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Ratón knockout

Un ratón knockout o ratón KO es un ratón modificado por ingeniería genética para que uno o más de sus genes estén inactivados mediante una técnica llamada bloqueo de genes. Su propósito es comprender el papel de un gen que ha sido secuenciado pero del que se desconoce su función o se conoce de forma incompleta. Inactivando el gen y estudiando las diferencias que presenta el ratón afectado, los investigadores pueden inferir la probable función de ese gen. El ratón es el organismo modelo más próximo a los seres humanos en los que esta técnica se puede realizar con facilidad, de modo que es el sujeto favorito de los experimentos de noqueo, especialmente cuando se plantean cuestiones genéticas relacionadas con la fisiología humana. El bloqueo de genes en ratas es mucho más difícil y solo se ha logrado después de 2003.[cita requerida]

Ratones knockout

El primer ratón knockout fue producido por Mario R. Capecchi, Martin Evans y Oliver Smithies en 19871989,[1]​ obteniendo por tal logro el Premio Nobel de Medicina en 2007. Varios aspectos de esta tecnología están bajo patente de la división Lexicon genetics de Lexicon Pharmaceuticals. Los diferentes métodos para generar ratones knockout están en su mayoría patentados en Estados Unidos. Los ratones obtenidos con estos métodos también pueden ser patentados en muchos países, entre estos también los Estados Unidos.

Uso

Noquear la actividad de un gen proporciona información sobre la tarea normal de ese gen. Los seres humanos comparten muchos genes con el ratón. Por tanto, observar las características de un ratón knockout proporciona información que se puede utilizar para comprender mejor cómo un gen semejante puede provocar o contribuir a la aparición de enfermedades en humanos.

Algunos ejemplos de investigaciones en las que los ratones KO han sido útiles serían el estudio y la modelización de diferentes tipos de cáncer, obesidad, enfermedades del corazón, diabetes, artritis, toxicomanías, ansiedad, envejecimiento y Parkinson. Los ratones knockout también ofrecen un contexto científico y biológico en el que se pueden desarrollar y probar fármacos y otras terapias.

Muchos de estos ratones modelo reciben el nombre del gen que se ha inactivado en ellos. Por ejemplo, el ratón KO p53 recibe este nombre por el gen p53, que codifica una proteína que normalmente suprime el crecimiento de tumores deteniendo la división celular. Los seres humanos que nacen con mutaciones que inactivan este gen padecen el Síndrome de Li-Fraumeni, una afección que aumenta dramáticamente el riesgo de desarrollar tumores óseos, cáncer de mama y hemopatías malignas en edad temprana. Otros modelos reciben nombres, a veces ingeniosos y creativos, de acuerdo con sus características físicas o comportamiento. Por ejemplo, "Methuselah" (matusalén) es un ratón KO diseñado para aumentar la longevidad (aunque existe el gen Methuselah) mientras que "Frantic" (espitado) es un modelo útil para estudiar los trastornos de ansiedad.

Procedimiento

Existen algunas variaciones sobre el procedimiento para producir ratones KO, siendo el siguiente el ejemplo más habitual.

  1. Se aísla el gen que se desea bloquear a partir de una genoteca de ratón. Posteriormente se diseña una nueva secuencia de ADN muy parecida al gen original y su inmediata vecina, salvo que está cambiada lo suficiente para hacerla inoperante. Normalmente también se incluye en la nueva secuencia un gen marcador, que los ratones normales no poseen y que les confiere resistencia a ciertos agentes tóxicos o produce un cambio observable (p.ej. color o fluorescencia). Las oportunidades de un suceso de recombinación con éxito son relativamente bajas, de modo que la mayoría de las células alteradas tienen cambiado solo uno de ambos cromosomas. se dice que son heterocigotos.
  2. A partir de un blastocisto de ratón (un embrión muy temprano que está formado por una masa esférica de células indiferenciadas rodeada de células extraembrionarias) se aíslan las células madre; después se cultivan in vitro. Como ejemplo, tomaremos una célula madre de un ratón blanco.
  3. Las células madre del paso 2 se combinan con la nueva secuencia del paso 1. Esto se realiza mediante electroporación (empleando un pulso eléctrico para transferir ADN a través de la membrana celular). Algunas de las células madre electroporadas incorporarán la nueva secuencia en el lugar en el que el gen antiguo estaba en su cromosoma. A esto se le llama recombinación homóloga. La razón por la que tiene lugar este proceso es que ambas secuencias, la vieja y la nueva, son muy similares. Utilizando el gen marcador del paso 1, se puede aislar rápidamente las células que han incorporado la nueva secuencia.
  4. Las células madre del paso 3 se insertan en un blastocisto de ratón. En este caso utilizamos blastocistos de ratón pardo. Estos blastocistos se implantan en el útero de una ratona, para llevar a término la gestación. Los blastocistos contienen dos tipos de células madre: las originales (ratón gris) y las modificadas (ratón blanco). El ratón neonato será por tanto una quimera genética: parte del cuerpo provendrá de las células madre originales y parte de las células modificadas. El pelaje también mostrará zonas blancas sobre pardo.
  5. Los ratones neonatos sólo serán útiles si la secuencia ha sido incorporada a la línea germinal. Estos ratones se cruzan con otros del tipo blanco para obtener una progenie completamente blanca. Estos ratones aún contienen una copia funcional del gen y tienen que someterse a cruzamiento endógamo para producir un ratón que no lleva ninguna copia funcional del gen original (es decir, que sea homocigótico para ese alelo).

Limitaciones

Aunque la tecnología de los ratones KO es una herramienta valiosa para la investigación, existen algunas limitaciones importantes:

  • Aproximadamente un 15% de los bloqueos de genes son letales en el desarrollo, lo que significa que los embriones genéticamente alterados no pueden prosperar en ratones adultos. Este problema frecuentemente se supera a través del uso de mutaciones condicionales.
  • La carencia de estudios sobre los límites del desarrollo embrionario en ratones adultos hace más difícil determinar la función de un gen en relación con la salud humana. En algunos casos, el gen podría tener funciones diferentes en adultos y embriones.
  • Noquear un gen también puede que no produzca ningún cambio observable en el ratón o incluso producir características diferentes a los observados en humanos en los que el mismo gen está inactivado. Por ejemplo, las mutaciones del gen p53 están asociadas con más de la mitad de los cánceres humanos y a menudo conducen a tumores en un conjunto de tejidos en particular. Sin embargo, cuando se noquea en ratón, los animales desarrollan tumores en tipos de tejido diferentes.
  • Se ha probado que algunos loci genómicos son muy difíciles de noquear. La razón podría estar en la presencia de secuencias repetitivas, metilación del ADN generalizada o presencia de heterocromatina.

Existe variabilidad en el procedimiento completo dependiendo bastante de la cadena a partir de las cuales se obtienen las células madre. Por lo general se usan las células derivadas de la cadena 129. Esta cadena específica no es adecuada para muchos experimentos (p.ej. de comportamiento) de modo que es bastante común retrocruzar la descendencia con otras cadenas.

Véase también

Referencias

  1. «El Nobel premia a tres científicos pioneros en la manipulación genética de ratones». El Muno. 9 de octubre de 2007. Consultado el 13 de noviembre de 2016. 
  • NHGRI. 2006. Knockout Mice

Enlaces externos

  • Instituto tejano de medicina genómica
  • Bioinformática, protocolos y servicios para ratones KO
  • Estudio de la función genética mediante la creación de ratones KO - una revisión de Science Creative Quarterly
  • - Sitio web del Knock Out Mouse Project (KOMP)
  • Ratones KO para el estudio de enfermedades- BSRC Alexander Fleming
  • Ratones KO - Biomedcode
  •   Datos: Q1364740

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Un raton knockout o raton KO es un raton modificado por ingenieria genetica para que uno o mas de sus genes esten inactivados mediante una tecnica llamada bloqueo de genes Su proposito es comprender el papel de un gen que ha sido secuenciado pero del que se desconoce su funcion o se conoce de forma incompleta Inactivando el gen y estudiando las diferencias que presenta el raton afectado los investigadores pueden inferir la probable funcion de ese gen El raton es el organismo modelo mas proximo a los seres humanos en los que esta tecnica se puede realizar con facilidad de modo que es el sujeto favorito de los experimentos de noqueo especialmente cuando se plantean cuestiones geneticas relacionadas con la fisiologia humana El bloqueo de genes en ratas es mucho mas dificil y solo se ha logrado despues de 2003 cita requerida Ratones knockout El primer raton knockout fue producido por Mario R Capecchi Martin Evans y Oliver Smithies en 1987 1989 1 obteniendo por tal logro el Premio Nobel de Medicina en 2007 Varios aspectos de esta tecnologia estan bajo patente de la division Lexicon genetics de Lexicon Pharmaceuticals Los diferentes metodos para generar ratones knockout estan en su mayoria patentados en Estados Unidos Los ratones obtenidos con estos metodos tambien pueden ser patentados en muchos paises entre estos tambien los Estados Unidos Indice 1 Uso 2 Procedimiento 3 Limitaciones 4 Vease tambien 5 Referencias 6 Enlaces externosUso EditarNoquear la actividad de un gen proporciona informacion sobre la tarea normal de ese gen Los seres humanos comparten muchos genes con el raton Por tanto observar las caracteristicas de un raton knockout proporciona informacion que se puede utilizar para comprender mejor como un gen semejante puede provocar o contribuir a la aparicion de enfermedades en humanos Algunos ejemplos de investigaciones en las que los ratones KO han sido utiles serian el estudio y la modelizacion de diferentes tipos de cancer obesidad enfermedades del corazon diabetes artritis toxicomanias ansiedad envejecimiento y Parkinson Los ratones knockout tambien ofrecen un contexto cientifico y biologico en el que se pueden desarrollar y probar farmacos y otras terapias Muchos de estos ratones modelo reciben el nombre del gen que se ha inactivado en ellos Por ejemplo el raton KO p53 recibe este nombre por el gen p53 que codifica una proteina que normalmente suprime el crecimiento de tumores deteniendo la division celular Los seres humanos que nacen con mutaciones que inactivan este gen padecen el Sindrome de Li Fraumeni una afeccion que aumenta dramaticamente el riesgo de desarrollar tumores oseos cancer de mama y hemopatias malignas en edad temprana Otros modelos reciben nombres a veces ingeniosos y creativos de acuerdo con sus caracteristicas fisicas o comportamiento Por ejemplo Methuselah matusalen es un raton KO disenado para aumentar la longevidad aunque existe el gen Methuselah mientras que Frantic espitado es un modelo util para estudiar los trastornos de ansiedad Procedimiento EditarExisten algunas variaciones sobre el procedimiento para producir ratones KO siendo el siguiente el ejemplo mas habitual Se aisla el gen que se desea bloquear a partir de una genoteca de raton Posteriormente se disena una nueva secuencia de ADN muy parecida al gen original y su inmediata vecina salvo que esta cambiada lo suficiente para hacerla inoperante Normalmente tambien se incluye en la nueva secuencia un gen marcador que los ratones normales no poseen y que les confiere resistencia a ciertos agentes toxicos o produce un cambio observable p ej color o fluorescencia Las oportunidades de un suceso de recombinacion con exito son relativamente bajas de modo que la mayoria de las celulas alteradas tienen cambiado solo uno de ambos cromosomas se dice que son heterocigotos A partir de un blastocisto de raton un embrion muy temprano que esta formado por una masa esferica de celulas indiferenciadas rodeada de celulas extraembrionarias se aislan las celulas madre despues se cultivan in vitro Como ejemplo tomaremos una celula madre de un raton blanco Las celulas madre del paso 2 se combinan con la nueva secuencia del paso 1 Esto se realiza mediante electroporacion empleando un pulso electrico para transferir ADN a traves de la membrana celular Algunas de las celulas madre electroporadas incorporaran la nueva secuencia en el lugar en el que el gen antiguo estaba en su cromosoma A esto se le llama recombinacion homologa La razon por la que tiene lugar este proceso es que ambas secuencias la vieja y la nueva son muy similares Utilizando el gen marcador del paso 1 se puede aislar rapidamente las celulas que han incorporado la nueva secuencia Las celulas madre del paso 3 se insertan en un blastocisto de raton En este caso utilizamos blastocistos de raton pardo Estos blastocistos se implantan en el utero de una ratona para llevar a termino la gestacion Los blastocistos contienen dos tipos de celulas madre las originales raton gris y las modificadas raton blanco El raton neonato sera por tanto una quimera genetica parte del cuerpo provendra de las celulas madre originales y parte de las celulas modificadas El pelaje tambien mostrara zonas blancas sobre pardo Los ratones neonatos solo seran utiles si la secuencia ha sido incorporada a la linea germinal Estos ratones se cruzan con otros del tipo blanco para obtener una progenie completamente blanca Estos ratones aun contienen una copia funcional del gen y tienen que someterse a cruzamiento endogamo para producir un raton que no lleva ninguna copia funcional del gen original es decir que sea homocigotico para ese alelo Limitaciones EditarAunque la tecnologia de los ratones KO es una herramienta valiosa para la investigacion existen algunas limitaciones importantes Aproximadamente un 15 de los bloqueos de genes son letales en el desarrollo lo que significa que los embriones geneticamente alterados no pueden prosperar en ratones adultos Este problema frecuentemente se supera a traves del uso de mutaciones condicionales La carencia de estudios sobre los limites del desarrollo embrionario en ratones adultos hace mas dificil determinar la funcion de un gen en relacion con la salud humana En algunos casos el gen podria tener funciones diferentes en adultos y embriones Noquear un gen tambien puede que no produzca ningun cambio observable en el raton o incluso producir caracteristicas diferentes a los observados en humanos en los que el mismo gen esta inactivado Por ejemplo las mutaciones del gen p53 estan asociadas con mas de la mitad de los canceres humanos y a menudo conducen a tumores en un conjunto de tejidos en particular Sin embargo cuando se noquea en raton los animales desarrollan tumores en tipos de tejido diferentes Se ha probado que algunos loci genomicos son muy dificiles de noquear La razon podria estar en la presencia de secuencias repetitivas metilacion del ADN generalizada o presencia de heterocromatina Existe variabilidad en el procedimiento completo dependiendo bastante de la cadena a partir de las cuales se obtienen las celulas madre Por lo general se usan las celulas derivadas de la cadena 129 Esta cadena especifica no es adecuada para muchos experimentos p ej de comportamiento de modo que es bastante comun retrocruzar la descendencia con otras cadenas Vease tambien EditarGenetica Mus musculus raton domestico Referencias Editar El Nobel premia a tres cientificos pioneros en la manipulacion genetica de ratones El Muno 9 de octubre de 2007 Consultado el 13 de noviembre de 2016 NHGRI 2006 Knockout Mice Premio Nobel de Fisiologia y Medicina 2007Enlaces externos EditarInstituto tejano de medicina genomica Bioinformatica protocolos y servicios para ratones KO Estudio de la funcion genetica mediante la creacion de ratones KO una revision de Science Creative Quarterly Sitio web del Knock Out Mouse Project KOMP Ratones KO para el estudio de enfermedades BSRC Alexander Fleming Ratones KO Biomedcode Datos Q1364740 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