Un barril beta es una estructura de proteínas formada por una serie de láminas beta que se tuercen y enrollan para formar una estructura cerrada en donde la primera cadena de láminas beta se une a la última a través de enlaces por puente de hidrógeno. Estas láminas beta generalmente forman arreglos antiparalelos. Las estructuras de barril se encuentran comúnmente en porinas y otras proteínas que se atraviesan membranas celulares y proteínas que se unen a ligandos hidrofóbicos en el centro del barril, como en las lipocalinas. Las estructuras de barril tipo porinas son hasta el 2-3% de los genes de una bacteria Gram negativas.[1] En muchos casos, la alternancia de cadenas contienen residuos aminoacídicos polares e hidrofóbicos, de modo que los residuos hidrofóbicos están orientados hacia el interior del barril para formar un núcleo hidrofóbico y los residuos polares están orientados hacia el exterior del barril sobre la superficie expuesta a solvente. Las porinas y otras proteínas de membrana que contienen barriles beta pueden revertir este patrón, con residuos hidrófobos orientados hacia el exterior, donde están en contacto con lípidos, y los residuos hidrófilos orientados hacia el interior del poro. Todos los barriles-beta se pueden clasificar en función de dos parámetros: el número de cadenas en la lámina beta, n, y el "número de cizalla", S, una medida de la forma escalonada de los capítulos de la lámina beta.[2] Estos dos parámetros (n y S) se relacionan con el ángulo de inclinación de las cadenas de láminas beta en relación con el eje del barril.[2] [3]
La proteína de unión a retinol humana es una lipocalina con un barril formado por ocho láminas beta de unión a retinol (vitamina A).
Tipos de barriles beta
La gran mayoría de los barriles beta posee una de las siguientes topologías:
Sándwich
Los barriles beta tipo sándwich son los de topologías más simple y consisten en una serie de láminas beta, cada una de las cuales posee enlaces de hidrógenos a la lámina inmediatamenta anterior y posterior en la secuencia primaria.
Greca
Aquellos con topología de tipo greca están conformados por láminas beta adyacentes en el espacio pero no en secuencia. Estos barriles beta generalmente consisten en al menos un motivo estructural en greca unido a una horquilla beta, o dos grecas sucesivas.
Remolino
El barril tipo remolino (jelly-roll en inglés) es una estructura compleja no local en donde cuatro pares de láminas beta antiparalelas y una sola de ellas adyacente en secuencia, están "envueltos" tridimensionalmente para adoptar la forma de un barril.
↑ Murzin A, Lesk A, Chothia C (1994). «Principles determining the structure of beta-sheet barrels in proteins. I. A theoretical analysis». J Mol Biol236 (5): 1369-1400. PMID 8126726. doi:10.1016/0022-2836(94)90064-7.
Liu WM. (1998). "Shear numbers of protein beta-barrels: definition refinements and statistics". J Mol Biol275(4): 541-5. PMID 9466929.
Enlaces externos
Explicación de topologías todo-beta
Imágenes y ejemplos de barriles beta transmembrana
Datos:Q310424
Multimedia:Protein Domain: Beta barrel
Agosto 04, 2021
barril, beta, barril, beta, estructura, proteínas, formada, serie, láminas, beta, tuercen, enrollan, para, formar, estructura, cerrada, donde, primera, cadena, láminas, beta, última, través, enlaces, puente, hidrógeno, estas, láminas, beta, generalmente, forma. Un barril beta es una estructura de proteinas formada por una serie de laminas beta que se tuercen y enrollan para formar una estructura cerrada en donde la primera cadena de laminas beta se une a la ultima a traves de enlaces por puente de hidrogeno Estas laminas beta generalmente forman arreglos antiparalelos Las estructuras de barril se encuentran comunmente en porinas y otras proteinas que se atraviesan membranas celulares y proteinas que se unen a ligandos hidrofobicos en el centro del barril como en las lipocalinas Las estructuras de barril tipo porinas son hasta el 2 3 de los genes de una bacteria Gram negativas 1 En muchos casos la alternancia de cadenas contienen residuos aminoacidicos polares e hidrofobicos de modo que los residuos hidrofobicos estan orientados hacia el interior del barril para formar un nucleo hidrofobico y los residuos polares estan orientados hacia el exterior del barril sobre la superficie expuesta a solvente Las porinas y otras proteinas de membrana que contienen barriles beta pueden revertir este patron con residuos hidrofobos orientados hacia el exterior donde estan en contacto con lipidos y los residuos hidrofilos orientados hacia el interior del poro Todos los barriles beta se pueden clasificar en funcion de dos parametros el numero de cadenas en la lamina beta n y el numero de cizalla S una medida de la forma escalonada de los capitulos de la lamina beta 2 Estos dos parametros n y S se relacionan con el angulo de inclinacion de las cadenas de laminas beta en relacion con el eje del barril 2 3 Barril beta de la porina especifica para sucrosa de la bacteria Salmonella typhimurium vista de lado Las porinas son proteinas transmembrana con centros huecos a traves de los cuales pueden difundir moleculas pequenas La proteina de union a retinol humana es una lipocalina con un barril formado por ocho laminas beta de union a retinol vitamina A Indice 1 Tipos de barriles beta 1 1 Sandwich 1 2 Greca 1 3 Remolino 2 Referencias 3 Enlaces externosTipos de barriles beta EditarLa gran mayoria de los barriles beta posee una de las siguientes topologias Sandwich Editar Los barriles beta tipo sandwich son los de topologias mas simple y consisten en una serie de laminas beta cada una de las cuales posee enlaces de hidrogenos a la lamina inmediatamenta anterior y posterior en la secuencia primaria Greca Editar Aquellos con topologia de tipo greca estan conformados por laminas beta adyacentes en el espacio pero no en secuencia Estos barriles beta generalmente consisten en al menos un motivo estructural en greca unido a una horquilla beta o dos grecas sucesivas Remolino Editar El barril tipo remolino jelly roll en ingles es una estructura compleja no local en donde cuatro pares de laminas beta antiparalelas y una sola de ellas adyacente en secuencia estan envueltos tridimensionalmente para adoptar la forma de un barril Referencias Editar Wimley WC 2003 The versatile beta barrel membrane protein Curr Opin Struct Biol 13 4 404 11 PMID 12948769 a b Murzin A Lesk A Chothia C 1994 Principles determining the structure of beta sheet barrels in proteins I A theoretical analysis J Mol Biol 236 5 1369 1400 PMID 8126726 doi 10 1016 0022 2836 94 90064 7 Liu WM 1998 Shear numbers of protein beta barrels definition refinements and statistics J Mol Biol 275 4 541 5 PMID 9466929 Enlaces externos EditarExplicacion de topologias todo beta Plegamientos todo beta en la base de datos SCOP Imagenes y ejemplos de barriles beta transmembrana Datos Q310424 Multimedia Protein Domain Beta barrelObtenido de https es wikipedia org w index php title Barril beta amp oldid 134914346, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
