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Asgardarchaeota

Asgardarchaeota, Asgard o Asgardia es un filo o supergrupo de arqueas recientemente definido.[2][3]​ Se identificó inicialmente mediante análisis genético y posteriormente pudo ser cultivado.[4]​ Este grupo ha despertado gran interés debido a que el análisis filogenético ha revelado que está íntimamente relacionado con el origen de los seres eucariotas, es decir, un arquea del grupo Asgard sería el ancestro procariota directo de la primera célula eucariota.[5]​ Inicialmente el grupo se denominó Lokiarchaeota,[6]​ el cual se ha redefinido en varias clases.

 
Asgard

Prometheoarchaeum, la primera arquea Asgard cultivada.
Taxonomía
Dominio: Archaea
(sin rango) Proteoarchaeota
Filo: Asgardarchaeota (P)
Zaremba et al. 2017
Clases

Características

Metabolismo: De acuerdo a los estudios metagenómicos, puede haber autotrofía anaerobia, dependencia del hidrógeno, organotrofía dependiente de hidrocarburos de cadena corta, fototrofía a base de rodopsina[7]​ y sintrofía.

Relación con los eucariontes

 
Escenario endosimbiotico propuesto para el origen de los eucariotas.

El análisis genómico ha revelado que hay varios componentes homólogos con los eucariontes relacionados con la maquinaria de transporte celular, encontrando genomas enriquecidos con proteínas que anteriormente estaban consideradas específicas para eucariotas; lo que abre una ventana en la búsqueda del origen de la complejidad celular eucariota.

Los genomas de las arqueas Asgard codifican un repertorio de proteínas que son características de los eucariontes, incluidas las involucradas en el tráfico membranal, la formación y/o transporte de vesículas, la ubiquitina y la formación del citoesqueleto.[5]

Descubrimiento

 
Caracterización microscópica y composición lípidica de las arqueas Asgard.

El nombre "Asgard", alude al recinto de los dioses de acuerdo con la mitología nórdica, debido a que el primer género identificado fue Lokiarchaeum, tras realizar un análisis metagenómico (destructivo) de una muestra de sedimentos centro-oceánicos que se obtuvo a 15 km de una fuente hidrotermal conocida como el Castillo de Loki, sobre la Dorsal de Gakkel en el océano Ártico (mar de Groenlandia), en el sedimento del fondo marino a 2.352 metros de profundidad, 0,3°C y sin señales de vida eucariota.[8]

La primera especie cultivada, Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum MK-D1 es una pequeña célula en forma de coco de alrededor de 550 nm de diámetro con largos tentáculos a menudo ramificados. Es un organismo anaeróbico de crecimiento extremadamente lento, sin orgánulos visibles que degrada los aminoácidos mediante sintrofía. Se extrajo del sedimento marino en la fosa de Nankai (Japón) a 2500 metros de profundidad y a una temperatura dos grados.[4]

Filogenia

Se ha propuesto que el clado que agrupa a las arqueas Asgard con los eucariontes puede denominarse "Eukaryomorpha".[9]​ Asgard o Asgardarchaeota es un taxón que puede considerarse parafilético debido a que está relacionado con el origen de los eucariontes del siguiente modo:[1][10]

 Eukaryomorpha 

Sipharchaeia

Lokiarchaeia

Thorarchaeia

Jordarchaeia

Heimdallarchaeia

 + α─proteobacteria 

Eukaryota

Referencias

  1. Jiarui Sun, Paul N. Evans, Emma J. Gagen, Ben J. Woodcroft, Brian P. Hedlund, Tanja Woyke, Philip Hugenholtz (2021). Recoding of stop codons expands the metabolic potential of two novel Asgardarchaeota lineages. Nature.
  2. GTDB database Asgardarchaeota
  3. Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, David W. Waite, William B Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz (2020). A rank-normalized archaeal taxonomy based on genome phylogeny resolves widespread incomplete and uneven classifications. Biorxiv.
  4. Imachi, Hiroyuki, et al. Isolation of an archaeon at the prokaryote-eukaryote interface. bioRxiv (2019): 726976.
  5. Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2016-2017, Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity. Nature 541, 353–358 (19 January 2017) doi:10.1038/nature21031
  6. Anja Spang et al. 2015 Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes. Nature. 2015 May 14; 521(7551): 173–179.
  7. Imachi, H., Nobu, M.K., Nakahara, N. et al. Isolation of an archaeon at the prokaryote–eukaryote interface. Nature 577, 519–525 (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-019-1916-6
  8. Dansker finder mikroorganismernes missing link Videnskab.dk 2015, Dinamarca
  9. Fournier GP & Poole AM 2018, A Briefly Argued Case That Asgard Archaea Are Part of the Eukaryote Tree. Front Microbiol. 2018 Aug 15;9:1896. doi: 10.3389/fmicb.2018.01896. eCollection 2018.
  10. Williams, Tom & Cox, Cymon & Foster, Peter & Szollosi, Gergely & Embley, T.. (2020). Phylogenomics provides robust support for a two-domains tree of life. Nature Ecology & Evolution. 4. 1-10. 10.1038/s41559-019-1040-x.
  •   Datos: Q45003302
  •   Multimedia: Category:Asgardarchaeota

asgardarchaeota, asgard, asgardia, filo, supergrupo, arqueas, recientemente, definido, identificó, inicialmente, mediante, análisis, genético, posteriormente, pudo, cultivado, este, grupo, despertado, gran, interés, debido, análisis, filogenético, revelado, es. Asgardarchaeota Asgard o Asgardia es un filo o supergrupo de arqueas recientemente definido 2 3 Se identifico inicialmente mediante analisis genetico y posteriormente pudo ser cultivado 4 Este grupo ha despertado gran interes debido a que el analisis filogenetico ha revelado que esta intimamente relacionado con el origen de los seres eucariotas es decir un arquea del grupo Asgard seria el ancestro procariota directo de la primera celula eucariota 5 Inicialmente el grupo se denomino Lokiarchaeota 6 el cual se ha redefinido en varias clases AsgardPrometheoarchaeum la primera arquea Asgard cultivada TaxonomiaDominio Archaea sin rango ProteoarchaeotaFilo Asgardarchaeota P Zaremba et al 2017ClasesHeimdallarchaeia Lokiarchaeia Thorarchaeia Candidatos 1 Jordarchaeia Sipharchaeia editar datos en Wikidata Indice 1 Caracteristicas 2 Relacion con los eucariontes 3 Descubrimiento 4 Filogenia 5 ReferenciasCaracteristicas EditarMetabolismo De acuerdo a los estudios metagenomicos puede haber autotrofia anaerobia dependencia del hidrogeno organotrofia dependiente de hidrocarburos de cadena corta fototrofia a base de rodopsina 7 y sintrofia Relacion con los eucariontes Editar Escenario endosimbiotico propuesto para el origen de los eucariotas El analisis genomico ha revelado que hay varios componentes homologos con los eucariontes relacionados con la maquinaria de transporte celular encontrando genomas enriquecidos con proteinas que anteriormente estaban consideradas especificas para eucariotas lo que abre una ventana en la busqueda del origen de la complejidad celular eucariota Los genomas de las arqueas Asgard codifican un repertorio de proteinas que son caracteristicas de los eucariontes incluidas las involucradas en el trafico membranal la formacion y o transporte de vesiculas la ubiquitina y la formacion del citoesqueleto 5 Descubrimiento Editar Caracterizacion microscopica y composicion lipidica de las arqueas Asgard El nombre Asgard alude al recinto de los dioses de acuerdo con la mitologia nordica debido a que el primer genero identificado fue Lokiarchaeum tras realizar un analisis metagenomico destructivo de una muestra de sedimentos centro oceanicos que se obtuvo a 15 km de una fuente hidrotermal conocida como el Castillo de Loki sobre la Dorsal de Gakkel en el oceano Artico mar de Groenlandia en el sedimento del fondo marino a 2 352 metros de profundidad 0 3 C y sin senales de vida eucariota 8 La primera especie cultivada Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum MK D1 es una pequena celula en forma de coco de alrededor de 550 nm de diametro con largos tentaculos a menudo ramificados Es un organismo anaerobico de crecimiento extremadamente lento sin organulos visibles que degrada los aminoacidos mediante sintrofia Se extrajo del sedimento marino en la fosa de Nankai Japon a 2500 metros de profundidad y a una temperatura dos grados 4 Filogenia EditarSe ha propuesto que el clado que agrupa a las arqueas Asgard con los eucariontes puede denominarse Eukaryomorpha 9 Asgard o Asgardarchaeota es un taxon que puede considerarse parafiletico debido a que esta relacionado con el origen de los eucariontes del siguiente modo 1 10 Eukaryomorpha Sipharchaeia Lokiarchaeia Thorarchaeia Jordarchaeia Heimdallarchaeia a proteobacteria Eukaryota Referencias Editar a b Jiarui Sun Paul N Evans Emma J Gagen Ben J Woodcroft Brian P Hedlund Tanja Woyke Philip Hugenholtz 2021 Recoding of stop codons expands the metabolic potential of two novel Asgardarchaeota lineages Nature GTDB database Asgardarchaeota Christian Rinke Maria Chuvochina Aaron J Mussig Pierre Alain Chaumeil David W Waite William B Whitman Donovan H Parks Philip Hugenholtz 2020 A rank normalized archaeal taxonomy based on genome phylogeny resolves widespread incomplete and uneven classifications Biorxiv a b Imachi Hiroyuki et al Isolation of an archaeon at the prokaryote eukaryote interface bioRxiv 2019 726976 a b Katarzyna Zaremba Niedzwiedzka et al 2016 2017 Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity Nature 541 353 358 19 January 2017 doi 10 1038 nature21031 Anja Spang et al 2015 Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes Nature 2015 May 14 521 7551 173 179 Imachi H Nobu M K Nakahara N et al Isolation of an archaeon at the prokaryote eukaryote interface Nature 577 519 525 2020 https doi org 10 1038 s41586 019 1916 6 Dansker finder mikroorganismernes missing link Videnskab dk 2015 Dinamarca Fournier GP amp Poole AM 2018 A Briefly Argued Case That Asgard Archaea Are Part of the Eukaryote Tree Front Microbiol 2018 Aug 15 9 1896 doi 10 3389 fmicb 2018 01896 eCollection 2018 Williams Tom amp Cox Cymon amp Foster Peter amp Szollosi Gergely amp Embley T 2020 Phylogenomics provides robust support for a two domains tree of life Nature Ecology amp Evolution 4 1 10 10 1038 s41559 019 1040 x Datos Q45003302 Multimedia Category AsgardarchaeotaObtenido de https es wikipedia org w index php title Asgardarchaeota 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