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Transposasa

Transposasa es una enzima que se une al final de un transposón y cataliza el movimiento del transposón a otra parte del genoma por un mecanismo de corta y pega, o un mecanismo de transposición replicativo.

La palabra "transposasa" fue acuñada por primera vez por los individuos que clonaron la enzima requerida para transposición del transposón Tn3.[1]​ La existencia de transposones fue postulada en 1940 por Barbara McClintock, quien estudiaba la herencia de maíz, pero la base molecular real para transposición estuvo descrita por grupos de invertigación posteriores. McClintock descubrió que las piezas de los cromosomas cambiaban su posición, saltando de un cromosoma a otro. El reposicionamiento de estos transposones (el cual codificaba para color) dejó otros genes de pigmentos para ser expresados.[2]​ La transposición en el maíz causó cambios en color; aun así, en otros organismos, como bacterias, puede causar resistencia a los antibiótico [2]​. La transposición es también importante para crear diversidad genética dentro de especies y adaptabilidad a condiciones de vida cambiantes.[3]​ Durante el curso de la evolución humana, tanto como el 40% del genoma humano ha sido movido entre lugares distintos del genoma usando métodos como la transposición de transposones.[2]

Las transposasas están clasificadas bajo Número EC: EC 2.7.7.

Los genes que codifican transposasas están muy extendidos en los genomas de la mayoría de los organismos y son los genes más abundantes conocidos.[4]

Transposasa Tn5

 

Transposasa Tn5 es un miembro del RNAsa de proteínas qué incluye integrasas retrovirales. Tn5 puede ser encontrado en Shewanella y Escherichia (bacterias).[5] El transposon de códigos para la resistencia de antibiótico a kanamycin y otro aminoglycosido (antibióticos).[3][6]

TN5 y otros transposases son notablemente inactivos. Porque el ADN de transposición son inherentemente mutagénicos, la baja actividad del transposases es necesaria para reducir el riesgo de causar una mutación fatal en el hospedero y eliminando los elementos transponibles. Una de las razones que no es tan reactivo Tn5 es porque el N - y C-terminal se encuentra relativamente cerca uno al otro y tienden a inhibir el uno al otro. Esto fue aclarada por la caracterización de varias mutaciones que dio lugar a formas hiperactivas de transposasas. L372P, es una mutación del aminoácido 372 en la transposasa Tn5. Este aminoácido es generalmente un residuo de leucina en medio de una hélice alfa. Cuando este leucina es reemplazado con un residuo de la prolina la hélice alfa está rota, introducir un cambio conformacional en el dominio C-terminal, separándolo del dominio N-Terminal suficiente para promover una mayor actividad de la proteína. [3] la transposición de un transposon a menudo necesita sólo tres piezas: el transposón, la enzima transposasa y el ADN diana para la inserción de los transposones. [3] Este es el caso de Tm5, que utiliza un mecanismo de cortar y pegar para mover alrededor de transposones. [3] Tn5 y más otros transposases contienen una DDE, que es el sitio activo que cataliza el movimiento de los transposones. Aspartato-97, 188-aspartato y glutamato-326 conforman el sitio activo, que es una tríada de residuos ácidos. [7] el motivo DDE se dice que coordinar los iones metálicos divalentes, más a menudo de magnesio y manganeso, que son importantes en la reacción catalítica. [7] porque transposase es increíblemente inactivo, la región DDE está mutada así la transposasa llega a ser hiperactiva y cataliza el movimiento de los transposones. [7] el glutamato se transforma en un aspartato y los dos asparates en glutamatos. [7] a través de esta mutación, el estudio de Tn5 llega a ser posible, pero algunos pasos en el proceso catalítico se pierden como resultado. [3]

Hay muchos da un paso cuál catalyze el movimiento del transposon, incluyendo Tnp atando, synapsis (la creación de un synaptic complejo), cleavage, captura de objetivo, y transferencia de hebra. Transposase Entonces ata a la hebra de ADN y crea un clamp sobre el transposon fin del ADN e inserta al sitio activo. Una vez el transposase ata al transposon, produce un synaptic complejo en qué dos transposases está atado en un cis/trans relación con el transposon.[5]

Los iones de magnesio activan oxígeno de moléculas de agua y exponerles a nucleophilic ataque.[6]​ Esto deja las moléculas de agua a nick el 3' hebras en ambos fines y crear un hairpin formación, el cual separa el transposon del ADN de donante.[5]​ Luego, el transposase mueve el transposon a una ubicación adecuada. No mucho es sabido sobre la captura de objetivo, a pesar de que hay una secuencia predispone cuál no ha sido todavía determinado.[5]​ Después de que captura de objetivo, el transposase ataca el ADN de objetivo nueve pares de base aparte, resultando en la integración del transposon al ADN de objetivo.[5]

Debido a las mutaciones del DDE, algunos pasos del proceso están perdidos—por ejemplo, cuándo este experimento está actuado en vitro, y SDS tratamiento de calor denatures el transposase. Aun así, es todavía incierto qué pasa al transposase en vivo.[5]

El estudio de transposase Tn5 es de importancia general debido a sus semejanzas a VIH-1 y otro retroviral enfermedades. Por estudiar Tn5, mucho también puede ser descubierto sobre otro transposases y sus actividades.[5]

Durmiente transposasa

Sleeping Beauty (SB) transposasa es el recombinase que paseos la Belleza de Dormir transposon sistema.[7]​ SB transposase Pertenece al DD[E/D] familia de transposases, los cuales en vuelta pertenecen a un grandes superfamily de polynucleotidyl transferases aquello incluye RNase H, RuvC Holliday resolvase, RAG proteínas, y retroviral integrases.[8][9]​ El SB el sistema está utilizado principalmente en animales vertebrados para transferencia de gen, incluyendo terapia de gen, y descubrimiento de gen.[10][11][12][13][14]​ El recientemente engineered SB100X es una enzima especialmente potente que dirige los niveles más altos de transposon la integración todavía desarrolló.[15][16]

Referencias

  1. Heffron F, McCarthy BJ, Ohtsubo H, Ohtsubo E (December 1979). «DNA sequence analysis of the transposon Tn3: three genes and three sites involved in transposition of Tn3». Cell 18 (4): 1153-63. PMID 391406. doi:10.1016/0092-8674(79)90228-9. 
  2. Goodsell, David (December 2006). «Transposase». Molecule of the Month. Protein Data Bank. 
  3. Reznikoff WS (March 2003). «Tn5 as a model for understanding DNA transposition». Molecular Microbiology 47 (5): 1199-206. PMID 12603728. doi:10.1046/j.1365-2958.2003.03382.x. 
  4. Aziz RK, Breitbart M, Edwards RA (July 2010). «Transposases are the most abundant, most ubiquitous genes in nature». Nucleic Acids Research 38 (13): 4207-17. PMC 2910039. PMID 20215432. doi:10.1093/nar/gkq140. 
  5. Reznikoff, William S. (2003). «Tn5 as a model for understanding DNA transposition». Molecular Microbiology 47 (5): 1199-1206. PMID 12603728. doi:10.1046/j.1365-2958.2003.03382.x. 
  6. Scott Lovell, Scott; Igor Y. Goryshin; William R. Reznikoff; Ivan Rayment (2002). «Two-metal active site binding of a Tn5 transposase synaptic complex». Nature Structural Biology 9 (4): 278-81. PMID 11896402. doi:10.1038/nsb778.  |last1= y |autor1= redundantes (ayuda)
  7. Ivics, Z., P.
  8. Craig,N.
  9. Nesmelova, I.
  10. Ivics, Z., Izsvak, Z. (2005) A whole lotta jumpin’ goin’ on: new transposon tools for vertebrate functional genomics.
  11. Izsvák, Zsuzsanna; Hackett, Perry B.; Cooper, Laurence J.N.; Ivics, Zoltán (septiembre de 2010). «Translating Sleeping Beauty transposition into cellular therapies: Victories and challenges». BioEssays 32 (9): 756-767. doi:10.1002/bies.201000027. 
  12. Aronovich, E.
  13. Carlson, C.
  14. Copeland, N.
  15. Mátés, L., et al. (2009) Molecular evolution of a novel hyperactive Sleeping Beauty transposase enables robust stable gene transfer in vertebrates.
  16. Grabundzija, I., Irgang, M., Mátés, L., Belay, E., Matrai, J., Gogol-Döring, A., Kawakami, K., Chen, W., Ruiz, P., Chuah, M.
  •   Datos: Q410629
  •   Multimedia: Category:Transposase

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El texto que sigue es una traduccion incompleta Si quieres colaborar con Wikipedia busca el articulo original y finaliza esta traduccion Copia y pega el siguiente codigo en la pagina de discusion del autor de este articulo subst Aviso traduccion incompleta Transposasa Transposasa es una enzima que se une al final de un transposon y cataliza el movimiento del transposon a otra parte del genoma por un mecanismo de corta y pega o un mecanismo de transposicion replicativo La palabra transposasa fue acunada por primera vez por los individuos que clonaron la enzima requerida para transposicion del transposon Tn3 1 La existencia de transposones fue postulada en 1940 por Barbara McClintock quien estudiaba la herencia de maiz pero la base molecular real para transposicion estuvo descrita por grupos de invertigacion posteriores McClintock descubrio que las piezas de los cromosomas cambiaban su posicion saltando de un cromosoma a otro El reposicionamiento de estos transposones el cual codificaba para color dejo otros genes de pigmentos para ser expresados 2 La transposicion en el maiz causo cambios en color aun asi en otros organismos como bacterias puede causar resistencia a los antibiotico 2 La transposicion es tambien importante para crear diversidad genetica dentro de especies y adaptabilidad a condiciones de vida cambiantes 3 Durante el curso de la evolucion humana tanto como el 40 del genoma humano ha sido movido entre lugares distintos del genoma usando metodos como la transposicion de transposones 2 Las transposasas estan clasificadas bajo Numero EC EC 2 7 7 Los genes que codifican transposasas estan muy extendidos en los genomas de la mayoria de los organismos y son los genes mas abundantes conocidos 4 Transposasa Tn5 Editar Transposasa Tn5 es un miembro del RNAsa de proteinas que incluye integrasas retrovirales Tn5 puede ser encontrado en Shewanella y Escherichia bacterias 5 El transposon de codigos para la resistencia de antibiotico a kanamycin y otro aminoglycosido antibioticos 3 6 TN5 y otros transposases son notablemente inactivos Porque el ADN de transposicion son inherentemente mutagenicos la baja actividad del transposases es necesaria para reducir el riesgo de causar una mutacion fatal en el hospedero y eliminando los elementos transponibles Una de las razones que no es tan reactivo Tn5 es porque el N y C terminal se encuentra relativamente cerca uno al otro y tienden a inhibir el uno al otro Esto fue aclarada por la caracterizacion de varias mutaciones que dio lugar a formas hiperactivas de transposasas L372P es una mutacion del aminoacido 372 en la transposasa Tn5 Este aminoacido es generalmente un residuo de leucina en medio de una helice alfa Cuando este leucina es reemplazado con un residuo de la prolina la helice alfa esta rota introducir un cambio conformacional en el dominio C terminal separandolo del dominio N Terminal suficiente para promover una mayor actividad de la proteina 3 la transposicion de un transposon a menudo necesita solo tres piezas el transposon la enzima transposasa y el ADN diana para la insercion de los transposones 3 Este es el caso de Tm5 que utiliza un mecanismo de cortar y pegar para mover alrededor de transposones 3 Tn5 y mas otros transposases contienen una DDE que es el sitio activo que cataliza el movimiento de los transposones Aspartato 97 188 aspartato y glutamato 326 conforman el sitio activo que es una triada de residuos acidos 7 el motivo DDE se dice que coordinar los iones metalicos divalentes mas a menudo de magnesio y manganeso que son importantes en la reaccion catalitica 7 porque transposase es increiblemente inactivo la region DDE esta mutada asi la transposasa llega a ser hiperactiva y cataliza el movimiento de los transposones 7 el glutamato se transforma en un aspartato y los dos asparates en glutamatos 7 a traves de esta mutacion el estudio de Tn5 llega a ser posible pero algunos pasos en el proceso catalitico se pierden como resultado 3 Hay muchos da un paso cual catalyze el movimiento del transposon incluyendo Tnp atando synapsis la creacion de un synaptic complejo cleavage captura de objetivo y transferencia de hebra Transposase Entonces ata a la hebra de ADN y crea un clamp sobre el transposon fin del ADN e inserta al sitio activo Una vez el transposase ata al transposon produce un synaptic complejo en que dos transposases esta atado en un cis trans relacion con el transposon 5 Los iones de magnesio activan oxigeno de moleculas de agua y exponerles a nucleophilic ataque 6 Esto deja las moleculas de agua a nick el 3 hebras en ambos fines y crear un hairpin formacion el cual separa el transposon del ADN de donante 5 Luego el transposase mueve el transposon a una ubicacion adecuada No mucho es sabido sobre la captura de objetivo a pesar de que hay una secuencia predispone cual no ha sido todavia determinado 5 Despues de que captura de objetivo el transposase ataca el ADN de objetivo nueve pares de base aparte resultando en la integracion del transposon al ADN de objetivo 5 Debido a las mutaciones del DDE algunos pasos del proceso estan perdidos por ejemplo cuando este experimento esta actuado en vitro y SDS tratamiento de calor denatures el transposase Aun asi es todavia incierto que pasa al transposase en vivo 5 El estudio de transposase Tn5 es de importancia general debido a sus semejanzas a VIH 1 y otro retroviral enfermedades Por estudiar Tn5 mucho tambien puede ser descubierto sobre otro transposases y sus actividades 5 Durmiente transposasa EditarSleeping Beauty SB transposasa es el recombinase que paseos la Belleza de Dormir transposon sistema 7 SB transposase Pertenece al DD E D familia de transposases los cuales en vuelta pertenecen a un grandes superfamily de polynucleotidyl transferases aquello incluye RNase H RuvC Holliday resolvase RAG proteinas y retroviral integrases 8 9 El SB el sistema esta utilizado principalmente en animales vertebrados para transferencia de gen incluyendo terapia de gen y descubrimiento de gen 10 11 12 13 14 El recientemente engineered SB100X es una enzima especialmente potente que dirige los niveles mas altos de transposon la integracion todavia desarrollo 15 16 Referencias Editar Heffron F McCarthy BJ Ohtsubo H Ohtsubo E December 1979 DNA sequence analysis of the transposon Tn3 three genes and three sites involved in transposition of Tn3 Cell 18 4 1153 63 PMID 391406 doi 10 1016 0092 8674 79 90228 9 a b c Goodsell David December 2006 Transposase Molecule of the Month Protein Data Bank Reznikoff WS March 2003 Tn5 as a model for understanding DNA transposition Molecular Microbiology 47 5 1199 206 PMID 12603728 doi 10 1046 j 1365 2958 2003 03382 x Aziz RK Breitbart M Edwards RA July 2010 Transposases are the most abundant most ubiquitous genes in nature Nucleic Acids Research 38 13 4207 17 PMC 2910039 PMID 20215432 doi 10 1093 nar gkq140 a b c d e f Reznikoff William S 2003 Tn5 as a model for understanding DNA transposition Molecular Microbiology 47 5 1199 1206 PMID 12603728 doi 10 1046 j 1365 2958 2003 03382 x Scott Lovell Scott Igor Y Goryshin William R Reznikoff Ivan Rayment 2002 Two metal active site binding of a Tn5 transposase synaptic complex Nature Structural Biology 9 4 278 81 PMID 11896402 doi 10 1038 nsb778 last1 y autor1 redundantes ayuda Ivics Z P Craig N Nesmelova I Ivics Z Izsvak Z 2005 A whole lotta jumpin goin on new transposon tools for vertebrate functional genomics Izsvak Zsuzsanna Hackett Perry B Cooper Laurence J N Ivics Zoltan septiembre de 2010 Translating Sleeping Beauty transposition into cellular therapies Victories and challenges BioEssays 32 9 756 767 doi 10 1002 bies 201000027 Aronovich E Carlson C Copeland N Mates L et al 2009 Molecular evolution of a novel hyperactive Sleeping Beauty transposase enables robust stable gene transfer in vertebrates Grabundzija I Irgang M Mates L Belay E Matrai J Gogol Doring A Kawakami K Chen W Ruiz P Chuah M Datos Q410629 Multimedia Category TransposaseObtenido de https es wikipedia org w index php title Transposasa amp oldid 136803109, wikipedia, wiki, leyendo, leer, libro, biblioteca,

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