El ARN ribosomal 5S (ARNr 5S o 5S rRNA) es una molécula de rRNA de aproximadamente 120 nucleótidos de longitud y una masa de 40 kDa. Es un componente estructural y funcional de la subunidad mayor del ribosoma en todos los dominios de la vida (Bacteria, Archaea, y Eukarya, con la excepción de los ribosomas mitocondriales de Fungi y Animalia). La nomenclatura 5S se refiere a la velocidad de sedimentación de la molécula en un ultra-centrífuga, medida en unidades Svedberg (S).[2]
Figura 1: Una representación 3D de una molécula de rRNA 5S, de la subunidad 50S de Escherichia coli. Está basada en una reconstrucción por microscopio de cryo-electrón.[1]
Biosíntesis
En procariontes, el gen de rRNA 5S está comúnmente ubicado en operones de rRNA río abajo de las subunidades menor y mayor del rRNA y se co-transcribe en un precursor policistrónico.[3] Una peculiaridad de los genomas nucleares eucariontes es la presencia de múltiples copias de rRNA 5S (5S rDNA) agrupadas en repeticiones en tandem, con un número de copias variable entre especies .[4][5] El rRNA 5S eucarionte está sintetizado por la ARN polimerasa III, mientras que otros rRNAs eucariontes son cortados de un precursos 45S transcrito por la ARN polimerasa I. En Xenopus oocytes, se ha demostrado que lo dedos 4-7 del factor de transcripción TFIIIA (de nueve dedos de zinc) se puede unir a la región central del rRNA 5S .[6][7] La unión entre el rRNA 5S y TFIIIA sirve para detener la transcripción del gen de rRNA 5S y estabilizar el transcrito del mismo hasta que sea requerido para el ensamblado del ribosoma.[8]
Estructura
La estructura secundaria del rRNA 5S consiste en cinco hélices (denotadas I-V en números romanos), cuatro bucles (B-E) y una bisagra (A), formando una estructura en forma de "Y". Los bucles C y D son horquillas terminales y los bucles B y E son internos .[4] Según los estudios filogenéticos, las hélices I y III son probablemente ancestrales.[9] La hélice III incluye dos adenosinas altamente conservadas .[10] Se cree que la hélice V interactúa con TFIIIA.[4]
Referencias
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Datos:Q10846137
Agosto 05, 2021
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El ARN ribosomal 5S ARNr 5S o 5S rRNA es una molecula de rRNA de aproximadamente 120 nucleotidos de longitud y una masa de 40 kDa Es un componente estructural y funcional de la subunidad mayor del ribosoma en todos los dominios de la vida Bacteria Archaea y Eukarya con la excepcion de los ribosomas mitocondriales de Fungi y Animalia La nomenclatura 5S se refiere a la velocidad de sedimentacion de la molecula en un ultra centrifuga medida en unidades Svedberg S 2 Figura 1 Una representacion 3D de una molecula de rRNA 5S de la subunidad 50S de Escherichia coli Esta basada en una reconstruccion por microscopio de cryo electron 1 Biosintesis EditarEn procariontes el gen de rRNA 5S esta comunmente ubicado en operones de rRNA rio abajo de las subunidades menor y mayor del rRNA y se co transcribe en un precursor policistronico 3 Una peculiaridad de los genomas nucleares eucariontes es la presencia de multiples copias de rRNA 5S 5S rDNA agrupadas en repeticiones en tandem con un numero de copias variable entre especies 4 5 El rRNA 5S eucarionte esta sintetizado por la ARN polimerasa III mientras que otros rRNAs eucariontes son cortados de un precursos 45S transcrito por la ARN polimerasa I En Xenopus oocytes se ha demostrado que lo dedos 4 7 del factor de transcripcion TFIIIA de nueve dedos de zinc se puede unir a la region central del rRNA 5S 6 7 La union entre el rRNA 5S y TFIIIA sirve para detener la transcripcion del gen de rRNA 5S y estabilizar el transcrito del mismo hasta que sea requerido para el ensamblado del ribosoma 8 Estructura EditarLa estructura secundaria del rRNA 5S consiste en cinco helices denotadas I V en numeros romanos cuatro bucles B E y una bisagra A formando una estructura en forma de Y Los bucles C y D son horquillas terminales y los bucles B y E son internos 4 Segun los estudios filogeneticos las helices I y III son probablemente ancestrales 9 La helice III incluye dos adenosinas altamente conservadas 10 Se cree que la helice V interactua con TFIIIA 4 Referencias Editar The 3D arrangement of the 23 S and 5 S rRNA in the Escherichia coli 50 S ribosomal subunit based on a cryo electron microscopic reconstruction at 7 5 A resolution J Mol Biol 298 1 35 59 2000 PMID 10756104 doi 10 1006 jmbi 2000 3635 5S Ribosomal RNA Database Nucleic Acids Res 30 1 176 8 January 2002 PMC 99124 PMID 11752286 doi 10 1093 nar 30 1 176 Kaczanowska Magdalena Ryden Aulin Monica 1 de septiembre de 2007 Ribosome biogenesis and the translation process in Escherichia coli Microbiology and molecular biology reviews MMBR 71 3 477 494 ISSN 1092 2172 PMC 2168646 PMID 17804668 doi 10 1128 MMBR 00013 07 Consultado el 18 de noviembre de 2016 a b c Ciganda Martin Williams Noreen 1 de julio de 2011 Eukaryotic 5S rRNA biogenesis Wiley Interdisciplinary Reviews RNA en ingles 2 4 523 533 ISSN 1757 7012 PMC 3278907 PMID 21957041 doi 10 1002 wrna 74 Consultado el 18 de noviembre de 2016 Douet J Tourmente S 1 de julio de 2007 Transcription of the 5S rRNA heterochromatic genes is epigenetically controlled in Arabidopsis thaliana and Xenopus laevis Heredity 99 1 5 13 ISSN 0018 067X PMID 17487217 doi 10 1038 sj hdy 6800964 Consultado el 18 de noviembre de 2016 McBryant Steven J Veldhoen Nik Gedulin Ben Leresche Anne Foster Mark P Wright Peter E Romaniuk Paul J Gottesfeld Joel M 21 de abril de 1995 Interaction of the RNA binding Fingers ofXenopusTranscription Factor IIIA with Specific Regions of 5 S Ribosomal RNA Journal of Molecular Biology 248 1 44 57 doi 10 1006 jmbi 1995 0201 Consultado el 18 de noviembre de 2016 Searles M A Lu D Klug A 4 de agosto de 2000 The role of the central zinc fingers of transcription factor IIIA in binding to 5 S RNA Journal of Molecular Biology 301 1 47 60 ISSN 0022 2836 PMID 10926492 doi 10 1006 jmbi 2000 3946 Consultado el 18 de noviembre de 2016 Pelham H R Brown D D 1 de julio de 1980 A specific transcription factor that can bind either the 5S RNA gene or 5S RNA Proceedings of the National Academy of Sciences en ingles 77 7 4170 4174 ISSN 0027 8424 PMID 7001457 doi 10 1073 pnas 77 7 4170 Consultado el 18 de noviembre de 2016 Sun Feng Jie Caetano Anolles Gustavo 1 de noviembre de 2009 The evolutionary history of the structure of 5S ribosomal RNA Journal of Molecular Evolution 69 5 430 443 ISSN 1432 1432 PMID 19639237 doi 10 1007 s00239 009 9264 z Consultado el 18 de noviembre de 2016 DiNitto J P Huber P W 23 de octubre de 2001 A role for aromatic amino acids in the binding of Xenopus ribosomal protein L5 to 5S rRNA Biochemistry 40 42 12645 12653 ISSN 0006 2960 PMID 11601989 Consultado el 18 de noviembre de 2016 Datos Q10846137Obtenido de https es wikipedia org w index php title ARN ribosomal 5S amp oldid 133522447, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
