Polimerasa
La polimerasa es una enzima capaz de transcribir o replicar ácidos nucleicos, que resultan cruciales en la división celular (ADN polimerasa) y en la transcripción del ADN (ARN polimerasa).[1] Las ADN polimerasa y la ARN polimerasa se utilizan para ensamblar moléculas de ADN y ARN, respectivamente, copiando una hebra de plantilla de ADN usando interacciones de emparejamiento de bases o ARN mediante replicación de media escalera.
| Polimerasa | ||||
|---|---|---|---|---|
| Estructuras disponibles | ||||
| PDB | Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum | |||
| Identificadores | ||||
| Identificadores externos | ||||
| Número EC | 2.7.7 | |||
| Estructura/Función proteica | ||||
| Tipo de proteína | Transferasa | |||
| Funciones | Enzima | |||
| Ortólogos | ||||
| Especies | ||||
| Ubicación (UCSC) |
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| PubMed (Búsqueda) | ||||
| PMC (Búsqueda) | ||||
| Polimerasa | ||
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| Estructura tridimensional de la ADN polimerasa | ||
| Identificadores | ||
La ADN polimerasa es la enzima que lleva a cabo la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), una técnica que ha desempeñado un papel esencial en el desarrollo de la genética.
Una polimerasa puede depender de la plantilla o ser independiente de la plantilla. La Poly(A)-ARN-Polimerasa (PAP) es un ejemplo de polimerasa independiente de la plantilla. También se sabe que la terminal desoxirribonucleotidil transferasa (TdT) tiene actividades independientes del molde y dependientes del molde.
Diferenciación
| Tipo | Abreviatura | Plantilla → Producto | Función |
|---|---|---|---|
| ADN-dependiente ADN polimerasa | DDDP | ADN → ADN | Replicación |
| ARN-dependiente ADN polimerasa | RDDP | ARN → ADN | Transcripción inversa |
| ADN-dependiente ARN polimerasa | DDRP | ADN → ARN | Transcripción |
| ARN-dependiente ARN polimerasa | RDRP | ARN → ARN | Replicación de los Virus ARN |
| independiente ARN polimerasa | → ARN | ||
| independiente ADN polimerasa | → ADN |
Clasificación
- ADN-dependiente ADN polimerasa (DDDP)
- Familia A: Incluye las ADN polimerasas eucariotas γ, θ, ν y la procariota I.
- Familia B: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ζ, α, δ, ε y la procariotas II. También se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
- Familia D: Incluye la ADN polimerasa procariota D y también se ha propuesto la inclusión de algunas ADN polimerasas virales.
- Familia X: Incluye las ADN polimerasas eucariotas β, σ, λ, μ, TDT y la procariota III.
- Familia Y: Incluye las ADN polimerasas eucariotas ι, κ, η y las procariotas IV y V.
- ADN-dependiente ARN polimerasa (DDRP)
- ARN-dependiente ADN polimerasa (RDDP)
- ARN-dependiente ARN polimerasa (RDRP)
- RdRP viral
- cRdRP eucariota (en algunos eucariotas infectados por virus de ARN)
- Elongación de ARN sin plantilla
- PAP, PNPase
Demostración
Un ejemplo de la ARN polimerasa, que funciona sin plantilla, es la Poly(A)-ARN-Polimerasa (PAP), que se une a la cola Poly(A) de la molécula del ARNm. La terminal desoxirribonucleotidil transferasa (TdT) es una ADN polimerasa independiente de la plantilla.
Por estructura
Las polimerasas generalmente se dividen en dos superfamilias, con pliegue de "mano derecha" y pliegue de "barril beta doble psi" (a menudo simplemente "doble barril"). El primero se ve en casi todas las ADN polimerasas y casi todas las polimerasas virales de subunidad única; están marcados por un dominio de "palma" conservado. Este último se observa en todas las ARN polimerasas de múltiples subunidades, en la cRdRP y en las ADN polimerasas de la "familia D" que se encuentran en las arqueas. La familia "X" representada por la ADN polimerasa beta tiene solo una forma vaga de "palma" y, a veces, se considera una superfamilia diferente.
Las primas generalmente no entran en ninguna categoría. Por ejemplo las primasas bacterianas suelen tener el dominio Toprim y están relacionadas con las topoisomerasas y la helicasa centelleo mitocondrial. Las primasas eucariotas y arqueanas forman una familia AEP no relacionada, posiblemente relacionada con la polimerasa palma. Sin embargo, ambas familias se asocian al mismo conjunto de helicasas.
Referencias
- Audesirk, Teresa; Audesirk, Gerald; Byers, Bruce E. (2003). Biología: la vida en la tierra. Pearson Educación. ISBN 9789702603702. Consultado el 1 de octubre de 2019.