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Haplogrupo S (ADN-Y)

Octubre 01, 2021

En genética humana, el haplogrupo S es un haplogrupo del ADN del cromosoma Y, característico de Oceanía, por lo que es común tanto en los nativos de Australia como en los de Melanesia y demás islas del Pacífico. Deriva del haplogrupo MS, y como tal está definido por el marcador P405[1]​ y B254. Hasta hace poco S se definió por el marcador M230, pero este queda ahora como un subclado.

S (P405) también es llamado K-P405[2]​ o K2b1a,[3]​ y se habría originado probablemente en Insulindia hace unos 44 mil años.[2]​

Subclados

 
Zona de distribución del haplogrupo S-M230 del ADN-Y.

Las frecuencias más importantes son las siguientes:

Rama S-M230

S1 (M230) es el clado de S más frecuente en Melanesia y el más estudiado. Tiene un origen probable en Nueva Guinea hace 28.000 a 41.000 años.[4]​

Según Kayser et al.2003,[5]​ S (M230) es característico de la región Melanesia y es predominante en la zona montañosa de Papúa Nueva Guinea, con frecuencias del 52%; en las costas de este país encuentra 16%, en las islas Molucas 21%, en los tolái de Nueva Bretaña 12,5% y en islas menores de la Sonda 10%.

Es importante en parte de las islas menores de la Sonda (Indonesia oriental), presentando en Lembata 34%, Sumba 16%, Pantar 15%, Timor 8%, Flores 8% y Alor 7%.[6]​

Frecuencias menores se encuentran en Malaita (Islas Salomón) con 8%[7]​ y poco en Nueva Guinea Occidental, salvo en la zona de lagos Paniai donde se encontró 74%.[8]​ En Vanuatu se encontró 9%, en Célebes 5%, en Nueva Bretaña 4% y en Filipinas 4%.[6]​

S-P60

Previamente se reportó como K* y con una frecuencia de 42% en aborígenes australianos.[9]​ Según otros datos, en Australia se encontró 30% en Tierra de Arnhem y 17% en Gran Desierto Arenoso.[10]​

Distribución por subclados

Según la filogenia más reciente (2014),[11]​ los subclados del haplogrupo S son los siguientes:

Haplogrupo S o K2b1a (P405/F3744, B254):

  • S* o K-P405* o K2b1a*: En Micronesia un 6%. En Selangor (Malasia).[12]​
  • S1 (B255)
    • S1*: Encontrado en restos en Australia.[12]​
    • S1a (Z41335, Y26122)
    • S1b (B275): En Filipinas
    • S1c
    • S1d (SK1806): En Papua New Guinea, Indonesia y Vanuatu.
    • K-P315 o K2b1a3: Típico de Melanesia.[13]​
  • S2 (P378) En Filipinas (pueblo aeta)[17]​ con una frecuencia del 60%.[6]​
  • S3 (P336) Poco en Indonesia, particularmente en Alor 26% y Borneo 5.8%.[6]​
  • S4 (BY22870) En Filipinas.



Referencias

  1. van Oven M et al 2014.Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. (versión 10-Jun-2014)
  2. ↑ YFull Experimental YTree v2.21 1000 Genomes Project © HGDP Project.
  3. Tatiana M Karafet et al 2014. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. European Journal of Human Genetics , (4 June 2014) | doi:10.1038/ejhg.2014.106
  4. ↑ Laura Scheinfeldt, Françoise Friedlaender, Jonathan Friedlaender, Krista Latham, George Koki, Tatyana Karafet, Michael Hammer and Joseph Lorenz, "Unexpected NRY Chromosome Variation in Northern Island Melanesia," Molecular Biology and Evolution 2006 23(8):1628-1641
  5. Kayser M, Brauer S, Weiss G, Schiefenho¨vel W, Underhill P, Shen P, Oefner P, Tommaseo-Ponzetta M, Stoneking (2003) Reduced Y-Chromosome, but Not Mitochondrial DNA, Diversity in Human Populations from West New Guinea Am J Hum Genet 72:281–302
  6. ↑ Karafet, T., Mendez, F., Sudoyo, H. et al. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. Eur J Hum Genet 23, 369–373 (2015). https://doi.org/10.1038/ejhg.2014.106
  7. Murray P. Cox y Marta Mirazón Lahr (2006) American Journal of Human Biology 18:35–50 2006
  8. ↑ Stefano Mona et al 2007, Patterns of Y-Chromosome Diversity Intersect with the Trans-New Guinea Hypothesis
  9. Hammer M et al. 2006 Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes.
  10. Kayser M et al. 2006, Melanesian and Asian Origins of Polynesians: mtDNA and Y Chromosome Gradients Across the Pacific. Molecular Biology and Evolution 23(11):2234–2244. (2006) doi:10.1093/molbev/msl093
  11. van Oven M et al 2014. Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. Hum Mutat 35(2):187-191. doi:10.1002/humu.22468. phylotree
  12. ↑ S Haplogroup YTree 2012-2020 YFull
  13. ↑ Tatiana M Karafet et al 2014. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. European Journal of Human Genetics. ISSN 1018-4813 EISSN 1476-5438
  14. Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  15. Y-DNA Haplogroup K and its Subclades. ISOGG, rev. 2014
  16. Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven et al., "The impact of the Austronesian expansion: evidence from mtDNA and Y-chromosome diversity in the Admiralty Islands of Melanesia," Molecular Biology and Evolution (2008)
  17. Y-DNA Haplogroup S and its Subclades - 2019-2020 ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree

Enlaces externos

  • en:Y-DNA haplogroups in Oceanian populations
  •   Datos: Q428836
  •   Multimedia: Haplogroup S of Y-DNA

Octubre 01, 2021
haplogrupo, genética, humana, haplogrupo, haplogrupo, cromosoma, característico, oceanía, común, tanto, nativos, australia, como, melanesia, demás, islas, pacífico, deriva, haplogrupo, como, está, definido, marcador, p405, b254, hasta, hace, poco, definió, mar. En genetica humana el haplogrupo S es un haplogrupo del ADN del cromosoma Y caracteristico de Oceania por lo que es comun tanto en los nativos de Australia como en los de Melanesia y demas islas del Pacifico Deriva del haplogrupo MS y como tal esta definido por el marcador P405 1 y B254 Hasta hace poco S se definio por el marcador M230 pero este queda ahora como un subclado S P405 tambien es llamado K P405 2 o K2b1a 3 y se habria originado probablemente en Insulindia hace unos 44 mil anos 2 Indice 1 Subclados 1 1 Rama S M230 1 2 S P60 1 3 Distribucion por subclados 2 Referencias 3 Enlaces externosSubclados Editar Zona de distribucion del haplogrupo S M230 del ADN Y Las frecuencias mas importantes son las siguientes Rama S M230 Editar S1 M230 es el clado de S mas frecuente en Melanesia y el mas estudiado Tiene un origen probable en Nueva Guinea hace 28 000 a 41 000 anos 4 Segun Kayser et al 2003 5 S M230 es caracteristico de la region Melanesia y es predominante en la zona montanosa de Papua Nueva Guinea con frecuencias del 52 en las costas de este pais encuentra 16 en las islas Molucas 21 en los tolai de Nueva Bretana 12 5 y en islas menores de la Sonda 10 Es importante en parte de las islas menores de la Sonda Indonesia oriental presentando en Lembata 34 Sumba 16 Pantar 15 Timor 8 Flores 8 y Alor 7 6 Frecuencias menores se encuentran en Malaita Islas Salomon con 8 7 y poco en Nueva Guinea Occidental salvo en la zona de lagos Paniai donde se encontro 74 8 En Vanuatu se encontro 9 en Celebes 5 en Nueva Bretana 4 y en Filipinas 4 6 S P60 Editar Previamente se reporto como K y con una frecuencia de 42 en aborigenes australianos 9 Segun otros datos en Australia se encontro 30 en Tierra de Arnhem y 17 en Gran Desierto Arenoso 10 Distribucion por subclados Editar Segun la filogenia mas reciente 2014 11 los subclados del haplogrupo S son los siguientes Haplogrupo S o K2b1a P405 F3744 B254 S o K P405 o K2b1a En Micronesia un 6 En Selangor Malasia 12 S1 B255 S1 Encontrado en restos en Australia 12 S1a Z41335 Y26122 S1a Encontrado en restos en Australia 12 S1a1 Z42413 S1a1 Encontrado en restos en Australia 12 S1a1a Z41513 En Australia S1a1a1 o K2b1a1 P60 P308 P304 Antes K1 K2 o K4 Es el haplogrupo mas importante entre los aborigenes australianos despues de C1 13 S1a1b M230 P202 P204 Es tipico de la region de Melanesia en especial en Papua Nueva Guinea en donde coincide con la zona de mayor diversidad en las lenguas papues Previamente fue denominado K5 renombrado S por Karafet et al 2008 14 y S1 por van Oven et al 2014 S1a1b1 M254 Comun en Melanesia y Este de Indonesia encontrandose 10 5 en las Islas menores de la Sonda 8 S M226 Poco en las islas del Almirantazgo y costas de Papua Nueva Guinea S1a2 Z41767 S1a2a o K2b1a2 P79 P307 P299 Antes K2 K3 o K6 Propio de Melanesia con 14 15 Polinesia 16 y Micronesia En Papua Nueva Guinea incluye a Nueva Bretana con un 23 4 y en disperso en las demas islas de PNG como las islas del Almirantazgo S1a3 FGC36892 Aborigenes de Australia S1b B275 En Filipinas S1c S1d SK1806 En Papua New Guinea Indonesia y Vanuatu K P315 o K2b1a3 Tipico de Melanesia 13 S2 P378 En Filipinas pueblo aeta 17 con una frecuencia del 60 6 S3 P336 Poco en Indonesia particularmente en Alor 26 y Borneo 5 8 6 S4 BY22870 En Filipinas Haplogrupos del cromosoma Y humanoAdan cromosomicoABTB CTDE CFD E C FC1 C2 G H IJKIJ KI J LT K2L T MS P NOM S Q R N OR1 R2R1a R1bReferencias Editar van Oven M et al 2014 Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome version 10 Jun 2014 a b YFull Experimental YTree v2 21 1000 Genomes Project c HGDP Project Tatiana M Karafet et al 2014 Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y chromosome haplogroup K M526 in Southeast Asia European Journal of Human Genetics 4 June 2014 doi 10 1038 ejhg 2014 106 a b Laura Scheinfeldt Francoise Friedlaender Jonathan Friedlaender Krista Latham George Koki Tatyana Karafet Michael Hammer and Joseph Lorenz Unexpected NRY Chromosome Variation in Northern Island Melanesia Molecular Biology and Evolution 2006 23 8 1628 1641 Kayser M Brauer S Weiss G Schiefenho vel W Underhill P Shen P Oefner P Tommaseo Ponzetta M Stoneking 2003 Reduced Y Chromosome but Not Mitochondrial DNA Diversity in Human Populations from West New Guinea Am J Hum Genet 72 281 302 a b c d Karafet T Mendez F Sudoyo H et al Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y chromosome haplogroup K M526 in Southeast Asia Eur J Hum Genet 23 369 373 2015 https doi org 10 1038 ejhg 2014 106 Murray P Cox y Marta Mirazon Lahr 2006 Y Chromosome Diversity Is Inversely Associated With Language Affiliation in Paired Austronesian and Papuan Speaking Communities from Solomon Islands American Journal of Human Biology 18 35 50 2006 a b Stefano Mona et al 2007 Patterns of Y Chromosome Diversity Intersect with the Trans New Guinea Hypothesis Hammer M et al 2006 Dual origins of the Japanese common ground for hunter gatherer and farmer Y chromosomes Kayser M et al 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