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Uroporfirinógeno descarboxilasa

La uroporfirinógeno descarboxilasa (uroporfirinógeno III descarboxilasa o UROD) es una enzima perteneciente al grupo de las liasas codificada por el gen UROD.[2]

Uroporfirinógeno descarboxilasa

Representación de la estructura de la uroporfirinógeno descarboxilasa humana, mutación Ile260Thr.
Estructuras disponibles
PDB
Identificadores
Nomenclatura
Símbolo UROD (HGNC: 12591)
Identificadores
externos
Número EC 4.1.1.37
Locus Cr. 1 p34.1
Estructura/Función proteica
Tamaño 367[1]​ (aminoácidos)
Funciones Actividad uroporfirinógeno descarboxilasa
Datos biotecnológicos/médicos
Enfermedades Porfiria cutánea tarda, porfiria hepatoeritropoyética
PubMed (Búsqueda)
PMC (Búsqueda)

Función

La uroporfirinógeno descarboxilasa es una enzima homodimérica que cataliza el quinto paso de la síntesis del grupo hemo, que se corresponde con la eliminación de grupos carboxilo de las cuatro cadenas laterales de acetato del uroporfirinógeno III para obtener coproporfirinógeno III:

uroporfirinógeno III   coproporfirinógeno III + 4 CO
2

Importancia clínica

Las mutaciones de esta enzima causan porfiria cutánea tarda tipo II (familiar) y porfiria hepatoeritropoyética.[2]

Mecanismo

A una concentración baja de sustrato, la reacción parece seguir un orden establecido en el que se eliminan los grupos carboxilos de los anillos D, A, B y C, mientras que a una concentración mayor de sustrato, el orden parece ser aleatorio. La enzima funciona como un dímero en disolución, y tanto las enzimas humanas como las del tabaco han sido cristalizadas y resueltas en alta resolución.

 
La reacción catalizada por UROD.

UROD es una descarboxilasa especial, ya que cataliza la reacción sin la intervención de cofactores, necesarios en la mayoría de descarboxilasas. Se ha propuesto que su mecanismo se produzca mediante la protonación del sustrato con un residuo de arginina.[3]​ En 2008 se demostró que el ratio de la reacción de UROD sin catálisis es de 10−19 s−1, por lo que a un pH de 10 la aceleración relativa en presencia de la enzima, o eficiencia enzimática, es el mayor de todas las enzimas conocidas, 6 x 1024 M−1.[4]

 
Mecanismo propuesto para la reacción de la uroporfirinógeno descarboxilasa

Referencias

  1. «uroporphyrinogen decarboxylase [Homo sapiens]». NCBI (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020. 
  2. «Entrez Gene: UROD uroporphyrinogen decarboxylase» (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020. 
  3. Silva, PJ; Ramos, MJ (2005). «Density-functional study of mechanisms for the cofactor-free decarboxylation performed by uroporphyrinogen III decarboxylase.». Journal of Physical Chemistry B (en inglés) 109: 18195-18200. doi:10.1021/jp051792s. 
  4. Lewis, CA; Wolfenden, R (noviembre de 2008). «Uroporphyrinogen decarboxylation as a benchmark for the catalytic proficiency of enzymes». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (en inglés) 105 (45): 17328-17333. PMC 2582308. PMID 18988736. doi:10.1073/pnas.0809838105. 

Enlaces externos

  •   Datos: Q409065

uroporfirinógeno, descarboxilasa, uroporfirinógeno, descarboxilasa, uroporfirinógeno, descarboxilasa, urod, enzima, perteneciente, grupo, liasas, codificada, urod, representación, estructura, uroporfirinógeno, descarboxilasa, humana, mutación, ile260thr, estru. La uroporfirinogeno descarboxilasa uroporfirinogeno III descarboxilasa o UROD es una enzima perteneciente al grupo de las liasas codificada por el gen UROD 2 Uroporfirinogeno descarboxilasaRepresentacion de la estructura de la uroporfirinogeno descarboxilasa humana mutacion Ile260Thr Estructuras disponiblesPDB Estructuras enzimaticasRCSB PDB PDBe PDBsumIdentificadoresNomenclatura Otros nombresUroporfirinogeno III descarboxilasa porfirinogeno carboxiliasa porfirinogeno descarboxilasa uroporfirinogeno III carboxiliasaSimboloUROD HGNC 12591 IdentificadoresexternosOMIM 613521MGI 98916EBI URODUniProt UROD Bases de datos de enzimasIntEnz entrada en IntEnz BRENDA entrada en BRENDA ExPASy NiceZime view KEGG entrada en KEEG PRIAM perfil PRIAM ExplorEnz entrada en ExplorEnz MetaCyc via metabolicaNumero EC4 1 1 37LocusCr 1 p34 1Estructura Funcion proteicaTamano367 1 aminoacidos Funciones Actividad uroporfirinogeno descarboxilasaDatos biotecnologicos medicosEnfermedadesPorfiria cutanea tarda porfiria hepatoeritropoyeticaPubMed Busqueda 1 PMC Busqueda 2 vte editar datos en Wikidata Indice 1 Funcion 2 Importancia clinica 3 Mecanismo 4 Referencias 5 Enlaces externosFuncion EditarLa uroporfirinogeno descarboxilasa es una enzima homodimerica que cataliza el quinto paso de la sintesis del grupo hemo que se corresponde con la eliminacion de grupos carboxilo de las cuatro cadenas laterales de acetato del uroporfirinogeno III para obtener coproporfirinogeno III uroporfirinogeno III displaystyle rightleftharpoons coproporfirinogeno III 4 CO2Importancia clinica EditarLas mutaciones de esta enzima causan porfiria cutanea tarda tipo II familiar y porfiria hepatoeritropoyetica 2 Mecanismo EditarA una concentracion baja de sustrato la reaccion parece seguir un orden establecido en el que se eliminan los grupos carboxilos de los anillos D A B y C mientras que a una concentracion mayor de sustrato el orden parece ser aleatorio La enzima funciona como un dimero en disolucion y tanto las enzimas humanas como las del tabaco han sido cristalizadas y resueltas en alta resolucion La reaccion catalizada por UROD UROD es una descarboxilasa especial ya que cataliza la reaccion sin la intervencion de cofactores necesarios en la mayoria de descarboxilasas Se ha propuesto que su mecanismo se produzca mediante la protonacion del sustrato con un residuo de arginina 3 En 2008 se demostro que el ratio de la reaccion de UROD sin catalisis es de 10 19 s 1 por lo que a un pH de 10 la aceleracion relativa en presencia de la enzima o eficiencia enzimatica es el mayor de todas las enzimas conocidas 6 x 1024 M 1 4 Mecanismo propuesto para la reaccion de la uroporfirinogeno descarboxilasaReferencias Editar uroporphyrinogen decarboxylase Homo sapiens NCBI en ingles Consultado el 17 de enero de 2020 a b Entrez Gene UROD uroporphyrinogen decarboxylase en ingles Consultado el 17 de enero de 2020 Silva PJ Ramos MJ 2005 Density functional study of mechanisms for the cofactor free decarboxylation performed by uroporphyrinogen III decarboxylase Journal of Physical Chemistry B en ingles 109 18195 18200 doi 10 1021 jp051792s Lewis CA Wolfenden R noviembre de 2008 Uroporphyrinogen decarboxylation as a benchmark for the catalytic proficiency of enzymes Proc Natl Acad Sci U S A en ingles 105 45 17328 17333 PMC 2582308 PMID 18988736 doi 10 1073 pnas 0809838105 Enlaces externos EditarEsta obra contiene una traduccion total derivada de Uroporphyrinogen III decarboxylase de la Wikipedia en ingles concretamente de esta version del 29 de septiembre de 2019 publicada por sus editores bajo la Licencia de documentacion libre de GNU y la Licencia Creative Commons Atribucion CompartirIgual 3 0 Unported Wikimedia Commons alberga una categoria multimedia sobre uroporfirinogeno descarboxilasa Datos Q409065Obtenido de https es wikipedia org w index php title Uroporfirinogeno descarboxilasa amp oldid 128783753, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

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