El dominio SH3 (del inglés Src Homology 3) es un pequeño dominio de proteínas de entre 55 y 70 aminoácidos identificado por primera vez como una región conservada en la proteína viral v-Crk y partes no catalíticas de enzimas tales como fosfolipasa y varias tironsinquinasas citoplasmáticas como Abl y Src.[1] También se ha identificado en varias otras familias de proteínas, tales como: Pi3 quinasa, Ras proteína activadora de GTPasa, CDC24 y CDC25. El dominio SH3 tiene una estructura de barril beta característico que consta de cinco o seis plegamientos tipo beta organizadas como dos láminas beta perfectamente ensambladas de forma antiparalela. Las regiones de unión pueden contener hélices cortas.[2] Aproximadamente 500 dominios SH3 son codificados en el genoma humano.[3]
El tipo SH3 es un dominio antiguo encontrado en eucariotas y procariotas. Ejemplos de plegamientos similares son los de OB, los cuales pueden por ejemplo unirse a los azúcares o al dominio de unión al ADN de la ADN integrasa del VIH. Tal funcionalidad los diferencia a la de los dominios SH3 con los cuales en ocasiones no tiene homología reconocible a nivel de secuencia aminoacídica. Los dominios SH3 clásicos se encuentra normalmente en las proteínas que interactúan con otras proteínas y median en el montaje de complejos de proteínas específicos, generalmente a través de la unión a péptidos ricos en prolina con su respectiva pareja de unión. Los SH3 clásicos en los seres humanos se limitan a las proteínas intracelulares, pero la pequeña familia de proteínas extracelulares MIA también contiene proteínas con un dominio SH3.[4]
Muchos epítopos de proteínas de unión a SH3 tienen una secuencia consenso: -X-P-p-X-P- con X siendo aminoácidos alifáticos, P siempre una prolina y p sólo a veces. La secuencia se une a la del bolsillo hidrofóbico del dominio SH3.[5]
Se han encontrado dominios SH3, que se unen a un motivo de consenso R-x-x-K. Ejemplos de ello son los dominios SH3 en la región C-terminal de proteínas adaptadoras como Grb2 y Mona (conocidas como Gads, Grap2, Grf40, GrpL etc.).[6] Otros motivos de unión a SH3 han surgido y siguen surgiendo en el curso de diversos estudios moleculares, poniendo de relieve la versatilidad de este dominio.
Dominios SH3 se encuentran en proteínas de las vías de señalización que regulan el citoesqueleto, la proteína Ras, y la quinasa Src y muchas otros. También regulan el estado de la actividad de proteínas adaptadoras y otras tirosinquinasas y están pensados para aumentar la especificidad de sustrato de la tirosinquinasas por uniéndose lejos del centro catalítico de la quinasa.
Referencias
Faravellia A., Dimasia N. (2006). «Expression, refolding and crystallizations of the Grb2-like (GADS) C-terminal SH3 domain complexed with a SLP-76 motif peptide». Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun62: 52-55. doi:10.1107/S1744309105041023.
Pawson T., Schlessingert J. (1993). «SH2 and SH3 domains.». Curr. Biol.3: 434-442. PMID 15335710.
Harkiolaki1 M., Lewitzky1 M., Gilbert R., Jones Y., Bourette R., Mouchiroud G., Sondermann H., Moarefi I., Feller S. (2003). «Structural basis for SH3 domain-mediated high-affinity binding between Mona/Gads and SLP-76.». The EMBO Journal3: 2571-2582. doi:10.1093/emboj/cdg258.
Stoll R, Bosserhoff A. (junio de 2008). «Extracellular SH3 domain containing proteins--features of a new protein family.». Curr Protein Pept Sci.9 (3): 221-6. PMID 18537677.
Witter DJ, Famiglietti SJ, Cambier JC, Castelhano AL. (1998). «Design and synthesis of SH3 domain binding ligands: modifications of the consensus sequence XPpXP.». Bioorg Med Chem Lett.8 (22): 3137-42. PMID 9873691.
Harkiolaki M, Tsirka T, Lewitzky M, Simister PC, Joshi D, Bird LE, Jones EY, O'Reilly N, Feller SM. (2009). «Distinct binding modes of two epitopes in Gab2 that interact with the SH3C domain of Grb2.». Structure.17 (6): 809-22. PMID 19523899.
dominio, dominio, inglés, homology, pequeño, dominio, proteínas, entre, aminoácidos, identificado, primera, como, región, conservada, proteína, viral, partes, catalíticas, enzimas, tales, como, fosfolipasa, varias, tironsinquinasas, citoplasmáticas, como, tamb. El dominio SH3 del ingles Src Homology 3 es un pequeno dominio de proteinas de entre 55 y 70 aminoacidos identificado por primera vez como una region conservada en la proteina viral v Crk y partes no cataliticas de enzimas tales como fosfolipasa y varias tironsinquinasas citoplasmaticas como Abl y Src 1 Tambien se ha identificado en varias otras familias de proteinas tales como Pi3 quinasa Ras proteina activadora de GTPasa CDC24 y CDC25 El dominio SH3 tiene una estructura de barril beta caracteristico que consta de cinco o seis plegamientos tipo beta organizadas como dos laminas beta perfectamente ensambladas de forma antiparalela Las regiones de union pueden contener helices cortas 2 Aproximadamente 500 dominios SH3 son codificados en el genoma humano 3 El tipo SH3 es un dominio antiguo encontrado en eucariotas y procariotas Ejemplos de plegamientos similares son los de OB los cuales pueden por ejemplo unirse a los azucares o al dominio de union al ADN de la ADN integrasa del VIH Tal funcionalidad los diferencia a la de los dominios SH3 con los cuales en ocasiones no tiene homologia reconocible a nivel de secuencia aminoacidica Los dominios SH3 clasicos se encuentra normalmente en las proteinas que interactuan con otras proteinas y median en el montaje de complejos de proteinas especificos generalmente a traves de la union a peptidos ricos en prolina con su respectiva pareja de union Los SH3 clasicos en los seres humanos se limitan a las proteinas intracelulares pero la pequena familia de proteinas extracelulares MIA tambien contiene proteinas con un dominio SH3 4 Muchos epitopos de proteinas de union a SH3 tienen una secuencia consenso X P p X P con X siendo aminoacidos alifaticos P siempre una prolina y p solo a veces La secuencia se une a la del bolsillo hidrofobico del dominio SH3 5 Se han encontrado dominios SH3 que se unen a un motivo de consenso R x x K Ejemplos de ello son los dominios SH3 en la region C terminal de proteinas adaptadoras como Grb2 y Mona conocidas como Gads Grap2 Grf40 GrpL etc 6 Otros motivos de union a SH3 han surgido y siguen surgiendo en el curso de diversos estudios moleculares poniendo de relieve la versatilidad de este dominio Dominios SH3 se encuentran en proteinas de las vias de senalizacion que regulan el citoesqueleto la proteina Ras y la quinasa Src y muchas otros Tambien regulan el estado de la actividad de proteinas adaptadoras y otras tirosinquinasas y estan pensados para aumentar la especificidad de sustrato de la tirosinquinasas por uniendose lejos del centro catalitico de la quinasa Referencias Editar Faravellia A Dimasia N 2006 Expression refolding and crystallizations of the Grb2 like GADS C terminal SH3 domain complexed with a SLP 76 motif peptide Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 62 52 55 doi 10 1107 S1744309105041023 Pawson T Schlessingert J 1993 SH2 and SH3 domains Curr Biol 3 434 442 PMID 15335710 Harkiolaki1 M Lewitzky1 M Gilbert R Jones Y Bourette R Mouchiroud G Sondermann H Moarefi I Feller S 2003 Structural basis for SH3 domain mediated high affinity binding between Mona Gads and SLP 76 The EMBO Journal 3 2571 2582 doi 10 1093 emboj cdg258 Stoll R Bosserhoff A junio de 2008 Extracellular SH3 domain containing proteins features of a new protein family Curr Protein Pept Sci 9 3 221 6 PMID 18537677 Witter DJ Famiglietti SJ Cambier JC Castelhano AL 1998 Design and synthesis of SH3 domain binding ligands modifications of the consensus sequence XPpXP Bioorg Med Chem Lett 8 22 3137 42 PMID 9873691 Harkiolaki M Tsirka T Lewitzky M Simister PC Joshi D Bird LE Jones EY O Reilly N Feller SM 2009 Distinct binding modes of two epitopes in Gab2 that interact with the SH3C domain of Grb2 Structure 17 6 809 22 PMID 19523899 Enlaces externos EditarDominio SH3 en PROSITE Entrada del dominio SH3 en la base de datos SMART Datos Q24771787 Obtenido de https es wikipedia org w index php title Dominio SH3 amp oldid 120677438, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
