BEAST es una multiplataforma para el análisis molecular mediante inferencia bayesiana con algorítmos MCMC. Está orientado a enraizar, calibrar en el tiempo filogenias usando relojes moleculares estrictos o relajados. Puede usarse como método de reconstrucción de filogenias pero también para testar hipótesis evolutivas sin condicionamiento a una simple topología de un árbol filogenético dado. BEAST usa MCMC para evaluar el espacio del árbol, por lo que, cada árbol es igualmente proporcional a su probabilidad posterior. Incluye una interfaz simple para llevar a cabo análisis estándar y una suite de programas para analizar los resultados.
Bibliografía
Drummond, Alexei J. et al. “Bayesian Phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7.” Molecular Biology and Evolution (2012)
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