De su actividad en tierras de España no existen noticias seguras, pero sí podemos seguirle la pista (fuente: Estrella, 1988) en su viaje de estudio por América del Sur.
Tras desembarcar en Buenos Aires se dirige en primer lugar a Chile y después a Perú, en donde pasará mucho tiempo en compañía de Juan José Tafalla, otro naturalista español; en 1801 se desplaza a Quito (Ecuador) para continuar con sus estudios sobre ciencias naturales y químicas, financiando el viaje y la investigación con fondos personales.
Muere en 1807 durante el transcurso de una expedición a la Cordillera de Los Llanganates, en Ecuador, a la búsqueda del tesoro perdido de los Incas.
El botánico ecuatoriano José Mejía del Valle y Lequerica (1775–1813) y la viuda de Guzmán intentarán en vano recuperar el abundante material del naturalista; durante años se creyó que se encontraba totalmente perdido, pero recientemente (según Estrella, 1988) se considera que una parte de ese material se conserva en Quito.
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