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Hélice beta

Noviembre 03, 2021

Una hélice beta es una estructura secundaria de proteínas formada de la asociación de láminas beta paralelas en un patrón helicoidal con dos o tres caras. La estructura se estabiliza por puentes de hidrógeno, interacciones proteína-proteína y, a veces por iones metálicos. Se han identificado hélices beta tanto en sentido horario como antihorario.

Hélice β monomérica, de sentido antihorario de la proteína anticongelante de la mariposa Choristoneura fumiferana (Código PDB 1M8N).
Hélice β dimérica, de sentido horario de la proteína anticongelante del escarabajo Tenebrio molitor (Código PDB 1EZG). Asociación cara a cara de hélices β.

Hélices de doble lámina

Las hélices beta más simples contienen dos "niveles" de láminas beta conectadas por seis bucles ricos en residuos de glicina que contienen invariablemente una aspartato que se une a un ion de calcio por bucle. Cada capa se compone de series casi planas de láminas beta en paralelo, enlazadas por puentes de hidrógeno y las dos capas juntas formando un núcleo hidrofóbico.

Hélices de triple lámina

Las hélices beta de tres láminas forman un prisma triangular distorsionado en el cual cada cara presenta puentes de hidrógeno paralelos entre láminas. Una de las tres hojas que forman el motivo estructural puede aparecer "doblado" en relación con los otros dos, que se encuentran enfrentados de forma similar a la le hélice beta de doble lámina. Dos de los tres bucles que enlazan las hojas pueden ser de una longitud arbitraria y puede incluso contener otros dominios estructurales, y el tercera se limita a solo dos residuos. Una repetición de hexapéptidos característica encontrado en hélices de ambos sentidos es:  . Las hélices beta de tres láminas son considerablemente más largas que su contraparte de dos láminas.

La primera hélice beta se observó en la enzima pectato liasa, que contiene una hélice de siete giros que llega a los 34 Å (3,4 nm) de longitud. Las proteínas de la cola del fago P22, poseen 13 vueltas y su homotrimero ensamblado es de 200 Å (20 nm) de longitud. Su interior está completamente cerrado sin poro central y contiene residuos hidrófobos y residuos neutralizados por puentes de sal.

Tanto la pectato liasa como las proteínas de la cola del fago P22 contienen proteínas que forman hélices de sentido horario; en sentido antihorario se han observado en enzimas, como la UDP-N-acetilglucosamina aciltransferasa y la anhidrasa carbónica de archaeas. Otras proteínas que contienen beta hélices son las proteínas anticongelantes del escarabajo Tenebrio molitor y la mariposa, Choristoneura fumiferana, donde treoninas espaciadas regularmente en hélices beta se unen a la superficie de los cristales de hielo e inhiben su crecimiento.

Las hélices beta pueden asociarse entre sí de manera eficaz, ya sea cara a cara (el apareamiento de las caras de su prisma triangular) o de extremo a extremo (formando puentes de hidrógeno). Por lo tanto, las hélices beta pueden ser utilizadas como "etiquetas" para inducir a otras proteínas a asociarse, de forma similar a una superhélice.

Referencias

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  • Yoder MD, Keen NT and Jurnak F. (1993) "New domain motif:the structure of pectate lyase C, a secreted plant virulence factor", Science, 260, 1503-1507.

Enlaces externos

  • Familia de proteínas CATH hélice-β (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).
  •   Datos: Q487869

Noviembre 03, 2021
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Una helice beta es una estructura secundaria de proteinas formada de la asociacion de laminas beta paralelas en un patron helicoidal con dos o tres caras La estructura se estabiliza por puentes de hidrogeno interacciones proteina proteina y a veces por iones metalicos Se han identificado helices beta tanto en sentido horario como antihorario Helice b monomerica de sentido antihorario de la proteina anticongelante de la mariposa Choristoneura fumiferana Codigo PDB 1M8N Helice b dimerica de sentido horario de la proteina anticongelante del escarabajo Tenebrio molitor Codigo PDB 1EZG Asociacion cara a cara de helices b Indice 1 Helices de doble lamina 2 Helices de triple lamina 3 Referencias 4 Enlaces externosHelices de doble lamina EditarLas helices beta mas simples contienen dos niveles de laminas beta conectadas por seis bucles ricos en residuos de glicina que contienen invariablemente una aspartato que se une a un ion de calcio por bucle Cada capa se compone de series casi planas de laminas beta en paralelo enlazadas por puentes de hidrogeno y las dos capas juntas formando un nucleo hidrofobico Helices de triple lamina EditarLas helices beta de tres laminas forman un prisma triangular distorsionado en el cual cada cara presenta puentes de hidrogeno paralelos entre laminas Una de las tres hojas que forman el motivo estructural puede aparecer doblado en relacion con los otros dos que se encuentran enfrentados de forma similar a la le helice beta de doble lamina Dos de los tres bucles que enlazan las hojas pueden ser de una longitud arbitraria y puede incluso contener otros dominios estructurales y el tercera se limita a solo dos residuos Una repeticion de hexapeptidos caracteristica encontrado en helices de ambos sentidos es L I V G A E D X 2 S T A V X displaystyle mathrm LIV GAED X 2 STAV X Las helices beta de tres laminas son considerablemente mas largas que su contraparte de dos laminas La primera helice beta se observo en la enzima pectato liasa que contiene una helice de siete giros que llega a los 34 A 3 4 nm de longitud Las proteinas de la cola del fago P22 poseen 13 vueltas y su homotrimero ensamblado es de 200 A 20 nm de longitud Su interior esta completamente cerrado sin poro central y contiene residuos hidrofobos y residuos neutralizados por puentes de sal Tanto la pectato liasa como las proteinas de la cola del fago P22 contienen proteinas que forman helices de sentido horario en sentido antihorario se han observado en enzimas como la UDP N acetilglucosamina aciltransferasa y la anhidrasa carbonica de archaeas Otras proteinas que contienen beta helices son las proteinas anticongelantes del escarabajo Tenebrio molitor y la mariposa Choristoneura fumiferana donde treoninas espaciadas regularmente en helices beta se unen a la superficie de los cristales de hielo e inhiben su crecimiento Las helices beta pueden asociarse entre si de manera eficaz ya sea cara a cara el apareamiento de las caras de su prisma triangular o de extremo a extremo formando puentes de hidrogeno Por lo tanto las helices beta pueden ser utilizadas como etiquetas para inducir a otras proteinas a asociarse de forma similar a una superhelice Referencias EditarBranden C Tooze J 1999 Introduction to Protein Structure 2nd ed Garland Publishing New York NY pp 84 6 Dicker IB and Seetharam S 1992 What is Known about the Structure and Function of the Eschericia coli Protein FirA Mol Microbiol 6 817 823 Kisker C Schindelin H Alber BE Ferry JG and Rees DC 1996 A left handed b helix revealed by the crystal structure of a carbonic anhydrase from the achaeon Methanosarcina thermophile EMBO J 15 2323 2330 Liou YC Tocilj A Davies PL and Jia Z 2000 Mimicry of ice structure by surface hydroxyls and water of a beta helix antifreeze protein Nature 406 322 324 Leinala EK Davies PL and Jia Z 2002 Crystal Structure of b Helical Anitfreeze Protein Points to a General Ice Binding Model Structure 10 619 627 Raetz CRH and Roderick SL 1995 A Left Handed Parallel b Helix in the Structure of UDP N Acetylglucosamine Acyltransferase Science 270 997 1000 Steinbacher S Seckler R Miller S Steipe B Huber R and Reinemer P 1994 Crystal structure of P22 tailspike protein interdigitated subunits in a thermostable trimer Science 265 383 386 Vaara M 1992 Eight bacterial proteins including UDP N acetylglucosamine acyltransferase LpxA and three other transferases of Escherichia coli consist of a six residue periodicity theme FEMS Microbiol Lett 97 249 254 Yoder MD Keen NT and Jurnak F 1993 New domain motif the structure of pectate lyase C a secreted plant virulence factor Science 260 1503 1507 Enlaces externos EditarFamilia SCOP de helices b de sentido horario Familia SCOP de helices b de sentido antihorario Familia de proteinas CATH helice b enlace roto disponible en Internet Archive vease el historial la primera version y la ultima Datos Q487869 Obtenido de https es wikipedia org w index php title Helice beta amp oldid 137501555, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, 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