Subtilasa
Las subtilasas son una familia de serina proteasas de tipo subtilisina. Parece que han desarrollado en forma independiente y convergente una tríada catalítica de Asp/Ser/His, como en las tripsina serina proteasas. La estructura de las proteínas en esta familia muestra que tienen un pliegue alfa/beta que contiene una hoja beta paralela de 7 hilos. La familia de la subtilisina es la segunda familia de serina proteasa más grande que se ha caracterizado hasta la actualidad. Actualmente se conocen más de 200 subtilasas, de las cuales más de 170 con su secuencia completa de aminoácidos.[2] La subtilasa es generalizada, encontrándose en eubacterias, arqueobacterias, eucariotas y virus.[3] La gran mayoría de la familia son endopeptidasas, aunque hay una exopeptidasa, tripeptidil peptidasa.[3][4] Se han determinado estructuras para varios miembros de la familia de la subtilisina, mostrando que las subtilisinas explotan la misma tríada catalítica que las quimotripsinas aunque los residuos se producen en un orden diferente (His/Asp/Ser en quimotripsina y Asp/His/Ser en subtilisina); de lo contrario las estructuras no muestran similitud con ninguna otra proteína.[3][4]Algunas subtilisinas son proteínas de mosaico, mientras que otras contienen extensiones N y C-terminales que no muestran semejanza de secuencia con ninguna otra proteína conocida.[3] Sobre la base de homología de secuencia, se ha propuesto una subdivisión en seis familias.[2]
| Subtilasa | ||
|---|---|---|
| Estructura del complejo formado entre la subtilisina Carlsberg y eglin c, un inhibidor de la elastasa de la sanguijuela Hirudo medicinalis .[1] | ||
| Identificadores | ||
| Símbolo | Peptidasa_S8 | |
| Pfam | PF00082 | |
| InterPro | IPR000209 | |
| PROSITE | PDOC00125 | |
| SCOP | 1cse | |
| CDD | cd00306 | |
Estructuras PDB disponibles: 1dbi A:134-391 2tec E:13-269 1tec E:13-269 3tec E:13-269 1thm :13-269 2st1 :113-373 1y1k E:113-373 5sic E:113-373 1sbn E:113-373 1ubn A:113-373 1s01 :113-373 1y3b E:113-373 2sni E:113-373 1tmg E:113-373 1dui A:113-373 1y4d E:113-373 1y4a E:113-373 1sib E:113-373 1tm4 E:113-373 2sic E:113-373 1aqn :113-373 1sud :113-373 1sup :113-373 1y3c E:113-373 1sbi :113-373 1tm1 E:113-373 1tm3 E:113-373 1yjb :113-373 1sua A:113-373 1y33 E:113-373 1sue :113-373 1tm5 E:113-373 1sub :113-373 1s02 :113-373 3sic E:113-373 1to2 E:113-373 1y3d E:113-373 1a2q :113-373 1yja :113-373 1y34 E:113-373 2sbt :113-373 1tm7 E:113-373 1y48 E:113-373 1gnv A:113-373 1ak9 :113-373 1sbh :113-373 1to1 E:113-373 1gns A:113-373 1suc :113-373 1st2 :113-373 1au9 :113-373 1v5i A:113-373 1yjc :113-373 1y3f E:113-373 1sbt :113-373 1lw6 E:113-373 1scj A:112-372 1mee A:6-266 1scn E:111-370 1af4 :111-370 1bfu :111-370 1sel B:111-370 1oyv A:111-370 1scd :111-370 1sca :111-370 1yu6 A:111-370 1cse E:111-370 1r0r E:111-370 1av7 :111-370 2sec E:111-370 3vsb :111-370 1bfk :111-370 1be8 :111-370 1scb :111-370 1sbc :111-370 1be6 :111-370 1avt :111-370 1c3l A:111-370 1vsb :111-370 1bh6 A:6-265 1mpt A:117-371 1wsd A:117-371 1ah2 :117-371 1iav A:6-260 1q5p A:6-260 1c9n A:6-260 1c9m A:6-260 1jea :6-260 1ndu A:6-260 1ndq A:6-260 1svn :6-260 1gci :6-260 1tk2 A:6-260 1c9j A:6-260 1st3 :6-260 1r6v A:164-457 1v6c B:150-561 1ea7 A:129-414 1cnm A:117-372 3prk E:117-372 1p7v A:117-372 1ic6 A:117-372 1pek E:117-372 2prk :117-372 1pj8 A:117-372 1ptk :117-372 1bjr E:117-372 1oyo A:117-372 1p7w A:117-372 1pfg A:117-372 1ht3 A:117-372 2pkc :117-372 1egq A:117-372 1s2n A:150-410 1sh7 B:150-410 1wmd A:211-514 1wme A:211-514 1wmf A:211-514 1xf1 B:107-573 1p8j D:127-427 1ot5 A:149-445 1r64 B:149-445 1sio A:195-521 1siu A:195-521 1sn7 A:195-521 1gtj 1:194-515 1gt9 1:194-515 1t1g A:194-515 1gtg 1:194-515 1gtl 2:194-515 1t1i A:194-515 1t1e A:194-515 1kdv A:227-552 1ga6 A:227-552 1ga4 A:227-552 1ke1 A:227-552 1ke2 A:227-552 1ga1 A:227-552 1kdy A:227-552 1kdz A:227-552 1nlu A:227-552 | ||
Las endopeptidasas de procesamiento de proproteína kexina, furina y enzimas relacionadas forman una subfamilia distinta conocida como la subfamilia kexina (S8B). Éstas escinden preferentemente C-terminal a los aminoácidos básicos pareados. Los miembros de esta subfamilia pueden ser identificados por motivos sutilmente diferentes alrededor del sitio activo.[3][4] Los miembros de la familia de la kexina, junto con las endopeptidasas R, T y K de la levadura Tritirachium y la peptidasa degradante de la cutícula de Metarhizium, requieren la activación de tiol. Esto puede atribuirse a la presencia de Cys-173 cerca de la histidina activa.[4] Sólo se conoce 1 miembro viral de la familia de la subtilisina, una proteasa de 56 kDa del virus del herpes 1, que infecta el bagre de canal.[3]
Las Sedolisinas (serina-carboxil peptidasas) son enzimas proteolíticas cuyo pliegue se asemeja al de la subtilisina; sin embargo, son considerablemente más grandes, con los dominios catalíticos maduros que contienen aproximadamente 375 aminoácidos. Las características definitorias de estas enzimas son una tríada catalítica única, Ser / Glu / Asp, así como la presencia de un residuo de ácido aspártico en el agujero de oxianión. Se han resuelto estructuras cristalinas de alta resolución para sedolisina de Pseudomonas sp. 101, así como para la kumamolisina de una bacteria termofílica, Bacillus novo sp. MN - 32. Las mutaciones en el gen humano conduce a una enfermedad neurodegenerativa fatal.[5]
Referencias
- Bode W, Papamokos E, Musil D (Agosto de 1987). «The high-resolution X-ray crystal structure of the complex formed between subtilisin Carlsberg and eglin c, an elastase inhibitor from the leech Hirudo medicinalis. Structural analysis, subtilisin structure and interface geometry». Eur. J. Biochem. 166 (3): 673-92. PMID 3301348. doi:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13566.x.
- ↑ Siezen RJ, Leunissen JA (1997). «Subtilases: the superfamily of subtilisin-like serine proteases». Protein Sci. 6 (3): 501-523. PMC 2143677. PMID 9070434. doi:10.1002/pro.5560060301.
- ↑ Rawlings ND, Barrett AJ (1994). «Families of serine peptidases». Meth. Enzymol. 244: 19-61. PMID 7845208. doi:10.1016/0076-6879(94)44004-2.
- ↑ Rawlings ND, Barrett AJ (1993). «Evolutionary families of peptidases». Biochem. J. 290: 205-218. PMC 1132403. PMID 8439290. doi:10.1042/bj2900205.
- Wlodawer A, Oda K, Li M, Gustchina A, Dunn BM, Oyama H (2003). «Structural and enzymatic properties of the sedolisin family of serine-carboxyl peptidases». Acta Biochim. Pol. 50 (1): 81-102. PMID 12673349.