Los dominios LIM son dominios estructurales de proteínas compuestos de dos motivos de dedos de zinc contiguos, unidos por una región de unión hidrofóbica compuesta de dos aminoácidos.[1] La denominación LIM proviene de las iniciales de las primeras proteínas en las que se hallaron este tipo de dominios: Lin11, Isl-1 y Mec-3.[2] Las proteínas que contienen dominios LIM han demostrado jugar un importante papel en la organización del citoesqueleto, la organogénesis y la oncogénesis. Los dominios LIM interacciones proteína:proteína que son cruciales para el correcto funcionamiento de determinados procesos celulares.
Dominio LIM
Estructura del 4º dominio LIM de la proteína PINCH. Los átomos de zinc se muestran en color gris.
Los diversos dominios LIM existentes presentan una alta divergencia en sus secuencias, aparte de ciertos residuos clave que se han mantenido conservados a lo largo de la evolución. Las secuencias divergentes permiten una gran flexibilidad en cuanto a los sitios de unión que pueden reconocer estos dominios. Los residuos conservados con aquellos implicados en el sitio de unión de zinc o en el núcleo hidrofóbico de la proteína. La secuencia consenso típica de los dominios LIM es la siguiente:
Los dominios LIM suelen aparecer en las proteínas en número superior a uno, tal y como sucede con las proteínas TES y LMO4, y también pueden acoplarse a otros dominios con el fin de conferir la función de unir o marcar la proteína, como en el caso de las LIM-quinasas.
Referencias
Kadrmas JL, Beckerle MC (2004). «The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus». Nat. Rev. Mol. Cell Biol.5 (11): 920-31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499.
Bach I (2000). «The LIM domain: regulation by association». Mech. Dev.91 (1-2): 5-17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7.
Enlaces externos
Base de datos DBD para la predicción de factores de transcripción el 4 de diciembre de 2008 en Wayback Machine.
Clasificación de factores de transcripción de acuerdo a la base de datos Transfac
Datos:Q24722007
Multimedia:Category:LIM domain
Septiembre 10, 2021
dominio, dominios, dominios, estructurales, proteínas, compuestos, motivos, dedos, zinc, contiguos, unidos, región, unión, hidrofóbica, compuesta, aminoácidos, denominación, proviene, iniciales, primeras, proteínas, hallaron, este, tipo, dominios, lin11, prote. Los dominios LIM son dominios estructurales de proteinas compuestos de dos motivos de dedos de zinc contiguos unidos por una region de union hidrofobica compuesta de dos aminoacidos 1 La denominacion LIM proviene de las iniciales de las primeras proteinas en las que se hallaron este tipo de dominios Lin11 Isl 1 y Mec 3 2 Las proteinas que contienen dominios LIM han demostrado jugar un importante papel en la organizacion del citoesqueleto la organogenesis y la oncogenesis Los dominios LIM interacciones proteina proteina que son cruciales para el correcto funcionamiento de determinados procesos celulares Dominio LIMEstructura del 4º dominio LIM de la proteina PINCH Los atomos de zinc se muestran en color gris IdentificadoresSimboloLIMPfamPF00412InterProIPR001781PROSITEPDOC00382SCOP1ctlEstructuras PDB disponibles PDB 1nyp editar datos en Wikidata Los diversos dominios LIM existentes presentan una alta divergencia en sus secuencias aparte de ciertos residuos clave que se han mantenido conservados a lo largo de la evolucion Las secuencias divergentes permiten una gran flexibilidad en cuanto a los sitios de union que pueden reconocer estos dominios Los residuos conservados con aquellos implicados en el sitio de union de zinc o en el nucleo hidrofobico de la proteina La secuencia consenso tipica de los dominios LIM es la siguiente C X 2 4 C X 13 19 W H X 2 4 C F LVI C X 2 4 C X 13 20 C X 2 4 C Organizacion de un dominio LIM Los dominios LIM suelen aparecer en las proteinas en numero superior a uno tal y como sucede con las proteinas TES y LMO4 y tambien pueden acoplarse a otros dominios con el fin de conferir la funcion de unir o marcar la proteina como en el caso de las LIM quinasas Referencias Editar Kadrmas JL Beckerle MC 2004 The LIM domain from the cytoskeleton to the nucleus Nat Rev Mol Cell Biol 5 11 920 31 PMID 15520811 doi 10 1038 nrm1499 Bach I 2000 The LIM domain regulation by association Mech Dev 91 1 2 5 17 PMID 10704826 doi 10 1016 S0925 4773 99 00314 7 Enlaces externos EditarBase de datos DBD para la prediccion de factores de transcripcion Archivado el 4 de diciembre de 2008 en Wayback Machine Clasificacion de factores de transcripcion de acuerdo a la base de datos Transfac Datos Q24722007 Multimedia Category LIM domainObtenido de https es wikipedia org w index php title Dominio LIM amp oldid 134226656, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
