NAMD (Not (just) Another Molecular Dynamics program)[1] es un software para dinámica molecular en paralelo diseñado para simulaciones de alto desempeño de sistemas biomoleculares. Se hizo acreedor de un premio Gordon Bell en 2002.[2] Está basado en objetos paralelos Charm++ y es escalable a cientos de procesadores en plataformas de punta y decenas de procesadores en cómodos clusters usando ethernet gigabit. NAMD usa el popular programa de presentación gráfica molecular VMD para configurar la simulación y analizar las trayectorias, siendo también parcialmente compatible con AMBER, CHARMM y X-PLOR.
«Flexibility and Interoperability in a Parallel Molecular Dynamics Code» (postscript).
(pdf). Archivado desde el original el 16 de julio de 2011. Consultado el 15 de marzo de 2013.
Datos:Q2078655
Multimedia:NAMD
Noviembre 02, 2021
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