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Blue Brain

El proyecto Blue Brain[1]​ tiene como objetivo estudiar la estructura del cerebro de mamíferos creando una simulación de todo el cerebro a nivel molecular. Esta ingeniería inversa del comportamiento permitirá avanzar en el entendimiento del funcionamiento del cerebro así como estudiar sus disfunciones.

El proyecto adquiere carácter internacional con el proyecto Cajal Blue Brain de la UPM (CeSViMa) que incorpora a España en la iniciativa.

Historia

El proyecto se inicia en 2002 cuando Henry Markram funda el Brain Mind Institute en el École Polytechnique. Sin embargo, no es hasta la firma del acuerdo de colaboración entre IBM y el profesor Henry Markram (6 de junio de 2005) cuando el proyecto inicia su andadura.

Durante el año 2006 el proyecto se centra en la creación del modelo de la columna cortical (la unidad funcional básica del cerebro). En noviembre de 2007 el proyecto alcanza un importante hito[2]​ al finalizar el modelo y con él la primera fase. El resultado de la primera fase es un proceso basado en datos para crear, validar e investigar la columna cortical.

En mayo de 2009,[3]​ se presenta la iniciativa española denominada Cajal Blue Brain. Este proyecto está coordinado por la UPM (Facultad de Informática/CeSViMa) con colaboración del Instituto Cajal del CSIC. El proyecto utiliza los recursos proporcionados por el supercomputador Magerit instalado en el CeSViMa.

Fases

El proyecto se ha dividido en dos fases, la primera de las cuales se completó en noviembre de 2007.

Fase I

El objetivo inicial del proyecto es simular la columna cortical, que puede considerarse la menor unidad funcional del neocórtex (la parte del cerebro que se cree responsable de las funciones superiores como el pensamiento consciente). Esta columna tiene una altura de 2 milímetros, un diámetro de 0,5 milímetros y contiene unas 60.000 neuronas en humanos.

La simulación se centra en la columna neocortical de las ratas, que tienen una estructura muy similar pero que contienen únicamente 10 000 neuronas y 108 conexiones sinápticas. Durante los últimos 10 años, el profesor Markram ha estudiado los tipos de neuronas y sus conexiones en esta columna para generar un modelo de su funcionamiento.

Fase II

Tras obtener el modelo de funcionamiento el siguiente paso es realizar y validar simulaciones basadas en dicho modelo. En esta fase se continuará con dos ramas diferentes:

  • Construcción de la simulación a nivel molecular, cuyo interés reside que permitirá estudiar los efectos de los genes
  • Simplificación de la simulación de la columna para permitir la simulación paralela de un gran número de columnas interconectadas, con el objetivo final de simular un neocórtex completo (que en el caso de los humanos consiste en un millón de columnas, aproximadamente).

Los siguientes pasos es ascender al nivel del gato para alcanzar seguidamente el de los primates.

Simulación total del cerebro

Un objetivo a largo plazo es construir una simulación detallada y funcional de los procesos fisiológicos en el cerebro humano: "No es imposible construir un cerebro humano, y podemos hacerlo en 10 años", Henry Markram, director del Blue Brain Project dijo en 2009 en la conferencia TED en Oxford.[4]​ En una entrevista de la BBC World Service, él dijo: "Si nosotros lo construimos correctamente este debería hablar y tener una inteligencia y un comportamiento en gran medida como un ser humano."[4]

Financiación

El proyecto está financiado principalmente por el gobierno suizo y en segundo lugar por las subvenciones y donaciones de algunos particulares. La EPFL compró la computadora Blue Gene a un costo reducido, porque en ese momento era todavía un prototipo y IBM estaba interesado en explorar cómo las diferentes aplicaciones se realizan en la máquina. BBP era una especie de beta tester.[5]

El proyecto es un candidato de los seis finalistas para la beca de investigación Tecnologías Emergentes y Futuras (FET) de la Comisión Europea. Si la subvención es concedida le serán otorgados mil millones de euros durante 10 años. A la luz de esta subvención, el proyecto ha pasado a denominarse Human Brain Project.[6]

A finales del 2012, o principios del 2013 al menos dos de los seis proyectos piloto que compiten por la beca FET se espera sean elegidos para ser lanzados como una iniciativa completa FET in 2013.[7]

Organismos involucrados

Además de la École Polytechnique otros organismos de países europeos colaboran activamente en el proyecto.

  Suiza

Es el núcleo del proyecto desde el que se coordina el resto de los centros.

École Polytechnique Fédérale de Lausanne

Esta institución dispone de un supercomputador Blue Gene, denominado Brainsim, en el que se ejecuta el software de simulación. Este software se compone del MPI-based Neocortical Simulator (NCS), desarrollado por Phil Goodman, combinado con el programa NEURON, de Michael Hines. La simulación no consiste en una simple red neuronal artificial sino que involucra modelos de neuronas mucho más realistas biológicamente.

España  España

La participación española está coordinada por la UPM que aglutina las colaboraciones de:

Universidad Politécnica de Madrid

 
El supercomputador Magerit (CeSViMa), el más potente de España, es usado por el proyecto

España entra en el proyecto a través del CeSViMa (Facultad de Informática de Madrid)[8]​ El proyecto se encarga de coordinar las actividades de investigación realizadas en España.

Las líneas de investigación se dividen principalmente en dos:

  • Experimentación neurológica realizada en colaboración con el Instituto Cajal (CSIC).
  • Herramientas informáticas de análisis de datos y simulación 3D. Para ello se dispone de los recursos ofertados por el CeSViMa,[9]​ entre los que se encuentra el supercomputador Magerit, el más potente de España.[10]

El proyecto Cajal Blue Brain es pionero en el uso de un microscopio de nanotecnología para el estudio del cerebro.[11]

Referencias

  1. "Mission to build a simulated brain begins" (news), project of Institute at the École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Switzerland, NewScientist, June 2005, webpage: NewSci7470.
  2. Hitos del proyecto Blue Brain
  3. «El proyecto Blue Brain ayudará a conocer cómo funciona el cerebro | EL LIBREPENSADOR noticias información opinión diario online digital | Ciencia y tecnología». Consultado el 2009. 
  4. Jonathan Fildes (22 de julio de 2009). «Artificial brain '10 years away'». BBC News. Consultado el 7 de enero de 2011. 
  5. «Blue Brain Project - IBM has not withdrawn support». Henry Markram, Project Director as quoted by IBM Switzerland to Technology Report on January 19, 2009. Consultado el 14 de abril de 2009. 
  6. «European researchers chase billion-euro technology prize». Nature, March 8, 2011. 
  7. «FET Flagship Pilots». 
  8. Sala de prensa de la Facultad de Informática: España se incorporará al Blue Brain Project con 25 millones de euros
  9. Nanotechnology Microscope for Brain Studies (Inglés)

Enlaces externos

  • Blue Brain Project, sitio web del proyecto Blue Brain internacional (en inglés).
  • , sitio web del proyecto Blue Brain en España (en inglés).
  • Cajal Blue Brain en Facebook, página del proyecto en la red social Facebook con información y eventos.
  • Human Brain Project (posible nuevo Blue Brain Project) Propuesta final para optar a fondos FET de la Comisión Europea que fue presentada el 23 de octubre del 2012.
  •   Datos: Q885651
  •   Multimedia: Blue Brain Project

blue, brain, proyecto, tiene, como, objetivo, estudiar, estructura, cerebro, mamíferos, creando, simulación, todo, cerebro, nivel, molecular, esta, ingeniería, inversa, comportamiento, permitirá, avanzar, entendimiento, funcionamiento, cerebro, así, como, estu. El proyecto Blue Brain 1 tiene como objetivo estudiar la estructura del cerebro de mamiferos creando una simulacion de todo el cerebro a nivel molecular Esta ingenieria inversa del comportamiento permitira avanzar en el entendimiento del funcionamiento del cerebro asi como estudiar sus disfunciones El proyecto adquiere caracter internacional con el proyecto Cajal Blue Brain de la UPM CeSViMa que incorpora a Espana en la iniciativa Indice 1 Historia 2 Fases 2 1 Fase I 2 2 Fase II 3 Simulacion total del cerebro 4 Financiacion 5 Organismos involucrados 5 1 Suiza 5 1 1 Ecole Polytechnique Federale de Lausanne 5 2 Espana Espana 5 2 1 Universidad Politecnica de Madrid 6 Referencias 7 Enlaces externosHistoria EditarEl proyecto se inicia en 2002 cuando Henry Markram funda el Brain Mind Institute en el Ecole Polytechnique Sin embargo no es hasta la firma del acuerdo de colaboracion entre IBM y el profesor Henry Markram 6 de junio de 2005 cuando el proyecto inicia su andadura Durante el ano 2006 el proyecto se centra en la creacion del modelo de la columna cortical la unidad funcional basica del cerebro En noviembre de 2007 el proyecto alcanza un importante hito 2 al finalizar el modelo y con el la primera fase El resultado de la primera fase es un proceso basado en datos para crear validar e investigar la columna cortical En mayo de 2009 3 se presenta la iniciativa espanola denominada Cajal Blue Brain Este proyecto esta coordinado por la UPM Facultad de Informatica CeSViMa con colaboracion del Instituto Cajal del CSIC El proyecto utiliza los recursos proporcionados por el supercomputador Magerit instalado en el CeSViMa Fases EditarEl proyecto se ha dividido en dos fases la primera de las cuales se completo en noviembre de 2007 Fase I Editar El objetivo inicial del proyecto es simular la columna cortical que puede considerarse la menor unidad funcional del neocortex la parte del cerebro que se cree responsable de las funciones superiores como el pensamiento consciente Esta columna tiene una altura de 2 milimetros un diametro de 0 5 milimetros y contiene unas 60 000 neuronas en humanos La simulacion se centra en la columna neocortical de las ratas que tienen una estructura muy similar pero que contienen unicamente 10 000 neuronas y 108 conexiones sinapticas Durante los ultimos 10 anos el profesor Markram ha estudiado los tipos de neuronas y sus conexiones en esta columna para generar un modelo de su funcionamiento Fase II Editar Tras obtener el modelo de funcionamiento el siguiente paso es realizar y validar simulaciones basadas en dicho modelo En esta fase se continuara con dos ramas diferentes Construccion de la simulacion a nivel molecular cuyo interes reside que permitira estudiar los efectos de los genes Simplificacion de la simulacion de la columna para permitir la simulacion paralela de un gran numero de columnas interconectadas con el objetivo final de simular un neocortex completo que en el caso de los humanos consiste en un millon de columnas aproximadamente Los siguientes pasos es ascender al nivel del gato para alcanzar seguidamente el de los primates Simulacion total del cerebro EditarUn objetivo a largo plazo es construir una simulacion detallada y funcional de los procesos fisiologicos en el cerebro humano No es imposible construir un cerebro humano y podemos hacerlo en 10 anos Henry Markram director del Blue Brain Project dijo en 2009 en la conferencia TED en Oxford 4 En una entrevista de la BBC World Service el dijo Si nosotros lo construimos correctamente este deberia hablar y tener una inteligencia y un comportamiento en gran medida como un ser humano 4 Financiacion EditarEl proyecto esta financiado principalmente por el gobierno suizo y en segundo lugar por las subvenciones y donaciones de algunos particulares La EPFL compro la computadora Blue Gene a un costo reducido porque en ese momento era todavia un prototipo y IBM estaba interesado en explorar como las diferentes aplicaciones se realizan en la maquina BBP era una especie de beta tester 5 El proyecto es un candidato de los seis finalistas para la beca de investigacion Tecnologias Emergentes y Futuras FET de la Comision Europea Si la subvencion es concedida le seran otorgados mil millones de euros durante 10 anos A la luz de esta subvencion el proyecto ha pasado a denominarse Human Brain Project 6 A finales del 2012 o principios del 2013 al menos dos de los seis proyectos piloto que compiten por la beca FET se espera sean elegidos para ser lanzados como una iniciativa completa FET in 2013 7 Organismos involucrados EditarAdemas de la Ecole Polytechnique otros organismos de paises europeos colaboran activamente en el proyecto Suiza Editar Es el nucleo del proyecto desde el que se coordina el resto de los centros Ecole Polytechnique Federale de Lausanne Editar Esta institucion dispone de un supercomputador Blue Gene denominado Brainsim en el que se ejecuta el software de simulacion Este software se compone del MPI based Neocortical Simulator NCS desarrollado por Phil Goodman combinado con el programa NEURON de Michael Hines La simulacion no consiste en una simple red neuronal artificial sino que involucra modelos de neuronas mucho mas realistas biologicamente Espana Espana Editar La participacion espanola esta coordinada por la UPM que aglutina las colaboraciones de Tres laboratorios del Consejo Superior de Investigaciones Cientificas CSIC Universidad de Castilla La Mancha Universidad Politecnica de Madrid Universidad Rey Juan CarlosUniversidad Politecnica de Madrid Editar El supercomputador Magerit CeSViMa el mas potente de Espana es usado por el proyecto Espana entra en el proyecto a traves del CeSViMa Facultad de Informatica de Madrid 8 El proyecto Cajal Blue Brain se encarga de coordinar las actividades de investigacion realizadas en Espana Las lineas de investigacion se dividen principalmente en dos Experimentacion neurologica realizada en colaboracion con el Instituto Cajal CSIC Herramientas informaticas de analisis de datos y simulacion 3D Para ello se dispone de los recursos ofertados por el CeSViMa 9 entre los que se encuentra el supercomputador Magerit el mas potente de Espana 10 El proyecto Cajal Blue Brain es pionero en el uso de un microscopio de nanotecnologia para el estudio del cerebro 11 Referencias Editar Mission to build a simulated brain begins news project of Institute at the Ecole Polytechnique Federale de Lausanne EPFL Switzerland NewScientist June 2005 webpage NewSci7470 Hitos del proyecto Blue Brain El proyecto Blue Brain ayudara a conocer como funciona el cerebro EL LIBREPENSADOR noticias informacion opinion diario online digital Ciencia y tecnologia Consultado el 2009 a b Jonathan Fildes 22 de julio de 2009 Artificial brain 10 years away BBC News Consultado el 7 de enero de 2011 Blue Brain Project IBM has not withdrawn support Henry Markram Project Director as quoted by IBM Switzerland to Technology Report on January 19 2009 Consultado el 14 de abril de 2009 European 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