Una hélice 310 es un tipo de estructura secundaria de proteínas poco común. Son más estrechas y más lárgas que una hélice alfa.
Vista lateral de una hélice 310 de residuos de alanina. En magenta se señalan dos enlaces de hidrógeno al mismo grupo peptídico; la distancia oxígeno-hidrógeno es de 1,83 Å. La cadena de la proteína se dirige hacia arriba; su extremo N-terminal está abajo y el C-terminal arriba. Las cadenas laterales apuntan ligeramente hacia el extremo N-terminal.
Estructura
Los aminoácidos en una hélice 310 están dispuestos en una estructura helicoidal de sentido horario. Cada aminoácido corresponde a 120° de giro en la hélice (es decir, la hélice tiene tres residuos por vuelta) y una traslación de 2,0 Å (0,2 nm) a lo largo del eje de la hélice. El grupo N-H de un aminoácido forma un enlace por puente de hidrógeno con el grupo C=O del aminoácido tres residuos anterior; estos enlaces de hidrógeno repetidos i + 3 → i definen la hélice 310. Estructuras similares incluyen la hélice alfa (con enlaces de hidrógeno i + 4 → i) y la hélice pi (con enlaces de hidrógeno i + 5 → i).
Los residuos en una hélice 310 adoptan típicamente ángulos diedros (φ, ψ) cercanos a −49°, −26°, de tal forma que el ángulo ψ de un residuo y el ángulo φ del siguiente suman unos −75°. En comparación, la suma de ángulos diedros de una hélice alfa es de aproximadamente −105°, mientras que los de una hélice pi suman unos −125°.
La fórmula general de rotación del ángulo Ω por residuo de cualquier hélice polipeptídica con configuración trans está dada por la ecuación:
Referencias
L. Pauling, R.B. Corey and H.R. Branson (1951) "The Structure of Proteins: Two Hydrogen-Bonded Helical Configurations of the Polypeptide Chain", Proc. Natl. Acad. Sci. USA37: 205-211. PMCID:PMC1063337
Datos:Q229812
Agosto 17, 2021
hélice, hélice, tipo, estructura, secundaria, proteínas, poco, común, más, estrechas, más, lárgas, hélice, alfa, vista, lateral, hélice, residuos, alanina, magenta, señalan, enlaces, hidrógeno, mismo, grupo, peptídico, distancia, oxígeno, hidrógeno, cadena, pr. Una helice 310 es un tipo de estructura secundaria de proteinas poco comun Son mas estrechas y mas largas que una helice alfa Vista lateral de una helice 310 de residuos de alanina En magenta se senalan dos enlaces de hidrogeno al mismo grupo peptidico la distancia oxigeno hidrogeno es de 1 83 A La cadena de la proteina se dirige hacia arriba su extremo N terminal esta abajo y el C terminal arriba Las cadenas laterales apuntan ligeramente hacia el extremo N terminal Estructura EditarLos aminoacidos en una helice 310 estan dispuestos en una estructura helicoidal de sentido horario Cada aminoacido corresponde a 120 de giro en la helice es decir la helice tiene tres residuos por vuelta y una traslacion de 2 0 A 0 2 nm a lo largo del eje de la helice El grupo N H de un aminoacido forma un enlace por puente de hidrogeno con el grupo C O del aminoacido tres residuos anterior estos enlaces de hidrogeno repetidos i 3 i definen la helice 310 Estructuras similares incluyen la helice alfa con enlaces de hidrogeno i 4 i y la helice pi con enlaces de hidrogeno i 5 i Los residuos en una helice 310 adoptan tipicamente angulos diedros f ps cercanos a 49 26 de tal forma que el angulo ps de un residuo y el angulo f del siguiente suman unos 75 En comparacion la suma de angulos diedros de una helice alfa es de aproximadamente 105 mientras que los de una helice pi suman unos 125 La formula general de rotacion del angulo W por residuo de cualquier helice polipeptidica con configuracion trans esta dada por la ecuacion 3 cos W 1 4 cos 2 f ps 2 displaystyle 3 cos Omega 1 4 cos 2 left frac varphi psi 2 right Referencias EditarL Pauling R B Corey and H R Branson 1951 The Structure of Proteins Two Hydrogen Bonded Helical Configurations of the Polypeptide Chain Proc Natl Acad Sci USA 37 205 211 PMCID PMC1063337 Datos Q229812Obtenido de https es wikipedia org w index php title Helice 310 amp oldid 120212794, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
