto permitirá a los campos de la medicina rápidamente emergentes de la medicina predictiva y la medicina personalizada y marcará un importante salto adelante para la revolución genética clínica. La secuenciación completa del genoma es claramente de gran importancia para la investigación sobre la base de las enfermedades genéticas y ha demostrado un beneficio significativo para un subgrupo de individuos con enfermedades poco frecuentes en la práctica clínica.[93]​[94]​[95]​[96]​

El CEO de Illumina, Jay Flatley, declaró en febrero de 2009 que Una lectura completa de ADN para todos los recién nacidos será técnicamente viable y asequible en menos de cinco años, con la promesa de una revolución en el cuidado de la salud y que en 2019 se han convertido en rutina para mapear los genes de los bebés cuando nacen.[97]​ Este uso potencial de la secuenciación del genoma es muy controvertida, ya que va en contra de las normas éticas establecidas para las pruebas genéticas predictivas de los menores asintomáticos que han sido bien establecidas el campo de la genética médica y el asesoramiento genético.[98]​[99]​[100]​[101]​ Las directrices tradicionales para las pruebas genéticas se han desarrollado en el transcurso de varias décadas, ya que primero se hizo posible la prueba de marcadores genéticos asociados con la enfermedad, antes de la llegada de costo eficaz, amplia el cribado genético. Se establece que las normas, como en las ciencias y el campo de la genética, están sujetas a cambios y a evolucionar con el tiempo.[102]​[103]​ Se desconoce si las normas tradicionales practicadas en genética médica hoy en día se verá alterada por nuevos avances tecnológicos tales como la secuenciación del genoma completo.

Actualmente disponible el cribado neonatal de enfermedades de la infancia permite la detección de enfermedades raras que pueden ser prevenidas o tratadas mejor por la detección e intervención temprana. Específicas pruebas genéticas también están disponibles para determinar una etiología cuando los síntomas de un niño parece tener una base genética. La secuenciación del genoma completo, además tiene el potencial de revelar una gran cantidad de información (tale como el estado del portador para trastornos autosómicos recesivos, los factores de riesgo genéticos para complejas enfermedades del adulto, y otra información médica y no médica predictiva) que en la actualidad no es completamente entendido, no puede ser clínicamente útil para el niño durante la infancia, y pueden no necesariamente ser necesitado por el individuo al llegar a la edad adulta.[104]​Además de predecir el riesgo de enfermedades en la infancia, las pruebas genéticas podrían tener otros beneficios (por ejemplo, el descubrimiento de la paternidad), pero también puede tener desventajas potenciales (la discriminación genética, pérdida de anonimato, y los impactos psicológicos).[105]​Muchas de las publicaciones relativas a las directrices éticas para las pruebas genéticas predictivas de los menores asintomáticos, por lo tanto puede tener más que ver con la protección de los menores y la preservación de la del individuo privacidad y autonomía conozcan o no su información genética, que con la tecnología que hace las pruebas posibles a sí mismos.[106]​

Debido a las recientes reducciones de costos (véase más arriba) la secuenciación de todo el genoma se ha convertido en una aplicación realista en el diagnóstico de ADN. En 2013, el consorcio de 3 Gb-TEST obteniendo financiación de la Unión Europea para preparar el sistema de atención de salud para estas innovaciones en el diagnóstico de ADN.[107]​[108]​ de evaluación de calidad, esquemas de evaluación de tecnologías sanitarias y directrices tienen que estar en su lugar. El consorcio de 3 Gb-TEST ha identificado el análisis e interpretación de datos de secuencias como el paso más complicado en el proceso de diagnóstico.[109]​ En la reunión del Consorcio en Atenas en septiembre de 2014, el Consorcio acuñó la palabra genotranslation para este paso crucial. Este paso lleva a una llamada genoreport. Se necesitan directrices para determinar el contenido requerido de estos informes.

Las preocupaciones éticas

La mayoría de los especialistas en ética insisten en que la privacidad de los individuos sometidos a pruebas genéticas debe estar protegido en todas las circunstancias.[110]​ Los datos obtenidos de la secuenciación del genoma no sólo puede revelar una gran cantidad de información sobre la persona que es la fuente de ADN, sino que puede también revelan una gran cantidad de información probabilística sobre la secuencia de ADN de los parientes genéticos más cercanos.[111]​ Por otra parte, los datos obtenidos de la secuenciación del genoma pueden también revelar una gran cantidad de información útil sobre los familiares presentes y futuros riesgos para la salud.[112]​ Esto plantea preguntas importantes acerca de cuáles son las obligaciones, si los hubiera, son propiedad de los miembros de la familia de las personas que se someten a las pruebas genéticas. En nuestra sociedad occidental / europea, los individuos se les anima a realizar la prueba por lo general para compartir información importante sobre el diagnóstico genético con sus parientes cercanos, ya que la importancia del diagnóstico genético de otros parientes cercanos y los hijos suele ser una de las razones para buscar una prueba genética en el primer lugar.[110]​Sin embargo, Sijmons et al. (2011) también mencionan que un dilema ético importante puede desarrollarse cuando los pacientes se niegan a compartir información en un diagnóstico que se hace para el trastorno genético grave que es altamente prevenible y donde existe un alto riesgo para los familiares portadores de la misma mutación de la enfermedad.[111]​ En tales circunstancias, el médico puede sospechar que los familiares prefieren saber del diagnóstico y, por tanto, el clínico puede hacer frente a un conflicto de intereses con respecto a la confidencialidad médico-paciente.[111]​

Otra de las principales preocupaciones de privacidad es la necesidad científica para poner información sobre genotipos y fenotipos de los pacientes en las bases de datos científicos públicos tales como las bases de datos específicas de locus.[111]​ A pesar de los datos del paciente son sólo anónimos se someten a las bases de datos específicas de locus, los pacientes podrían todavía ser identificables por sus familiares en el caso de encontrar una enfermedad rara o una mutación poco frecuente.[111]​

Referencias

  1. Kijk magazine, 01 January 2009
  2. Wellcome Trust Case Control Consortium; Clayton, David G.; Cardon, Lon R.; Craddock, Nick; Deloukas, Panos; Duncanson, Audrey; Kwiatkowski, Dominic P.; McCarthy, Mark I.; Ouwehand, Willem H.; Samani, Nilesh J.; Todd; Donnelly, Peter; Barrett, Jeffrey C.; Burton, Paul R.; Davison, Dan; Donnelly, Peter; Easton, Doug; Evans, David; Leung, Hin-Tak; Marchini, Jonathan L.; Morris; Spencer, Chris C. A.; Tobin, Martin D.; Cardon, Lon R.; Clayton, David G.; Attwood, Antony P.; Boorman, James P.; Cant, Barbara; Everson, Ursula et al. (June 2007). «Genome-wide asociativo testudo fo 14,000 cases fo leven concomo diseases and 3,000 shared controls». Nature 447 (7145): 661-78. Bibcode:2007Natur.447..661B. PMC 2719288. PMID 17554300. doi:10.1038/nature05911. 
  3. Mailman MD, Feolo M, Jin Y, Kimura M, Tryka K, Bagoutdinov R, Hao L, Kiang A, Paschall J, Phan L, Popova N, Pretel S, Ziyabari L, Lee M, Shao Y, Wang ZY, Sirotkin K, Ward M, Kholodov M, Zbicz K, Beck J, Kimelman M, Shevelev S, Preuss D, Yaschenko E, Graeff A, Ostell J, Sherry ST (October 2007). «The NCBI dbGaP database of genotypes and phenotypes». Nat. Genet. 39 (10): 1181-6. PMC 2031016. PMID 17898773. doi:10.1038/ng1007-1181. 
  4. Fareed, M., Afzal, M (2013) "Single nucleotide polymorphism in genome-wide association of human population: A tool for broad spectrum service". Egyptian Journal of Medical Human Genetics 14: 123–134. http://dx.doi.org/10.1016/j.ejmhg.2012.08.001.
  5. Braslavsky, Ido; et al. (2003). «Sequence information can be obtained from single DNA molecules». Proc Natl Acad Sci USA 100 (7): 3960-3984. 
  6. Single-cell Sequencing Makes Strides in the Clinic with Cancer and PGD First Applications from Clinical Sequencing News. By Monica Heger. October 02, 2013
  7. Yurkiewicz, Ilana R.; Korf, Bruce R.; Lehmann, Lisa Soleymani (16 de enero de 2014). «Prenatal whole-genome sequencing--is the quest to know a fetus's future ethical?». The New England Journal of Medicine 370 (3): 195-197. ISSN 1533-4406. PMID 24428465. doi:10.1056/NEJMp1215536. Consultado el 8 de agosto de 2016. 
  8. Roach JC, Glusman G, Smit AF, et al. (April 2010). «Analysis of genetic inheritance in a family quartet by whole-genome sequencing». Science 328 (5978): 636-9. PMC 3037280. PMID 20220176. doi:10.1126/science.1186802. 
  9. Campbell CD, Chong JX, Malig M, et al. (November 2012). «Estimating the human mutation rate using autozygosity in a founder population». Nat. Genet. 44 (11): 1277-81. PMC 3483378. PMID 23001126. doi:10.1038/ng.2418. 
  10. Ye K, Beekman M, Lameijer EW, Zhang Y, Moed MH, van den Akker EB, Deelen J, Houwing-Duistermaat JJ, Kremer D, Anvar SY, Laros JF, Jones D, Raine K, Blackburne B, Potluri S, Long Q, Guryev V, van der Breggen R, Westendorp RG, 't Hoen PA, den Dunnen J, van Ommen GJ, Willemsen G, Pitts SJ, Cox DR, Ning Z, Boomsma DI, Slagboom PE (December 2013). «Aging as accelerated accumulation of somatic variants: whole-genome sequencing of centenarian and middle-aged monozygotic twin pairs». Twin Res Hum Genet 16 (6): 1026-32. PMID 24182360. doi:10.1017/thg.2013.73. 
  11. Keightley PD (February 2012). «Rates and fitness consequences of new mutations in humans». Genetics 190 (2): 295-304. PMC 3276617. PMID 22345605. doi:10.1534/genetics.111.134668. 
  12. Tuna M, Amos CI (November 2013). «Genomic sequencing in cancer». Cancer Lett. 340 (2): 161-70. PMID 23178448. doi:10.1016/j.canlet.2012.11.004. 
  13. Staden R (June 1979). «A strategy of DNA sequencing employing computer programs». Nucleic Acids Res. 6 (7): 2601-10. PMC 327874. PMID 461197. doi:10.1093/nar/6.7.2601. 
  14. Edwards, A; Caskey, T. (1991). «Closure strategies for random DNA sequencing». Methods: A Companion to Methods in Enzymology 3 (1): 41-47. doi:10.1016/S1046-2023(05)80162-8. 
  15. Edwards A, Voss H, Rice P, Civitello A, Stegemann J, Schwager C, Zimmermann J, Erfle H, Caskey CT, Ansorge W (April 1990). «Automated DNA sequencing of the human HPRT locus». Genomics 6 (4): 593-608. PMID 2341149. doi:10.1016/0888-7543(90)90493-E. 
  16. Roach JC, Boysen C, Wang K, Hood L (March 1995). «Pairwise end sequencing: a unified approach to genomic mapping and sequencing». Genomics 26 (2): 345-53. PMID 7601461. doi:10.1016/0888-7543(95)80219-C. 
  17. Fleischmann RD, Adams MD, White O, Clayton RA, Kirkness EF, Kerlavage AR, Bult CJ, Tomb JF, Dougherty BA, Merrick JM; Adams; White; Clayton; Kirkness; Kerlavage; Bult; Tomb; Dougherty; Merrick; McKenney; Sutton; Fitzhugh; Fields; Gocyne; Scott; Shirley; Liu; Glodek; Kelley; Weidman; Phillips; Spriggs; Hedblom; Cotton; Utterback; Hanna; Nguyen; Saudek et al. (July 1995). «Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd». Science 269 (5223): 496-512. Bibcode:1995Sci...269..496F. PMID 7542800. doi:10.1126/science.7542800. 
  18. ↑ Mukhopadhyay R (February 2009). «DNA sequencers: the next generation». Anal. Chem. 81 (5): 1736-40. PMID 19193124. doi:10.1021/ac802712u. 
  19. . Nanotechwire. 5 de agosto de 2008. Archivado desde el original el 14 de julio de 2011. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  20. . Reuters. 12 de enero de 2009. Archivado desde el original el 9 de septiembre de 2009. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  21. [1]Uso incorrecto de la plantilla enlace roto (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
  22. . Pacific Biosciences. Archivado desde el original el 24 de febrero de 2009. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  23. . Complete Genomics. 2009. Archivado desde el original el 27 de marzo de 2009. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  24. Ronaghi M, Uhlén M, Nyrén P (July 1998). «A sequencing method based on real-time pyrophosphate». Science 281 (5375): 363, 365. PMID 9705713. doi:10.1126/science.281.5375.363. 
  25. Ronaghi M, Karamohamed S, Pettersson B, Uhlén M, Nyrén P (November 1996). «Real-time DNA sequencing using detection of pyrophosphate release». Anal. Biochem. 242 (1): 84-9. PMID 8923969. doi:10.1006/abio.1996.0432. 
  26. Nyrén P (2007). «The history of pyrosequencing». Methods Mol. Biol. 373: 1-14. ISBN 1-59745-377-3. PMID 17185753. doi:10.1385/1-59745-377-3:1. 
  27. . Archivado desde el original el 31 de marzo de 2012. Consultado el 5 de noviembre de 2014. 
  28. «Article : Race to Cut Whole Genome Sequencing Costs Genetic Engineering & Biotechnology News — Biotechnology from Bench to Business». Genengnews.com. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  29. . Eyeondna.com. Archivado desde el original el 25 de marzo de 2009. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  30. Harmon, Katherine (28 de junio de 2010). «Genome Sequencing for the Rest of Us». Scientific American. Consultado el 13 de agosto de 2010. 
  31. San Diego/Orange County Technology News. . Freshnews.com. Archivado desde el original el 5 de diciembre de 2008. Consultado el 24 de febrero de 2009. 
  32. ↑ «Article : Whole Genome Sequencing in 24 Hours Genetic Engineering & Biotechnology News — Biotechnology from Bench to Business». Genengnews.com. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  33. «Pacific Bio lifts the veil on its high-speed genome-sequencing effort». VentureBeat. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  34. «Bio-IT World». Bio-IT World. 6 de octubre de 2008. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  35. «With New Machine, Helicos Brings Personal Genome Sequencing A Step Closer». Xconomy. 22 de abril de 2008. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  36. . Nextbigfuture.com. 25 de marzo de 2008. Archivado desde el original el 20 de diciembre de 2010. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  37. «Han Cao's nanofluidic chip could cut DNA sequencing costs dramatically». Technology Review.  (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
  38. John Carroll (14 de julio de 2008). «Pacific Biosciences gains $100M for sequencing tech». FierceBiotech. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  39. Sibley, Lisa (8 de febrero de 2009). «Complete Genomics brings radical reduction in cost». Silicon Valley / San Jose Business Journal (Sanjose.bizjournals.com). Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  40. Carlson, Rob (2 de enero de 2007). . Synthesis.cc. Archivado desde el original el 8 de agosto de 2009. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  41. "PRIZE Overview: Archon X PRIZE for Genomics".
  42. Bentley DR (December 2006). «Whole-genome re-sequencing». Curr. Opin. Genet. Dev. 16 (6): 545-552. PMID 17055251. doi:10.1016/j.gde.2006.10.009. 
  43. «GeneTests.org». 
  44. Diamandis, Peter. «Outpaced by Innovation: Canceling an XPRIZE». Huffington Post. 
  45. «SOLiD System — a next-gen DNA sequencing platform announced». Gizmag.com. 27 de octubre de 2007. Consultado el 24 de febrero de 2009. 
  46. . Dddmag.com. 1 de abril de 2010. Archivado desde el original el 15 de abril de 2011. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  47. «Complete Genomics, Broad Institute Forge Cancer Sequencing Collaboration». Bio-IT World. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  48. ↑ Walsh, Fergus (8 de abril de 2009). «Era of personalised medicine awaits». BBC News. Consultado el 3 de mayo de 2010. 
  49. . Everygenome.com. Archivado desde el original el 19 de octubre de 2011. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  50. . Scienceblogs.com. Archivado desde el original el 6 de junio de 2011. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  51. «Illumina demos concept iPhone app for genetic data sharing». mobihealthnews. 10 de junio de 2009. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  52. Wade, Nicholas (11 de agosto de 2009). «Cost of Decoding a Genome Is Lowered». The New York Times. Consultado el 3 de mayo de 2010. 
  53. Camille Ricketts (13 de agosto de 2009). «Pacific Biosciences takes $68M as genome sequencing becomes more competitive». VentureBeat. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  54. «Pacific Biosciences Raises Additional $68 Million in Financing». FierceBiotech. 12 de agosto de 2009. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  55. «Silicon Valley startup Complete Genomics promises low-cost DNA sequencing». San Jose Mercury News. Mercurynews.com. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  56. . Istockanalyst.com. 24 de agosto de 2009. Archivado desde el original el 27 de octubre de 2011. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  57. Jacquin Niles. . GenomeWeb. Archivado desde el original el 16 de julio de 2011. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  58. ↑ «NHGRI Awards More than $50M for Low-Cost DNA Sequencing Tech Development». Genome Web. 2009. 
  59. JOHN MARKOFF (5 de octubre de 2009). «I.B.M. Joins Pursuit of $1,000 Personal Genome». The Newyork Times. Consultado el 15 de mayo de 2013. 
  60. Shankland, Stephen (6 de octubre de 2009). «IBM Research jumps into genetic sequencing | Deep Tech». CNET News. News.cnet.com. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  61. «Copia archivada». Archivado desde el original el 16 de enero de 2015. Consultado el 6 de noviembre de 2009. 
  62. Drmanac R, Sparks AB, Callow MJ et al: Human genome sequencing using unchained base reads on self-assembling DNA nanoarrays" Science 327(5961), 78-81 (2010)
  63. . Scienceblogs.com. Archivado desde el original el 6 de junio de 2011. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  64. «Five Thousand Bucks for Your Genome». Technology Review. 20 de octubre de 2008. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  65. http://journals.lww.com/geneticsinmedicine/Abstract/2011/03000/Making_a_definitive_diagnosis__Successful_clinical.15.aspx
  66. «One In A Billion: A boy's life, a medical mystery». 
  67. «US clinics quietly embrace whole-genome sequencing». 
  68. Herper, Matthew (3 de junio de 2010). «Your Genome is Coming». Forbes. Consultado el 13 de agosto de 2010. 
  69. Lauerman, John (5 de febrero de 2009). «Complete Genomics Drives Down Cost of Genome Sequence to $5,000». Bloomberg.com. Consultado el 28 de enero de 2011. 
  70. «Illumina Announces $5,000 Genome Pricing». 
  73. «Products». dnadtc.com. Consultado el 28 de noviembre de 2012. 
  74. «Gene By Gene Launches DNA DTC». The Wall Street Journal. 29 de noviembre de 2012. Consultado el 29 de noviembre de 2012. 
  75. Vorhaus, Dan (29 de noviembre de 2012). «DNA DTC: The Return of Direct to Consumer Whole Genome Sequencing». genomicslawreport.com. Consultado el 30 de noviembre de 2012. 
  76. «Finished bacterial genomes from shotgun sequence data». 
  77. Koren, Sergey (July 2012). «Hybrid error correction and de novo assembly of single-molecule sequencing reads». NatureBiotechnology 30: 693. doi:10.1038/nbt.2280. 
  78. A Klammer, Aaron (July 2012). «A hybrid approach for the automated finishing of bacterial genomes». NatureBiotechnology 30 (7). Consultado el 1 de julio de 2012. 
  79. «Mind the Gap:Upgrading Genomes with Pacific Biosciences RS Long-Read Sequencing Technology». 
  80. «Illumina Sequencer Enables $1,000 Genome». News: Genomics & Proteomics. Gen. Eng. Biotechnol. News (paper) 34 (4). 15 de febrero de 2014. p. 18. 
  81. . Gladstone.ucsf.edu. Archivado desde el original el 30 de junio de 2010. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  82. Nishida N, Koike A, Tajima A, Ogasawara Y, Ishibashi Y, Uehara Y, Inoue I, Tokunaga K (2008). «Evaluating the performance of Affymetrix SNP Array 6.0 platform with 400 Japanese individuals». BMC Genomics 9 (1): 431. PMC 2566316. PMID 18803882. doi:10.1186/1471-2164-9-431. 
  83. Petrone, Justin. «Illumina, DeCode Build 1M SNP Chip; Q2 Launch to Coincide with Release of Affy's 6.0 SNP Array | BioArray News | Arrays». GenomeWeb. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  84. . Archivado desde el original el 25 de diciembre de 2008. Consultado el 5 de noviembre de 2014. |http://www.genomeweb.com/arrays/illumina-decode-build-1m-snp-chip-q2-launch-coincide-release-affys-60-snp-array}}
  85. «Affymetrix stock slumps 30% on forecast». Sacramento Business Journal (Sacramento.bizjournals.com). 25 de julio de 2008. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  86. Bluis, John (24 de abril de 2006). «Affymetrix Gets Chipped Again». Fool.com. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  87. «The chips are down». Nature 444 (7117): 256-7. November 2006. Bibcode:2006Natur.444..256.. PMID 17108930. doi:10.1038/444256a. 
  88. Coombs A (October 2008). «The sequencing shakeup». Nat. Biotechnol. 26 (10): 1109-12. PMID 18846083. doi:10.1038/nbt1008-1109. 
  89. «Following Diagnostic Sequencing Success, MCW Creates Comprehensive Framework to Guide Future Cases». 
  90. The Wall Street Journal http://online.wsj.com/public/page/0_0_WP_3001.html?currentPlayingLocation=82&currentlyPlayingCollection=Small%20Business&currentlyPlayingVideoId={CF4393A6-F71C-4FE2-A2F5-73271E1CA8E7} |url= sin título (ayuda). 
  91. Ashley EA, Butte AJ, Wheeler MT, Chen R, Klein TE, Dewey FE, Dudley JT, Ormond KE, Pavlovic A, Morgan AA, Pushkarev D, Neff NF, Hudgins L, Gong L, Hodges LM, Berlin DS, Thorn CF, Sangkuhl K, Hebert JM, Woon M, Sagreiya H, Whaley R, Knowles JW, Chou MF, Thakuria JV, Rosenbaum AM, Zaranek AW, Church GM, Greely HT, Quake SR, Altman RB. (May 2010). «Clinical assessment incorporating a personal genome». Lancet 375 (9725): 1525-35. PMC 2937184. PMID 20435227. doi:10.1016/S0140-6736(10)60452-7. 
  92. «Genomes, Environments, Traits (GET) Evidence». 
  93. Ng SB, Buckingham KJ, Lee C, et al. (January 2010). «Exome sequencing identifies the cause of a mendelian disorder». Nat. Genet. 42 (1): 30-5. PMC 2847889. PMID 19915526. doi:10.1038/ng.499. 
  94. Hannibal MC, Buckingham KJ, Ng SB, et al. (July 2011). «Spectrum of MLL2 (ALR) mutations in 110 cases of Kabuki syndrome». Am. J. Med. Genet. A. 155A (7): 1511-6. PMC 3121928. PMID 21671394. doi:10.1002/ajmg.a.34074. 
  95. Worthey EA, Mayer AN, Syverson GD, et al. (March 2011). . Genet. Med. 13 (3): 255-62. PMID 21173700. doi:10.1097/GIM.0b013e3182088158. Archivado desde el original el 27 de enero de 2016. Consultado el 5 de noviembre de 2014. 
  96. Goh V, Helbling D, Biank V, Jarzembowski J, Dimmock D (June 2011). «Next Generation Sequencing Facilitates The Diagnosis In A Child With Twinkle Mutations Causing Cholestatic Liver Failure». J Pediatr Gastroenterol Nutr 54 (2): 291-4. PMID 21681116. doi:10.1097/MPG.0b013e318227e53c. 
  97. Henderson, Mark (9 de febrero de 2009). «Genetic mapping of babies by 2019 will transform preventive medicine». London: Times Online. Consultado el 23 de febrero de 2009. 
  98. McCabe LL, McCabe ER (June 2001). «Postgenomic medicine. Presymptomatic testing for prediction and prevention». Clin Perinatol 28 (2): 425-34. PMID 11499063. doi:10.1016/S0095-5108(05)70094-4. 
  99. Nelson RM, Botkjin JR, Kodish ED, et al. (June 2001). «Ethical issues with genetic testing in pediatrics». Pediatrics 107 (6): 1451-5. PMID 11389275. doi:10.1542/peds.107.6.1451. 
  100. Borry P, Fryns JP, Schotsmans P, Dierickx K (February 2006). «Carrier testing in minors: a systematic review of guidelines and position papers». Eur. J. Hum. Genet. 14 (2): 133-8. PMID 16267502. doi:10.1038/sj.ejhg.5201509. 
  101. Borry P, Stultiens L, Nys H, Cassiman JJ, Dierickx K (November 2006). «Presymptomatic and predictive genetic testing in minors: a systematic review of guidelines and position papers». Clin. Genet. 70 (5): 374-81. PMID 17026616. doi:10.1111/j.1399-0004.2006.00692.x. 
  102. Mesoudi A, Danielson P (August 2008). «Ethics, evolution and culture». Theory Biosci. 127 (3): 229-40. PMID 18357481. doi:10.1007/s12064-008-0027-y. 
  103. Ehrlich PR, Levin SA (June 2005). «The evolution of norms». PLoS Biol. 3 (6): e194. PMC 1149491. PMID 15941355. doi:10.1371/journal.pbio.0030194. 
  104. Mayer AN, Dimmock DP, Arca MJ, et al. (March 2011). «A timely arrival for genomic medicine». Genet. Med. 13 (3): 195-6. PMID 21169843. doi:10.1097/GIM.0b013e3182095089. 
  105. De Cristofaro, E. (2012). «Whole Genome Sequencing: Innovation Dream or Privacy Nightmare?». ArXiv Repository 1210: 4820. Bibcode:2012arXiv1210.4820D. arXiv:1210.4820. 
  106. Borry, P.; Evers-Kiebooms, G.; Cornel, MC; Clarke, A; Dierickx, K; Public Professional Policy Committee (PPPC) of the European Society of Human Genetics (ESHG) (2009). «Genetic testing in asymptomatic minors Background considerations towards ESHG Recommendations». Eur J Hum Genet 17 (6): 711-9. PMC 2947094. PMID 19277061. doi:10.1038/ejhg.2009.25. 
  107. http://cordis.europa.eu/project/rcn/109460_en.html. 
  108. Beyond public health genomics: proposals from an international working group. PMID 25168910. 
  109. http://rd-connect.eu/?wysija-page=1&controller=email&action=view&email_id=13&wysijap=subscriptions. 
  110. ↑ Sijmons, R.H; Van Langen, I.M (2011). «A clinical perspective on ethical issues in genetic issues». Accountability in Research: Policies and Quality Assurance 18 (3): 148-162. doi:10.1080/08989621.2011.575033. 
  111. ↑ Sijmons, R.H.; Van Langen, I.M, (2011). «A clinical perspective on ethical issues in genetic testing». Accountability in Research: Policies and Quality Assurance 18 (3): 148-162. doi:10.1080/08989621.2011.575033. 
  112. McGuire, Amy, L; Caulfield, Timothy (2008). «Science and Society: Research ethics and the challenge of whole-genome sequencing». Nature Reviews: Genetics 9 (2): 152-156. doi:10.1038/nrg2302. 

Enlaces externos

  • Archon X Prize for Genomics
  • Outsmart Your Genes: Book that discusses full genome sequencing and its impact upon health care and society
  •   Datos: Q2068526

Agosto 24, 2021
secuenciación, genoma, para, secuenciación, véase, secuenciación, secuenciación, genoma, varios, procesos, laboratorio, determina, secuencia, completa, genoma, organismo, proceso, único, esto, supone, secuenciación, todos, cromosomas, organismo, así, como, con. Para la secuenciacion del ADN vease Secuenciacion del ADN La secuenciacion del genoma es uno o varios procesos de laboratorio que determina la la secuencia completa de ADN en el genoma de un organismo en un proceso unico Esto supone la secuenciacion de todos los cromosomas de un organismo con ADN asi como el contenido en el de mitocondrias y para las plantas en cloroplastos Imagen de los 23 pares de cromosomas de cuerpo humano La secuenciacion del genoma entero no debe confundirse con el analisis de ADN que solo determina la probabilidad de que el material genetico proviene de un individuo o grupo en particular y no contiene informacion adicional sobre las relaciones geneticas origen o susceptibilidad a enfermedades especificas 1 Tambien a diferencia de la consecuencia del genoma completo el genotipo SOPAN cubre menos del 0 1 del genoma Casi todos los genomas completos son exclusivamente de los microbios el termino genoma completo asi se utiliza libremente para significar mas del 97 El resto de este articulo se centra en los genomas humanos casi completos En general conocer la secuenciacion completa de ADN del genoma de un individuo no proporciona por si sola informacion clinica util pero esto puede cambiar con el tiempo ya que un gran numero de estudios cientificos continuan siendo publicados detallando asociaciones claras entre variantes geneticas especificas y las enfermedades 2 3 La herramienta de secuenciacion de genes en el nivel SNP permite a los cientificos identificar variantes funcionales de los estudios de asociacion y mejorar el conocimiento a disposicion de los investigadores interesados en la biologia evolutiva y por lo tanto pueden sentar las bases para predecir la susceptibilidad a la enfermedad y la respuesta a los farmacos 4 Ademas al alinear los genomas secuenciados se pueden obtener las mutaciones somaticas producidas como las sustituciones de bases Indice 1 Las celulas utilizadas para la secuenciacion 2 Frecuencias de mutacion en los canceres 3 Las primeras tecnicas 4 Las tecnicas actuales 5 Comercializacion 5 1 Incentivo 5 2 2007 5 3 2009 5 4 2010 5 5 2011 5 6 2012 5 7 2014 6 Interrupcion al mercado de arreglos de ADN 7 Secuenciacion vs analisis 8 Uso de diagnostico y el impacto social 9 Las preocupaciones eticas 10 Referencias 11 Enlaces externosLas celulas utilizadas para la secuenciacion EditarCasi cualquier muestra biologica que contenga una copia completa del ADN incluso una cantidad muy pequena de ADN o ADN antiguo puede proporcionar el material genetico necesario para la secuenciacion del genoma completo Dichas muestras pueden incluir saliva celulas epiteliales la medula osea foliculos pilosos pues el cabello no contiene ADN al estar constituido enteramente por queratina semillas hojas de las plantas o cualquier otra cosa que tenga celulas que contengan ADN La secuencia del genoma en una sola celula seleccionada de una poblacion mixta de celulas se puede determinar usando tecnicas de secuenciacion de genoma de la celula unica Esto tiene ventajas importantes en microbiologia ambiental en los casos en que una sola celula de una especie de microorganismo particular puede ser aislado de una poblacion mixta por microscopia sobre la base de sus caracteristicas morfologicas distintivas u otros En tales casos las medidas normalmente necesarias de aislamiento y el crecimiento del organismo en cultivo pueden ser omitidas permitiendo asi la secuenciacion de un espectro mucho mayor de genomas de organismos 5 La secuenciacion del genoma de celulas individuales esta siendo probado como un metodo de diagnostico genetico de preimplantacion en el que una celula de embrion creada por la fertilizacion in vitro es tomada y analizada antes de la transferencia de embriones en el utero 6 Despues de la implantacion el ADN fetal libre de celulas puede ser tomado por una sencilla venopuncion de la madre y se utiliza para la secuenciacion del genoma del feto 7 Frecuencias de mutacion en los canceres EditarLa secuenciacion del genoma entero ha establecido la frecuencia de mutacion de los genomas humanos completos La frecuencia de mutaciones en el genoma entre generaciones de seres humanos de padres a hijos es de alrededor de 70 nuevas mutaciones por generacion 8 9 Se encontro un nivel aun mas bajo de variacion comparando la secuenciacion del genoma completo de las celulas sanguineas de un par de gemelos monocigoticos gemelos identicos de 100 anos de edad 10 Solo se encontraron 8 diferencias somaticas aunque la variacion somatica que ocurre en menos del 20 de las celulas de la sangre se detecta En la proteina especificamente las regiones del genoma humano de codificacion se estima que hay alrededor de 0 35 mutaciones que cambiarian la secuencia de la proteina entre generaciones padre hijo al menos de una proteina mutada por generacion 11 Tipos de cancer sin embargo tienen frecuencias de mutacion mucho mas altas La frecuencia particular depende del tipo de tejido si existe una deficiencia de reparacion del ADN un desajuste y la exposicion a agentes que danan el ADN tales como irradiacion UV o de los componentes del humo del tabaco Atun y Amos han resumido las frecuencias de mutacion por megabase Mb 12 como se muestra en la tabla junto con las frecuencias indicadas de mutaciones por genoma Las altas frecuencias de mutacion en el cancer reflejan la inestabilidad del genoma Lo cual es caracteristico de los canceres Frecuencias de mutacion Tipo de celula La frecuencia de mutacion Mb Mb La frecuencia de mutacion por genoma diploideLa linea germinal 0 023 70Meduloblastoma 0 15 0 6 900 3 600Leucemia linfocitica aguda 0 3 1 800Leucemia linfocitica cronica lt 1 lt 6 000Cancer de prostata 0 9 5 400Mieloma multiple 2 9 17 400Carcinoma colorrectal 5 30 000Estable de microsatelites MSS 2 8 16 800Microsatelites inestable MSI 47 282 000Carcinoma hepatocelular 4 2 25 200Cancer de mama 1 18 1 66 7 080 9 960Cancer de pulmon 17 7 106 200Cancer de pulmon de celulas pequenas 7 4 44 400Cancer de pulmon en celulas los fumadores 10 5 63 000Cancer de pulmon de celulas no pequenas los no fumadores 0 6 3 600Adenocarcinoma de pulmon los fumadores 9 8 58 500Adenocarcinoma de pulmon los no fumadores 1 7 10 200Melanoma 30 180 000Irradiacion UV melanoma cronico inducido 111 666 000Melanoma no inducido por irradiacion UV en piel sin pelo de las extremidades 3 14 18 000 84 000Melanoma inducido por UV en piel con cabello 5 55 30 000 330 000Las primeras tecnicas Editar Un ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer Tales secuenciadores capilares automatizados son los primeros esfuerzos de secuenciacion de genomas La secuenciacion de casi la totalidad de un genoma humano se llevo a cabo por primera vez en 2000 en parte mediante el uso de la secuenciacion escopeta Mientras la secuencia completa del genoma escopeta para los pequenos 4000 7000 pares de bases genomas ya estaba en uso en 1979 13 una aplicacion mas amplia se beneficio de la secuencia final por parejas conocido coloquialmente como secuenciacion de doble canon de escopeta Como proyectos de secuenciacion comenzaron a asumir mas y mas complicados genomas varios grupos comenzaron a darse cuenta de que la informacion util se puede obtener mediante la secuenciacion de los dos extremos de un fragmento de ADN Aunque realizar la secuenciacion de ambos extremos del misma fragmento y hacer el seguimiento de los datos emparejados era mas engorroso que la secuenciacion de un solo extremo de dos fragmentos distintos el conocimiento de que las dos secuencias se orientan en direcciones opuestas y a punto de la longitud de un fragmento era valiosa en la reconstruccion de la secuencia del fragmento objetivo original La primera descripcion publicada de la utilizacion de extremos emparejados fue en 1990 como parte de la secuencia humana de la HPRT locus 14 aunque el uso de extremos emparejados se limito a cerrar las brechas despues de la aplicacion de un enfoque tradicional de secuenciacion escopeta La primera descripcion teorica de una estrategia de secuenciacion final emparejada suponiendo fragmentos de longitud constante fue en 1991 15 En 1995 Roach et al introdujo la innovacion de utilizar fragmentos de distintos tamanos 16 y ha demostrado que una estrategia de secuenciacion por pares puros seria posible en objetivos grandes La estrategia fue adoptada posteriormente por el Instituto de Investigacion Genomica TIGR para secuenciar el genoma completo de la bacteria Haemophilus influenzae en 1995 17 y luego por Celera Genomics para secuenciar todo el genoma de la mosca de fruta en 2000 18 y posteriormente todo el genoma humano Applied Biosystems que ahora se llama Life Technologies fabricado los secuenciadores capilares automatizados utilizados tanto por Celera Genomics y el Proyecto Genoma Humano Si bien la secuenciacion capilar fue el primer enfoque para secuenciar con exito un genoma humano casi completo todavia es demasiado caro y lleva mucho tiempo para fines comerciales Debido a esto la tecnologia de secuenciacion escopeta a pesar de que todavia es relativamente nueva desde el ano 2005 esta siendo desplazada por tecnologias como la pirosecuenciacion secuenciacion SMRT y tecnologia nanoporo 18 Debido a que la secuencia de datos que se produce puede ser bastante grande por ejemplo existen aproximadamente seis mil millones de pares de bases en cada genoma diploide humana los datos del genoma se almacenan electronicamente y requieren una gran potencia de calculo y capacidad de almacenamiento La secuenciacion completa del genoma hubiera sido casi imposible antes de la llegada de los microprocesadores los ordenadores y la era de la informacion Las tecnicas actuales EditarUna forma posible de lograr una secuenciacion rentable y de alto rendimiento necesario para llevar a cabo la secuenciacion del genoma completo es mediante el uso de tecnologia de nanoporos que es una tecnologia patentada por la Universidad de Harvard y Oxford Nanopore Tecnologias con licencia para las empresas de biotecnologia 19 Para facilitar su iniciativas de secuenciacion del genoma completo Illumina tecnologia de secuenciacion de nanoporos con licencia de Oxford Tecnologias Nanopore y Sequenom licencia la tecnologia de la Universidad de Harvard 20 21 Otra forma posible de lograr secuenciacion de alto rendimiento es mediante la utilizacion de fluoroforo Pacific Biosciences esta utilizando actualmente este enfoque en su tecnologia de secuenciacion de ADN SMRT siglas en ingles para molecula unica en tiempo real 22 Complete Genomics ha desarrollado la tecnologia ADN Nanoball DNB que organiza el ADN en arreglos de autoensamblaje 23 Pirosecuenciacion es un metodo de secuenciacion de ADN basado en la secuenciacion por principio de sintesis La tecnica fue desarrollada por Pal Nyren y su estudiante Mostafa Ronaghi en el Instituto Real de Tecnologia en Estocolmo en 1996 24 25 26 y en la actualidad esta siendo utilizado por 454 Life Sciences como base para una plataforma de secuenciacion del genoma completo 27 Comercializacion Editar Coste total de la secuenciacion de un genoma humano calculado por elNHGRI Un numero de empresas publicas y privadas estan compitiendo para desarrollar una plataforma de secuenciacion del genoma completo que sea comercialmente solida tanto para la investigacion y uso clinico 28 incluyendo Illumina 29 Knome 30 Sequenom 31 454 Life Sciences 32 Pacific Biosciences 33 Complete Genomics 34 Helicos Biosciences 35 GE Global Research General Electric Affymetrix IBM Intelligent Bio Systems 36 Life Technologies y Oxford Nanopore Technologies 37 Estas empresas estan fuertemente financiadas y respaldadas por los capitalistas de riesgo fondos de cobertura y bancos de inversion 38 39 Incentivo Editar En octubre de 2006 la Fundacion X Prize que trabaja en colaboracion con la Fundacion J Craig Venter Science establecio el X Premio Arconte de Genomica 40 con la intencion de otorgar US 10 millones para el primer equipo que logre construir un dispositivo y usarlo para secuenciar 100 genomas humanos dentro de 10 dias o menos con una precision de no mas de un error en cada millon de bases secuenciadas con secuencias que cubran con precision al menos el 98 del genoma y con un costo recurrente de no mas de 1 000 dolares por genoma 41 Una tasa de error de 1 en 1 000 000 bases de un total de aproximadamente seis mil millones de bases en el genoma diploide humana significaria unos 6 000 errores por genoma Las tasas de error necesarios para su uso clinico generalizado como la medicina predictiva 42 se encuentra en la actualidad por mas de 1 400 pruebas de secuenciacion de genes individuales clinicos 43 por ejemplo errores en los genes BRCA1 gen de cancer de mama analisis de riesgos A partir de agosto de 2013 el X Premio Arconte de Genomica ha sido cancelado 44 2007 Editar En 2007 Applied Biosystems comenzo a vender un nuevo tipo de secuenciador llamado sistema solido 45 La tecnologia permite a los usuarios secuenciar 60 gigabases por ejecucion 46 2009 Editar En marzo de 2009 se anuncio que Complete Genomics habia firmado un acuerdo con el Instituto Broad de secuenciar los genomas del cancer de los pacientes y de secuenciar genomas completos de cinco de ellos 47 En abril de 2009 Complete Genomics anuncio que planeaba secuenciar 1000 genomas completos entre junio de 2009 y el final del ano y que planeaban ser capaces de secuenciar genomas completos de un millon por ano para el 2013 48 En junio de 2009 Illumina anuncio que iban a lanzar su servicio propio de secuenciacion de genoma completo a una profundidad de 30x por 48 000 por genoma 49 50 Jay Flatley Presidente y CEO de Illumina declaro que durante los proximos cinco anos quiza mas pronto el precio para la secuenciacion del genoma completo caera de 48 000 a menos de 1 000 51 En agosto de 2009 el fundador de Helicos Biosciences Stephen Quake declaro que usando la molecula del secuenciador de la compania secuencio su propio genoma completo por menos de 50 000 Dijo que espera que el costo de secuencias el genoma completo de cada persona disminuya a 1 000 en los proximos dos o tres anos 52 En agosto de 2009 Pacific Biosciences aseguro un adicional de 68 millones en nuevo financiamiento con lo que su capitalizacion total de 188 millones 53 Pacific Biosciences dijo que van a utilizar esta inversion adicional con el fin de prepararse para el proximo lanzamiento de su servicio de secuenciacion del genoma completo en 2010 54 Complete Genomics seguido de asegurar otros 45 millones en una cuarta ronda de fondos de riesgo durante el mismo mes 55 Complete Genomics tambien ha hecho la afirmacion de que sera secuenciar 10 000 genomas completos a finales de 2010 56 GE Global Research es tambien parte de esta carrera para comercializar la secuenciacion del genoma completo ya que han estado trabajando en la creacion de un servicio que ofrecera un genoma completo por 1 000 o menos 57 58 En octubre de 2009 IBM anuncio que tambien estaban en la carrera para proporcionar la secuenciacion del genoma completo por menos de 1 000 con el objetivo final de poder proporcionar sus servicios de 100 USD por genoma 59 La tecnologia de secuenciacion del genoma completo de IBM que utiliza nanoporos que se conoce como el ADN Transistor 60 En noviembre de 2009 Complete Genomics publico un articulo revisado por pares en la ciencia que demuestra su capacidad para secuenciar un genoma humano completo por 1 700 USD 61 De ser cierto esto significaria que el costo de la secuenciacion del genoma completo ha bajado de forma exponencial dentro de un solo ano a partir de alrededor de 100 000 a 50 000 y ahora a 1 700 Este costo de consumibles se detalla claramente en la Ciencia de papel 62 Sin embargo Complete Genomics ha publicado previamente declaraciones de que era incapaz de seguir Por ejemplo la empresa declaro que lanzaria oficialmente y liberar su servicio durante el verano de 2009 proporcionara un 5000 servicio de la secuenciacion del genoma completo por el verano de 2009 y secuencia de 1 000 genomas entre junio de 2009 y el final de 2009 todos los cuales a partir de noviembre de 2009 aun no se han producido 48 63 64 Complete Genomics lanzo su servicio de secuenciacion del genoma humano en I D en octubre de 2008 y su servicio comercial en mayo de 2010 La compania secuencio 50 genomas en 2009 Desde entonces ha aumentado significativamente el rendimiento de su fabrica de la secuenciacion del genoma y fue capaz de secuenciar y analizar los genomas de 300 en Q3 2010 Tambien en noviembre de 2009 Complete Genomics anuncio que estaba comenzando un estudio de la secuenciacion del genoma humano a gran escala de la enfermedad de Huntington hasta 100 genomas con el Instituto de Biologia de Sistemas 2010 Editar En marzo de 2010 los investigadores del Colegio Medico de Wisconsin anuncio el primer uso exitoso de secuenciacion de Genoma amplia para cambiar el tratamiento de un paciente 65 Esta historia fue retomada mas tarde por la cual el articulo obtuvo un Pulitzer 66 y la promociona como un significativo logro en la revistaNature 67 y por el director de los NIH en congresos En junio de 2010 Illumina bajo el costo de su servicio de secuenciacion individual a 19 500 2011 Editar Knome ofrece los servicios de la secuenciacion del genoma completo 98 por US 39 5 mil para los consumidores o 29 500 para los investigadores en funcion de sus necesidades 68 69 En mayo de 2011 Illumina redujo su servicio de secuenciacion completa del genoma de 5 000 dolares por genoma humano o 4 000 si el pedido es de 50 o mas 70 Helicos Biosciences Pacific Biosciences Complete Genomics Illumina Sequenom Ion Sistemas torrent Halcyon Molecular NABsys aparece IBM y GE Global a todo ser va cabeza a cabeza en la carrera para la comercializacion de la secuenciacion del genoma completo 18 58 2012 Editar En enero de 2012 Life Technologies presento un secuenciador para decodificar un genoma humano en un dia por 1 000 dolares aunque estas afirmaciones aun no se han validado por los clientes en los dispositivos comerciales 71 Una empresa del Reino Unido que salio de la Universidad de Oxford ha llegado con una maquina de secuenciacion del ADN the MinION del tamano de una memoria USB que cuesta 900 y permite secuenciar genomas mas pequenos pero genomas humanos no completos en la primera version 72 Mientras Oxford Nanopore declaro en febrero que iban a atacar con un secuenciador en el acceso temprano comercial a finales de 2012 esto no ocurrio En noviembre de 2012 de Gene Gene Ltd comenzo a ofrecer la secuenciacion del genoma completo a un precio introductorio de 5 495 con un requisito minimo de 3 muestras por pedido Actualmente el precio es de 6995 dolares y el requisito minimo quedo eliminado 73 74 75 Una serie de publicaciones en 2012 demostro la utilidad de la secuenciacion de SMRT de Pacific Biosciences en la generacion de secuencias del genoma completo con el conjunto novo 76 Algunas de estas publicaciones informaron sobre tuberias automatizadas que podrian ser utilizados para generar estos conjuntos de todo el genoma 77 78 Otros trabajos demostraron como se podrian utilizar datos de la secuencia PacBio para actualizar los proyectos de genomas para completar genomas 79 2014 Editar Una noticia en febrero de 2014 declaro que Illumina habia anunciado el tan esperado genoma humano por 1000 dolares por parte de la empresa HiSeq X 10 system 80 Interrupcion al mercado de arreglos de ADN EditarLa secuenciacion completa del genoma proporciona informacion sobre un genoma que es varios ordenes de magnitud mayor que la proporcionada por el lider anterior en la tecnologia de genotipado las secuencias de ADN Para los seres humanos las secuencias de ADN actualmente proporcionan informacion genotipica en un maximo de un millon de variantes geneticas 81 82 83 mientras que la secuenciacion del genoma completo proporcionara informacion sobre los seis mil millones de bases en el genoma humano o 3 000 veces mas de datos Debido a esto la secuenciacion del genoma completo se considera una innovacion disruptiva a los mercados de matriz de ADN como la exactitud en un rango de 99 98 a 99 999 en regiones de ADN no repetitivas y su coste de consumibles de 5000 por 6 mil millones de pares de bases es competitivo para algunas aplicaciones con secuencias de ADN 500 por 1 millon de pares de bases 32 Agilent otro fabricante de chip de ADN establecida se trabaja en la dirigida region selectiva tecnologias de secuenciacion del genoma 84 Se cree que Affymetrix el pionero de la tecnologia de matriz en la decada de 1990 ha quedado a la zaga debido a la significativa turbulencia corporativa y de valores y actualmente no esta trabajando en algun enfoque de secuenciacion del genoma completo conocido 85 86 87 No se sabe que va a pasar con el mercado de matriz de ADN una vez que la secuenciacion del genoma completo se convierta en un mercado generalizado especialmente en lo que las empresas y laboratorios que desarrollan esta tecnologia de punta para realizar economias de escala Se postula sin embargo que esta nueva tecnologia puede disminuir significativamente el tamano del mercado total para secuencias de ADN y cualquier otra tecnologia de secuenciacion una vez que se convierte en un lugar comun para los individuos y para los recien nacidos tienen sus genomas completos secuenciados 88 Secuenciacion vs analisis EditarEn principio la secuenciacion del genoma completo puede proporcionar datos en bruto sobre los seis mil millones de nucleotidos en el ADN de un individuo Sin embargo no proporciona un analisis de lo que significa la informacion o la forma en que podria ser utilizado en diversas aplicaciones clinicas como en la medicina para ayudar a prevenir la enfermedad A partir de 2010 las empresas que estan trabajando en la secuenciacion del genoma completo proporcionan datos certificados CLIA Illumina y servicios de analisis para la interpretacion de los datos del genoma completo knome con una sola institucion que ofrece la secuenciacion y el analisis en un entorno clinico 89 Sin embargo hay mucho espacio para los investigadores o empresas para mejorar este tipo de analisis y hacerlo util para los medicos y los pacientes 90 91 92 Uso de diagnostico y el impacto social EditarBarato la secuenciacion del genoma completo eficiente sera un logro importante no solo para el campo de la genomica sino para toda la civilizacion humana ya que por primera vez las personas podran tener la totalidad de su genoma secuenciado Utilizando esta informacion se especula que los profesionales de la salud como los medicos y los asesores geneticos con el tiempo sera capaz de utilizar la informacion genomica para predecir que enfermedades puede tener en el futuro una persona y tratar de minimizar el impacto de esta enfermedad o evitar por completo a traves de la implementacion de diagnosticos personalizados la medicina preventiva La secuenciacion completa del genoma permitira a los profesionales de la salud para analizar todo el genoma humano de un individuo y por lo tanto detectar todas las variantes geneticas relacionadas con la enfermedad independientemente de la prevalencia o frecuencia de la variante genetica Esto permitira a los campos de la medicina rapidamente emergentes de la medicina predictiva y la medicina personalizada y marcara un importante salto adelante para la revolucion genetica clinica La secuenciacion completa del genoma es claramente de gran importancia para la investigacion sobre la base de las enfermedades geneticas y ha demostrado un beneficio significativo para un subgrupo de individuos con enfermedades poco frecuentes en la practica clinica 93 94 95 96 El CEO de Illumina Jay Flatley declaro en febrero de 2009 que Una lectura completa de ADN para todos los recien nacidos sera tecnicamente viable y asequible en menos de cinco anos con la promesa de una revolucion en el cuidado de la salud y que en 2019 se han convertido en rutina para mapear los genes de los bebes cuando nacen 97 Este uso potencial de la secuenciacion del genoma es muy controvertida ya que va en contra de las normas eticas establecidas para las pruebas geneticas predictivas de los menores asintomaticos que han sido bien establecidas el campo de la genetica medica y el asesoramiento genetico 98 99 100 101 Las directrices tradicionales para las pruebas geneticas se han desarrollado en el transcurso de varias decadas ya que primero se hizo posible la prueba de marcadores geneticos asociados con la enfermedad antes de la llegada de costo eficaz amplia el cribado genetico Se establece que las normas como en las ciencias y el campo de la genetica estan sujetas a cambios y a evolucionar con el tiempo 102 103 Se desconoce si las normas tradicionales practicadas en genetica medica hoy en dia se vera alterada por nuevos avances tecnologicos tales como la secuenciacion del genoma completo Actualmente disponible el cribado neonatal de enfermedades de la infancia permite la deteccion de enfermedades raras que pueden ser prevenidas o tratadas mejor por la deteccion e intervencion temprana Especificas pruebas geneticas tambien estan disponibles para determinar una etiologia cuando los sintomas de un nino parece tener una base genetica La secuenciacion del genoma completo ademas tiene el potencial de revelar una gran cantidad de informacion tale como el estado del portador para trastornos autosomicos recesivos los factores de riesgo geneticos para complejas enfermedades del adulto y otra informacion medica y no medica predictiva que en la actualidad no es completamente entendido no puede ser clinicamente util para el nino durante la infancia y pueden no necesariamente ser necesitado por el individuo al llegar a la edad adulta 104 Ademas de predecir el riesgo de enfermedades en la infancia las pruebas geneticas podrian tener otros beneficios por ejemplo el descubrimiento de la paternidad pero tambien puede tener desventajas potenciales la discriminacion genetica perdida de anonimato y los impactos psicologicos 105 Muchas de las publicaciones relativas a las directrices eticas para las pruebas geneticas predictivas de los menores asintomaticos por lo tanto puede tener mas que ver con la proteccion de los menores y la preservacion de la del individuo privacidad y autonomia conozcan o no su informacion genetica que con la tecnologia que hace las pruebas posibles a si mismos 106 Debido a las recientes reducciones de costos vease mas arriba la secuenciacion de todo el genoma se ha convertido en una aplicacion realista en el diagnostico de ADN En 2013 el consorcio de 3 Gb TEST obteniendo financiacion de la Union Europea para preparar el sistema de atencion de salud para estas innovaciones en el diagnostico de ADN 107 108 de evaluacion de calidad esquemas de evaluacion de tecnologias sanitarias y directrices tienen que estar en su lugar El consorcio de 3 Gb TEST ha identificado el analisis e interpretacion de datos de secuencias como el paso mas complicado en el proceso de diagnostico 109 En la reunion del Consorcio en Atenas en septiembre de 2014 el Consorcio acuno la palabra genotranslation para este paso crucial Este paso lleva a una llamada genoreport Se necesitan directrices para determinar el contenido requerido de estos informes Las preocupaciones eticas EditarLa mayoria de los especialistas en etica insisten en que la privacidad de los individuos sometidos a pruebas geneticas debe estar protegido en todas las circunstancias 110 Los datos obtenidos de la secuenciacion del genoma no solo puede revelar una gran cantidad de informacion sobre la persona que es la fuente de ADN sino que puede tambien revelan una gran cantidad de informacion probabilistica sobre la secuencia de ADN de los parientes geneticos mas cercanos 111 Por otra parte los datos obtenidos de la secuenciacion del genoma pueden tambien revelar una gran cantidad de informacion util sobre los familiares presentes y futuros riesgos para la salud 112 Esto plantea preguntas importantes acerca de cuales son las obligaciones si los hubiera son propiedad de los miembros de la familia de las personas que se someten a las pruebas geneticas En nuestra sociedad occidental europea los individuos se les anima a realizar la prueba por lo general para compartir informacion importante sobre el diagnostico genetico con sus parientes cercanos ya que la importancia del diagnostico genetico de otros parientes cercanos y los hijos suele ser una de las razones para buscar una prueba genetica en el primer lugar 110 Sin embargo Sijmons et al 2011 tambien mencionan que un dilema etico importante puede desarrollarse cuando los pacientes se niegan a compartir informacion en un diagnostico que se hace para el trastorno genetico grave que es altamente prevenible y donde existe un alto riesgo para los familiares portadores de la misma mutacion de la enfermedad 111 En tales circunstancias el medico puede sospechar que los familiares prefieren saber del diagnostico y por tanto el clinico puede hacer frente a un conflicto de intereses con respecto a la confidencialidad medico paciente 111 Otra de las principales preocupaciones de privacidad es la necesidad cientifica para poner informacion sobre genotipos y fenotipos de los pacientes en las bases de datos cientificos publicos tales como las bases de datos especificas de locus 111 A pesar de los datos del paciente son solo anonimos se someten a las bases de datos especificas de locus los pacientes podrian todavia ser identificables por sus familiares en el caso de encontrar una enfermedad rara o una mutacion poco frecuente 111 Referencias Editar Kijk magazine 01 January 2009 Wellcome Trust Case Control Consortium Clayton David G Cardon Lon R Craddock Nick Deloukas Panos Duncanson Audrey Kwiatkowski Dominic P McCarthy Mark I Ouwehand Willem H Samani Nilesh J Todd Donnelly Peter Barrett Jeffrey C Burton Paul R Davison Dan Donnelly Peter Easton Doug Evans David Leung Hin Tak Marchini Jonathan L Morris Spencer Chris C A Tobin Martin D Cardon Lon R Clayton David G Attwood Antony P Boorman James P Cant Barbara Everson Ursula et al June 2007 Genome wide asociativo testudo fo 14 000 cases fo leven concomo diseases and 3 000 shared controls Nature 447 7145 661 78 Bibcode 2007Natur 447 661B PMC 2719288 PMID 17554300 doi 10 1038 nature05911 Mailman MD Feolo M Jin Y Kimura M Tryka K Bagoutdinov R Hao L Kiang A Paschall J Phan L Popova N Pretel S Ziyabari L Lee M Shao Y Wang ZY Sirotkin K Ward M Kholodov M Zbicz K Beck J Kimelman M Shevelev S Preuss D Yaschenko E Graeff A Ostell J Sherry ST October 2007 The NCBI dbGaP database of genotypes and phenotypes Nat Genet 39 10 1181 6 PMC 2031016 PMID 17898773 doi 10 1038 ng1007 1181 Fareed M Afzal M 2013 Single nucleotide polymorphism in genome wide association of human population A tool for broad spectrum service Egyptian Journal of Medical Human Genetics 14 123 134 http dx doi org 10 1016 j ejmhg 2012 08 001 Braslavsky Ido et al 2003 Sequence information can be obtained from single DNA molecules Proc Natl Acad Sci USA 100 7 3960 3984 Single cell Sequencing Makes Strides in the Clinic with Cancer and PGD First Applications from Clinical Sequencing News By Monica Heger October 02 2013 Yurkiewicz Ilana R Korf Bruce R Lehmann Lisa Soleymani 16 de enero de 2014 Prenatal whole genome sequencing is the quest to know a fetus s future ethical The New England Journal of Medicine 370 3 195 197 ISSN 1533 4406 PMID 24428465 doi 10 1056 NEJMp1215536 Consultado el 8 de agosto de 2016 Roach JC Glusman G Smit AF et al April 2010 Analysis of genetic inheritance in a family quartet by whole genome sequencing Science 328 5978 636 9 PMC 3037280 PMID 20220176 doi 10 1126 science 1186802 Campbell CD Chong JX Malig M et al November 2012 Estimating the human mutation rate using autozygosity in a founder population Nat Genet 44 11 1277 81 PMC 3483378 PMID 23001126 doi 10 1038 ng 2418 Ye K Beekman M Lameijer EW Zhang Y Moed MH van den Akker EB Deelen J Houwing Duistermaat JJ Kremer D Anvar SY Laros JF Jones D Raine K Blackburne B Potluri S Long Q Guryev V van der Breggen R Westendorp RG t Hoen PA den Dunnen J van Ommen GJ Willemsen G Pitts SJ Cox DR Ning Z Boomsma DI Slagboom PE December 2013 Aging as accelerated accumulation of somatic variants whole genome sequencing of centenarian and middle aged monozygotic twin pairs Twin Res Hum Genet 16 6 1026 32 PMID 24182360 doi 10 1017 thg 2013 73 Keightley PD February 2012 Rates and fitness consequences of new mutations in humans Genetics 190 2 295 304 PMC 3276617 PMID 22345605 doi 10 1534 genetics 111 134668 Tuna M Amos CI November 2013 Genomic sequencing in cancer Cancer Lett 340 2 161 70 PMID 23178448 doi 10 1016 j canlet 2012 11 004 Staden R June 1979 A strategy of DNA sequencing employing computer programs Nucleic Acids Res 6 7 2601 10 PMC 327874 PMID 461197 doi 10 1093 nar 6 7 2601 Edwards A Caskey T 1991 Closure strategies for random DNA sequencing Methods A Companion to Methods in Enzymology 3 1 41 47 doi 10 1016 S1046 2023 05 80162 8 Edwards A Voss H Rice P Civitello A Stegemann J Schwager C Zimmermann J Erfle H Caskey CT Ansorge W April 1990 Automated DNA sequencing of the human HPRT locus Genomics 6 4 593 608 PMID 2341149 doi 10 1016 0888 7543 90 90493 E Roach JC Boysen C Wang K Hood L March 1995 Pairwise end sequencing a unified approach to genomic mapping and sequencing Genomics 26 2 345 53 PMID 7601461 doi 10 1016 0888 7543 95 80219 C Fleischmann RD Adams MD White O Clayton RA Kirkness EF Kerlavage AR Bult CJ Tomb JF Dougherty BA Merrick JM Adams White Clayton Kirkness Kerlavage Bult Tomb Dougherty Merrick McKenney Sutton Fitzhugh Fields Gocyne Scott Shirley Liu Glodek Kelley Weidman Phillips Spriggs Hedblom Cotton Utterback Hanna Nguyen Saudek et al July 1995 Whole genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd Science 269 5223 496 512 Bibcode 1995Sci 269 496F PMID 7542800 doi 10 1126 science 7542800 a b Mukhopadhyay R February 2009 DNA sequencers the next generation Anal Chem 81 5 1736 40 PMID 19193124 doi 10 1021 ac802712u Harvard University and Oxford Nanopore Technologies Announce Licence Agreement to Advance Nanopore DNA Sequencing and other Applications Nanotechwire 5 de agosto de 2008 Archivado desde el original el 14 de julio de 2011 Consultado el 23 de febrero de 2009 Illumina and Oxford Nanopore Enter into Broad Commercialization Agreement Reuters 12 de enero de 2009 Archivado desde el original el 9 de septiembre de 2009 Consultado el 23 de febrero de 2009 1 Uso incorrecto de la plantilla enlace roto enlace roto disponible en Internet Archive vease el historial la primera version y la ultima Single Molecule Real Time SMRT DNA Sequencing Pacific Biosciences Archivado desde el original el 24 de febrero de 2009 Consultado el 23 de febrero de 2009 Complete Human Genome Sequencing Technology Overview Complete Genomics 2009 Archivado desde el original el 27 de marzo de 2009 Consultado el 23 de febrero de 2009 Ronaghi M Uhlen M Nyren P July 1998 A sequencing method based on real time pyrophosphate Science 281 5375 363 365 PMID 9705713 doi 10 1126 science 281 5375 363 Ronaghi M Karamohamed S Pettersson B Uhlen M Nyren P November 1996 Real time DNA sequencing using detection of pyrophosphate release Anal Biochem 242 1 84 9 PMID 8923969 doi 10 1006 abio 1996 0432 Nyren P 2007 The history of pyrosequencing Methods Mol Biol 373 1 14 ISBN 1 59745 377 3 PMID 17185753 doi 10 1385 1 59745 377 3 1 Copia archivada Archivado desde el original el 31 de marzo de 2012 Consultado el 5 de noviembre de 2014 Article Race to Cut Whole Genome Sequencing Costs Genetic Engineering amp Biotechnology News Biotechnology from Bench to Business Genengnews com Consultado el 23 de febrero de 2009 Whole Genome Sequencing Costs Continue to Drop Eyeondna com Archivado desde el original el 25 de marzo de 2009 Consultado el 23 de febrero de 2009 Harmon Katherine 28 de junio de 2010 Genome Sequencing for the Rest of Us Scientific American Consultado el 13 de agosto de 2010 San Diego Orange County Technology News Sequenom to Develop Third Generation Nanopore Based Single Molecule Sequencing Technology Freshnews com Archivado desde el original el 5 de diciembre de 2008 Consultado el 24 de febrero de 2009 a b Article Whole Genome Sequencing in 24 Hours Genetic Engineering amp Biotechnology News Biotechnology from Bench to Business Genengnews com Consultado el 23 de febrero de 2009 Pacific Bio lifts the veil on its high speed genome sequencing effort VentureBeat Consultado el 23 de febrero de 2009 Bio IT World Bio IT World 6 de octubre de 2008 Consultado el 23 de febrero de 2009 With New Machine Helicos Brings Personal Genome Sequencing A Step Closer Xconomy 22 de abril de 2008 Consultado el 28 de enero de 2011 Whole genome sequencing costs continue to fall 300 million in 2003 1 million 2007 60 000 now 5000 by year end Nextbigfuture com 25 de marzo de 2008 Archivado desde el original el 20 de diciembre de 2010 Consultado el 28 de enero de 2011 Han Cao s nanofluidic chip could cut DNA sequencing costs dramatically Technology Review enlace roto disponible en Internet Archive vease el historial la primera version y la ultima John Carroll 14 de julio de 2008 Pacific Biosciences gains 100M for sequencing tech FierceBiotech Consultado el 23 de febrero de 2009 Sibley Lisa 8 de febrero de 2009 Complete Genomics brings radical reduction in cost Silicon Valley San Jose Business Journal Sanjose bizjournals com Consultado el 23 de febrero de 2009 Carlson Rob 2 de enero de 2007 A Few Thoughts on Rapid Genome Sequencing and The Archon Prize synthesis Synthesis cc Archivado desde el original el 8 de agosto de 2009 Consultado el 23 de febrero de 2009 PRIZE Overview Archon X PRIZE for Genomics Bentley DR December 2006 Whole genome re sequencing Curr Opin Genet Dev 16 6 545 552 PMID 17055251 doi 10 1016 j gde 2006 10 009 GeneTests org Diamandis Peter Outpaced by Innovation Canceling an XPRIZE Huffington Post SOLiD System a next gen DNA sequencing platform announced Gizmag com 27 de octubre de 2007 Consultado el 24 de febrero de 2009 The 1000 Genome Coming Soon Dddmag com 1 de abril de 2010 Archivado desde el original el 15 de abril de 2011 Consultado el 28 de enero de 2011 Complete Genomics Broad Institute Forge Cancer Sequencing Collaboration Bio IT World Consultado el 28 de enero de 2011 a b Walsh Fergus 8 de abril de 2009 Era of personalised medicine awaits BBC News Consultado el 3 de mayo de 2010 Individual genome sequencing Illumina Inc Everygenome com Archivado desde el original el 19 de octubre de 2011 Consultado el 28 de enero de 2011 Illumina launches personal genome sequencing service for 48 000 Genetic Future Scienceblogs com Archivado desde el original el 6 de junio de 2011 Consultado el 28 de enero de 2011 Illumina demos concept iPhone app for genetic data sharing mobihealthnews 10 de junio de 2009 Consultado el 28 de enero de 2011 Wade Nicholas 11 de agosto de 2009 Cost of Decoding a Genome Is Lowered The New York Times Consultado el 3 de mayo de 2010 Camille Ricketts 13 de agosto de 2009 Pacific Biosciences takes 68M as genome sequencing becomes more competitive VentureBeat Consultado el 28 de enero de 2011 Pacific Biosciences Raises Additional 68 Million in Financing FierceBiotech 12 de agosto de 2009 Consultado el 28 de enero de 2011 Silicon Valley startup Complete Genomics promises low cost DNA sequencing San Jose Mercury News Mercurynews com Consultado el 28 de enero de 2011 Silicon Valley Startup Complete Genomics Promises Low Cost DNA Sequencing Istockanalyst com 24 de agosto de 2009 Archivado desde el original el 27 de octubre de 2011 Consultado el 28 de enero de 2011 Jacquin Niles Explaining Sequencing The Daily Scan GenomeWeb Archivado desde el original el 16 de julio de 2011 Consultado el 28 de enero de 2011 a b NHGRI Awards More than 50M for Low Cost DNA Sequencing Tech Development Genome Web 2009 JOHN MARKOFF 5 de octubre de 2009 I B M Joins Pursuit of 1 000 Personal Genome The Newyork Times Consultado el 15 de mayo de 2013 Shankland Stephen 6 de octubre de 2009 IBM Research jumps into genetic sequencing Deep Tech CNET News News cnet com Consultado el 28 de enero de 2011 Copia archivada Archivado desde el original el 16 de enero de 2015 Consultado el 6 de noviembre de 2009 Drmanac R Sparks AB Callow MJ et al Human genome sequencing using unchained base reads on self assembling DNA nanoarrays Science 327 5961 78 81 2010 Broad Institute to use Complete Genomics to sequence genomes of cancer patients Genetic Future Scienceblogs com Archivado desde el original el 6 de junio de 2011 Consultado el 28 de enero de 2011 Five Thousand Bucks for Your Genome Technology Review 20 de octubre de 2008 Consultado el 23 de febrero de 2009 http journals lww com geneticsinmedicine Abstract 2011 03000 Making a definitive diagnosis Successful clinical 15 aspx One In A Billion A boy s life a medical mystery US clinics quietly embrace whole genome sequencing Herper Matthew 3 de junio de 2010 Your Genome is Coming Forbes Consultado el 13 de agosto de 2010 Lauerman John 5 de febrero de 2009 Complete Genomics Drives Down Cost of Genome Sequence to 5 000 Bloomberg com Consultado el 28 de enero de 2011 Illumina Announces 5 000 Genome Pricing https web archive org web 20121223070004 http www lifetechnologies com us en home about us news gallery press releases 2012 life techologies itroduces the bechtop io proto html html https web archive org web 20130107022605 http www nytimes com 2012 02 18 health oxford nanopore unveils tiny dna sequencing device html Products dnadtc com Consultado el 28 de noviembre de 2012 Gene By Gene Launches DNA DTC The Wall Street Journal 29 de noviembre de 2012 Consultado el 29 de noviembre de 2012 Vorhaus Dan 29 de noviembre de 2012 DNA DTC The Return of Direct to Consumer Whole Genome Sequencing genomicslawreport com Consultado el 30 de noviembre de 2012 Finished bacterial genomes from shotgun sequence data Koren Sergey July 2012 Hybrid error correction and de novo assembly of single molecule sequencing reads NatureBiotechnology 30 693 doi 10 1038 nbt 2280 A Klammer Aaron July 2012 A hybrid approach for the automated finishing of bacterial genomes NatureBiotechnology 30 7 Consultado el 1 de julio de 2012 Mind the Gap Upgrading Genomes with Pacific Biosciences RS Long Read Sequencing Technology Illumina Sequencer Enables 1 000 Genome News Genomics amp Proteomics Gen Eng Biotechnol News paper 34 4 15 de febrero de 2014 p 18 Genomics Core Gladstone ucsf edu Archivado desde el original el 30 de junio de 2010 Consultado el 23 de febrero de 2009 Nishida N Koike A Tajima A Ogasawara Y Ishibashi Y Uehara Y Inoue I Tokunaga K 2008 Evaluating the performance of Affymetrix SNP Array 6 0 platform with 400 Japanese individuals BMC Genomics 9 1 431 PMC 2566316 PMID 18803882 doi 10 1186 1471 2164 9 431 Petrone Justin Illumina DeCode Build 1M SNP Chip Q2 Launch to Coincide with Release of Affy s 6 0 SNP Array BioArray News Arrays GenomeWeb Consultado el 23 de febrero de 2009 Agilent Technologies Announces Licensing Agreement with Broad Institute to Develop Genome Partitioning Kits to Streamline Next Generation Sequencing Archivado desde el original el 25 de diciembre de 2008 Consultado el 5 de noviembre de 2014 http www genomeweb com arrays illumina decode build 1m snp chip q2 launch coincide release affys 60 snp array Affymetrix stock slumps 30 on forecast Sacramento Business Journal Sacramento bizjournals com 25 de julio de 2008 Consultado el 23 de febrero de 2009 Bluis John 24 de abril de 2006 Affymetrix Gets Chipped Again Fool com Consultado el 23 de febrero de 2009 The chips are down Nature 444 7117 256 7 November 2006 Bibcode 2006Natur 444 256 PMID 17108930 doi 10 1038 444256a Coombs A October 2008 The sequencing shakeup Nat Biotechnol 26 10 1109 12 PMID 18846083 doi 10 1038 nbt1008 1109 Following Diagnostic Sequencing Success MCW Creates Comprehensive Framework to Guide Future Cases The Wall Street Journal http online wsj com public page 0 0 WP 3001 html currentPlayingLocation 82 amp currentlyPlayingCollection Small 20Business amp currentlyPlayingVideoId CF4393A6 F71C 4FE2 A2F5 73271E1CA8E7 url sin titulo ayuda Ashley EA Butte AJ Wheeler MT Chen R Klein TE Dewey FE Dudley JT Ormond KE Pavlovic A Morgan AA Pushkarev D Neff NF Hudgins L Gong L Hodges LM Berlin DS Thorn CF Sangkuhl K Hebert JM Woon M Sagreiya H Whaley R Knowles JW Chou MF Thakuria JV Rosenbaum AM Zaranek AW Church GM Greely HT Quake SR Altman RB May 2010 Clinical assessment incorporating a personal genome Lancet 375 9725 1525 35 PMC 2937184 PMID 20435227 doi 10 1016 S0140 6736 10 60452 7 Genomes Environments Traits GET Evidence Ng SB Buckingham KJ Lee C et al January 2010 Exome sequencing identifies the cause of a mendelian disorder Nat Genet 42 1 30 5 PMC 2847889 PMID 19915526 doi 10 1038 ng 499 Hannibal MC Buckingham KJ Ng SB et al July 2011 Spectrum of MLL2 ALR mutations in 110 cases of Kabuki syndrome Am J Med Genet A 155A 7 1511 6 PMC 3121928 PMID 21671394 doi 10 1002 ajmg a 34074 Worthey EA Mayer AN Syverson GD et al March 2011 Making a definitive diagnosis successful clinical application of whole exome sequencing in a child with intractable inflammatory bowel disease Genet Med 13 3 255 62 PMID 21173700 doi 10 1097 GIM 0b013e3182088158 Archivado desde el original el 27 de enero de 2016 Consultado el 5 de noviembre de 2014 Goh V Helbling D Biank V Jarzembowski J Dimmock D June 2011 Next Generation Sequencing Facilitates The Diagnosis In A Child With Twinkle Mutations Causing Cholestatic Liver Failure J Pediatr Gastroenterol Nutr 54 2 291 4 PMID 21681116 doi 10 1097 MPG 0b013e318227e53c Henderson Mark 9 de febrero de 2009 Genetic mapping of babies by 2019 will transform preventive medicine London Times Online Consultado el 23 de febrero de 2009 McCabe LL McCabe ER June 2001 Postgenomic medicine Presymptomatic testing for prediction and prevention Clin Perinatol 28 2 425 34 PMID 11499063 doi 10 1016 S0095 5108 05 70094 4 Nelson RM Botkjin JR Kodish ED et al June 2001 Ethical issues with genetic testing in pediatrics Pediatrics 107 6 1451 5 PMID 11389275 doi 10 1542 peds 107 6 1451 Borry P Fryns JP Schotsmans P Dierickx K February 2006 Carrier testing in minors a systematic review of guidelines and position papers Eur J Hum Genet 14 2 133 8 PMID 16267502 doi 10 1038 sj ejhg 5201509 Borry P Stultiens L Nys H Cassiman JJ Dierickx K November 2006 Presymptomatic and predictive genetic testing in minors a systematic review of guidelines and position papers Clin Genet 70 5 374 81 PMID 17026616 doi 10 1111 j 1399 0004 2006 00692 x Mesoudi A Danielson P August 2008 Ethics evolution and culture Theory Biosci 127 3 229 40 PMID 18357481 doi 10 1007 s12064 008 0027 y Ehrlich PR Levin SA June 2005 The evolution of norms PLoS Biol 3 6 e194 PMC 1149491 PMID 15941355 doi 10 1371 journal pbio 0030194 Mayer AN Dimmock DP Arca MJ et al March 2011 A timely arrival for genomic medicine Genet Med 13 3 195 6 PMID 21169843 doi 10 1097 GIM 0b013e3182095089 De Cristofaro E 2012 Whole Genome Sequencing Innovation Dream or Privacy Nightmare ArXiv Repository 1210 4820 Bibcode 2012arXiv1210 4820D arXiv 1210 4820 Borry P Evers Kiebooms G Cornel MC Clarke A Dierickx K Public Professional Policy Committee PPPC of the European Society of Human Genetics ESHG 2009 Genetic testing in asymptomatic minors Background considerations towards ESHG Recommendations Eur J Hum Genet 17 6 711 9 PMC 2947094 PMID 19277061 doi 10 1038 ejhg 2009 25 http cordis europa eu project rcn 109460 en html Falta la url ayuda Beyond public health genomics proposals from an international working group PMID 25168910 http rd connect eu wysija page 1 amp controller email amp action view amp email id 13 amp wysijap subscriptions Falta la url ayuda a b Sijmons R H Van Langen I M 2011 A clinical perspective on ethical issues in genetic issues Accountability in Research Policies and Quality Assurance 18 3 148 162 doi 10 1080 08989621 2011 575033 La referencia utiliza el parametro obsoleto coauthors ayuda a b c d e Sijmons R H Van Langen I M 2011 A clinical perspective on ethical issues in genetic testing Accountability in Research Policies and Quality Assurance 18 3 148 162 doi 10 1080 08989621 2011 575033 La referencia utiliza el parametro obsoleto coauthors ayuda McGuire Amy L Caulfield Timothy 2008 Science and Society Research ethics and the challenge of whole genome sequencing Nature Reviews Genetics 9 2 152 156 doi 10 1038 nrg2302 Enlaces externos EditarArchon X Prize for Genomics James Watson s Personal Genome Sequence AAAS Science Genome Sequencing Poster Outsmart Your Genes Book that discusses full genome sequencing and its impact upon health care and society Whole genome linkage analysis Datos Q2068526Obtenido de https es wikipedia org w index php title Secuenciacion del genoma amp oldid 135840976, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

español

, española, descargar, gratis, descargar gratis, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, imagen, música, canción, película, libro, juego, juegos