ARMAN (o Archaeal Richmond Mine Acidophilic Nanoorganisms) son arqueas descubiertas por primera vez en los ambientes ácidos de una mina del norte de California (Iron Mountain Mine). Se detectaron cinco grupos, denominados de ARMAN-1 a ARMAN-5, pero nuevos análisis los dividen en el orden Parvarchaeales y el filo Micrarchaeota.[1][2]
Estos nuevos grupos de Archaea fueron pasados por alto en una PCR anterior porque los ARMAN presentan varios desajustes con los iniciadores comúnmente utilizados para los genes ARNr 16S. Fueron finalmente detectados usando la técnica de secuenciamiento shotgun.[3] Sus genes ARNr 16S difieren entre los tres grupos tanto como el 17%. Antes de su descubrimiento, todas las archaea encontradas en la montaña pertenecían al orden Thermoplasmatales (por ejemplo, Ferroplasma).
El examen de las diferentes zonas de la mina utilizando sondas fluorescentes específicas a los grupos ARMAN ha revelado que siempre están presentes en comunidades asociadas con el drenaje ácido de la mina, que tiene un pH menor de 1,5. Normalmente constituyen un pequeño porcentaje (5-25%) de la comunidad. La filtración de muestras y el examen usando microscopía ha puesto de manifiesto que son células muy pequeñas (aproximadamente de 300 nm de diámetro), posiblemente las más pequeñas formas de vida libre. Son simbiontes obligados de los termoplasmatos o las arqueas de la clase Thermoplasmata.[4]
Referencias
GTDB database Nanoarchaeota
Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, David W. Waite, William B Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz (2020). A rank-normalized archaeal taxonomy based on genome phylogeny resolves widespread incomplete and uneven classifications. Biorxiv.
Brett J. Baker, Gene W. Tyson, Richard I. Webb, Judith Flanagan, Phil Hugenholtz and Jill F. Banfield (2006) Lineages of acidophilic Archaea revealed by community genomic analysis. Science. 314,1933-1935. Abstract
«Genomic Expansion of Domain Archaea Highlights Roles for Organisms from New Phyla in Anaerobic Carbon Cycling». Current Biology25: 690-701. doi:10.1016/j.cub.2015.01.014.
Enlaces externos
JGI Community Sequencing Program
Datos:Q3488883
Abril 02, 2022
arman, archaeal, richmond, mine, acidophilic, nanoorganisms, arqueas, descubiertas, primera, ambientes, ácidos, mina, norte, california, iron, mountain, mine, detectaron, cinco, grupos, denominados, pero, nuevos, análisis, dividen, orden, parvarchaeales, filo,. ARMAN o Archaeal Richmond Mine Acidophilic Nanoorganisms son arqueas descubiertas por primera vez en los ambientes acidos de una mina del norte de California Iron Mountain Mine Se detectaron cinco grupos denominados de ARMAN 1 a ARMAN 5 pero nuevos analisis los dividen en el orden Parvarchaeales y el filo Micrarchaeota 1 2 ARMANCelula ARMAN encontrada en una mina de hierroTaxonomiaDominio ArchaeaSuperfilo DPANNFilosParvarchaeota Micrarchaeota editar datos en Wikidata Estos nuevos grupos de Archaea fueron pasados por alto en una PCR anterior porque los ARMAN presentan varios desajustes con los iniciadores comunmente utilizados para los genes ARNr 16S Fueron finalmente detectados usando la tecnica de secuenciamiento shotgun 3 Sus genes ARNr 16S difieren entre los tres grupos tanto como el 17 Antes de su descubrimiento todas las archaea encontradas en la montana pertenecian al orden Thermoplasmatales por ejemplo Ferroplasma El examen de las diferentes zonas de la mina utilizando sondas fluorescentes especificas a los grupos ARMAN ha revelado que siempre estan presentes en comunidades asociadas con el drenaje acido de la mina que tiene un pH menor de 1 5 Normalmente constituyen un pequeno porcentaje 5 25 de la comunidad La filtracion de muestras y el examen usando microscopia ha puesto de manifiesto que son celulas muy pequenas aproximadamente de 300 nm de diametro posiblemente las mas pequenas formas de vida libre Son simbiontes obligados de los termoplasmatos o las arqueas de la clase Thermoplasmata 4 Referencias Editar GTDB database Nanoarchaeota Christian Rinke Maria Chuvochina Aaron J Mussig Pierre Alain Chaumeil David W Waite William B Whitman Donovan H Parks Philip Hugenholtz 2020 A rank normalized archaeal taxonomy based on genome phylogeny resolves widespread incomplete and uneven classifications Biorxiv Brett J Baker Gene W Tyson Richard I Webb Judith Flanagan Phil Hugenholtz and Jill F Banfield 2006 Lineages of acidophilic Archaea revealed by community genomic analysis Science 314 1933 1935 Abstract Genomic Expansion of Domain Archaea Highlights Roles for Organisms from New Phyla in Anaerobic Carbon Cycling Current Biology 25 690 701 doi 10 1016 j cub 2015 01 014 Enlaces externos EditarJGI Community Sequencing Program 2006 Berkeley Press Release Datos Q3488883 Obtenido de https es wikipedia org w index php title ARMAN amp oldid 137249284, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,
