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Fosforilasa quinasa

La fosforilasa quinasa (PHK) (EC 2.7.11.19) es una serina/treonina proteína quinasa específica que activa la glucógeno fosforilasa para liberar glucosa-1-fosfato procedente del glucógeno. La PHK fosforila la glucógeno fosforilasa en dos residuos serina provocando un cambio conformacional que favorece a la glucógeno fosforilasa "a" más activa que la glucógeno fosforilasa "b" desfosforilada.[3][4]

Fosforilasa quinasa subunidad catalítica gamma 1[1]

Figura 1. Estructura de la subunidad catalítca gamma
Estructuras disponibles
PDB

Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

Identificadores
Símbolos PHKG1 (HGNC: 8930) PHKG
Identificadores
externos
Número EC 2.7.11.19
Locus Cr. 7 p11.2
Estructura/Función proteica
Tamaño 387 (aminoácidos)
Ortólogos
Especies
Entrez
5260
UniProt
Q16816 n/a
RefSeq
(ARNm)
NM_006213 n/a
PubMed (Búsqueda)
PMC (Búsqueda)
Fosforilasa quinasa subunidad catalítica gamma 2[2]
Estructuras disponibles
PDB

Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

Identificadores
Símbolos PHKG2 (HGNC: 8930) PHK-gamma-T
Identificadores
externos
Número EC 2.7.11.19
Locus Cr. 16 p11.2
Estructura/Función proteica
Tamaño 406 (aminoácidos)
Ortólogos
Especies
Entrez
5261
UniProt
Q15735 n/a
RefSeq
(ARNm)
NM_000294 n/a
PubMed (Búsqueda)
PMC (Búsqueda)
Glucógeno fosforilasa b + 2 ATP Glucógeno fosforilasa a + 2 ADP

La enzima se presenta como un homotetrámero de tetrámeros situados en forma de "mariposa". Cada uno de los cuatro tetrámeros está formado de una subunidad α, una subunidad β, una subunidad γ y una subunidad δ. La subunidad γ contiene el sitio con actividad catalítica mientras que las otras tres subunidades tienen funciones reguladoras.

Cuando no están modificadas las subunidades α y β inhiben la catálisis enzimática, pero la fosforilación de ambas unidades por la proteína quinasa A reduce sus actividades inhibidoras. La subunidad δ es la proteína eucariota calmodulina que tiene 4 sitios de unión para el ion calcio. Cuando los niveles citosólicos de Ca2+ suben por encima de ≈10-7 M, la subunidad δ sufre un gran cambio conformacional que activa la actividad quinasa uniéndose a la subunidad γ catalítica.[5]

Figura 2. Degradación del glucógeno mediada por la glucógeno fosforilasa, fosforilasa quinasa y proteína quinasa A.


Genes

Los genes relacionados con la fosforilasa quinasa son:

  • Subunidad alfa: PHKA1, PHKA2
  • Subunidad beta: PHKB
  • Subunidad catalítica gamma: PHKG1, PHKG2
  • Subunidad delta (calmodulina): CALM1, CALM2, CALM3

Las fichas proteína de esta página representan las subunidades gamma catalíticas.

Historia

La fosforilasa quinasa fue la primera proteína quinasa en ser aislada y caracterizada en detalle. Lo consiguieron por primera vez Krebs, Graves y Fischer en los años 1950.[6][7][8]​ En ese momento, la comunidad científica no era consciente de la importancia de la fosforilación de proteínas en la regulación de los procesos celulares y muchos consideraban a las fosfoproteínas como no importantes biológicamente. Como la modificación covalente por fosforilación es un método extendido e importante para la regulación bioquímica en una gran variedad de procesos celulares, el descubrimiento de la fosforilasa quinasa tuvo un enorme impacto en el conocimiento científico de los mecanismos reguladores.

El sustrato de la PHK, la glucógeno fosforilasa, fue aislada por Carl and Gerty Cori en los años 1930. Determinaron que existían dos formas: una forma inactiva "b" y una forma activa "a". Por razones desconocidas en aquel momento, la única forma de aislar la glucógeno fosforilasa "a" del tejido muscular era mediante filtración por papel - otros métodos como la centrifugación no funcionaban. Fue Fischer et al. quien teorizó que la presencia de iones calcio en el papel de filtro era la que generaba la forma "a" activa. Investigaciones posteriores revelaron que los iones calcio estaban activando la fosforilasa quinasa a través de la subunidad reguladora δ provocando la fosforilación de la glucógeno fosforilasa.[9][10][11]

Mecanismo

Los detalles precisos del mecanismo catalítico de la fosforilasa quinasa todavía están en estudio.[12][13][14][15][16]​ Aunque parezca sorprendente ya que la enzima fue aislada hace unos 50 años, existen dificultades significativas en estudiar los detalles finos de la estructura y mecanismo de la PHK debido a su tamaño grande y a su alto nivel de complejidad.[5]​ En el sitio activo, existe una homología significativa entre la PHK y otras proteínas quinasas como la proteína quinasa A. En contraste a estas proteínas que típicamente requieren la fosforilación de un residuo serina o treonina en el sitio catalítico para ser activas, la subunidad catalítica γ de la PHK está constituvimante activa debido a la presencia de un residuo glutamato (Glu-182) cargado negativamente.[14][15]

Datos estructurales y bioquímicos sugieren un posible mecanismo de acción para la fosforilación de la glucógeno fosforilasa por la PHK: La transferencia directa del grupo fosfato desde el ATP al sustrato serina.[12]

Estructura

La fosforilasa quinasa es una holoenzima hexadecamérica de peso molecular 1.3 MDa, aunque su tamaño puede variar algo debido a las diferentes isoformas de las subunidades obtenidas por splicing de mRNA.[17][18][19]​ Consiste en cuatro homotetrámeros cada uno formado de cuatro subunidades (α,β,δ,γ). Solamente la subunidad γ tiene actividad catalítica, mientras que las otras tienen funciones reguladoras. Debido a la inestabilidad de las subunidades reguladoras en solución, solamente la subunidad γ se ha cristalizado individualmente.

Las subunidades están situadas en dos lóbulos orientados espalda contra espalda en lo que se ha descrito como una forma de "mariposa" con simetría D2.[17][20][21]​ Cada lóbulo consiste de dos tetrámeros, cada uno formado por las subunidades αβδγ mencionadas anteriormente. La subunidad δ es la calmodulina, mientras que las subunidades α y β son homólogos estrechamente relacionados uno con el otro y se ha propuesto que se han formado por duplicación del gen y la consiguiente diferenciación.[22]

Función biológica y regulación

 
Figura 3. Regulación de la fosforilasa quinasa.

Fisiológicamente la fosforilasa quinasa juega un papel importante en estimular la degradación del glucógeno a glucosa libre mediante la fosforilación de la glucógeno fosforilasa y estabilizando su forma activa. Esta actividad es particularmente importante en las células del hígado y del músculo, aunque para propósitos diferentes. Mientras que en las células musculares la degradación del glucógeno sirve para proporcionar la energía para la actividad física que se está llevando a cabo, en las células del hígado la degradación del glucógeno es responsable de mantener la concentración de glucosa en la sangre. Por tanto, los mecanismos reguladores de la actividad de la PHK varían algo dependiendo del tipo de célula.[3]

En general, la enzima está regulada alostéricamente y por fosforilación reversible. Las hormonas, los impulsos nerviosos y la contracción del músculo estimulan la liberación de iones calcio. Estos actúan como activadores alostéricos, uniéndose a las subunidades δ de la fosforilasa quinasa y activando parcialmente la actividad enzimática. Esta unión estabiliza parcialmente la proteína en la forma activa. La fosforilasa quinasa está completamente activada cuando las subunidades α y β son fosforiladas por la proteína quinasa A y la subunidad δ está unida a iones calcio.[5][10][23]

En las células musculares, la fosforilación de las subunidades α y β por la proteína quinasa A es el resultado de una cascada de señalización mediada por cAMP iniciada por la unión de la epinefrina a los receptores beta-adrenérgicos de la superficie celular. Adicionalmente, la liberación de iones calcio del retículo sarcoplasmático durante la contracción muscular inactiva la subunidad δ inhibidora y activa totalmente la PHK.

En las células del hígado, el proceso es algo más complejo. El glucagón y la epinefrina pueden empezar la cascada cAMP-proteína quinasa A, pero la epinefrina también se puede unir a un receptor alfa-adrenérgico para empezar una cascada fosfoinositida resultando en la liberación de Ca2+ del retículo endoplasmático.

Cuando la célula necesita parar la degradación de glucógeno, la PHK es defosforilada por las fosfatasas 1 y 2, devolviendo a las subunidades α y β a su configuración inhibidora inicial.[24][25]

Relevancia clínica

Los defectos en los genes de la fosforilasa quinasa pueden resultar en síntomas fisiológicos clasificados como enfermedades de almacenamiento de glucógeno. Entre éstas, algunas de las más comunes son las glucogenosis del hígado (XLG), que pueden ser subdivididas en XLG I y XLG II.[26][27]​ Clínicamente, estas enfermedades se manifiestan por un desarrollo físico lento durante la niñez y por un tamaño anormalmente grande del hígado. En la XLG I la actividad de la PHK está anormalmente reducida en las células hepáticas y en las de la sangre, mientras que en la XLG II la actividad enzimática está disminuida solamente en las células hepáticas. Estas dos enfermedades están debidas a mutaciones en el gen PHKA2, que codifica la subunidad α de la fosforilasa quinasa. En el caso de la XLG I, las mutaciones resultan en subunidades α malformadas e inestables, mientras que en la XLG II las mutaciones alteran las subunidades menos severamente. Basados en datos estructurales y bioinformáticos, algunos han sugerido que las subunidades α y β pueden tener una actividad catalítica similar a las glicoamilasas y que las mutaciones en la subunidad α pueden contribuir a los síntomas de la XLG II.[28][29]​ De todas formas, esta actividad catalítica no ha sido aun confirmada.

Referencias

  1. «PHKG1 Gene». Consultado el 23 de octubre de 2011. 
  2. «PHKG2 Gene». Consultado el 23 de octubre de 2011. 
  3. Berg, J., Tymoczko, J. & Stryer, L. Biochemistry. W.H. Freeman and Co.: New York, 2007.
  4. «ENZYME entry: EC 2.7.11.19». Consultado el 23 de octubre de 2011. 
  5. Brushia R, Walsh D (1999). «Phosphorylase kinase: the complexity of its regulation is reflected in the complexity of its structure». Front Biosci 4: D618-41. PMID 10487978. doi:10.2741/Brushia. 
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  7. Krebs EG, Graves DJ, Fischer EH (1959). «Factors affecting the activity of muscle phosphorylase b kinase». J Biol Chem 234: 2867-2873. PMID 14411853. 
  8. Fischer EH, Krebs EG (1955). «Conversion of phosphorylase b to phosphorylase a in muscle extracts». J Biol Chem 216 (1): 121-132. PMID 13252012. 
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  10. Cohen P (1982). «The role of protein phosphorylation in neural and hormonal control of cellular activity». Nature 296 (5858): 613-620. PMID 6280056. doi:10.1038/296613a0. 
  11. Cohen P (1973). «The Subunit Structure of Rabbit-Skeletal-Muscle Phosphorylase Kinase, and the Molecular Basis of Its Activation Reactions». Eur J Biochem 34 (1): 1-14. PMID 4349654. doi:10.1111/j.1432-1033.1973.tb02721.x. 
  12. Skamnaki VT et al. (1999). «Catalytic mechanism of phosphorylase kinase probed by mutational studies». Biochemistry 38 (44): 14718-14730. PMID 10545198. doi:10.1021/bi991454f. 
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  14. Lowe ED et al. (1997). «The crystal structure of a phosphorylase kinase peptide substrate complex: kinase substrate recognition». EMBO J 16 (22): 6646-6658. PMC 1170269. PMID 9362479. doi:10.1093/emboj/16.22.6646. 
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  •   Datos: Q906540

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La fosforilasa quinasa PHK EC 2 7 11 19 es una serina treonina proteina quinasa especifica que activa la glucogeno fosforilasa para liberar glucosa 1 fosfato procedente del glucogeno La PHK fosforila la glucogeno fosforilasa en dos residuos serina provocando un cambio conformacional que favorece a la glucogeno fosforilasa a mas activa que la glucogeno fosforilasa b desfosforilada 3 4 Fosforilasa quinasa subunidad catalitica gamma 1 1 Figura 1 Estructura de la subunidad catalitca gammaEstructuras disponiblesPDBBuscar ortologos PDBe RCSB Estructuras enzimaticasRCSB PDB PDBe PDBsumIdentificadoresSimbolosPHKG1 HGNC 8930 PHKGIdentificadoresexternosOMIM 172470EBI PHKG1GeneCards Gen PHKG1UniProt PHKG1 Bases de datos de enzimasIntEnz entrada en IntEnz BRENDA entrada en BRENDA ExPASy NiceZime view KEGG entrada en KEEG PRIAM perfil PRIAM ExplorEnz entrada en ExplorEnz MetaCyc via metabolicaNumero EC2 7 11 19LocusCr 7 p11 2 Ontologia genicaReferencias AmiGO QuickGOEstructura Funcion 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enzima se presenta como un homotetramero de tetrameros situados en forma de mariposa Cada uno de los cuatro tetrameros esta formado de una subunidad a una subunidad b una subunidad g y una subunidad d La subunidad g contiene el sitio con actividad catalitica mientras que las otras tres subunidades tienen funciones reguladoras Cuando no estan modificadas las subunidades a y b inhiben la catalisis enzimatica pero la fosforilacion de ambas unidades por la proteina quinasa A reduce sus actividades inhibidoras La subunidad d es la proteina eucariota calmodulina que tiene 4 sitios de union para el ion calcio Cuando los niveles citosolicos de Ca2 suben por encima de 10 7 M la subunidad d sufre un gran cambio conformacional que activa la actividad quinasa uniendose a la subunidad g catalitica 5 Figura 2 Degradacion del glucogeno mediada por la glucogeno fosforilasa fosforilasa quinasa y proteina quinasa A Indice 1 Genes 2 Historia 3 Mecanismo 4 Estructura 5 Funcion biologica y regulacion 6 Relevancia clinica 7 ReferenciasGenes EditarLos genes relacionados con la fosforilasa quinasa son Subunidad alfa PHKA1 PHKA2 Subunidad beta PHKB Subunidad catalitica gamma PHKG1 PHKG2 Subunidad delta calmodulina CALM1 CALM2 CALM3Las fichas proteina de esta pagina representan las subunidades gamma cataliticas Historia EditarLa fosforilasa quinasa fue la primera proteina quinasa en ser aislada y caracterizada en detalle Lo consiguieron por primera vez Krebs Graves y Fischer en los anos 1950 6 7 8 En ese momento la comunidad cientifica no era consciente de la importancia de la fosforilacion de proteinas en la regulacion de los procesos celulares y muchos consideraban a las fosfoproteinas como no importantes biologicamente Como la modificacion covalente por fosforilacion es un metodo extendido e importante para la regulacion bioquimica en una gran variedad de procesos celulares el descubrimiento de la fosforilasa quinasa tuvo un enorme impacto en el conocimiento cientifico de los mecanismos reguladores El sustrato de la PHK la glucogeno fosforilasa fue aislada por Carl and Gerty Cori en los anos 1930 Determinaron que existian dos formas una forma inactiva b y una forma activa a Por razones desconocidas en aquel momento la unica forma de aislar la glucogeno fosforilasa a del tejido muscular era mediante filtracion por papel otros metodos como la centrifugacion no funcionaban Fue Fischer et al quien teorizo que la presencia de iones calcio en el papel de filtro era la que generaba la forma a activa Investigaciones posteriores revelaron que los iones calcio estaban activando la fosforilasa quinasa a traves de la subunidad reguladora d provocando la fosforilacion de la glucogeno fosforilasa 9 10 11 Mecanismo EditarLos detalles precisos del mecanismo catalitico de la fosforilasa quinasa todavia estan en estudio 12 13 14 15 16 Aunque parezca sorprendente ya que la enzima fue aislada hace unos 50 anos existen dificultades significativas en estudiar los detalles finos de la estructura y mecanismo de la PHK debido a su tamano grande y a su alto nivel de complejidad 5 En el sitio activo existe una homologia significativa entre la PHK y otras proteinas quinasas como la proteina quinasa A En contraste a estas proteinas que tipicamente requieren la fosforilacion de un residuo serina o treonina en el sitio catalitico para ser activas la subunidad catalitica g de la PHK esta constituvimante activa debido a la presencia de un residuo glutamato Glu 182 cargado negativamente 14 15 Datos estructurales y bioquimicos sugieren un posible mecanismo de accion para la fosforilacion de la glucogeno fosforilasa por la PHK La transferencia directa del grupo fosfato desde el ATP al sustrato serina 12 Estructura EditarLa fosforilasa quinasa es una holoenzima hexadecamerica de peso molecular 1 3 MDa aunque su tamano puede variar algo debido a las diferentes isoformas de las subunidades obtenidas por splicing de mRNA 17 18 19 Consiste en cuatro homotetrameros cada uno formado de cuatro subunidades a b d g Solamente la subunidad g tiene actividad catalitica mientras que las otras tienen funciones reguladoras Debido a la inestabilidad de las subunidades reguladoras en solucion solamente la subunidad g se ha cristalizado individualmente Las subunidades estan situadas en dos lobulos orientados espalda contra espalda en lo que se ha descrito como una forma de mariposa con simetria D2 17 20 21 Cada lobulo consiste de dos tetrameros cada uno formado por las subunidades abdg mencionadas anteriormente La subunidad d es la calmodulina mientras que las subunidades a y b son homologos estrechamente relacionados uno con el otro y se ha propuesto que se han formado por duplicacion del gen y la consiguiente diferenciacion 22 Funcion biologica y regulacion Editar Figura 3 Regulacion de la fosforilasa quinasa Fisiologicamente la fosforilasa quinasa juega un papel importante en estimular la degradacion del glucogeno a glucosa libre mediante la fosforilacion de la glucogeno fosforilasa y estabilizando su forma activa Esta actividad es particularmente importante en las celulas del higado y del musculo aunque para propositos diferentes Mientras que en las celulas musculares la degradacion del glucogeno sirve para proporcionar la energia para la actividad fisica que se esta llevando a cabo en las celulas del higado la degradacion del glucogeno es responsable de mantener la concentracion de glucosa en la sangre Por tanto los mecanismos reguladores de la actividad de la PHK varian algo dependiendo del tipo de celula 3 En general la enzima esta regulada alostericamente y por fosforilacion reversible Las hormonas los impulsos nerviosos y la contraccion del musculo estimulan la liberacion de iones calcio Estos actuan como activadores alostericos uniendose a las subunidades d de la fosforilasa quinasa y activando parcialmente la actividad enzimatica Esta union estabiliza parcialmente la proteina en la forma activa La fosforilasa quinasa esta completamente activada cuando las subunidades a y b son fosforiladas por la proteina quinasa A y la subunidad d esta unida a iones calcio 5 10 23 En las celulas musculares la fosforilacion de las subunidades a y b por la proteina quinasa A es el resultado de una cascada de senalizacion mediada por cAMP iniciada por la union de la epinefrina a los receptores beta adrenergicos de la superficie celular Adicionalmente la liberacion de iones calcio del reticulo sarcoplasmatico durante la contraccion muscular inactiva la subunidad d inhibidora y activa totalmente la PHK En las celulas del higado el proceso es algo mas complejo El glucagon y la epinefrina pueden empezar la cascada cAMP proteina quinasa A pero la epinefrina tambien se puede unir a un receptor alfa adrenergico para empezar una cascada fosfoinositida resultando en la liberacion de Ca2 del reticulo endoplasmatico Cuando la celula necesita parar la degradacion de glucogeno la PHK es defosforilada por las fosfatasas 1 y 2 devolviendo a las subunidades a y b a su configuracion inhibidora inicial 24 25 Relevancia clinica EditarLos defectos en los genes de la fosforilasa quinasa pueden resultar en sintomas fisiologicos clasificados como enfermedades de almacenamiento de glucogeno Entre estas algunas de las mas comunes son las glucogenosis del higado XLG que pueden ser subdivididas en XLG I y XLG II 26 27 Clinicamente estas enfermedades se manifiestan por un desarrollo fisico lento durante la ninez y por un tamano anormalmente grande del higado En la XLG I la actividad de la PHK esta anormalmente reducida en las celulas hepaticas y en las de la sangre mientras que en la XLG II la actividad enzimatica esta disminuida solamente en las celulas hepaticas Estas dos enfermedades estan debidas a mutaciones en el gen PHKA2 que codifica la subunidad a de la fosforilasa quinasa En el caso de la XLG I las mutaciones resultan en subunidades a malformadas e inestables mientras que en la XLG II las mutaciones alteran las subunidades menos severamente Basados en datos estructurales y bioinformaticos algunos han sugerido que las subunidades a y b pueden tener una actividad catalitica similar a las glicoamilasas y que las mutaciones en la subunidad a pueden contribuir a los sintomas de la XLG II 28 29 De todas formas esta actividad catalitica no ha sido aun confirmada Referencias Editar PHKG1 Gene Consultado el 23 de octubre de 2011 PHKG2 Gene Consultado el 23 de octubre de 2011 a b Berg J Tymoczko J amp Stryer L Biochemistry W H Freeman and Co New York 2007 ENZYME entry EC 2 7 11 19 Consultado el 23 de octubre de 2011 a b c Brushia R Walsh D 1999 Phosphorylase kinase the complexity of its regulation is reflected in the complexity of its structure Front Biosci 4 D618 41 PMID 10487978 doi 10 2741 Brushia Fischer EH 2010 Phosphorylase and the origin of reversible protein phosphorylation Biol Chem 391 2 3 131 137 PMID 20030590 doi 10 1515 BC 2010 011 Krebs EG Graves DJ Fischer EH 1959 Factors affecting the 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