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Interferometría de polarización dual

La interferometría de polarización dual (DPI) es una técnica analítica que prueba las capas moleculares adsorbidas a la superficie de una guía de ondas utilizando la onda evanescente de un rayo láser. Se utiliza para medir el cambio conformacional en proteínas u otras biomoléculas, según funcionan (lo que se conoce como relación de actividad de conformación).

Instrumentación

La DPI[1]​ enfoca la luz láser en dos guías de ondas. Una de estas funciones como guía de ondas de "detección" que tiene una superficie expuesta, mientras que la segunda funciona para mantener un haz de referencia. Se forma un patrón de interferencia bidimensional en el campo lejano combinando la luz que pasa a través de las dos guías de ondas. La técnica DPI rota la polarización del láser para excitar alternativamente dos modos de polarización de las guías de ondas. La medición del interferograma para ambas polarizaciones permite calcular tanto el índice de refracción como el espesor de la capa adsorbida. La polarización se puede cambiar rápidamente, lo que permite mediciones en tiempo real de las reacciones químicas que tienen lugar en la superficie de un chip en un sistema de flujo continuo. Estas medidas se pueden utilizar para inferir información conformacional sobre las interacciones moleculares que tienen lugar, a medida que cambian el tamaño de la molécula (a partir del grosor de la capa) y la densidad de pliegues (a partir del RI). La DPI se usa típicamente para caracterizar interacciones bioquímicas cuantificando cualquier cambio conformacional al mismo tiempo que se miden las velocidades de reacción, las afinidades y la termodinámica.

La técnica es cuantitativa y en tiempo real (10 Hz) con una resolución dimensional de 0.01 nm.[2]

Aplicaciones

Una nueva aplicación para la interferometría de polarización dual surgió en 2008, donde la intensidad de la luz que pasa a través de la guía de ondas se extingue en presencia de crecimiento de cristales. Esto ha permitido controlar las etapas más tempranas de la nucleación de cristales de proteínas.[3]​ Las versiones posteriores de los interferómetros de polarización dual también tienen la capacidad de cuantificar el orden y la interrupción en películas delgadas birrefringentes.[4]​ Esto se ha utilizado, por ejemplo, para estudiar la formación de bicapas lipídicas y su interacción con proteínas de membrana.[5][6]

Referencias

  1. Cross, G; Reeves, AA; Brand, S; Popplewell, JF; Peel, LL; Swann, MJ; Freeman, NJ (2003). «A new quantitative optical biosensor for protein characterisation». Biosensors and Bioelectronics 19 (4): 383-90. PMID 14615097. doi:10.1016/S0956-5663(03)00203-3. 
  2. Swann, MJ; Freeman, NJ; Cross, GH (2007). «Dual Polarization Interferometry: A Real-Time Optical Technique for Measuring (Bio)Molecular Orientation, Structure and Function at the Solid/Liquid Interface». En Marks, R.S.; Lowe, C.R.; Cullen, D.C., eds. Handbook of Biosensors and Biochips. Vol. 1. Wiley. Pt. 4, Ch. 33, pp. 549–568. ISBN 978-0-470-01905-4. 
  3. Boudjemline, A; Clarke, DT; Freeman, NJ; Nicholson, JM; Jones, GR (2008). «Early stages of protein crystallization as revealed by emerging optical waveguide technology». Journal of Applied Crystallography 41 (3): 523. doi:10.1107/S0021889808005098. 
  4. Mashaghi, A; Swann, M; Popplewell, J; Textor, M; Reimhult, E (2008). «Optical Anisotropy of Supported Lipid Structures Probed by Waveguide Spectroscopy and Its Application to Study of Supported Lipid Bilayer Formation Kinetics». Analytical Chemistry 80 (10): 3666-76. PMID 18422336. doi:10.1021/ac800027s. 
  5. Sanghera, N; Swann, MJ; Ronan, G; Pinheiro, TJ (2009). «Insight into early events in the aggregation of the prion protein on lipid membranes». Biochimica et Biophysica Acta 1788 (10): 2245-51. PMID 19703409. doi:10.1016/j.bbamem.2009.08.005. 
  6. Lee, TH; Heng, C; Swann, MJ; Gehman, JD; Separovic, F; Aguilar, MI (2010). «Real-time quantitative analysis of lipid disordering by aurein 1.2 during membrane adsorption, destabilisation and lysis». Biochimica et Biophysica Acta 1798 (10): 1977-86. PMID 20599687. doi:10.1016/j.bbamem.2010.06.023. 

Otras lecturas

  • Cross, GH; Ren, Y; Freeman, NJ (1999). «Young's fringes from vertically integrated slab waveguides: Applications to humidity sensing». Journal of Applied Physics 86 (11): 6483. Bibcode:1999JAP....86.6483C. doi:10.1063/1.371712. 
  • Cross, G (2003). «A new quantitative optical biosensor for protein characterisation». Biosensors and Bioelectronics 19 (4): 383-90. PMID 14615097. doi:10.1016/S0956-5663(03)00203-3. 
  • Freeman, NJ; Peel, LL; Swann, MJ; Cross, GH; Reeves, A; Brand, S; Lu, JR (2004). «Real time, high resolution studies of protein adsorption and structure at the solid–liquid interface using dual polarization interferometry». Journal of Physics: Condensed Matter 16 (26): S2493-S2496. Bibcode:2004JPCM...16S2493F. doi:10.1088/0953-8984/16/26/023. 
  • Khan, TR; Grandin, HM; Mashaghi, A; Textor, M; Reimhult, E; Reviakine, I (2008). «Lipid redistribution in phosphatidylserine-containing vesicles adsorbing on titania.». Biointerphases 3 (2): FA90. PMID 20408675. doi:10.1116/1.2912098. 
  •   Datos: Q3799470

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La interferometria de polarizacion dual DPI es una tecnica analitica que prueba las capas moleculares adsorbidas a la superficie de una guia de ondas utilizando la onda evanescente de un rayo laser Se utiliza para medir el cambio conformacional en proteinas u otras biomoleculas segun funcionan lo que se conoce como relacion de actividad de conformacion Indice 1 Instrumentacion 2 Aplicaciones 3 Referencias 4 Otras lecturasInstrumentacion EditarLa DPI 1 enfoca la luz laser en dos guias de ondas Una de estas funciones como guia de ondas de deteccion que tiene una superficie expuesta mientras que la segunda funciona para mantener un haz de referencia Se forma un patron de interferencia bidimensional en el campo lejano combinando la luz que pasa a traves de las dos guias de ondas La tecnica DPI rota la polarizacion del laser para excitar alternativamente dos modos de polarizacion de las guias de ondas La medicion del interferograma para ambas polarizaciones permite calcular tanto el indice de refraccion como el espesor de la capa adsorbida La polarizacion se puede cambiar rapidamente lo que permite mediciones en tiempo real de las reacciones quimicas que tienen lugar en la superficie de un chip en un sistema de flujo continuo Estas medidas se pueden utilizar para inferir informacion conformacional sobre las interacciones moleculares que tienen lugar a medida que cambian el tamano de la molecula a partir del grosor de la capa y la densidad de pliegues a partir del RI La DPI se usa tipicamente para caracterizar interacciones bioquimicas cuantificando cualquier cambio conformacional al mismo tiempo que se miden las velocidades de reaccion las afinidades y la termodinamica La tecnica es cuantitativa y en tiempo real 10 Hz con una resolucion dimensional de 0 01 nm 2 Aplicaciones EditarUna nueva aplicacion para la interferometria de polarizacion dual surgio en 2008 donde la intensidad de la luz que pasa a traves de la guia de ondas se extingue en presencia de crecimiento de cristales Esto ha permitido controlar las etapas mas tempranas de la nucleacion de cristales de proteinas 3 Las versiones posteriores de los interferometros de polarizacion dual tambien tienen la capacidad de cuantificar el orden y la interrupcion en peliculas delgadas birrefringentes 4 Esto se ha utilizado por ejemplo para estudiar la formacion de bicapas lipidicas y su interaccion con proteinas de membrana 5 6 Referencias Editar Cross G Reeves AA Brand S Popplewell JF Peel LL Swann MJ Freeman NJ 2003 A new quantitative optical biosensor for protein characterisation Biosensors and Bioelectronics 19 4 383 90 PMID 14615097 doi 10 1016 S0956 5663 03 00203 3 Swann MJ Freeman NJ Cross GH 2007 Dual Polarization Interferometry A Real Time Optical Technique for Measuring Bio Molecular Orientation Structure and Function at the Solid Liquid Interface En Marks R S Lowe C R Cullen D C eds Handbook of Biosensors and Biochips Vol 1 Wiley Pt 4 Ch 33 pp 549 568 ISBN 978 0 470 01905 4 Boudjemline A Clarke DT Freeman NJ Nicholson JM Jones GR 2008 Early stages of protein crystallization as revealed by emerging optical waveguide technology Journal of Applied Crystallography 41 3 523 doi 10 1107 S0021889808005098 Mashaghi A Swann M Popplewell J Textor M Reimhult E 2008 Optical Anisotropy of Supported Lipid Structures Probed by Waveguide Spectroscopy and Its Application to Study of Supported Lipid Bilayer Formation Kinetics Analytical Chemistry 80 10 3666 76 PMID 18422336 doi 10 1021 ac800027s Sanghera N Swann MJ Ronan G Pinheiro TJ 2009 Insight into early events in the aggregation of the prion protein on lipid membranes Biochimica et Biophysica Acta 1788 10 2245 51 PMID 19703409 doi 10 1016 j bbamem 2009 08 005 Lee TH Heng C Swann MJ Gehman JD Separovic F Aguilar MI 2010 Real time quantitative analysis of lipid disordering by aurein 1 2 during membrane adsorption destabilisation and lysis Biochimica et Biophysica Acta 1798 10 1977 86 PMID 20599687 doi 10 1016 j bbamem 2010 06 023 Otras lecturas EditarCross GH Ren Y Freeman NJ 1999 Young s fringes from vertically integrated slab waveguides Applications to humidity sensing Journal of Applied Physics 86 11 6483 Bibcode 1999JAP 86 6483C doi 10 1063 1 371712 Cross G 2003 A new quantitative optical biosensor for protein characterisation Biosensors and Bioelectronics 19 4 383 90 PMID 14615097 doi 10 1016 S0956 5663 03 00203 3 Freeman NJ Peel LL Swann MJ Cross GH Reeves A Brand S Lu JR 2004 Real time high resolution studies of protein adsorption and structure at the solid liquid interface using dual polarization interferometry Journal of Physics Condensed Matter 16 26 S2493 S2496 Bibcode 2004JPCM 16S2493F doi 10 1088 0953 8984 16 26 023 Khan TR Grandin HM Mashaghi A Textor M Reimhult E Reviakine I 2008 Lipid redistribution in phosphatidylserine containing vesicles adsorbing on titania Biointerphases 3 2 FA90 PMID 20408675 doi 10 1116 1 2912098 Datos Q3799470Obtenido de https es wikipedia org w index php title Interferometria de polarizacion dual amp oldid 131127584, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

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