InterPro es una plataforma con acceso a base de datos de familias, dominios y sitios funcionales de proteínas en donde las características identificables encontradas en proteínas conocidas pueden ser aplicadas a nuevas secuencias de proteínas.
Fue creada en 1999 tras la formación del InterPro Consortium entre el grupo de Swiss-Prot en el Instituto Europeo de Bioinformática y el Instituto Suizo de Bioinformática y los miembros fundadores de las bases de datos Pfam, PRINTS, PROSITE y ProDom. Actualmente integra información de las bases de datos PROSITE, Pfam, PRINTS, ProDom, SMART, TIGRFAMs, PIRSF, SUPERFAMILY, GENE3D y PANTHER.
La base de datos está disponible para búsquedas por texto y basadas en secuencia a través de un servicio web, y para descargas por FTP anónimo. Incluye varios formatos de salida como tablas de texto, documentos XML y gráficos para facilitar el análisis de sus resultados. Al igual que las otras bases de datos del Instituto Europeo de Bioinformática, se encuentra en dominio público.
Referencias
Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, Bairoch A, Bateman A, Binns D, Bradley P, Bork P, Bucher P, Cerutti L, Copley R, Courcelle E, Das U, Durbin R, Fleischmann W, Gough J, Haft D, Harte N, Hulo N, Kahn D, Kanapin A, Krestyaninova M, Lonsdale D, Lopez R, Letunic I, Madera M, Maslen J, McDowall J, Mitchell A, Nikolskaya AN, Orchard S, Pagni M, Ponting CP, Quevillon E, Selengut J, Sigrist CJ, Silventoinen V, Studholme DJ, Vaughan R, Wu CH (2005). «InterPro, progress and status in 2005». Nucleic Acids Res.33 (Database issue): D201-5. PMID 15608177. doi:10.1093/nar/gki106.
Quevillon E, Silventoinen V, Pillai S, Harte N, Mulder N, Apweiler R, Lopez R (2005). «InterProScan: protein domains identifier». Nucleic Acids Res.33 (Web Server issue): W116-20. PMID 15980438. doi:10.1093/nar/gki442.
Enlaces externos
Sitio web de InterPro
Datos:Q3047275
Enero 31, 2023
interpro, plataforma, acceso, base, datos, familias, dominios, sitios, funcionales, proteínas, donde, características, identificables, encontradas, proteínas, conocidas, pueden, aplicadas, nuevas, secuencias, proteínas, creada, 1999, tras, formación, consortiu. InterPro es una plataforma con acceso a base de datos de familias dominios y sitios funcionales de proteinas en donde las caracteristicas identificables encontradas en proteinas conocidas pueden ser aplicadas a nuevas secuencias de proteinas Fue creada en 1999 tras la formacion del InterPro Consortium entre el grupo de Swiss Prot en el Instituto Europeo de Bioinformatica y el Instituto Suizo de Bioinformatica y los miembros fundadores de las bases de datos Pfam PRINTS PROSITE y ProDom Actualmente integra informacion de las bases de datos PROSITE Pfam PRINTS ProDom SMART TIGRFAMs PIRSF SUPERFAMILY GENE3D y PANTHER La base de datos esta disponible para busquedas por texto y basadas en secuencia a traves de un servicio web y para descargas por FTP anonimo Incluye varios formatos de salida como tablas de texto documentos XML y graficos para facilitar el analisis de sus resultados Al igual que las otras bases de datos del Instituto Europeo de Bioinformatica se encuentra en dominio publico Referencias EditarMulder NJ Apweiler R Attwood TK Bairoch A Bateman A Binns D Bradley P Bork P Bucher P Cerutti L Copley R Courcelle E Das U Durbin R Fleischmann W Gough J Haft D Harte N Hulo N Kahn D Kanapin A Krestyaninova M Lonsdale D Lopez R Letunic I Madera M Maslen J McDowall J Mitchell A Nikolskaya AN Orchard S Pagni M Ponting CP Quevillon E Selengut J Sigrist CJ Silventoinen V Studholme DJ Vaughan R Wu CH 2005 InterPro progress and status in 2005 Nucleic Acids Res 33 Database issue D201 5 PMID 15608177 doi 10 1093 nar gki106 Quevillon E Silventoinen V Pillai S Harte N Mulder N Apweiler R Lopez R 2005 InterProScan protein domains identifier Nucleic Acids Res 33 Web Server issue W116 20 PMID 15980438 doi 10 1093 nar gki442 Enlaces externos EditarSitio web de InterPro Datos Q3047275 Obtenido de https es wikipedia org w index php title InterPro amp oldid 147393850, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
