Degradación del ARN mensajero mediada por mutación terminadora
Enero 16, 2023
La Degradación del ARN mensajero mediada por mutaciones terminadoras, más conocida por sus siglas en inglés: NMD (de Nonsense Mediated Decay) es un mecanismo celular de vigilancia del ARN mensajero para detectar mutaciones terminadoras (las que crean nuevos codones de paro) y evitar la expresión de proteínas truncadas o erróneas. En mamíferos, la NMD se inicia por el complejo de unión de exones (EJC) que se depositan durante el splicing del pre ARNm. Normalmente, un EJC es retirado por el ribosoma durante la primera ronda de traducción del ARNm. No obstante, si se da un EJC en un punto de la secuencia más allá ("downstream") del codón "sin sentido" (también llamado de parada o terminación), entonces este EJC aún permanecerá unido al ARNm cuando el ribosoma llegue al codón de terminación, y de ese modo servirá para desencadenar la NMD, ya que los factores proteicos implicados en esta función identifican la presencia de un EJC "corriente abajo" como un problema, de modo que el ARNm erróneo se degrada, por ejemplo mediante el exosoma.[1] Con raras excepciones, un EJC no se deposita corriente abajo de un codón terminador.
Mecanismo de funcionamiento del sistema NMD
En otros organismos, como las levaduras o Drosophila melanogaster, la NMD se desencadena por un mecanismo completamente diferente. La clave de todo este mecanismo parece ser la secuencia del ARNm corriente abajo de o bien los codones terminadores prematuros o los naturales.
El Proyecto Vega usa los siguientes parámetros en sus bases de datos para establecer un candidato de posible NMD: "Si la secuencia codificante ... de un transcrito finaliza >50pb a partir de un punto de splicing corriente abajo, se le anotará como NMD."[2]
Referencias
Chang et al. (2007). «The nonsense-mediated decay RNA surveillance pathway». Annu Rev Biochem.76: 51-74. PMID 17352659. doi:10.1146/annurev.biochem.76.050106.093909.
Metzstein MM, Krasnow MA. (2006). «Functions of the Nonsense-Mediated mRNA Decay Pathway in Drosophila Development». PLoS Genet.2 (12). PMID 17196039.
. Lynne Maquat (25 de octubre de 2002). «Nonsense-Mediated mRNA Decay in Mammalian Cells: Evidence for a "Pioneer" Round of mRNA Translation» (Abstract)(en inglés). Oak Ridge National Laboratory. Consultado el 3 de enero de 2008.
Datos:Q14911527
Enero 16, 2023
degradación, mensajero, mediada, mutación, terminadora, degradación, mensajero, mediada, mutaciones, terminadoras, más, conocida, siglas, inglés, nonsense, mediated, decay, mecanismo, celular, vigilancia, mensajero, para, detectar, mutaciones, terminadoras, cr. La Degradacion del ARN mensajero mediada por mutaciones terminadoras mas conocida por sus siglas en ingles NMD de Nonsense Mediated Decay es un mecanismo celular de vigilancia del ARN mensajero para detectar mutaciones terminadoras las que crean nuevos codones de paro y evitar la expresion de proteinas truncadas o erroneas En mamiferos la NMD se inicia por el complejo de union de exones EJC que se depositan durante el splicing del pre ARNm Normalmente un EJC es retirado por el ribosoma durante la primera ronda de traduccion del ARNm No obstante si se da un EJC en un punto de la secuencia mas alla downstream del codon sin sentido tambien llamado de parada o terminacion entonces este EJC aun permanecera unido al ARNm cuando el ribosoma llegue al codon de terminacion y de ese modo servira para desencadenar la NMD ya que los factores proteicos implicados en esta funcion identifican la presencia de un EJC corriente abajo como un problema de modo que el ARNm erroneo se degrada por ejemplo mediante el exosoma 1 Con raras excepciones un EJC no se deposita corriente abajo de un codon terminador Mecanismo de funcionamiento del sistema NMD En otros organismos como las levaduras o Drosophila melanogaster la NMD se desencadena por un mecanismo completamente diferente La clave de todo este mecanismo parece ser la secuencia del ARNm corriente abajo de o bien los codones terminadores prematuros o los naturales El Proyecto Vega usa los siguientes parametros en sus bases de datos para establecer un candidato de posible NMD Si la secuencia codificante de un transcrito finaliza gt 50pb a partir de un punto de splicing corriente abajo se le anotara como NMD 2 Referencias Editar Chang et al 2007 The nonsense mediated decay RNA surveillance pathway Annu Rev Biochem 76 51 74 PMID 17352659 doi 10 1146 annurev biochem 76 050106 093909 Vega project s transcript classification documentation Bibliografia EditarMetzstein MM Krasnow MA 2006 Functions of the Nonsense Mediated mRNA Decay Pathway in Drosophila Development PLoS Genet 2 12 PMID 17196039 Lynne Maquat 25 de octubre de 2002 Nonsense Mediated mRNA Decay in Mammalian Cells Evidence for a Pioneer Round of mRNA Translation Abstract en ingles Oak Ridge National Laboratory Consultado el 3 de enero de 2008 Datos Q14911527 Obtenido de https es wikipedia org w index php title Degradacion del ARN mensajero mediada por mutacion terminadora amp oldid 145898203, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
