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Factor de elongación

Los factores de elongación o de alargamiento son sustancias de naturaleza proteica imprescindibles para que el ribosoma pueda realizar la traducción genética, es decir, el proceso de biosíntesis de proteínas en todo ser vivo. Se denomina elongación al crecimiento en longitud de una cadena de polipéptidos mediante la formación de enlaces que añaden aminoácidos nuevos a la cadena.

Factor de elongación bacteriano EF-Tu (azul) durante la combinación con un ARNt (rojo).

Los factores de elongación están presentes tanto en las células procariotas como en las eucariotas, en estas últimas existen factores diferentes en el citoplasma y las mitocondrias. Se han descrito diversas mutaciones en los genes que codifican los factores de elongación que provocan enfermedades graves en humanos. La bacteria Corynebacterium diphtheriae agente causante de la difteria produce una toxina que actúa sobre el factor de elongación EF-2 y altera su función.[1][2][3]

Tipos de factores de elongación y principales homólogos

Se han descrito 4 tipos de factores de elongación, los cuales tienen homólogos en cada organismo, pudiendo resumirse de la siguiente manera:

arqueanos bacterianos eucariotas Función
citoplasmáticos mitocondriales
aEF1A EF-Tu eEF1A mtEFTu Activo en la traducción, mediando la entrada del aminoacil ARNt en un sitio libre del ribosoma.[4]
aEF1B EF-Ts eEF1B mtEFTs Factor de intercambio de nucleótidos para regenerar a EF1A/Tu de su forma inactiva a la activa.[5]
aEF2 EF-G eEF2 mtEFG1 Cataliza la translocación del ARNt y ARNm del ribosoma al final de cada ronda de alargamiento.[6]
aIF5A EF-P eIF5A - Desbloqueo del ribosoma causado por secuencias de aminoácidos específicas.[7]

Nomenclatura

La nomenclatura proviene del inglés. Por ejemplo, aEF1A viene de archaeal translation elongation factor 1 alpha. Las siglas EF-Tu vienen de elongation factor thermo unstable (factor de alargamiento termo-inestable) y Ts de termo-estable. eIF5A fue identificado primero como un factor de iniciación (IF), antes que por un factor de elongación.

Los factores de elongación eucariotas citoplasmáticos provienen evolutivamente de los arqueanos, por lo que tienen la misma nomenclatura. En cambio los factores eucariotas mitocondriales tienen origen bacteriano y por lo tanto llevan una nomenclatura paralela.

Células procariotas

Son 4 factores de elongación en la célula procariota. En bacterias, la proteína más abundante que poseen es EF-Tu. EF-G tiene doble función, como factor de elongación y como factor de reciclaje del ribosoma. En arqueas y bacterias, se ha determinado que a pesar de la homología, los factores poseen estructuras distintas, lo que justifica el uso de diferente nomenclatura.

Células eucariotas

Se ha descrito 4 factores citoplasmáticos y 3 mitocondriales. Adicionalmente, las plantas y algas poseen más factores de elongación en sus plastos.

Citoplasma

Se han descrito los siguientes factores de elongación:

  • eEF1 o eEF-1. Complejo factor de elongación eucariota 1. Se han descrito diversos casos de enfermedad en humanos causados por mutaciones en el gen que codifica el eEF-1.[8]​ Es un complejo de proteínas que han adquirido funciones adicionales para satisfacer las demandas de un medio celular complejo a través de diversas subunidades como las siguientes:
    • eEF1A (antes eEF1α) actúa como suministro de Aminoacil ARNt al ribosoma
    • eEF1B regenera a eEF1A de su forma inactiva (EF1A-GDP) a su forma activa (EF1A-GTP). Destacan las siguientes subunidades:[9]
      • eEF1Bα, de amplia distribución
      • eEF1Bβ, específico en plantas
      • eEF1Bγ, componente estructural
      • eEF1Bδ, en animales
  • eEF2 o eEF-2. Factor de elongación eucariota 2. Es el objetivo de la toxina diftérica (de Corynebacterium diphtheriae) y la exotoxina A (de Pseudomonas aeruginosa).[10]
  • eIF5A es la única proteína conocida que contiene el aminoácido inusual hipusina.

Mitocondria

  • El factor de elongación mitocondrial Tu (mtEFTu) depende del gen TUFM.
  • El factor de elongación mitocondrial TS (mtEFTs) viene del gen TSFM.[11]
  • Las mitocondrias contienen dos homólogos del EFG bacteriano, mtEFG1 y mtEFG2, que son 35% idénticos, pero mientras que mtEFG1 cataliza específicamente la translocación de la traducción, mtEFG2 participa como factor de reciclaje de ribosomas, por lo que mtEFG2 podría renombrarse como mtRRF2.[12]​ El factor mtEFG1 viene del gen GFM1.[13]

Referencias

  1. Alberts, B. et al. (2002). Molecular Biology of the Cell, 4th ed. New York: Garland Science. ISBN 0-8153-3218-1
  2. Berg, J. M. et al. (2002). Biochemistry, 5th ed. New York: W.H. Freeman and Company. ISBN 0-7167-3051-0
  3. Singh, B. D. (2002). Fundamentals of Genetics, New Delhi, India: Kalyani Publishers. ISBN 81-7663-109-4
  4. Weijland A, Harmark K, Cool RH, Anborgh PH, Parmeggiani A (1992). "Elongation factor Tu: a molecular switch in protein biosynthesis". Molecular Microbiology. 6 (6): 683–8. doi:10.1111/j.1365-2958.1992.tb01516.x. PMID 1573997.
  5. InterPro 77.0 (2019), Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 Classification of protein families
  6. Jørgensen, R; Ortiz, PA; Carr-Schmid, A; Nissen, P; Kinzy, TG; Andersen, GR (2003). "Two crystal structures demonstrate large conformational changes in the eukaryotic ribosomal translocase". Nature Structural Biology. 10 (5): 379–85. doi:10.1038/nsb923. PMID 12692531.
  7. Danuza Rossi, Reginaldo Kuroshu, Cleslei Zanelli, Sandro Valentini (2014), eIF5A and EF-P: Two Unique Translation Factors Are Now Traveling the Same Road Wiley Interdiscip Rev RNA, 5 (2), 209-22 PMID: 24402910 DOI: 10.1002/wrna.1211
  8. OMIM: Eukariotic Translation Elongation Factor 1.
  9. Sasikumar, Arjun N.; Perez, Winder B.; Kinzy, Terri Goss (July 2012). "The Many Roles of the Eukaryotic Elongation Factor 1 Complex". Wiley Interdisciplinary Reviews. RNA. 3 (4): 543–555. doi:10.1002/wrna.1118. ISSN 1757-7004. PMC 3374885. PMID 22555874.
  10. Jørgensen R, Merrill AR, Andersen GR (2006). "The life and death of translation elongation factor 2". Biochemical Society Transactions. 34 (Pt 1): 1–6. doi:10.1042/BST20060001. PMID 16246167.
  11. OMIM: Ts Translation Elongatio Factor.
  12. Paulien Smits, Jan Smeitink & Lambert van den Heuvel 2010, Mitochondrial Translation and Beyond: Processes Implicated in Combined Oxidative Phosphorylation Deficiencies. BioMed Research International Article ID 737385 | 24 pages | https://doi.org/10.1155/2010/737385
  13. OMIM: Mitochondrial Elongation Factor G1.
  •   Datos: Q126252

factor, elongación, factores, elongación, alargamiento, sustancias, naturaleza, proteica, imprescindibles, para, ribosoma, pueda, realizar, traducción, genética, decir, proceso, biosíntesis, proteínas, todo, vivo, denomina, elongación, crecimiento, longitud, c. Los factores de elongacion o de alargamiento son sustancias de naturaleza proteica imprescindibles para que el ribosoma pueda realizar la traduccion genetica es decir el proceso de biosintesis de proteinas en todo ser vivo Se denomina elongacion al crecimiento en longitud de una cadena de polipeptidos mediante la formacion de enlaces que anaden aminoacidos nuevos a la cadena Factor de elongacion bacteriano EF Tu azul durante la combinacion con un ARNt rojo Los factores de elongacion estan presentes tanto en las celulas procariotas como en las eucariotas en estas ultimas existen factores diferentes en el citoplasma y las mitocondrias Se han descrito diversas mutaciones en los genes que codifican los factores de elongacion que provocan enfermedades graves en humanos La bacteria Corynebacterium diphtheriae agente causante de la difteria produce una toxina que actua sobre el factor de elongacion EF 2 y altera su funcion 1 2 3 Indice 1 Tipos de factores de elongacion y principales homologos 1 1 Nomenclatura 1 2 Celulas procariotas 1 3 Celulas eucariotas 1 3 1 Citoplasma 1 3 2 Mitocondria 2 ReferenciasTipos de factores de elongacion y principales homologos EditarSe han descrito 4 tipos de factores de elongacion los cuales tienen homologos en cada organismo pudiendo resumirse de la siguiente manera arqueanos bacterianos eucariotas Funcioncitoplasmaticos mitocondrialesaEF1A EF Tu eEF1A mtEFTu Activo en la traduccion mediando la entrada del aminoacil ARNt en un sitio libre del ribosoma 4 aEF1B EF Ts eEF1B mtEFTs Factor de intercambio de nucleotidos para regenerar a EF1A Tu de su forma inactiva a la activa 5 aEF2 EF G eEF2 mtEFG1 Cataliza la translocacion del ARNt y ARNm del ribosoma al final de cada ronda de alargamiento 6 aIF5A EF P eIF5A Desbloqueo del ribosoma causado por secuencias de aminoacidos especificas 7 Nomenclatura Editar La nomenclatura proviene del ingles Por ejemplo aEF1A viene de archaeal translation elongation factor 1 alpha Las siglas EF Tu vienen de elongation factor thermo unstable factor de alargamiento termo inestable y Ts de termo estable eIF5A fue identificado primero como un factor de iniciacion IF antes que por un factor de elongacion Los factores de elongacion eucariotas citoplasmaticos provienen evolutivamente de los arqueanos por lo que tienen la misma nomenclatura En cambio los factores eucariotas mitocondriales tienen origen bacteriano y por lo tanto llevan una nomenclatura paralela Celulas procariotas Editar Son 4 factores de elongacion en la celula procariota En bacterias la proteina mas abundante que poseen es EF Tu EF G tiene doble funcion como factor de elongacion y como factor de reciclaje del ribosoma En arqueas y bacterias se ha determinado que a pesar de la homologia los factores poseen estructuras distintas lo que justifica el uso de diferente nomenclatura Celulas eucariotas Editar Se ha descrito 4 factores citoplasmaticos y 3 mitocondriales Adicionalmente las plantas y algas poseen mas factores de elongacion en sus plastos Citoplasma Editar Se han descrito los siguientes factores de elongacion eEF1 o eEF 1 Complejo factor de elongacion eucariota 1 Se han descrito diversos casos de enfermedad en humanos causados por mutaciones en el gen que codifica el eEF 1 8 Es un complejo de proteinas que han adquirido funciones adicionales para satisfacer las demandas de un medio celular complejo a traves de diversas subunidades como las siguientes eEF1A antes eEF1a actua como suministro de Aminoacil ARNt al ribosoma eEF1B regenera a eEF1A de su forma inactiva EF1A GDP a su forma activa EF1A GTP Destacan las siguientes subunidades 9 eEF1Ba de amplia distribucion eEF1Bb especifico en plantas eEF1Bg componente estructural eEF1Bd en animales eEF2 o eEF 2 Factor de elongacion eucariota 2 Es el objetivo de la toxina difterica de Corynebacterium diphtheriae y la exotoxina A de Pseudomonas aeruginosa 10 eIF5A es la unica proteina conocida que contiene el aminoacido inusual hipusina Mitocondria Editar El factor de elongacion mitocondrial Tu mtEFTu depende del gen TUFM El factor de elongacion mitocondrial TS mtEFTs viene del gen TSFM 11 Las mitocondrias contienen dos homologos del EFG bacteriano mtEFG1 y mtEFG2 que son 35 identicos pero mientras que mtEFG1 cataliza especificamente la translocacion de la traduccion mtEFG2 participa como factor de reciclaje de ribosomas por lo que mtEFG2 podria renombrarse como mtRRF2 12 El factor mtEFG1 viene del gen GFM1 13 Referencias Editar Alberts B et al 2002 Molecular Biology of the Cell 4th ed New York Garland Science ISBN 0 8153 3218 1 Berg J M et al 2002 Biochemistry 5th ed New York W H Freeman and Company ISBN 0 7167 3051 0 Singh B D 2002 Fundamentals of Genetics New Delhi India Kalyani Publishers ISBN 81 7663 109 4 Weijland A Harmark K Cool RH Anborgh PH Parmeggiani A 1992 Elongation factor Tu a molecular switch in protein biosynthesis Molecular Microbiology 6 6 683 8 doi 10 1111 j 1365 2958 1992 tb01516 x PMID 1573997 InterPro 77 0 2019 Translation elongation factor EF1B ribosomal protein S6 Classification of protein families Jorgensen R Ortiz PA Carr Schmid A Nissen P Kinzy TG Andersen GR 2003 Two crystal structures demonstrate large conformational changes in the eukaryotic ribosomal translocase Nature Structural Biology 10 5 379 85 doi 10 1038 nsb923 PMID 12692531 Danuza Rossi Reginaldo Kuroshu Cleslei Zanelli Sandro Valentini 2014 eIF5A and EF P Two Unique Translation Factors Are Now Traveling the Same Road Wiley Interdiscip Rev RNA 5 2 209 22 PMID 24402910 DOI 10 1002 wrna 1211 OMIM Eukariotic Translation Elongation Factor 1 Sasikumar Arjun N Perez Winder B Kinzy Terri Goss July 2012 The Many Roles of the Eukaryotic Elongation Factor 1 Complex Wiley Interdisciplinary Reviews RNA 3 4 543 555 doi 10 1002 wrna 1118 ISSN 1757 7004 PMC 3374885 PMID 22555874 Jorgensen R Merrill AR Andersen GR 2006 The life and death of translation elongation factor 2 Biochemical Society Transactions 34 Pt 1 1 6 doi 10 1042 BST20060001 PMID 16246167 OMIM Ts Translation Elongatio Factor Paulien Smits Jan Smeitink amp Lambert van den Heuvel 2010 Mitochondrial Translation and Beyond Processes Implicated in Combined Oxidative Phosphorylation Deficiencies BioMed Research International Article ID 737385 24 pages https doi org 10 1155 2010 737385 OMIM Mitochondrial Elongation Factor G1 Datos Q126252Obtenido de https es wikipedia org w index php title Factor de elongacion amp oldid 133022421, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

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